YX-2-107

别名: YX-2-107; SCHEMBL24172331; CS-0634381
目录号: V35105 纯度: ≥98%
YX-2-107 是一种选择性降解 CDK6 的 PROTAC(IC50= 4.4 nM)。
YX-2-107 CAS号: 2417408-46-7
产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
YX-2-107 是一种选择性降解 CDK6 的 PROTAC(IC50= 4.4 nM)。 YX-2-107在体外能有效抑制RB磷酸化和FOXM1表达,抑制大鼠Ph+ALL的发展。 YX-2-107可用于Ph染色体阳性(Ph+)急性淋巴细胞白血病(ALL)的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK6 4.4 nM (IC50)
体外研究 (In Vitro)
在 Ph+ BV173 和 SUP-B15 细胞中,YX-2-107(2000 nM;48 小时)抑制 S 期[1]。 BV173 细胞中的 CDK6 被 YX-2-107 选择性降解(0、1.6、8、40、200 和 1000 nM;4 小时)[1]。 YX-2-107 (2000 nM;72 h) 可抑制 Ph+ BV173 和 SUP-B15 细胞的 RB 磷酸化和 FOXM1 表达[1]。
体内研究 (In Vivo)
4 小时后,YX-2-107(10 mg/kg;腹腔注射;单次)从血浆中清除,最大浓度为 741 nM,比 CDK6 降解 IC50 高 150 倍[1]。药理学上,YX-2-107(150 mg/kg;腹腔注射;每天一次,持续三天)抑制小鼠 Ph+ ALL 的生长[1]。
细胞实验
细胞周期分析[1]
细胞类型: Ph+ BV173 和 SUP-B15 细胞
测试浓度: 2000 nM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 抑制 S 期进入。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: Ph+ BV173 和 SUP-B15 细胞
测试浓度: 2000 nM
孵育时间:72 h
实验结果:抑制RB的磷酸化和FOXM1的表达。
动物实验
动物/疾病模型: NRG-SGM3 小鼠(Ph+ ALL 异种移植模型)[1]。
剂量: 150 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip);每日一次,连续 3 天
实验结果: 抑制原发性 Ph+ ALL S 期细胞的比例,抑制 CDK4/6 调控的磷酸化 RB 的表达,以及在较小程度上抑制 FOXM1 的表达,并诱导 CDK6 的选择性降解。

动物/疾病模型: C57BL/6j 小鼠[1]。
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip);单项
实验结果: 1.19 YX-2-107 在 C57BL/6j 小鼠体内的药代动力学/PK 参数 [1]。腹腔注射 (10 mg/kg) Tmax (h) 0.5 Cmax (ng/mL) 660 AUC0-t (ng/mL·h) 815 AUC0-∞ (ng/mL·h) 987
参考文献

[1]. Selective inhibition of Ph-positive ALL cell growth through kinase-dependent and -independent effects by CDK6-specific PROTACs. Blood. 2020 Apr 30;135(18):1560-1573.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C45H51N11O9
分子量
889.954749345779
精确质量
889.39
元素分析
C, 60.73; H, 5.78; N, 17.31; O, 16.18
CAS号
2417408-46-7
PubChem CID
166642460
外观&性状
Yellow to orange solid powder
LogP
1.3
tPSA
246
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
16
重原子数目
65
分子复杂度/Complexity
1880
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NCCCCNCC(N1CCN(C2=CC=C(NC3=NC=C4C(C)=C(C(C)=O)C(=O)N(C5CCCC5)C4=N3)N=C2)CC1)=O)(=O)COC1=CC=CC2=C1C(=O)N(C1CCC(=O)NC1=O)C2=O
InChi Key
JNYCZFGLJGFFEL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C45H51N11O9/c1-26-31-23-49-45(52-40(31)55(28-8-3-4-9-28)43(63)38(26)27(2)57)50-34-14-12-29(22-48-34)53-18-20-54(21-19-53)37(60)24-46-16-5-6-17-47-36(59)25-65-33-11-7-10-30-39(33)44(64)56(42(30)62)32-13-15-35(58)51-41(32)61/h7,10-12,14,22-23,28,32,46H,3-6,8-9,13,15-21,24-25H2,1-2H3,(H,47,59)(H,51,58,61)(H,48,49,50,52)
化学名
N-(4-((2-(4-(6-((6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-7-oxo-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)amino)pyridin-3-yl)piperazin-1-yl)-2-oxoethyl)amino)butyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide
别名
YX-2-107; SCHEMBL24172331; CS-0634381
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (112.37 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.81 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1237 mL 5.6183 mL 11.2366 mL
5 mM 0.2247 mL 1.1237 mL 2.2473 mL
10 mM 0.1124 mL 0.5618 mL 1.1237 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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