A-366

别名: A 366A-366 A366
目录号: V9842 纯度: ≥98%
A-366 (A366) 是一种新型、有效的肽竞争性组蛋白甲基转移酶 G9a 抑制剂,具有抗癌活性。
A-366 CAS号: 1527503-11-2
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述

描述:A-366 (A366) 是一种新型、高效的肽竞争性组蛋白甲基转移酶 G9a 抑制剂,具有抗癌活性。它对 G9a 的抑制 IC50 为 3 nM,对其他甲基转移酶和非表观遗传靶点的选择性超过 100 倍。A-366 已被证明能以 100 nM 的 IC50 抑制细胞中的 H3K9 甲基化,并且与以往的喹唑啉类探针相比,其细胞毒性极低。A-366 选择性地抑制 G9a 及其密切相关的 GLP (EHMT1),但不抑制其他组蛋白甲基转移酶。尽管对 H3K9me2 甲基化的细胞活性与其他已知的 G9a/GLP 小分子抑制剂相当,但 A-366 对肿瘤细胞系生长的细胞毒性作用显著降低。


生物活性&实验参考方法
靶点
G9a (histone H3 lysine-9 methyltransferase) – potently diminishes H3K9 dimethylation
Histamine H3 receptor (H3R) – functional antagonist: KB = 15 nM [2-150 nM] at human H3R (hH3R) determined from Schild analysis; also active at rat H3R (rH3R) with EC50 = 2.3 nM [0.4-14.9 nM] for shifting histamine activation in CRE-Luc assay
Spindlin1 (epigenetic reader protein) – inhibitory activity[1]
体外研究 (In Vitro)
A-366(0.01-10 μM;14 天)影响 MV4;11 细胞的活力并诱导其分化 [4]。在 PC-3 前列腺癌细胞中,A-366(0.3-3 μM;72 小时)以浓度和时间依赖的方式降低 H3K9me2 的总体水平,其细胞 EC50 值约为 300 nM。A-366(0.01-10 μM;4 天;HL-60 细胞)以剂量依赖的方式降低细胞分化和增殖。经 A-366 处理的 HL-60 细胞的 DNA 含量分析显示 G1 期细胞增加,这与细胞阻滞一致 [4]。
1 μM 的 A-366 能有效置换人 H3R 上的 [3H]N-甲基组胺,其抑制作用与匹托利桑相当(根据图 1,抑制率约为 90%,具体百分比未说明)[1]。
在利用稳定表达大鼠 H3R 的 HEK-293T 细胞进行的 CRE-Luc 报告基因检测中,A-366 浓度依赖性地改变了组胺诱导的 cAMP 减少,显示出拮抗剂特性。通过 Schild 回归计算得出,A-366 对人 H3R 的亲和力 (KB) 为 15 nM [2-150 nM](斜率为 0.79±0.45,与 1 无显著差异)。 [1]
A-366抑制了G9a酶活性,AlphaLISA检测显示H3K9二甲基化水平降低(未提供确切的IC50值)。[1]
A-366也显示出对Spindlin1的抑制活性(未提供确切的IC50值)。[1]
在1 μM浓度下的选择性筛选显示,A-366对放射性配体与多巴胺D1、D2、D3、D5受体和组胺H4受体的结合抑制作用显著低于其对H3R的抑制作用(P<0.02),表明其具有亚型选择性。在 H3R、H4R、D1R 和 D2R 位点,A-366 和 UNC-0642 之间的差异不显著 (P>0.22),但 UNC-0642 在 D2R 和 D3R 位点对 [3H]螺哌隆的置换作用高于 A-366 (P<0.01)。[1]
体内研究 (In Vivo)
当用 A-366(30 mg/kg;渗透泵;每日一次,持续 14 天)治疗 MV4;11 异种移植瘤时,可观察到生长抑制 [4]。
在 MV4;11 AML 侧腹异种移植瘤模型中,通过渗透泵以 30 mg/kg/天的剂量连续 14 天给予 A-366,可观察到轻微的肿瘤生长抑制(45% TGI)[4]。
酶活实验
