GSK 690 Hydrochloride

别名: GSK 690 (Hydrochloride); 2436760-79-9; EX-A8792;
目录号: V52030 纯度: ≥98%
GSK 690 (HCl) 是赖氨酸特异性脱甲基酶 1 (LSD1) 的可逆抑制剂,Kd 为 9 nM,IC50 为 37 nM。
GSK 690 Hydrochloride CAS号: 2436760-79-9
产品类别: Histone Demethylase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
1mg
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50mg
100mg
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产品描述
GSK 690 (HCl) 是赖氨酸特异性脱甲基酶 1 (LSD1) 的可逆抑制剂,Kd 为 9 nM,IC50 为 37 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
KDM1/LSD1
体外研究 (In Vitro)
在所有四种研究的 RMS 细胞系(RD、RH30、RMS13 和 TE381.T 细胞)中,GSK690 (1-10 μM) 和 JNJ-26481585 协同作用导致细胞死亡[2]。 GSK690/JNJ-26481585 共处理改变了促凋亡和抗凋亡蛋白平衡,其中 RD 细胞使用 1 μM GSK690,RH30 细胞使用 10 μM GSK690[2]。 GSK690/JNJ-26481585 共处理会导致浓度为 10 μM 的 RH30 细胞和浓度为 1 μM 的 RD 细胞发生 caspase 依赖性细胞死亡 [2]。添加 GSK690 可以进一步增强 JNJ-26481585 诱导的 G2/M 期阻滞 [2]。
酶活实验
LSD1酶活性测定[1]
在康宁384孔低凸缘白色平底聚苯乙烯(编号3574)微孔板中,在10μL的反应体积中进行了检测,该反应体积由50 mM TrisHCl、50 mM NaCl、1 mM DTT、0.01%吐温-20和1%DMSO组成,在10点、3倍稀释系列中有或没有化合物,0.2μM组蛋白H3(1-21)K4(Me1)生物素肽底物和1 nM LSD1。在25°C下使反应进行30分钟,然后在LANCE检测缓冲液中加入0.3 mM反苯环丙胺停止反应,并通过加入1 nM铕-α-未修饰的H3K4抗体和25 nM ULight链霉抗生物素来定量去甲基化肽的水平,也在LANCE检测缓冲液中。在另外60分钟的潜伏期后,在PHERAstar FS平板阅读器上读取TR-FRET信号,激发波长为340 nm,发射波长为665 nm。
SPR结合试验[1] 使用Biacore T200、S200和S51仪器通过SPR评估化合物与LSD1之间的直接结合。使用胺偶联将LSD1固定到CM5或CM7芯片上。在15°C下,在10 mM HEPES、pH 7.4、150 mM NaCl、1%DMSO、0.05%吐温中以30 mL/min的流速进行相互作用实验。化合物在缓冲液中稀释,并在制备的表面上以递增的浓度注射15-25秒。通过减去未经处理的参考通道的信号和空白注射的反应,对传感器图进行双重参考。使用T200评估软件3.0,通过稳态响应的剂量响应分析或整个传感图的回归分析(1:1相互作用模型,包括质量传输限制项)得出亲和力。
细胞实验
转导[2]
对于BCL-2的过表达,如前所述,使用磷酸钙转染法用20μg含有小鼠BCL-2(mBCL-2)或EV的小鼠干细胞病毒(pMSCV)载体转染Phoenix包装细胞。39通过慢病毒转导产生稳定的细胞系,并用10μg/ml Blasticidin进行筛选。对于MCL-1过表达,使用Lipofectamine 2000,用20μg的pCMV-Tag3B质粒转染细胞,该质粒由Genentech股份有限公司提供,含有EV、野生型MCL-1(WT)或磷酸化突变MCL-1。
RNA干扰[2]
对于siRNA的瞬时敲除,使用Lipofectamine RNAiMAX试剂和OptiMEM用10 nM(BMF、BIM、NOXA)和20 nM(BAK)SilencerSelect siRNA反向转染细胞。使用了以下siRNA构建体:对照siRNA(4390842)和靶向siRNA(BMF的s40385和s40387,BIM的s195012和s223065,NOXA的s10708和s10709,BAK的s1880和s1881)。
蛋白质印迹分析[2]
如前所述,使用以下抗体进行蛋白质印迹分析:小鼠抗NOXA、大鼠抗BMF、兔抗MCL-1、小鼠抗BCL-2、兔抗BAK、兔抗半胱氨酸蛋白酶-3、兔抗丝氨酸蛋白酶-9、兔抗BIM、小鼠抗PARP、兔抗PUMA、兔抗BCL-xL、小鼠抗GAPDH、兔抗H3K4me2、兔防乙酰化组蛋白H3和小鼠抗组蛋白H3或小鼠抗β-Actin。使用与辣根过氧化物酶结合的山羊抗小鼠、山羊抗兔和山羊抗大鼠IgG以及增强化学发光或红外染料标记的二抗和红外成像进行检测。为了检测组蛋白修饰,使用补充有皮尔斯核酸酶的RIPA缓冲液裂解细胞。显示了至少两个独立实验的代表性印迹。
定量实时PCR[2]
根据制造商的说明,使用peqGOLD总RNA试剂盒分离总RNA。对于cDNA合成,根据制造商的方案,使用随机引物,使用RevertAid H减第一链cDNA合成试剂盒,使用1μg总RNA合成相应的cDNA。为了定量基因表达水平,使用7900GR快速实时PCR系统进行了基于SYBR绿色的定量实时PCR。以28S rRNA表达作为参考对数据进行标准化。熔解曲线分析可作为扩增产物特异性的对照。通过使用ΔΔct方法计算靶转录物与参考转录物的相对表达水平。每个基因至少进行了三次独立的重复实验。
参考文献

[1]. Development of (4-Cyanophenyl)glycine Derivatives as Reversible Inhibitors of Lysine Specific Demethylase 1. J Med Chem. 2017 Oct 12;60(19):7984-7999.

