PROTAC-O4I2

别名: PROTAC-O4I-2
目录号: V40084 纯度: ≥98%
PROTAC-O4I2 是一种靶向剪接因子 3B1 (SF3B1) 的 PROTAC。
PROTAC-O4I2 CAS号: 2785323-62-6
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
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产品描述
PROTAC-O4I2 是一种靶向剪接因子 3B1 (SF3B1) 的 PROTAC。 PROTAC-O4I2 在 K562 细胞中诱导 FLAG-SF3B1 降解,IC50 为 0.244 μM。 PROTAC-O4I2 还诱导 K562 WT 细胞凋亡。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
体外研究 (In Vitro)
PROTAC-O4I2 通过将沙利度胺引入泛素 E3 连接酶 cereblon (CRBN) 中,优先降解 SF3B1 并防止细胞中肿瘤的形成 [1]。 STAT-O4I2 抑制并降解 K562 细胞中的 SF3B1。 SF3B1 WT、SF3B1 OE 和 SF3B1 K700E 细胞受到 PROTAC-O4I2 的非增殖影响,IC50 值分别为 228、63 和 90 nM [1]。 PROTAC-O4I2 在 K562 细胞中的 IC50 值为 0.244 μM,以浓度依赖性方式导致 FLAG-SF3B1 降解 [1]。
体内研究 (In Vivo)
PROTAC-O4I2 (10 μM) 抑制肿瘤的维持和发展,从而显着提高果蝇在肠道肿瘤模型中的存活率[1]。
细胞实验
细胞增殖测定[1]
细胞类型: K562 对照细胞 (WT)、过表达 SF3B1 的细胞 (OE) 和表达 SF3B1K700E (K700E) 的细胞
测试浓度: 1 pM、0.1 nM、10 nM、1 μM、100 μM
孵育持续时间:72 小时
实验结果:在 K562 中在 WT 细胞中,亲本化合物 O4I2 表现出边际抗增殖作用 (IC50 >10 μM)。相比之下,PROTAC-O4I2 表现出显着更高的毒性,IC50 为 228 nM,比 pladienolide B(IC50,76 nM)低近 3 倍。过表达 SF3B1 WT 的细胞对 pladienolide B 具有轻微抗性(IC50,134 nM),但对 PROTAC-O4I2 更敏感(IC50 值为 63 nM)。

细胞凋亡分析[1]
细胞类型: K562 细胞
测试浓度: 1 μM
孵育时间: 48小时
实验结果:在表达SF3B1WT或SF3B1K700E的细胞中诱导细胞凋亡。
动物实验
动物/疾病模型:黑腹果蝇[1]
剂量:10 μM
给药途径:将果蝇喂食于浸有 PROTAC-O4I2 的圆形滤纸上,滤纸置于 5% 蔗糖溶液中,维持在 18℃,每 2 天更换一次新鲜配制的样品瓶。
实验结果:降低了干细胞活性,抑制了肿瘤的发生和发展,并提高了果蝇 ISC 肿瘤模型的存活率。
参考文献

[1]. A PROTAC targets splicing factor 3B1. Cell Chem Biol. 2021 Nov 18;28(11):1616-1627.e8.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H29CLN6O5S
分子量
609.10
精确质量
608.16
CAS号
2785323-62-6
PubChem CID
162641046
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.453±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)
LogP
4.9
tPSA
178
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
42
分子复杂度/Complexity
1030
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=CC(=CC=1)NC1=NC(=CS1)C(NCCCCCCNC1=CC=CC2C(N(C(C=21)=O)C1C(NC(CC1)=O)=O)=O)=O
InChi Key
UWYLVQJEOCYCEW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H29ClN6O5S/c30-17-8-10-18(11-9-17)33-29-34-21(16-42-29)25(38)32-15-4-2-1-3-14-31-20-7-5-6-19-24(20)28(41)36(27(19)40)22-12-13-23(37)35-26(22)39/h5-11,16,22,31H,1-4,12-15H2,(H,32,38)(H,33,34)(H,35,37,39)
化学名
2-(4-chloroanilino)-N-[6-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]hexyl]-1,3-thiazole-4-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 250 mg/mL (410.44 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.41 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6418 mL 8.2088 mL 16.4177 mL
5 mM 0.3284 mL 1.6418 mL 3.2835 mL
10 mM 0.1642 mL 0.8209 mL 1.6418 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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