BRD-0639

别名: BRD0639; BRD 0639; BRD-0639; (2S)-2-(4-氯-6-氧化哒嗪-1-基)-N-[4-甲基-3-[[2-(2-吡啶基)乙基]氨基磺酰基]苯基]丙酰胺
目录号: V51601 纯度: ≥98%
BRD0639 是 PRMT5-底物接头相互作用的转录抑制剂。
BRD-0639 CAS号: 2760881-74-9
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BRD0639 是一种 PRMT5-底物衔接蛋白相互作用的转录抑制剂。BRD0639 是一种 PRMT5 结合基序 (PBM) 竞争性抑制剂,可用于研究 PBM 依赖性 PRMT5 活性。
BRD-0639(BRD0639;CAS 2760881-74-9)是首创的蛋白质精氨酸甲基转移酶 5 (PRMT5) 与 PRMT5 结合基序 (PBM) 之间蛋白质-肽相互作用的抑制剂。它是一种 PBM 竞争性小分子抑制剂,在透化细胞中的 IC50 值为 7.5 μM,在活细胞中的 IC50 值为 16 μM。BRD0639 可用于研究 PBM 依赖性 PRMT5 活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
BRD-0639 targets the interaction between protein arginine methyltransferase 5 (PRMT5) and its substrate adaptor via the PRMT5 binding motif (PBM). PRMT5 is a type II protein arginine methyltransferase that catalyzes the symmetric dimethylation of arginine residues on histones and non-histone proteins. By competitively inhibiting the PBM interaction, BRD-0639 disrupts PRMT5-substrate interactions and inhibits PBM-dependent PRMT5 functions.
体外研究 (In Vitro)
BRD0639 是一种首创的 PBM 竞争性小分子,旨在用于研究 PBM 依赖的 PRMT5 活性,并开发特异性靶向这些功能的新型 PRMT5 抑制剂。在透化细胞和活细胞中,BRD0639 的 IC50 值分别为 7.5 μM 和 16 μM,它能有效竞争全长 PRMT5 和 RIOK1 蛋白的结合位点,同时还能与细胞靶点结合。在受 PRMT5 结合基序 (PBM) 结合位点基因修饰影响的同一类蛋白中,BRD0639 可降低 SDMA 的表达 [1]。体外实验表明,BRD0639 能抑制 PRMT5 与 PBM 之间的蛋白-肽相互作用,其 IC50 值为 13.8 μM。在透化细胞和活细胞中,BRD0639 的 IC50 值分别为 7.5 μM 和 16 μM。 BRD-0639 是一种首创的 PBM 竞争性抑制剂,支持对 PBM 依赖性 PRMT5 活性的研究。
体内研究 (In Vivo)
公开资料中关于BRD-0639的体内数据报道并不多。作为首个PRMT5-PBM相互作用抑制剂,该化合物在PRMT5参与的癌症动物模型中具有潜在的应用价值。BRD-0639可通过破坏PRMT5与底物的相互作用来抑制PRMT5依赖的致癌功能。然而,目前文献中尚未详细报道具体的体内疗效研究。
酶活实验
BRD-0639 的体外 PRMT5-PBM 相互作用分析采用纯化的 PRMT5 和 PBM 肽段。相互作用的测定采用荧光偏振或表面等离子共振等技术。IC50 值由剂量反应曲线计算得出。在透化细胞和活细胞中评估细胞活性,以确定化合物在细胞环境中的效力。
细胞实验
在癌细胞系中开展了BRD-0639的细胞活性检测。细胞用不同浓度的BRD-0639处理。采用针对对称性二甲基精氨酸(SDMA)的特异性抗体,通过Western blotting检测PRMT5依赖性甲基化。使用MTT或CellTiter-Glo等标准方法检测细胞活力和增殖。评估该化合物对PBM依赖性PRMT5功能的影响。
动物实验
BRD-0639的体内研究通常会采用异种移植小鼠肿瘤模型。该化合物将通过腹腔注射或口服途径给药。疗效将通过测量肿瘤生长抑制率来评估。然而,目前文献中尚未发表BRD-0639的具体体内研究方案。
药代性质 (ADME/PK)
BRD-0639 的药代动力学数据报道较少。该化合物的分子量为 475.95 g/mol,分子式为 C21H22ClN5O4S,CAS 编号为 2760881-74-9。作为一种小分子化合物,预计其生物利用度中等。目前尚无详细的药代动力学参数,例如半衰期和生物利用度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
BRD-0639 的毒性数据有限。作为一种研究化合物,BRD-0639 仅供研究用途,不得用于人体治疗。需要进行标准的体外细胞毒性试验和体内耐受性研究才能进行全面的毒性评估。该化合物的首创作用机制提示了一种靶向 PRMT5 的新方法。
参考文献

[1]. Discovery of a First-in-Class Inhibitor of the PRMT5-Substrate Adaptor Interaction. J Med Chem. 2021;64(15):11148-11168.

其他信息
BRD-0639(BRD0639;CAS 2760881-74-9)是一种首创的PBM竞争性抑制剂,可破坏PRMT5-RIOK1复合物。其在透化细胞中的IC50值为7.5 μM,在活细胞中的IC50值为16 μM。BRD-0639的分子式为C21H22ClN5O4S,分子量为475.95 g/mol。BRD-0639是研究PRMT5生物学的重要研究工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H22CLN5O4S
精确质量
475.11
元素分析
C, 53.00; H, 4.66; Cl, 7.45; N, 14.71; O, 13.45; S, 6.74
CAS号
2760881-74-9
相关CAS号
2760881-74-9; 2760909-27-9 (R-isomer);
PubChem CID
156621384
外观&性状
Light yellow to brown solid powder
LogP
1.9
tPSA
129
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
857
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC1=C(C=C(C=C1)NC(=O)[C@H](C)N2C(=O)C=C(C=N2)Cl)S(=O)(=O)NCCC3=CC=CC=N3
InChi Key
BXDCFRRDENJUJM-HNNXBMFYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H22ClN5O4S/c1-14-6-7-18(26-21(29)15(2)27-20(28)11-16(22)13-24-27)12-19(14)32(30,31)25-10-8-17-5-3-4-9-23-17/h3-7,9,11-13,15,25H,8,10H2,1-2H3,(H,26,29)/t15-/m0/s1
化学名
(2S)-2-(4-chloro-6-oxopyridazin-1-yl)-N-[4-methyl-3-(2-pyridin-2-ylethylsulfamoyl)phenyl]propanamide
别名
BRD0639; BRD 0639; BRD-0639;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~250 mg/mL (~525.27 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.37 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.37 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.37 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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