Pyroxamide

别名: N-羟基-N'-3-吡啶基辛二酰胺; N-羟基-N''-3-吡啶基辛二酰胺; N-羟基-N-3-吡啶基辛二酰胺; N-羟基-N'-3-吡啶基辛烷二酰胺
目录号: V39523 纯度: ≥98%
Pyroxamide 是组蛋白脱乙酰酶 1 (HDAC1) 的有效抑制剂,ID50 为 100 nM。
Pyroxamide CAS号: 382180-17-8
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
吡罗酰胺是一种强效的组蛋白去乙酰化酶1 (HDAC1) 抑制剂,其半数抑制浓度 (ID50) 为 100 nM。吡罗酰胺可诱导白血病细胞凋亡和细胞周期阻滞。
吡罗酰胺(CAS 382180-17-8),又名 N-羟基-N'-3-吡啶基辛二酰胺,是一种强效的组蛋白去乙酰化酶1 (HDAC1) 抑制剂,其半数抑制浓度 (IC50) 为 100 nM。该化合物的分子式为 C13H19N3O3,分子量为 265.31。它属于组蛋白去乙酰化酶抑制剂类药物,具有潜在的抗癌特性。吡罗酰胺通过抑制 HDAC,促进组蛋白的过度乙酰化,导致染色质结构开放,从而重新激活抑癌基因的表达。该化合物可诱导白血病细胞凋亡和细胞周期阻滞。吡唑酰胺是一种基于羟肟酸的HDAC抑制剂,它通过螯合HDAC活性位点中的锌离子发挥作用,这是此类抑制剂的常见机制。它是一种研究化合物,用于研究HDAC在癌症和其他疾病中的作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC1 100 nM (ID50)
Histone deacetylase 1 (HDAC1). Pyroxamide is a potent inhibitor of HDAC1 with an IC50 of 100 nM. HDAC1 is a class I histone deacetylase that removes acetyl groups from histone lysine residues, leading to chromatin condensation and transcriptional repression. By inhibiting HDAC1, Pyroxamide promotes histone hyperacetylation, which opens chromatin structure and reactivates the expression of tumor suppressor genes and other genes involved in cell cycle regulation and apoptosis. The compound's hydroxamic acid moiety chelates the zinc ion in the HDAC active site, blocking the enzyme's deacetylase activity. This mechanism is shared by other hydroxamic acid-based HDAC inhibitors such as suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA, vorinostat). Pyroxamide may also inhibit other HDAC isoforms, though its selectivity profile is not extensively characterized in the available literature.
体外研究 (In Vitro)
吡罗酰胺(1.25-20.0 μM;24-72 小时)可抑制 RH30B 和 RD 细胞的增殖,在 20.0 μM 浓度下导致 44% 的细胞死亡,72 小时后培养细胞死亡率达 86% [1]。吡罗酰胺(10.0-20.0 μM;48 小时)在 10.0 μM 和 20.0 μM 浓度下分别使亚 G1 期细胞比例达到 45.0% 和 72.3% [1]。
吡罗酰胺对 HDAC1 具有强效的体外活性,IC50 为 100 nM。在基于细胞的实验中,该化合物可诱导白血病细胞凋亡和细胞周期阻滞。可通过 Western blot 检测处理细胞中组蛋白乙酰化水平来评估该化合物抑制 HDAC 活性的能力,乙酰化水平升高表明 HDAC 活性受到抑制。吡唑酰胺的抗增殖作用已在多种癌细胞系中得到证实,该化合物显示出潜在的抗癌特性。其羟肟酸部分对其HDAC抑制活性至关重要,因为它能螯合酶活性位点中的催化锌离子。然而,现有文献中并未广泛报道更详细的体外数据,包括针对其他HDAC亚型的IC50值和选择性谱。
体内研究 (In Vivo)
吡罗酰胺作为HDAC抑制剂的作用机制提示其可能具有体内活性。HDAC抑制剂在多种临床前模型中均显示出抗肿瘤活性,而吡罗酰胺诱导白血病细胞凋亡和细胞周期阻滞的能力提示其具有潜在的体内疗效。然而,现有文献中关于吡罗酰胺的具体体内数据,包括动物模型疗效、药代动力学和毒性等方面的报道并不多见。该化合物目前主要用作研究HDAC生物学和评估HDAC抑制剂在癌症治疗中应用潜力的研究工具。需要开展进一步的研究来全面阐明其体内活性和治疗潜力。
酶活实验
使用重组HDAC1酶进行吡唑酰胺的酶抑制试验。将该化合物与酶和荧光底物(通常为含有乙酰化赖氨酸残基的肽)孵育,通过监测底物脱乙酰化后荧光强度的增加来测定脱乙酰酶活性的抑制情况。IC50值为100 nM,由剂量反应曲线确定。使用重组HDAC2、HDAC3、HDAC6和其他亚型,通过类似的试验评估其对其他HDAC亚型的选择性。该化合物的作用机制——羟肟酸部分螯合锌——可通过与锌的竞争性试验或比较其对锌配位改变的HDAC突变体的活性来证实。
细胞实验
细胞活力检测[2]
细胞类型: RD 细胞;RH30B 细胞
测试浓度: 1.25-20.0 μM
孵育时间: 24 小时;48 小时;72 小时
实验结果: 导致 RD 和 RH30B 细胞的生长减少。
细胞周期分析[2]
细胞类型: RD 细胞;RH30B 细胞
测试浓度: 10.0 μM; 20.0 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 与对照组相比,48 小时后亚 G1 期细胞比例增加。
使用多种癌细胞系,特别是白血病细胞系,对吡唑酰胺进行基于细胞的检测。将细胞用不同浓度(通常为纳摩尔至微摩尔级)的吡唑酰胺处理特定时间(24-72 小时),并评估以下终点:组蛋白乙酰化水平(通过蛋白质印迹法)、细胞活力(通过 MTT 或 CellTiter-Glo 法)、细胞凋亡(通过膜联蛋白 V 染色或 caspase 激活)和细胞周期分布(通过流式细胞术)。通过测量细胞生长抑制的 IC50 值来评估该化合物的抗增殖作用。可以通过与其他 HDAC 抑制剂进行比较,或者使用 HDAC 过表达或敲低细胞系来证实所观察到的效果的特异性。
动物实验
吡罗酰胺的体内研究通常涉及对小鼠癌症模型(例如白血病异种移植模型)进行给药。该化合物将通过多种途径(例如口服、腹腔注射、静脉注射)以特定剂量和给药方案给药。药效学终点包括测量肿瘤组织中的组蛋白乙酰化水平、评估肿瘤生长抑制情况以及评估生存期。药代动力学参数,例如血浆浓度-时间曲线、半衰期、清除率和生物利用度,将通过连续血液采样测定。然而,现有文献中关于吡罗酰胺的具体体内数据报道并不多。
药代性质 (ADME/PK)
现有文献中关于吡罗酰胺的药代动力学性质报道不多。作为一种分子量为265.31的小分子HDAC抑制剂,该化合物口服给药时预计具有良好的生物利用度,但这需要通过实验验证。该化合物的羟肟酸部分可能易受代谢清除,这在羟肟酸类HDAC抑制剂中较为常见。储存建议遵循研究化合物的标准储存条件。需要进一步的药代动力学表征才能进行全面的分析。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中关于吡罗酰胺的毒理学数据报道不多。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于临床。HDAC抑制剂作为一类药物,可能具有剂量限制性毒性,包括疲劳、胃肠道反应和骨髓抑制,但吡罗酰胺的具体毒性特征需要在临床前毒理学研究中确定。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备(手套、实验服、护目镜)和保持良好的通风。
参考文献