采用基于 AlphaLISA 的方法检测 G9a 抑制作用。将化合物与 5 mM G9a 酶、100 mM 组蛋白 H3 (1-21) 片段和 15 μM S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 在 384 孔白色微孔板中于检测缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 9.0、50 mM NaCl、1 mM 二硫苏糖醇、0.01% Tween-20)中孵育 30 分钟。加入抗 H3K9me2 受体磁珠终止反应。孵育 60 分钟后,加入链霉亲和素包被的供体磁珠,继续孵育 30 分钟。使用积分时间为 1000 ms 的 AlphaLISA 发光滤光片测量发光值。[1]
Spindlin1 抑制作用采用荧光偏振位移法测定。对十二个浓度进行三次重复测定以获得IC50值(未提供A-366的确切值)。[1]
GPCR的放射性配体置换试验:将表达人H3R的转染HEK-293T细胞的膜制备物与A-366(滴定范围0.003-1000 nM,重复两次)和2 nM [3H]N-甲基组胺孵育90分钟。使用10 μM匹托利桑测定非特异性结合。为了筛选脱靶选择性,将1 μM A-366与相应的受体在表2所述的条件下孵育(D1/D5使用[3H]SCH23390,D2/D3使用[3H]螺哌隆,H4R使用[3H]组胺)。孵育结束后,将样品过滤到预先用0.3%聚乙烯亚胺浸泡过的GF/B滤膜上,用4℃水洗涤三次,干燥后进行闪烁计数。[1]
细胞实验
细胞活力检测 [4]
细胞类型: MV4;11 个细胞
测试浓度: 0.01-10 μM
孵育时间: 14 天
实验结果: 导致细胞增殖抑制和活力降低,与 CD11b 染色观察到的剂量反应相符。
在稳定转染大鼠 H3R cDNA 和含有 cAMP 反应元件的荧光素酶载体的 HEK-293T 细胞中进行 CRE-Luc 报告基因检测。将细胞以每孔 2×10⁵ 个细胞/200 μL 的密度接种于聚乙烯亚胺包被的 96 孔板中,培养基为不含酚红的 DMEM,含 1% FBS,并使其贴壁 24-48 小时。然后,使用液体处理机器人,在有或无A-366(10至100,000 nM)的情况下,加入福斯克林(终浓度3 μM)和系列稀释的Nα-甲基组胺(10,000至0.01 mM)。将混合物在培养条件下(37.0°C,5.0% CO₂,95%湿度)孵育5小时。移除培养基后,用80 μL裂解缓冲液(25 μM三羟甲基氨基甲烷、10%甘油、2 μM乙二醇单乙二胺四乙酸、1% Triton X-100、5 μM MgSO₄·7H₂O、1 μM二硫苏糖醇)在300 rpm下振荡30分钟裂解细胞。将裂解液转移至白色微孔板中,注入40 μL检测缓冲液(25 mM甘氨酰甘氨酸、15 mM MgSO₄·7H₂O、15 mM KH₂PO₄、4 mM EGTA酸、2 mM二硫苏糖醇、1 mM ATP、50 μM辅酶A、0.02 mg/mL D-荧光素钾盐)后立即记录发光值,使用进样模块,积分时间为3000 ms。数据以仅含福斯克林的对照组(100%)和福斯克林加10 μM Nα-甲基组胺组(0%)进行标准化。[1]
动物实验
动物/疾病模型: 6-8周龄SCID米色雌性小鼠(MV4;11异种移植瘤)[4]
剂量: 30 mg/kg
给药途径: 通过微型渗透泵;每日一次,持续14天
实验结果: 在该模型中,A-366治疗产生了45%的肿瘤生长抑制率。
MV4;11侧腹异种移植瘤疗效研究:将MV4;11细胞(5×10^6)与Matrigel混合,皮下注射到雌性SCID米色小鼠的侧腹。当肿瘤体积达到约200 mm³时,将小鼠分组(每组n=10)。 A-366 由 98% 的 PEG-400 和 2% 的 Tween-80 配制而成,并通过渗透泵以 30 mg/kg/天的剂量给药,持续 14 天。每周使用数字游标卡尺测量两次肿瘤体积。计算肿瘤生长抑制率 (TGI) [4]。
药代性质 (ADME/PK)
在荷瘤小鼠中,通过渗透泵给药后,A-366 在肿瘤组织和其他组织中均显示出显著的积累[4]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
初步的最大耐受剂量 (MTD) 研究显示,腹腔注射 A-366 后,动物在 10 mg/kg 剂量下出现毒性 [4]。
- 在人外周血单核细胞 (PBMC,非转化细胞) 中,A-366 在浓度高达 10 μM 时对细胞活力没有影响 [4]。
参考文献

[1]. Epigenetics meets GPCR: inhibition of histone H3 methyltransferase (G9a) and histamine H3 receptor for Prader-Willi Syndrome. Sci Rep. 2020;10(1):13558. Published 2020 Aug 11.

