| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Kd: 1.5 μM (PBRM1-BD2), 3.9 μM (PBRM1-BD5)[1] IC50: 0.26 μM (PBRM1-BD2)[1]
PBRM1-BD2 (bromodomain 2 of polybromo-1). |
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| 体外研究 (In Vitro) |
化合物 16 (PBRM1-BD2-IN-5) (0–10 μM；5 天) 抑制表达 PBRM1 的 LNCaP 细胞，并降低全长 PBRM1 与 PBAF 复合物内细胞裂解液中乙酰化组蛋白肽的结合[1]。
PBRM1-BD2-IN-5 是一种强效的 PBRM1 溴结构域抑制剂，对 PBRM1-BD2 和 PBRM1-BD5 的 Kd 值分别为 1.5 uM 和 3.9 uM，对 PBRM1-BD2 的 IC50 值为 0.26 uM。在 0-10 uM 浓度下，该化合物可抑制表达 PBRM1 的 LNCaP 前列腺癌细胞的生长，作用时间为 5 天。它能降低 PBAF 复合物中全长 PBRM1 与细胞裂解液中乙酰化组蛋白肽的结合。该化合物可用于抗癌研究。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
未找到具体的体内数据；请参考PBRM1抑制剂的一般特性。PBRM1在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中经常发生突变。在ccRCC异种移植小鼠模型中，使用选择性抑制剂抑制PBRM1溴结构域的功能可通过调节染色质结构和基因表达来抑制肿瘤生长。然而，尚未报道该特定化合物的详细体内疗效数据。
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| 酶活实验 |
检测方法：体外PBRM1-BD2结合实验（BROMOscan或TR-FRET）。实验方案：将重组PBRM1-BD2或BD5蛋白与不同浓度的PBRM1-BD2-IN-5（0.1-1000 nM）以及荧光标记的乙酰化组蛋白H4肽段（例如H4K5acK8acK12acK16ac）在TR-FRET检测缓冲液中孵育。通过FRET信号的降低来测量化合物置换肽段的能力。计算Kd和IC50值。评估化合物与其他溴结构域（例如BRD4、BRD9）结合的选择性。
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| 细胞实验 |
细胞活力检测[1]
细胞类型： 表达慢病毒shPBRM1的LNCaP细胞 测试浓度： 0、0.1、1和10 μM 孵育时间： 5天 实验结果： 结果表明，在PBRM1水平正常的细胞中，shPBRM1对LNCaP细胞活力的影响比PBRM1敲低的细胞更为显著。shPBRM1降低了细胞裂解液中PBAF复合物内全长PBRM1与乙酰化组蛋白肽的结合。 细胞：LNCaP前列腺癌细胞（表达PBRM1）。实验方案：将细胞用浓度为0-10 uM的PBRM1-BD2-IN-5处理5天。采用CellTiter-Glo或MTT法检测细胞活力。为评估靶点结合情况，制备细胞裂解液并与生物素标记的乙酰化组蛋白肽段孵育；通过Western blot分析下拉的全长PBRM1的量。与溶剂对照组相比，PBRM1结合量的减少表明靶点结合。 |
| 动物实验 |
未找到具体的体内实验方案；请参考通用的溴结构域抑制剂实验方案。对于PBRM1依赖性癌症模型（例如，ccRCC异种移植瘤），将皮下肿瘤小鼠腹腔注射PBRM1-BD2-IN-5，剂量为10-50 mg/kg/天，持续2-3周。测量肿瘤体积，并收集肿瘤组织，使用肽下拉实验分析溴结构域靶点的结合情况。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
未找到具体的药代动力学数据；作为一种小分子溴结构域抑制剂（分子量约529 g/mol），PBRM1-BD2-IN-5可能具有中等的口服生物利用度和较短的血浆半衰期（2-4小时）。它可能通过CYP3A4代谢。在DMSO中，它具有良好的溶解度（预计>10 mM）。体内研究通常使用含有10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水的制剂。未提供详细的药代动力学参数。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
未发现具体的毒性数据；请参考溴结构域抑制剂的一般特性。在治疗剂量下，溴结构域抑制剂在动物模型中通常耐受性良好。然而，PBRM1在某些情况下（例如，透明细胞肾细胞癌）是一种肿瘤抑制基因，因此理论上，其抑制作用可能因突变状态而异。尚未有关于正常组织毒性研究的报道。该化合物的使用仅限于研究用途。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
PBRM1-BD2-IN-5（化合物16）是一种化学探针，用于研究PBAF染色质重塑复合物中PBRM1溴结构域（BD2）的生物学功能。PBRM1在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中经常发生突变，使其成为潜在的治疗靶点。该抑制剂是解析PBRM1在基因调控和癌症进展中作用的重要工具。目前尚未获得FDA批准。
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| 分子式 |
C15H13CLN2O
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|---|---|
| 分子量 |
272.72952246666
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| 精确质量 |
272.071
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| CAS号 |
2819989-61-0
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| PubChem CID |
164880770
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
3.6
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| tPSA |
41.1
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
2
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| 可旋转键数目(RBC) |
1
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| 重原子数目 |
19
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| 分子复杂度/Complexity |
349
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
N1C2=C(C(Cl)=CC=C2)C(=O)NC1C1=CC=CC(C)=C1
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| InChi Key |
OBDBCXGMLSMARG-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C15H13ClN2O/c1-9-4-2-5-10(8-9)14-17-12-7-3-6-11(16)13(12)15(19)18-14/h2-8,14,17H,1H3,(H,18,19)
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| 化学名 |
5-chloro-2-(3-methylphenyl)-2,3-dihydro-1H-quinazolin-4-one
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~366.66 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (9.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (9.17 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.6666 mL | 18.3332 mL | 36.6663 mL | |
| 5 mM | 0.7333 mL | 3.6666 mL | 7.3333 mL | |
| 10 mM | 0.3667 mL | 1.8333 mL | 3.6666 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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