DD-03-156 ((S,R,S)-AHPC-Me-PEG2-dabrafenib)

别名: DD-03-156; 2769753-69-5; DD 03-156;

目录号: V53108 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

DD-03-156 是 CDK17 和 LIMK2 的有效且特异性的降解剂。

DD-03-156 ((S,R,S)-AHPC-Me-PEG2-dabrafenib) CAS号: 2769753-69-5
产品类别: CDK

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

DD-03-156 是 CDK17 和 LIMK2 的有效且特异性的降解剂。 DD-03-156 的选择性和效力非常好，为开发降解 CDK17 的化学探针提供了先进的起点。 DD-03-156 是 CDK17 和 LIMK2 的有效且特异性的降解剂。 DD-03-156 的选择性和效力非常好，为开发降解 CDK17 的化学探针提供了先进的起点。

生物活性&实验参考方法

靶点	CDK17;LIMK2; VHL; PROTAC degrader
体外研究 (In Vitro)	在这里，我们发现了至少一种Lead降解分子DD-03-156，它能诱导CDK17和LIMK2的有效和选择性降解（图1J）[1]。
细胞实验	细胞CRBN和VHL参与的竞争性置换分析[1] 在化合物处理前一天，将用mCherry报告基因稳定表达BRD4BD2-GFP的HEK293T细胞以30-50%的融合率接种在384孔板中，每孔含有10%FBS的50μL FluoroBrite DMEM培养基。使用D300e数字分配器（HP）分配降解剂滴定和100 nM dBET6或250 nM AT1，标准化为0.5%DMSO，并与细胞孵育5小时。如上所述，使用Acumen对测定板进行成像。实验进行了三次，使用非线性拟合变斜率模型计算了导致BRD4BD2 eGFP累积（EC50）增加50%的浓度值 CellTiter肾小球活力测定[1] 将MM1.S以每孔10000个细胞的速度接种在96孔微孔板中，在补充有10%FBS的RPMI-1640培养基中，并与化合物一起孵育（最终DMSO浓度为0.1%）。根据制造商的方案，在添加药物后72小时使用CellTiter Glo（Promega）测量相对细胞存活率。每项分析均以生物三份进行。 KiNativ活细胞分析方案[1] CRBN−/−MOLT-4细胞被置于15 cm的新鲜培养基（RPMI-1640+10%FBS）中，并用候选化合物处理5小时。为了收获细胞，使用CellStripper分离溶液通过分离收获平板，用冷PBS洗涤两次，然后离心并在液氮中快速冷冻细胞颗粒。KiNativ分析实验的其余部分由ActivX Biosciences进行
参考文献	[1]. Mapping the Degradable Kinome Provides a Resource for Expedited Degrader Development. Cell. 2020;183(6):1714-1731.e10.
其他信息	靶向蛋白降解 (TPD) 是指利用小分子诱导泛素依赖性蛋白降解。TPD 在药物研发中具有重要意义，因为它能够靶向以往难以触及的靶点。然而，由于对诱导靶点降解所需的关键分子事件的相对重要性缺乏了解，降解剂的发现和优化仍然效率低下。本文中，我们利用化学蛋白质组学对可降解激酶组进行注释。我们构建的庞大数据集为约 200 种激酶提供了化学先导化合物，并证明目前从活性最高的结合剂入手进行筛选的方法并非发现活性化合物的有效途径。我们开发了多靶点降解剂，以解答关于泛素-蛋白酶体系统的基本问题，并揭示了激酶降解依赖于 p97。这项工作不仅将推动激酶降解剂的发现，还将为评估整个基因家族的靶向降解提供蓝图，从而加速对激酶组之外的 TPD 的理解。 [1] 技术进步往往促进了新的生物学发现（Botstein，2010）。我们证明，该数据库可以作为研究泛素-蛋白酶体系统（UPS）基础生物学的丰富小分子工具来源，通过探究AAA⁺-ATPase p97的作用来实现这一目标。我们的观察表明，大部分可降解激酶的加工依赖于p97，并且这种依赖性与所募集的E3连接酶（CRBN、VHL和IAP）无关。尽管关于p97在促进激酶蛋白酶体降解中的作用仍有许多未知之处，但本研究展示了如何利用我们收集的多靶点降解剂来揭示UPS扰动对不同基因家族蛋白质降解的影响。我们方法的局限性在于，它仅能提供基于已报道的激酶结合剂、常用连接子和E3泛素连接酶募集配体开发的降解剂的TPD信息，而要生成所有可能的变体是不现实的。此外，这些降解剂是在永生化癌细胞系的生物学环境中进行测试的。研究发现，所有这些变量都会显著影响特定靶标的降解，因此，如果将研究范围扩展到本研究之外，很可能会有更多发现。因此，我们设想将可降解激酶组数据库视为一个动态资源，随着新结果的出现而不断扩充。我们预期，这个庞大的数据集不仅能够加速开发针对整个激酶组的降解剂化学探针和具有临床意义的先导化合物，还能促进基于信息学和分子建模的方法的发展，从而提高降解活性的预测能力，并促进这些双功能实体的合理设计。[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C53H62F3N9O8S3
分子量	1106.30509901047
精确质量	1105.38355
CAS号	2769753-69-5
PubChem CID	163196237
外观&性状	White to off-white solid powder
LogP	7.6
tPSA	292 Å²
氢键供体(HBD)数目	5
氢键受体(HBA)数目	19
可旋转键数目(RBC)	23
重原子数目	76
分子复杂度/Complexity	1990
定义原子立体中心数目	4
SMILES	S1C=NC(C)=C1C1C=CC(=CC=1)[C@H](C)NC([C@@H]1C[C@H](CN1C([C@H](C(C)(C)C)NC(CCOCCOCCNC1=NC=CC(C2=C(C3C=CC=C(C=3F)NS(C3C(=CC=CC=3F)F)(=O)=O)N=C(C(C)(C)C)S2)=N1)=O)=O)O)=O
InChi Key	BMLDGVCSNFURAJ-QUQZIOAQSA-N
InChi Code	InChI=1S/C53H62F3N9O8S3/c1-30(32-15-17-33(18-16-32)44-31(2)59-29-74-44)60-48(68)40-27-34(66)28-65(40)49(69)47(52(3,4)5)62-41(67)20-23-72-25-26-73-24-22-58-51-57-21-19-39(61-51)45-43(63-50(75-45)53(6,7)8)35-11-9-14-38(42(35)56)64-76(70,71)46-36(54)12-10-13-37(46)55/h9-19,21,29-30,34,40,47,64,66H,20,22-28H2,1-8H3,(H,60,68)(H,62,67)(H,57,58,61)/t30-,34+,40-,47+/m0/s1
化学名	(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[2-[2-[[4-[2-tert-butyl-4-[3-[(2,6-difluorophenyl)sulfonylamino]-2-fluorophenyl]-1,3-thiazol-5-yl]pyrimidin-2-yl]amino]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]pyrrolidine-2-carboxamide
别名	DD-03-156; 2769753-69-5; DD 03-156;
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意：请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : 200 mg/mL (180.78 mM) H2O : < 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (4.52 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 5 mg/mL (4.52 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (4.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : 200 mg/mL (180.78 mM)
H2O : < 0.1 mg/mL

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (4.52 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 5 mg/mL (4.52 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (4.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	0.9039 mL	4.5195 mL	9.0391 mL
	5 mM	0.1808 mL	0.9039 mL	1.8078 mL
	10 mM	0.0904 mL	0.4520 mL	0.9039 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。