AK-1

别名: 3-[(六氢-1H-氮杂卓-1-基)磺酰基]-N-(3-硝基苯基)苯甲酰胺;SIRT2 Inhibitor II, AK-1
目录号: V6633 纯度: ≥98%
AK-1 是一种有效、特异性和细胞穿透性的 SIRT2 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 12.5 μM。
AK-1 CAS号: 330461-64-8
产品类别: Sirtuin
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
AK-1 是一种高效、特异性强且能穿透细胞的 SIRT2 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 12.5 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Sirtuin 2 (SIRT2) (inhibitor) [1]
体外研究 (In Vitro)
在患有亨廷顿病的果蝇中,10 μM 的 AK-1 具有显著的神经保护作用,使横纹肌数量从 5.2 增加到 5.6 [1]。AK-1 的 IC50 值为 12.5 μM,是一种强效、选择性强且细胞渗透性高的 SIRT2 抑制剂 [2]。AK-1 通过阻断 NF-κB/CSN2 通路,导致 Snail 转录因子被蛋白酶降解。Snail 水平降低会导致 p21 过表达,从而减缓伤口愈合、G1 期阻滞和细胞增殖。在 HT-29 结肠癌细胞中,AK-1 也调节 Snail-p21 轴 [3]。在缺氧环境下,AK-1 以 VHL 依赖的方式增强 HIF-1α 的泛素化,从而通过蛋白酶体途径触发 HIF-1α 的降解。在AK-1处理的细胞中,HIF-1α表达的下调降低了其转录活性,进而降低了HIF-1靶基因之一BNIP3的表达[4]。在表达突变亨廷顿蛋白片段(Htt171-82Q)的原代纹状体神经元中,用AK-1(1、2和4 μM)处理可剂量依赖性地挽救神经元活力,这通过NeuN阳性细胞计数来衡量。[1]
AK-1处理(2 μM,7天)显著减少了表达Htt171-82Q的原代纹状体神经元中突变亨廷顿蛋白包涵体的数量。 [1]
AK-1(2 μM,48 小时)处理原代纹状体神经元后,微阵列分析显示参与甾醇生物合成的基因显著下调,包括胆固醇合成途径中的多种酶。qPCR 证实了这一效应。[1]
AK-1(5 μM,48 小时)处理可显著降低表达 Htt171-82Q 的原代纹状体神经元以及未转导和表达 Htt171-18Q 的神经元中的甾醇(胆固醇和胆固醇酯)水平。[1]
AK-1(20 μM,1 小时)处理可降低原代纹状体神经元中甾醇调节元件结合蛋白 2 (SREBP-2) 的核转运,免疫细胞化学染色显示其活性降低。 [1]
AK-1 的神经保护作用可被野生型 SIRT2 的过表达所消除,证实了其靶向活性。[1]
体内研究 (In Vivo)
在亨廷顿病果蝇模型(所有神经元均表达Httex1 Q93)中,用添加了AK-1(10 μM)的培养基喂养果蝇7天,可显著提高感光神经元的存活率,这通过伪瞳孔技术进行评估。每个复眼小眼中存活的视杆细胞数量从5.2个增加到5.5个(P < 0.02)。[1]
在亨廷顿病秀丽隐杆线虫模型(触觉感受器神经元表达polyQ N端Htt)中,用AK-1(100 μM)处理48小时可显著挽救缺陷的触觉反应。这种改善仅限于表达突变polyQ的动物。[1]
细胞实验
原代纹状体神经元培养及存活率:将胚胎大鼠的原代纹状体神经元用表达Htt171-18Q或Htt171-82Q的慢病毒载体进行转导。转导后第3天开始,用不同浓度的AK-1(1、2、4 μM)处理神经元。转导后14天,固定细胞并用抗NeuN(神经元标记物)抗体染色。在每个处理条件下,计数多个视野中的NeuN阳性细胞数量,以评估神经元存活率。[1]
包涵体分析:用AK-1(2 μM)处理表达Htt171-82Q的原代纹状体神经元。用抗亨廷顿蛋白(EM48)抗体进行免疫染色,以观察包涵体。对含有包涵体的细胞数量进行定量。 [1]
基因表达分析(微阵列和qPCR):将原代纹状体神经元(未转导或表达Htt171-18Q/82Q)用AK-1(2 μM)处理48小时。提取总RNA并进行微阵列杂交。分析数据以鉴定差异表达基因和通路。部分基因变化通过定量实时PCR进行验证。[1]
甾醇测定:将原代纹状体神经元用AK-1(5 μM)处理48小时。提取细胞脂质,并使用酶法定量胆固醇和胆固醇酯的水平。[1]
SREBP-2核转运分析:将原代纹状体神经元用AK-1(20 μM)处理1小时。细胞经固定后进行内源性SREBP-2免疫染色,并用DAPI复染。通过显微镜观察确定SREBP-2主要定位于细胞核的细胞百分比。[1]
动物实验
果蝇*模型:** 将表达Httex1 Q93全神经元的刚羽化的果蝇喂食添加了AK-1 (10 μM) 或载体的标准培养基,持续7天。采用伪瞳孔技术评估神经退行性变,该技术通过计数每个复眼小眼中存活的视杆细胞(感光神经元)数量来评估。[1]
* ***秀丽隐杆线虫*模型:** 将触觉感受器神经元中表达polyQ N端Htt的线虫置于含有AK-1 (100 μM) 或载体的琼脂平板上培养48小时。通过用毛发轻轻抚摸线虫尾部并记录其反应来评估触觉反应。 [1]