[2]. Identification of a small-molecule ligand of the epigenetic reader protein Spindlin1 via a versatile screening platform. Nucleic Acids Res. 2016;44(9):e88.

[3]. Discovery and development of potent and selective inhibitors of histone methyltransferase g9a. ACS Med Chem Lett. 2014;5(2):205-209. Published 2014 Jan 2.

[4]. The Histone Methyltransferase Inhibitor A-366 Uncovers a Role for G9a/GLP in the Epigenetics of Leukemia. PLoS One. 2015;10(7):e0131716. Published 2015 Jul 6.

其他信息
A-366 是一种基于螺环 2-氨基-3H-吲哚的 G9a 抑制剂,由于其固有的脒基或芳香胍基官能团,在生理 pH 值下可能被质子化。它含有一个 3-吡咯烷基丙氧基部分,该部分模拟组蛋白 H3K9 的赖氨酸残基,并阻断 G9a 活性位点中的赖氨酸结合通道。A-366 被鉴定为一种强效的 H3R 拮抗剂,具有高亲和力(对人 H3R 的 KB = 15 nM)以及对多巴胺 D1、D2、D3、D5 受体和组胺 H4 受体的选择性。该化合物对 G9a 和 Spindlin1 均有抑制作用,使其成为一种多靶点配体。该研究提出,A-366 可能通过拮抗 H3R 受体,为普拉德-威利综合征 (PWS) 提供症状缓解,并通过 G9a 介导的印记基因恢复,实现病因干预。作者指出,A-366 已进入临床前开发后期阶段,并且在小鼠或大鼠模型中具有良好的耐受性,表明其适合未来在 PWS 中进行体内研究。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H27N3O2
分子量
329.4366
精确质量
329.21
CAS号
1527503-11-2
PubChem CID
76285486
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.057
tPSA
60.08
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
471
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
BKCDJTRMYWSXMC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H27N3O2/c1-23-16-12-14-15(21-18(20)19(14)6-4-7-19)13-17(16)24-11-5-10-22-8-2-3-9-22/h12-13H,2-11H2,1H3,(H2,20,21)
化学名
5'-methoxy-6'-(3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)spiro[cyclobutane-1,3'-indol]-2'-amine
别名
A 366A-366 A366
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~151.77 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.59 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.59 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0355 mL 15.1773 mL 30.3545 mL
5 mM 0.6071 mL 3.0355 mL 6.0709 mL
10 mM 0.3035 mL 1.5177 mL 3.0355 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Screening for selectivity of G9a-inhibitors at 1 µM among dopamine D1, D5, D2 and D3 receptors (D1R, D5R, D2R, D3R, respectively) and at the histamine H4 receptor (H4R). For comparison, the figure depicts the inhibition of specific binding to H3R that was extracted from affinity screening data. Bars represent means ± s.d. of the inhibition of radioligand binding to the respective receptor by either A-366, UNC-0642 or control compound (100 µM fluphenazine for D1R and D5R, 10 µM haloperidol for D2R and D3R, 100 µM JNJ-7777120 for H4R or 10 µM pitolisant for H3R).[3H]-SCH23390, [3H]-spiperone, [3H]-histamine and [3H]Nα-methylhistamine were used as radiolabelled tracers at D1R/D5R, D2R/D3R, H4R and H3R, respectively, each at approx. 1 × KD.[1].Reiner D, et al. Epigenetics meets GPCR: inhibition of histone H3 methyltransferase (G9a) and histamine H3 receptor for Prader-Willi Syndrome. Sci Rep. 2020;10(1):13558. Published 2020 Aug 11.
  • Schild-assay revealing antagonist properties of A-366 at rat isoform of H3R. (a) Effects of the H3R agonist Nα-methylhistamine on formation of cAMP concentrations were studied in a cAMP response element-driven luciferase reporter gene (CRE-Luc) assay in HEK-293 T cells that were stably transfected with the receptor as described by Nordemann et al.44,45 Evaluated data originated from two independent experiments performed in duplicate and are stated as means ± s.d. (b) Data from panel a were transformed to a Schild-plot that resulted in a regression of R2 = 0.91 (black line, with 95% confidence band depicted with small dots). The slope was not different from unity (grey line).[1].Reiner D, et al. Epigenetics meets GPCR: inhibition of histone H3 methyltransferase (G9a) and histamine H3 receptor for Prader-Willi Syndrome. Sci Rep. 2020;10(1):13558. Published 2020 Aug 11.
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