[1]. Inhibition of transformed cell growth and induction of cellular differentiation by pyroxamide, an inhibitor of histone deacetylase. Clin Cancer Res. 2001 Apr;7(4):962-70.

[2]. Histone deacetylase inhibitors induce growth suppression and cell death in human rhabdomyosarcoma in vitro.Clin Cancer Res. 2003 Nov 15;9(15):5749-55.

其他信息
N'-羟基-N-(3-吡啶基)辛二酰胺是一种芳香酰胺。吡罗酰胺已在临床试验中用于治疗多种疾病,包括白血病、淋巴瘤、小肠癌、癌前病变和骨髓增生异常综合征。吡罗酰胺是羟肟酸的合成衍生物,具有抗肿瘤特性。吡罗酰胺抑制参与转录的组蛋白去乙酰化酶;诱导核心组蛋白过度乙酰化,从而调节染色质结构并影响某些抑制肿瘤生长的基因的转录;并诱导细胞生长停滞和凋亡。吡罗酰胺正在进行癌症化疗的临床试验。(NCI04)
吡罗酰胺是一种强效的HDAC1抑制剂(IC50 = 100 nM),具有潜在的抗癌特性。它属于羟肟酸类组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂,可诱导白血病细胞凋亡和细胞周期阻滞。该化合物是研究HDAC生物学和评估HDAC抑制剂在癌症治疗中潜在疗效的研究工具。它尚未获准用于临床,也没有上市的药物产品。其同义词包括N-羟基-N'-3-吡啶基辛二酰胺和N1-羟基-N8-(吡啶-3-基)辛二酰胺。该化合物可从多家化学品供应商处获得。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H19N3O3
分子量
265.31
精确质量
265.142
CAS号
382180-17-8
PubChem CID
4996
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
折射率
1.570
LogP
0.04
tPSA
91.32
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
284
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
PTJGLFIIZFVFJV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H19N3O3/c17-12(15-11-6-5-9-14-10-11)7-3-1-2-4-8-13(18)16-19/h5-6,9-10,19H,1-4,7-8H2,(H,15,17)(H,16,18)
化学名
N'-hydroxy-N-pyridin-3-yloctanediamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 125 mg/mL (471.15 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.84 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7692 mL 18.8459 mL 37.6918 mL
5 mM 0.7538 mL 3.7692 mL 7.5384 mL
10 mM 0.3769 mL 1.8846 mL 3.7692 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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