果蝇模型:将表达Httex1 Q93全神经元的刚羽化的果蝇喂食添加了AK-1(10 μM)或载体的标准培养基,持续7天。采用伪瞳孔技术评估神经退行性变,该技术通过计数每个复眼小眼中存活的视杆细胞(感光神经元)数量来评估。[1]
秀丽隐杆线虫模型:将触觉感受器神经元中表达polyQ N-ter Htt的线虫置于含有AK-1(100 μM)或载体的琼脂平板上培养48小时。通过用毛发轻轻抚摸线虫尾部并记录其反应来评估触觉反应。[1]
参考文献

[1]. SIRT2 inhibition achieves neuroprotection by decreasing sterol biosynthesis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 27;107(17):7927-32.

[2]. AK-1, a SIRT2 inhibitor, destabilizes HIF-1α and diminishes its transcriptional activity during hypoxia. Cancer Lett. 2016 Apr 1;373(1):138-45.

[3]. SIRT2 inhibition achieves neuroprotection by decreasing sterol biosynthesis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 27;107(17):7927-32.

[4]. A Brain-Permeable Small Molecule Reduces Neuronal Cholesterol by Inhibiting Activity of Sirtuin 2 Deacetylase. ACS Chem Biol. 2011 Jun 17;6(6):540-6.

[5]. AK-1, a specific SIRT2 inhibitor, induces cell cycle arrest by downregulating Snail in HCT116 human colon carcinoma cells. Cancer Lett. 2015 Jan 28;356(2 Pt B):637-45.

