KB02-SLF

别名: KB02-SLF; 2384184-40-9; [(1R)-1-[3-[3-[2-[2-[[2-[[1-(2-chloroacetyl)-3,4-dihydro-2H-quinolin-6-yl]oxy]acetyl]amino]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate; SCHEMBL22111181; KB02SLF

目录号: V51907 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

KB02-SLF是一种基于PROTAC的核FKBP12降解剂（分子胶）。

KB02-SLF CAS号: 2384184-40-9
产品类别: Apoptosis

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

规格	价格
1mg
5mg
10mg
50mg
Other Sizes

大包装询价

020-31522723 sales@invivochem.cn

Other Forms of KB02-SLF:

KB02-COOH

点击了解更多

InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
相关产品

产品描述

KB02-SLF是一种基于PROTAC的核FKBP12降解剂（分子胶）。 KB02-SLF通过共价修饰DCAF16（E3连接酶）促进FKBP12降解，并可以提高生物系统中蛋白质降解的持久性。 KB02-SLF由SLF和泛素E3连接酶配体(KB02)通过连接子连接而成。

生物活性&实验参考方法

靶点	FKBP12; DCAF16 (E3 ligase)
体外研究 (In Vitro)	使用 KB02-SLF（2 µM；4-72 小时；HEK293T 细胞）处理可显着降低核 FKBP12，并且这种效果可持续完整的 4-72 小时[1]。细胞成像实验证实了 KB02-SLF 处理的细胞中核定位 FKBP12 的选择性丢失。在大约 0.5–5μM 的浓度范围内，KB02-SLF 会促进 FKBP12_NLS 的损失，但在较高浓度下，它会表现出不同程度的活性下降。 DCAF16 调解 KB02-SLF[1] 引起的 FKBP12_NLS 降级。
酶活实验	FLAG-FKBP12_NLS相互作用蛋白的鉴定[1] 稳定表达FLAG-FKBP12_NLS的HEK293T轻、重SILAC细胞在10µM MG132存在下，分别用DMSO和KB02-SLF（2或10µM）处理2 h。收集重细胞和轻细胞，在1% NP-40裂解缓冲液中裂解，并加入完整的蛋白酶抑制剂鸡尾酒。用2 mg总蛋白裂解物进行FLAG免疫沉淀（每个样品20µL浆液），从轻、重细胞裂解物中富集FLAG- fkbp12_nls。用IP洗涤缓冲液洗涤FLAG树脂四次后，将轻质和重质样品中的FLAG树脂混合，用PBS洗涤一次。FLAG-FKBP12_NLS及其关联的蛋白质被加热在65ºC筛选了与8 M尿素PBS 10分钟,然后用12.5毫米减少德勤在65ºC 15分钟和烷基化25毫米碘乙酰胺在37ºC 30分钟。蛋白质的解决方案与PBS稀释2 M尿素和2µg胰蛋白酶消化在37ºC 6 h。胰蛋白酶的肽和5%甲酸酸化和加载到石英毛细管柱(250µM)挤满了3厘米C18树脂。采用LTQ-Orbitrap Elite质谱联用Thermo UltiMate 3000 UHPLC系统对多肽进行分析。肽在毛细管柱上分离，毛细管柱上填充了3cm的强阳离子交换（SCX）树脂，10cm的C18树脂和5µm的尖端。采用五步MudPIT法和CIMAGE软件分析肽，如前所述51。为了生成图3d和补充图5c中的图，应用了以下质量过滤器：(1)蛋白质必须至少有两个定量肽；(2)在对照SILAC中必须缺乏蛋白质（在10µM MG132存在下，分别用DMSO或10µM KB02-SLF处理稳定表达pCDH空载体的轻、重氨基酸标记的HEK293T细胞2 h）。(3)蛋白质必须在至少两次重复中定量；(4) 3个重复的重/轻比变异系数< 0.5。 <人力资源> isoTOP-ABPP [1] < br > HEK293T细胞用DMSO或10µM KB02-SLF处理2小时。收集细胞，使用与前面描述的相同的方法进行isoTOP-ABPP样品制备。 <人力资源> 偏远的污点[1]< br > 用PEI转染试剂将HA-DCAF16质粒转染HEK293T细胞24 h，用DMSO或KB02-SLF（5µM）处理2 h。收集细胞，用完全蛋白酶抑制剂鸡尾酒在1% NP-40裂解缓冲液中裂解。HA免疫沉淀（20µL浆液抗HA琼脂糖，4°C, 2 h），总蛋白裂解物2 mg，纯化HA- dcaf16。用IP洗涤缓冲液洗涤HA树脂四次后，HA亲和凝胶在2X Laemmli样品缓冲液中95℃加热10 min，洗脱HA- dcaf16蛋白。蛋白质用14% Novex Tris-Glycine迷你凝胶溶解，并转移到PVDF膜上。将重组his标记的FKBP12蛋白用新鲜的5% BSA在TBST缓冲液中稀释（终浓度：2µg/mL），在4°C下孵育过夜（14 h），用TBST缓冲液洗涤3次，用抗his - hrp抗体（5% BSA在TBST中稀释1:1000）室温孵育4 h，用TBST缓冲液洗涤3次。用cl - exposure薄膜在ECL + western blotting检测试剂显影后，记录膜内化学发光信号。同样的蛋白样品用另一种14%的Novex Tris-Glycine迷你凝胶溶解，平行进行抗ha Western blot分析。
细胞实验	蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： HEK293T 细胞测试浓度： 2 µM 孵育时间： 4 hrs（小时）、8 hrs（小时）、24 hrs（小时）、48 hrs（小时）、72 hrs（小时）实验结果：促进核 FKBP12 的大幅减少持续4-72小时的时间范围。
参考文献	[1]. Electrophilic PROTACs that degrade nuclear proteins by engaging DCAF16. Nat Chem Biol. 2019 Jul;15(7):737-746.
