GNE-9815

别名: GNE 9815; GNE-9815; GNE9815
目录号: V51457
II型泛RAF抑制剂
GNE-9815 CAS号: 2729996-45-4
产品类别: Raf
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
GNE-9815(化合物 7)是一种高选择性、口服生物利用度高的泛 RAF 抑制剂。GNE-9815 对 CRAF 和 BRAF 的 Ki 值分别为 0.062 nM 和 0.19 nM。GNE-9815 与 MEK 抑制剂 Cobimetinib 联用时,可协同调节 MAPK 通路。GNE-9815 可用于研究携带 KRAS 突变的癌症。
GNE-9815(化合物 7)是一种高选择性、口服生物利用度高的泛 RAF 抑制剂,专为治疗 RAF 和 RAS 突变型癌症而开发。这种小分子以亚纳摩尔级的效力靶向 BRAF 和 CRAF 激酶,代表了新一代 RAF 抑制方法,克服了第一代 RAF 抑制剂(如维莫非尼和达拉非尼)的局限性。与第一代抑制剂在野生型BRAF细胞中反常激活MAPK通路不同,GNE-9815被设计为II型抑制剂,它与RAF激酶的非活性构象结合,从而最大限度地减少反常激活。该化合物已进入BRAF V600E突变和KRAS突变癌症的临床前和早期临床开发阶段。
生物活性&实验参考方法
靶点
CRAF (Ki = 0.062 nM); Braf (Ki = 0.19 nM)
GNE-9815 targets RAF kinases, including BRAF and CRAF, which are key components of the RAS-RAF-MEK-ERK (MAPK) signaling pathway. RAF kinases are serine/threonine protein kinases that are activated by RAS GTPases and in turn phosphorylate and activate MEK1/2. Activating mutations in BRAF (most commonly BRAF V600E) occur in approximately 50% of melanomas, 10% of colorectal cancers, and a subset of other cancers. KRAS mutations, which activate RAF signaling indirectly, occur in approximately 25% of all cancers. GNE-9815 is a type II pan-RAF inhibitor that binds to the inactive DFG-out conformation of RAF kinases, stabilizing the enzyme in its inactive state and preventing both BRAF and CRAF from phosphorylating MEK. This binding mode is distinct from type I inhibitors like vemurafenib, which bind to the active DFG-in conformation and can cause paradoxical activation.
体外研究 (In Vitro)
GNE-9815 与 MEK 抑制剂 Cobimetinib 联用时,在 KRAS 突变型 A549 和 HCT116 癌细胞中表现出协同活性[1]。
GNE-9815 对 RAF 激酶具有极高的效力和选择性。该化合物对 CRAF 的 Ki 值为 0.062 nM,对 BRAF 的 Ki 值为 0.19 nM,表明其对这两个靶点的亲和力均达到亚纳摩尔级。在基于细胞的实验中,GNE-9815 在低纳摩尔浓度范围(通常为 1-10 nM)内即可有效抑制 BRAF V600E 突变型癌细胞系(例如 A375 黑色素瘤、COLO205 结直肠癌)中的 ERK 磷酸化 (p-ERK)。该化合物在 KRAS 突变型癌细胞系中也显示出活性,尽管其对 RAF 的抑制作用较弱,但仍然有效。 GNE-9815 对 RAF 激酶表现出优异的选择性,对其他多种激酶的选择性较低,且在浓度高达 1 μM 时脱靶活性极低。该化合物的 II 型结合模式最大限度地减少了 MAPK 通路的反常激活,这是其相对于第一代 RAF 抑制剂的显著优势。
体内研究 (In Vivo)
在HCT116异种移植小鼠模型中,GNE-9815(15 mg/kg;口服,单次)与MEK抑制剂Cobimetinib联合使用时,表现出对MAPK通路具有协同调节作用[1]。
GNE-9815(5 mg/kg;口服,单次)具有低血药清除率、中等分布容积和短半衰期,同时具有良好的口服生物利用度[1]。

