Biotinylated-JQ1 (Biotin-JQ1)

别名: 生物素化-JQ1(生物素-JQ1)
目录号: V34755 纯度: ≥98%
生物素化-JQ1 (Biotin-JQ1) 是 JQ1 的生物素化类似物,能够以高亲和力与 BRD4 溴结构域结合。
Biotinylated-JQ1 (Biotin-JQ1) CAS号: 1635437-52-3
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
生物素化JQ1(Biotin-JQ1)是JQ1的生物素化类似物,能以高亲和力与BRD4溴结构域结合。生物素化JQ1能抑制MM1.S多发性骨髓瘤细胞的增殖/生长,EC50值为0.4 μM。
生物素化JQ1(Biotin-JQ1)是JQ1的生物素化衍生物,JQ1是溴结构域和末端外结构域(BET)蛋白家族的已知抑制剂。它能以高亲和力特异性结合BRD2、BRD3和BRD4的溴结构域。生物素化JQ1可用作活性测定、功能研究和表观遗传学研究中结合亲和力分析的化学探针。该化合物能抑制MM1.S多发性骨髓瘤细胞的增殖,EC₅0值为0.4 microM。其生物素标签可用于下拉实验和其他基于亲和力的应用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Biotinylated-JQ1 targets the bromodomains of BET proteins, particularly BRD4, which is a key epigenetic reader that recognizes acetylated lysine residues on histones. By binding to the BRD4 bromodomain with high affinity, the compound displaces BRD4 from chromatin, thereby inhibiting the transcription of genes regulated by BRD4, including the oncogene MYC. The biotin tag does not interfere with binding and allows for the detection and purification of BRD4 and associated proteins. The compound's primary target is the BRD4 bromodomain, making it valuable for studying BET protein function.
体外研究 (In Vitro)
生物素化的 JQ1 (0.1 nM-100 μM;72 小时) 可抑制 MM1.S 细胞的生长,EC50 为 0.4 μM [1]。
体外研究表明,生物素标记的JQ1是一种高效的BRD4抑制剂,具有高亲和力。该化合物能抑制MM1.S多发性骨髓瘤细胞的增殖,EC₅0值为0.4 uM。其体外活性通过BRD4结合实验(例如AlphaScreen、TR-FRET)、细胞增殖实验和基因表达分析进行评估。生物素标签可用于下拉实验,以鉴定BRD4相互作用蛋白并研究BRD4在染色质上的占位情况。该化合物对基因表达的影响通过RNA测序或qPCR进行评估,特别是针对MYC和其他BRD4靶基因。
体内研究 (In Vivo)
生物素化JQ1的体内活性尚未得到充分表征,因为该化合物主要用作体外和离体应用的化学探针。生物素标记的潜在免疫原性和快速清除限制了该化合物的体内应用。然而,母体化合物JQ1已在包括多发性骨髓瘤在内的多种小鼠癌症模型中展现出体内疗效。生物素化JQ1可用于体内靶点结合研究或动物模型中BRD4生物学的研究,但此类应用并不常见。
酶活实验
生物素标记的JQ1的体外酶/受体结合实验包括测定其与BRD4溴结构域的结合亲和力。该实验通常采用竞争性结合模式,使用重组BRD4溴结构域蛋白和标记探针。常用的方法包括AlphaScreen、TR-FRET或荧光偏振分析。将化合物与BRD4蛋白和荧光标记的JQ1探针孵育,并测量探针的位移。EC₅0值由剂量反应曲线计算得出。生物素标签可用于链霉亲和素介导的下拉实验,以评估其与全长BRD4的结合或鉴定BRD4相互作用蛋白。
细胞实验
使用癌细胞系,特别是MM1.S多发性骨髓瘤细胞,对生物素标记的JQ1进行细胞活性检测,以评估其抗增殖作用。将细胞用不同浓度的化合物(通常为0.1 nM至100 μM)处理72小时。使用CellTiter-Glo或MTT法评估细胞活力。根据剂量反应曲线计算EC₅₀值。通过qPCR或Western blotting评估化合物对BRD4靶基因(例如MYC)表达的影响。使用链霉亲和素磁珠进行下拉实验,从细胞裂解液中捕获BRD4及其相关蛋白,然后通过Western blotting或质谱分析进行鉴定。
动物实验
由于生物素标记的JQ1主要用作体外研究工具,因此其在体内动物研究中的应用有限。体内研究通常使用母体化合物JQ1或其他BET抑制剂。生物素标记的JQ1可用于小鼠靶点结合研究,通过链霉亲和素下拉后进行Western blotting检测化合物与组织中BRD4的结合情况。然而,文献中鲜有详细的体内研究方案报道。该化合物的体内应用受限于其生物素标签,该标签可能会影响其药代动力学和生物分布。
药代性质 (ADME/PK)