其他信息	Ligand-dependent protein degradation has emerged as a compelling strategy to pharmacologically control the protein content of cells. So far, however, only a limited number of E3 ligases have been found to support this process. Here, we use a chemical proteomic strategy that leverages broadly reactive, cysteine-directed electrophilic fragments coupled to selective ligands for intracellular proteins (for example, SLF for FKBP12, JQ1 for BRD4) to screen for heterobifunctional degrader compounds (or proteolysis targeting chimeras, PROTACs) that operate by covalent adduction of E3 ligases. This approach identified DCAF16-a poorly characterized substrate recognition component of CUL4-DDB1 E3 ubiquitin ligases-as a target of electrophilic PROTACs that promote the nuclear-restricted degradation of proteins. We find that only a modest fraction (~10-40%) of DCAF16 needs to be modified to support protein degradation, pointing to the potential for electrophilic PROTACs to induce neosubstrate degradation without substantially perturbing the function of the participating E3 ligase.[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C50H65CLN4O12
分子量	949.523713827133
精确质量	948.428
元素分析	C, 63.25; H, 6.90; Cl, 3.73; N, 5.90; O, 20.22
CAS号	2384184-40-9
相关CAS号	KB02-COOH;2375196-30-6
PubChem CID	137347727
外观&性状	White to yellow solid powder
LogP	6.1
tPSA	188
氢键供体(HBD)数目	2
氢键受体(HBA)数目	12
可旋转键数目(RBC)	26
重原子数目	67
分子复杂度/Complexity	1600
定义原子立体中心数目	2
SMILES	ClCC(N1C2C=CC(=CC=2CCC1)OCC(NCCOCCOCCC(NC1=CC=CC(=C1)[C@@H](CCC1C=CC(=C(C=1)OC)OC)OC([C@@H]1CCCCN1C(C(C(C)(C)CC)=O)=O)=O)=O)=O)=O
InChi Key	OKJBKEQXKMMRPL-WVILEFPPSA-N
InChi Code	InChI=1S/C50H65ClN4O12/c1-6-50(2,3)47(59)48(60)55-23-8-7-14-40(55)49(61)67-41(19-15-34-16-20-42(62-4)43(29-34)63-5)36-11-9-13-37(30-36)53-44(56)21-25-64-27-28-65-26-22-52-45(57)33-66-38-17-18-39-35(31-38)12-10-24-54(39)46(58)32-51/h9,11,13,16-18,20,29-31,40-41H,6-8,10,12,14-15,19,21-28,32-33H2,1-5H3,(H,52,57)(H,53,56)/t40-,41+/m0/s1
化学名	[(1R)-1-[3-[3-[2-[2-[[2-[[1-(2-chloroacetyl)-3,4-dihydro-2H-quinolin-6-yl]oxy]acetyl]amino]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate
别名	KB02-SLF; 2384184-40-9; [(1R)-1-[3-[3-[2-[2-[[2-[[1-(2-chloroacetyl)-3,4-dihydro-2H-quinolin-6-yl]oxy]acetyl]amino]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate; SCHEMBL22111181;
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意：请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮和光照。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : 100 mg/mL (105.32 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (5.27 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 5 mg/mL (5.27 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (5.27 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : 100 mg/mL (105.32 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (5.27 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 5 mg/mL (5.27 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

View More

配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (5.27 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.0532 mL	5.2658 mL	10.5316 mL
	5 mM	0.2106 mL	1.0532 mL	2.1063 mL
	10 mM	0.1053 mL	0.5266 mL	1.0532 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。