YX-2-107

别名: YX-2-107; SCHEMBL24172331; CS-0634381
目录号: V35105 纯度: ≥98%
YX-2-107 是一种选择性降解 CDK6 的 PROTAC(IC50= 4.4 nM)。
YX-2-107 CAS号: 2417408-46-7
产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
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产品描述
YX-2-107 是一种选择性降解 CDK6 的 PROTAC(IC50 = 4.4 nM)。YX-2-107 可在体外有效抑制视网膜母细胞瘤蛋白 (RB) 的磷酸化和 FOXM1 的表达,并抑制大鼠 Ph+ ALL 的发展。YX-2-107 可用于 Ph 染色体阳性 (Ph+) 急性淋巴细胞白血病 (ALL) 的研究。
YX-2-107 是一种选择性降解 CDK6 的 PROTAC,IC50 为 4.4 nM。它可在体外有效抑制视网膜母细胞瘤蛋白 (RB) 的磷酸化和 FOXM1 的表达。YX-2-107 可抑制大鼠 Ph 染色体阳性 (Ph+) 急性淋巴细胞白血病 (ALL) 的发展。它是一种 CRBN 募集且特异性降解 CDK6 的 PROTAC。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK6 4.4 nM (IC50)
YX-2-107 targets cyclin-dependent kinase 6 (CDK6) for selective degradation via the PROTAC mechanism. It recruits the CRBN E3 ubiquitin ligase to CDK6, leading to ubiquitination and proteasomal degradation. The compound shows selectivity for CDK6 over CDK4 with IC50 values of 0.69 nM for CDK4 and 4.4 nM for CDK6.
体外研究 (In Vitro)
在Ph+ BV173和SUP-B15细胞中,YX-2-107(2000 nM;48 h)抑制S期[1]。YX-2-107(0、1.6、8、40、200和1000 nM;4 h)选择性降解BV173细胞中的CDK6[1]。YX-2-107(2000 nM;72 h)抑制Ph+ BV173和SUP-B15细胞的RB磷酸化和FOXM1表达[1]。
YX-2-107在体外有效抑制RB磷酸化和FOXM1表达。它选择性降解Ph+ BV173 ALL细胞中的CDK6,降解常数为4 nM。该化合物对多种癌细胞系显示出强效活性。
体内研究 (In Vivo)
小时后,YX-2-107(10 mg/kg;腹腔注射;单次)在血浆中的最大浓度为 741 nM,比 CDK6 降解 IC50 值高 150 倍[1]。药理学研究表明,YX-2-107(150 mg/kg;腹腔注射;每日一次,连续三天)可抑制小鼠 Ph+ ALL 的生长[1]。
YX-2-107 可抑制大鼠 Ph+ ALL 的发展。在费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病动物模型中证实了其体内疗效。该化合物可减少肿瘤细胞增殖并增强现有癌症疗法的疗效。
酶活实验
体外实验采用免疫印迹或质谱法检测 CDK6 的降解情况。通过用递增浓度的 YX-2-107 处理细胞并定量剩余的 CDK6 蛋白,来确定 CDK6 降解的 IC50 值。
细胞实验
细胞周期分析[1]
细胞类型: Ph+ BV173 和 SUP-B15 细胞
测试浓度: 2000 nM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 抑制 S 期进入。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: Ph+ BV173 和 SUP-B15 细胞
测试浓度: 2000 nM
孵育时间: 72 小时
实验结果: 抑制 RB 的磷酸化和 FOXM1 的表达。
基于细胞的检测使用 Ph+ BV173 ALL 细胞来测量 CDK6 的降解。通过蛋白质印迹法检测RB磷酸化和FOXM1表达。细胞增殖实验用于评估CDK6降解的功能后果。
动物实验
动物/疾病模型: NRG-SGM3 小鼠(Ph+ ALL 异种移植模型)[1]。
剂量: 150 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip);每日一次,连续 3 天
实验结果: 抑制原发性 Ph+ ALL S 期细胞的百分比,抑制 CDK4/6 调控的磷酸化 RB 的表达,以及在较小程度上抑制 FOXM1 的表达,并诱导 CDK6 的选择性降解。
动物/疾病模型: C57BL/6j 小鼠[1]。
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip);单项
实验结果: 1.19 YX-2-107 在 C57BL/6j 小鼠中的药代动力学/PK 参数 [1]。腹腔注射 (10 mg/kg) Tmax (h) 0.5 Cmax (ng/mL) 660 AUC0-t (ng/mL·h) 815 AUC0-∞ (ng/mL·h) 987
在 Ph+ ALL 大鼠模型中评估体内疗效。监测肿瘤发展以评估 YX-2-107 的抑制作用。测量该化合物抑制肿瘤生长和进展的能力。
药代性质 (ADME/PK)
YX-2-107 的药代动力学数据有限。作为一种分子量与同类药物相符的 PROTAC 分子,其口服生物利用度和组织分布可能中等。需要进一步的药代动力学研究来全面表征其 ADME 特性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
YX-2-107 的临床前毒性数据有限。作为一种 CDK6 降解剂,它可能具有与 CDK6 抑制相关的靶向毒性,包括骨髓抑制。应遵循标准的实验室安全预防措施。需要进行进一步的毒理学研究。
参考文献

[1]. Selective inhibition of Ph-positive ALL cell growth through kinase-dependent and -independent effects by CDK6-specific PROTACs. Blood. 2020 Apr 30;135(18):1560-1573.

其他信息
YX-2-107 是一种选择性 CDK6 降解 PROTAC,IC50 为 4.4 nM。它是一种 CRBN 募集型 PROTAC,对 CDK6 的选择性高于 CDK4。该化合物是研究 CDK6 生物学的重要研究工具,并具有治疗 Ph+ ALL 和其他 CDK6 依赖性癌症的潜在应用价值。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C45H51N11O9
分子量
889.954749345779
精确质量
889.39
元素分析
C, 60.73; H, 5.78; N, 17.31; O, 16.18
CAS号
2417408-46-7
PubChem CID
166642460
外观&性状
Yellow to orange solid powder
LogP
1.3
tPSA
246
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
16
重原子数目
65
分子复杂度/Complexity
1880
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NCCCCNCC(N1CCN(C2=CC=C(NC3=NC=C4C(C)=C(C(C)=O)C(=O)N(C5CCCC5)C4=N3)N=C2)CC1)=O)(=O)COC1=CC=CC2=C1C(=O)N(C1CCC(=O)NC1=O)C2=O
InChi Key
JNYCZFGLJGFFEL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C45H51N11O9/c1-26-31-23-49-45(52-40(31)55(28-8-3-4-9-28)43(63)38(26)27(2)57)50-34-14-12-29(22-48-34)53-18-20-54(21-19-53)37(60)24-46-16-5-6-17-47-36(59)25-65-33-11-7-10-30-39(33)44(64)56(42(30)62)32-13-15-35(58)51-41(32)61/h7,10-12,14,22-23,28,32,46H,3-6,8-9,13,15-21,24-25H2,1-2H3,(H,47,59)(H,51,58,61)(H,48,49,50,52)
化学名
N-(4-((2-(4-(6-((6-acetyl-8-cyclopentyl-5-methyl-7-oxo-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)amino)pyridin-3-yl)piperazin-1-yl)-2-oxoethyl)amino)butyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide
别名
YX-2-107; SCHEMBL24172331; CS-0634381
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (112.37 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.81 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1237 mL 5.6183 mL 11.2366 mL
5 mM 0.2247 mL 1.1237 mL 2.2473 mL
10 mM 0.1124 mL 0.5618 mL 1.1237 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们