其他信息
AK-1 是一种选择性强、结构多样的 SIRT2 小分子抑制剂。它此前已被鉴定和表征,作为寻找帕金森病神经保护化合物的研究的一部分。[1] 本研究表明,AK-1 在多种亨廷顿病模型中具有神经保护作用,包括果蝇、秀丽隐杆线虫和哺乳动物原代神经元。[1] AK-1 的神经保护机制与甾醇生物合成的下调有关。通过抑制 SIRT2,AK-1 减少了转录因子 SREBP-2 的核转运,导致胆固醇合成基因表达降低,细胞甾醇水平下降。这可以抵消突变亨廷顿蛋白引起的甾醇稳态失衡。 [1]
AK-1的神经保护作用已被证实具有靶向性,因为过表达野生型SIRT2会阻断其作用,而显性负性SIRT2突变体则能模拟其作用。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
403.12
CAS号
330461-64-8
PubChem CID
1341463
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.630
LogP
4.11
tPSA
120.68
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
650
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1=C([H])C([H])=C([H])C(C(N([H])C2C([H])=C([H])C([H])=C(C=2[H])[N+](=O)[O-])=O)=C1[H])(N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H])(=O)=O
InChi Key
HAYBKCHPEBZNGW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H21N3O5S/c23-19(20-16-8-6-9-17(14-16)22(24)25)15-7-5-10-18(13-15)28(26,27)21-11-3-1-2-4-12-21/h5-10,13-14H,1-4,11-12H2,(H,20,23)
化学名
3-(azepan-1-ylsulfonyl)-N-(3-nitrophenyl)benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 50 mg/mL (~123.93 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.20 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT03210740 COMPLETED Drug: AM001 Cream, 7.5%
Drug: Vehicle Cream
Actinic Keratosis AmDerma 2017-06-06 Phase 2
NCT06092346 RECRUITING AK1, OMIM *103000, Adenylate Kinase Deficiency
ADA2, OMIM *607575,Sneddon Syndrome; VAIHS
ADSL, OMIM *608222, Adenylosuccinate Lyase Deficiency
AICDA, OMIM *605257, Immunodeficiency With Hyper-IgM, Type 2; HIGM2
2023-12-19
NCT05865730 RECRUITING Other: Live Bacterial Product - Akkermansia muciniphila Carcinoma, Non-Small-Cell Lung
Carcinoma, Renal Cell
EverImmune 2022-10-01 Phase 2
生物数据图片
  • Neuroprotective effects of SIRT2 inhibitors in invertebrate models of HD. (A) AGK2 and AK-1 decrease the degeneration of light-sensing rhabdomeres in the Drosophila eye. *, P < 0.02 (for 10 μM AGK2 or AK-1, respectively). (B and C) Heterozygous and homozygous deletion of Sirt2 shows a dose-dependent reduction in the Drosophila model of HD. AK-1 (D) and AGK2 (E) rescued the defective touch response in C. elegans expressing polyQ N-ter Htt fused to CFP in touch receptor neurons. (*, P < 0.05).[1].Ruth Luthi-Carter, et al. SIRT2 inhibition achieves neuroprotection by decreasing sterol biosynthesis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 27;107(17):7927-32.
  • SIRT2 inhibition protects against Htt171-82Q toxicity in primary striatal neurons. (A) As shown previously, Htt171-82Q (black bar) exhibits toxicity toward striatal neurons as compared with Htt171-18Q (white bar). AK-1 rescued Htt171-82Q-expressing cells in a dose-dependent manner (at concentrations of 1, 2, and 4 μM) (A) and significantly reduced the number of mutant Htt positive inclusions (B). AGK2 also rescued striatal neurons from Htt171-82Q toxicity (C) and significantly reduced the number of inclusions (D). Overexpression of SIRT2WT abrogates neuroprotection by AK-1 (E). A lentiviral vector encoding CFP is used as a coinfection control. A dominant negative deacetylase mutant SIRT2H150Y significantly decreases Htt171-82Q toxicity in primary striatal neurons (F) and also significantly reduced the number of inclusions (G). A lentiviral vector encoding CFP is used as a coinfection control (* P < 0.05).[1].Ruth Luthi-Carter, et al. SIRT2 inhibition achieves neuroprotection by decreasing sterol biosynthesis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 27;107(17):7927-32.
  • Gene expression and metabolic effects of SIRT2 inhibition in neurons. (A) Multiple genes controlling sterol biosynthesis are down-regulated by AK-1 treatment. Scheme depicts enzymes in sterol biosynthesis whose RNAs are down-regulated by AK-1 treatment by the criterion of FDR P < 0.05. (The segment of the pathway between acetoacetate and cholesterol is shown.) Full analyses of the data, including statistical measures, fold-changes, and Gene Ontology analyses, are presented in Dataset S1 and S2. (B–D) SIRT2 inhibition reverses Htt171-82Q-mediated increase in sterols. (B) DMSO-treated neurons expressing Htt171-82Q had significantly higher sterol levels (cholesterol and cholesteryl esters) than those expressing either CFP or Htt171-18Q and this effect was reversed by treatment with AK-1, AGK2 (5 μM, 48 hrs) (C), and SIRT2H150Y (D) (*P < 0.05).[1].Ruth Luthi-Carter, et al. SIRT2 inhibition achieves neuroprotection by decreasing sterol biosynthesis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 27;107(17):7927-32.
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