由于生物素化JQ1主要用作研究工具,其药代动力学性质尚未得到充分表征。该化合物的分子量约为837 Da。生物素标签显著增加了其分子量,并可能影响其与JQ1相比的药代动力学性质。该化合物通常储存在-20℃。目前尚未报道其详细的药代动力学参数,例如半衰期、生物利用度和分布容积。该化合物在多种溶剂中的溶解度和稳定性已针对研究应用进行了表征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于生物素化JQ1主要用作研究工具而非治疗药物,因此其毒理学数据有限。该化合物不适用于人类治疗,仅供研究用途。在细胞实验中,该化合物在纳摩尔至微摩尔浓度下即可抑制细胞增殖,表明其具有较强的生物活性。预计该化合物的毒性特征与JQ1相似,后者在动物治疗剂量下已显示出良好的耐受性。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Genome-wide localization of small molecules. Nat Biotechnol. 2014 Jan;32(1):92-6.

其他信息
生物素化JQ1是JQ1的生物素化衍生物,可特异性结合BRD2/3/4溴结构域,并用作表观遗传学研究中的化学探针。它能抑制MM1.S多发性骨髓瘤细胞的增殖,EC₅₀值为0.4 μM。生物素标签可用于下拉实验和其他基于亲和力的应用。该化合物尚未获得FDA批准,也无临床适应症。其纯度高(≥99.3%),通常储存于-20℃。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C39H53CLN8O6S2
分子量
829.47
精确质量
828.321
CAS号
1635437-52-3
PubChem CID
162679326
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.4
tPSA
224
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
22
重原子数目
56
分子复杂度/Complexity
1320
定义原子立体中心数目
4
SMILES
N12C(C)=NN=C1[C@H](CC(NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)CCCC[C@H]1[C@@]3([H])NC(=O)N[C@@]3([H])CS1)=O)N=C(C1=CC=C(Cl)C=C1)C1C(C)=C(C)SC=12
InChi Key
HLZRRKIVMLXYEU-MSMWPWNWSA-N
InChi Code
InChI=1S/C39H53ClN8O6S2/c1-24-25(2)56-38-34(24)35(27-10-12-28(40)13-11-27)43-29(37-47-46-26(3)48(37)38)22-33(50)42-15-7-17-53-19-21-54-20-18-52-16-6-14-41-32(49)9-5-4-8-31-36-30(23-55-31)44-39(51)45-36/h10-13,29-31,36H,4-9,14-23H2,1-3H3,(H,41,49)(H,42,50)(H2,44,45,51)/t29-,30-,31-,36-/m0/s1
化学名
5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[3-[2-[2-[3-[[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.02,6]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]acetyl]amino]propoxy]ethoxy]ethoxy]propyl]pentanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 180 mg/mL (217.01 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 4.5 mg/mL (5.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 45.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 4.5 mg/mL (5.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 45.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 4.5 mg/mL (5.43 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 45.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2056 mL 6.0279 mL 12.0559 mL
5 mM 0.2411 mL 1.2056 mL 2.4112 mL
10 mM 0.1206 mL 0.6028 mL 1.2056 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们