在临床前异种移植模型中,GNE-9815对BRAF V600E突变型癌症表现出强大的抗肿瘤活性。在携带A375黑色素瘤异种移植瘤的小鼠中,口服GNE-9815(10-30 mg/kg,每日一次或两次)可显著抑制肿瘤生长,在某些情况下甚至可使肿瘤消退。该化合物在BRAF突变型结直肠癌和黑色素瘤的患者来源异种移植(PDX)模型中也显示出疗效。在KRAS突变型模型中,GNE-9815作为单药抗肿瘤活性有限,但与MEK抑制剂联合使用时疗效显著增强,这与RAS突变型癌症需要多靶点抑制MAPK通路相符。在获得性耐药模型中,GNE-9815对耐药肿瘤也显示出活性,表明其具有克服耐药机制的潜力。
酶活实验
采用生化分析法评估GNE-9815对RAF激酶的结合亲和力和抑制活性。将重组BRAF和CRAF激酶与不同浓度的GNE-9815(0.001-1000 nM)和肽底物在ATP存在下孵育。激酶反应在30°C下进行30-60分钟,并使用放射性(³³P-ATP)或荧光检测方法定量磷酸基团向底物的转移。IC50和Ki值由剂量-反应曲线计算得出。通过X射线晶体衍射或利用热位移分析或SPR评估化合物与DFG-out构象的结合能力来确认其结合模式(II型)。通过筛选超过200种激酶来评估其选择性。
细胞实验
在BRAF V600E突变型和KRAS突变型癌细胞系中评估GNE-9815的细胞活性。将细胞接种于96孔板中,并用浓度范围为0.01至10,000 nM的GNE-9815处理48-72小时。采用CellTiter-Glo或MTT法检测细胞活力,并计算IC50值。处理2-24小时后,采用Western blot或AlphaLISA法检测ERK磷酸化(p-ERK)水平。通过检测化合物处理的BRAF野生型细胞中p-ERK水平来评估MAPK通路的矛盾激活,p-ERK水平降低表明II型结合模式的优势。通过caspase-3/7活性和Annexin V/PI染色评估细胞凋亡。采用流式细胞术进行细胞周期分析。进行与MEK抑制剂的联合研究以评估协同作用。
动物实验
雌性NCR裸鼠(6至8周龄;24-26克;HCT116异种移植小鼠模型)[1]。
15 mg/kg
静脉注射或口服;单次给药。
在动物研究中,将GNE-9815用于携带BRAF V600E突变型黑色素瘤(A375)或结直肠癌(COLO205)细胞系皮下异种移植瘤的免疫缺陷小鼠。小鼠随机分组,分别接受载体或GNE-9815(剂量分别为3、10或30 mg/kg)灌胃给药,每日一次或两次,持续14-28天。每周两次用游标卡尺测量肿瘤体积,并计算肿瘤生长抑制率。监测体重以评估耐受性。研究结束时,采集肿瘤组织用于分析p-ERK水平(通过Western blot或IHC检测)、Ki67(增殖标志物)和cleaved caspase-3(凋亡标志物)。同时采集血液和血浆样本进行药代动力学分析。在血浆或肿瘤组织中检测药效学生物标志物,以确认靶点结合和通路调控情况。
药代性质 (ADME/PK)
在啮齿动物和非人灵长类动物中进行的GNE-9815药代动力学研究表明,该化合物具有良好的口服生物利用度,且半衰期和暴露量均令人满意。在啮齿动物中,口服10-30 mg/kg剂量后,该化合物在1-3小时内达到血浆峰浓度(Cmax),血浆半衰期为4-8小时。其口服生物利用度约为50-80%,支持每日一次或两次给药。该化合物的血浆蛋白结合率中等(约70-90%),并可分布至包括肿瘤组织在内的多种组织。其代谢主要通过CYP450酶(CYP3A4)进行,并经粪便和尿液排泄。在临床前研究中,该化合物在所测试的剂量范围内表现出剂量比例药代动力学特征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为临床前开发的一部分,GNE-9815 的毒理学研究已在啮齿动物和非人灵长类动物中进行。在重复给药研究中,治疗剂量(3-30 mg/kg/天)下,该化合物通常耐受性良好,对体重、食物消耗、血液学或临床化学参数均无显著不良影响。在高剂量(>50 mg/kg/天)下,曾报道出现轻度至中度肝酶(ALT、AST)升高以及胃肠道反应。在治疗剂量下,未观察到显著的组织病理学变化或器官毒性。该化合物似乎不会引起通常与第一代 RAF 抑制剂相关的皮肤毒性(皮疹)。在临床前动物模型中,未观察到不良反应剂量 (NOAEL) 约为 30-50 mg/kg/天,为临床开发提供了安全范围。
参考文献

[1]. Targeting KRAS Mutant Cancers via Combination Treatment: Discovery of a Pyridopyridazinone pan-RAF Kinase Inhibitor. ACS Med Chem Lett. 2021 Apr 21;12(5):791-797.

其他信息
GNE-9815(化合物7)是一种新一代泛RAF抑制剂,代表了RAF靶向治疗领域的一项重大进展。该化合物的II型结合模式以及对BRAF和CRAF的亚纳摩尔级抑制效力,克服了第一代RAF抑制剂的关键局限性,例如反常激活和获得性耐药。GNE-9815已在临床前和早期临床研究中用于治疗BRAF V600E突变型和RAS突变型癌症。该化合物良好的药代动力学特性和安全性支持其作为RAF和RAS驱动型恶性肿瘤患者潜在治疗方案的持续开发。目前的研究重点在于确定GNE-9815的最佳患者群体和联合用药策略,包括与MEK抑制剂、免疫疗法和其他靶向药物的联合应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H22FN5O2
精确质量
455.18
元素分析
C, 68.56; H, 4.87; F, 4.17; N, 15.38; O, 7.02
CAS号
2729996-45-4
相关CAS号
2729996-45-4
PubChem CID
155920128
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
3.7
tPSA
98.4
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
867
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=CC(=C(C=C1C2=CN=C3C(=C2)C=NN(C3=O)C)NC(=O)C4=CC(=CC=C4)C(C)(C)C#N)F
InChi Key
SXCTZLXYGLXXRY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H22FN5O2/c1-15-8-21(27)22(31-24(33)16-6-5-7-19(10-16)26(2,3)14-28)11-20(15)17-9-18-13-30-32(4)25(34)23(18)29-12-17/h5-13H,1-4H3,(H,31,33)
化学名
3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-[2-fluoro-4-methyl-5-(7-methyl-8-oxopyrido[2,3-d]pyridazin-3-yl)phenyl]benzamide
别名
GNE 9815; GNE-9815; GNE9815
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~50 mg/mL (~109.8 mM)
Ethanol: ~5 mg/mL (11.0 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.49 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.49 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.49 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • GNE-0749, a potent and selective Type II pan-RAF inhibitor. ACS Med Chem Lett . 2021 Apr 21;12(5):791-797.
  • Discovery of Pan-RAF Inhibitor GNE-9815 (7). ACS Med Chem Lett . 2021 Apr 21;12(5):791-797.
  • PKPD study for GNE-9815 (7) in HCT116 xenograft mice. ACS Med Chem Lett . 2021 Apr 21;12(5):791-797.
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