[2]. Concomitant epigenetic targeting of LSD1 and HDAC synergistically induces mitochondrial apoptosis in rhabdomyosarcoma cells. Cell Death Dis. 2017 Jun 15;8(6):e2879.

其他信息
赖氨酸特异性去甲基化酶1 (LSD1) 的抑制已被证实能够诱导急性髓系白血病 (AML) 中白血病干细胞的分化。由非特异性抑制剂反苯环丙胺开发的不可逆抑制剂已进入临床试验;然而,开发有效的可逆抑制剂则更具挑战性。本文中,我们描述了我们通过高通量筛选和后续的计算机模拟方法鉴定LSD1可逆抑制剂的努力。我们从一个经生化和生物物理实验验证的先导化合物 (12) 出发,描述了我们如何从GSK-690 (1) 出发开发非环状骨架跃迁。进一步将骨架修饰为(4-氰基苯基)甘氨酰胺(例如,29a)后,我们开发了化合物32,其在替代细胞生物标志物检测中的Kd值为32 nM,EC50值为0.67 μM。此外,该衍生物不像化合物 1 那样表现出对 hERG 的敏感性,因此有望成为进一步开发的先导化合物。[1]
赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 在包括横纹肌肉瘤 (RMS) 在内的多种癌症中过表达。然而,LSD1 是否可作为 RMS 的治疗靶点尚不清楚。因此,我们研究了 LSD1 抑制剂单独使用或与其他表观遗传修饰剂(例如组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂)联合使用的潜在疗效。我们发现 LSD1 抑制剂(例如 GSK690、Ex917)和 HDAC 抑制剂(例如 JNJ-26481585、SAHA)具有协同作用,可诱导 RMS 细胞死亡。相比之下,LSD1 抑制剂作为单一药物对 RMS 细胞的细胞毒性很低。从机制上讲,GSK690 与 JNJ-26481585 协同作用,上调促凋亡蛋白 BH3 结构域蛋白 BMF、PUMA、BIM 和 NOXA 的 mRNA 水平。这种 mRNA 水平的升高伴随着 BMF、PUMA、BIM 和 NOXA 蛋白水平的相应上调。重要的是,单独敲低 BMF、BIM 或 NOXA 均能显著降低 GSK690/JNJ-26481585 介导的细胞死亡。同样,BAK 基因沉默也能显著挽救 GSK690/JNJ-26481585 联合处理引起的细胞死亡。此外,抗凋亡蛋白 BCL-2 或 MCL-1 的过表达也能显著保护 RMS 细胞免受 GSK690/JNJ-26481585 诱导的细胞死亡。此外,GSK690 与 JNJ-26481585 协同作用,增强 caspase-9 和 -3 的激活。与此一致的是,添加泛 caspase 抑制剂 N-苄氧羰基-Val-Ala-Asp-氟甲基酮 (zVAD.fmk) 可显著降低 GSK690/JNJ-26481585 介导的细胞死亡。总之,LSD1 和 HDAC 的联合抑制可通过改变促凋亡和抗凋亡 BCL-2 蛋白的比例,使其向凋亡方向倾斜,从而协同诱导 RMS 细胞死亡,进而激活内源性凋亡途径。这表明 LSD1 和 HDAC 抑制剂的联合治疗是 RMS 的一种有前景的新疗法。[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H24CLN3O
分子量
405.919864654541
精确质量
405.16
CAS号
2436760-79-9
相关CAS号
GSK 690;2101305-84-2
PubChem CID
135397147
外观&性状
Typically exists as Light yellow to yellow solids at room temperature
tPSA
57.9Ų
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
527
定义原子立体中心数目
1
SMILES
Cl.O(C1C=NC(C2C=CC(C)=CC=2)=C(C2C=CC(C#N)=CC=2)C=1)C[C@H]1CNCC1
InChi Key
DBTSJYXXWZFXNJ-FSRHSHDFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H23N3O.ClH/c1-17-2-6-21(7-3-17)24-23(20-8-4-18(13-25)5-9-20)12-22(15-27-24)28-16-19-10-11-26-14-19;/h2-9,12,15,19,26H,10-11,14,16H2,1H3;1H/t19-;/m1./s1
化学名
4-[2-(4-methylphenyl)-5-[[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methoxy]pyridin-3-yl]benzonitrile;hydrochloride
别名
GSK 690 (Hydrochloride); 2436760-79-9; EX-A8792;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 125 mg/mL (307.94 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.12 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.12 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.12 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4635 mL 12.3177 mL 24.6354 mL
5 mM 0.4927 mL 2.4635 mL 4.9271 mL
10 mM 0.2464 mL 1.2318 mL 2.4635 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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