ALW-II-41-27

别名: ALWII-41-27; ALW-II-41-27; ALW II-41-27; ALW II-4127; ALW-II-4127; ALWII-4127 N-[4-[(4-乙基-1-哌嗪基)甲基]-3-(三氟甲基)苯基]-4-甲基-3-[[[5-(2-噻吩基)-3-吡啶基]羰基]氨基]苯甲酰胺
目录号: V8240 纯度: ≥98%
ALW-II-41-27 是一种有效的 Eph 受体酪氨酸激酶抑制剂,对 Eph2 的 IC50 为 11 nM。
ALW-II-41-27 CAS号: 1186206-79-0
产品类别: Ephrin Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

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产品描述
ALW-II-41-27 是一种强效的 Eph 受体酪氨酸激酶抑制剂,对 Eph2 的 IC50 为 11 nM。ALW-II-41-27 通过抑制 EPHA2 抑制体内肿瘤生长,同时降低了厄洛替尼耐药肿瘤细胞的存活率和增殖能力。ALW-II-41-27 也有效降低了对第三代 EGFR TKI AZD9291 产生耐药性的细胞的活力。所有这些发现都表明 EPHA2 参与了 EGFR 突变、TKI 耐药肺癌细胞的存活,并提示 EPHA2 可能是这些肿瘤治疗干预的重要靶点。


ALW-II-41-27 是一种小分子酪氨酸激酶抑制剂,可有效抑制 EphA2 的功能。

在三阴性乳腺癌(TNBC)模型中,该抑制剂通过调节细胞周期调控因子来抑制肿瘤细胞增殖,降低c-Myc和细胞周期蛋白E2的水平,同时提高p27/KIP1的表达。该抑制剂在体外和体内均显示出疗效,包括在患者来源的异种移植模型中,且基于EphA2缺陷细胞的测试,其脱靶效应极小。
生物活性&实验参考方法
靶点
EphA2 (Kd = 12 nM)
EphA2 (receptor tyrosine kinase); RET (tyrosine kinase) - reported to inhibit RET in other models (REF 25).
体外研究 (In Vitro)
ALW-II-41-27 可抑制经 Tel 融合蛋白 EphA3、Kit、Fms、KDR、FLT1、FGR、Src、Lyn、Bmx 和 Bcr-Abl 转化的 Ba/F3 细胞,EC50 低于 500 nM。Bcr-Abl 和 ALW-II-41-27 之间存在交叉反应。 ALW-II-41-27 可抑制 b-raf、CSF1R、DDR1、DDR2、EphA2、EphA5、EphA8、EphB1、EphB2、EphB3、Frk、Kit、Lck、p38α、p38β、PDGFRα、PDGFRβ、Raf1 以及众多其他激酶,表明噻吩基团的引入可显著影响激酶选择性[1]。
ALW-II-41-27 在 MTT 实验中以剂量依赖的方式显著抑制 MDA-MB-231 细胞的生长,培养 72 小时后(参考文献 6a)。
与对照组相比,ALW-II-41-27 处理降低了 MDA-MB-231 细胞中 c-Myc 和细胞周期蛋白 E2 的水平,同时提高了 p27/KIP1 的水平(参考文献 6a)。 6b)。
ALW-II-41-27显著降低了MDA-MB-231细胞中酪氨酸588位点的EphA2磷酸化水平(参考文献6b)。
与NG-25对照组相比,ALW-II-41-27处理降低了野生型C3-TAg肿瘤细胞中c-Myc、P-Rb和cyclin E2的表达,并增强了p27/KIP1的表达(参考文献6d)。
ALW-II-41-27显著降低了野生型C3-TAg三维球状体培养物中的集落大小,模拟了EphA2缺陷的影响;对 EphA2 缺陷型 C3-TAg 细胞系的影响并不显著,表明脱靶效应极小(REF 6f, 6g)。
ALW-II-41-27 显著降低了 C3-TAg 细胞中 EphA2 的基础酪氨酸磷酸化和 ephrin-A1-Fc 诱导的酪氨酸磷酸化(REF 6e)。
体内研究 (In Vivo)
在两个独立的TNBC PDX细胞系(HCI-001和HCI-010)中,ALW-II-41-27治疗在治疗后3-5天内显著降低了肿瘤体积,且该效果持续至第7天(参考文献6i;S7a)。
接受ALW-II-41-27治疗的动物的肿瘤细胞增殖(Ki67)显著降低(参考文献6j;S7c),而细胞凋亡无变化(S7d,S7e)。
与对照组相比,ALW-II-41-27治疗的肿瘤组织切片中c-Myc蛋白表达降低,p27/KIP1蛋白表达升高(S7f)。
接受两剂ALW-II-41-27治疗的动物的PDX肿瘤裂解物(HCC-010)中EphA2磷酸化水平显著降低。对照处理动物(S7g)。
酶活实验
为了评估 EphA2 磷酸化:将 C3-TAg 细胞饥饿处理,然后在有或无 ALW-II-41-27 或 NG-25 对照的情况下,用 ephrin-A1-Fc (1 μg/ml) 刺激 0、15 和 30 分钟。使用抗 EphA2 抗体(C-20/SC-924 和 D7)从 500 μg 细胞裂解液中免疫沉淀 EphA2,然后用 A/G PLUS-琼脂糖珠进行分离。使用混合的 PY99 和 PY20 抗体检测免疫沉淀产物中的酪氨酸磷酸化以及 EphA2(参考文献 6e)。
为了在 PDX 肿瘤中验证靶点:对一组独立的 HCC-010 PDX 肿瘤荷瘤动物进行治疗,分别在 0 小时和 8 小时给予载体或 ALW-II-41-27 处理。在最后一次治疗后 1 小时收集肿瘤。制备肿瘤裂解液并进行 EphA2 免疫沉淀。用磷酸化 EphA2 (Tyr588) 抗体检测裂解液和免疫沉淀产物,然后剥离膜并重新用总 EphA2 (S7g) 抗体检测。
细胞实验
为了确定EPHA2的功能,将肌源性前体细胞在GM培养基中暴露于ALW-II-41-27(0.5 μM)12小时,之后进行肌源性分化。MTT生长实验:将MDA-MB-231和野生型C3-TAg肿瘤细胞在浓度递增(0.5-1 μM)的ALW-II-41-27存在下培养,并与对照NG-25进行比较。培养72小时后,通过MTT法评估细胞生长情况。将3×10^3个细胞接种于96孔板中,每个处理至少设置四个复孔,培养基为生长培养基。加入MTT试剂后,使用多功能酶标仪读取结果。细胞生长或存活率以对照细胞为基准进行标准化(参考文献 6a、6c)。
三维球状体培养:将野生型和 EphA2 缺陷型 C3-TAg 细胞在 Matrigel 基质上进行三维球状体培养 7 天,分别加入 1 μM ALW-II-41-27 或 NG-25 对照。使用 NIH Image J 软件在显微照片中测量集落大小(参考文献 6f、6g)。
免疫印迹分析:用 ALW-II-41-27 或 NG-25 对照处理细胞,收集细胞裂解物(25-50 μg),并使用针对 P-EphA2 Tyr588、c-Myc、p27/KIP1、cyclin E2、P-Rb 和 β-actin 的抗体进行免疫印迹分析。使用化学发光或 LI-COR Odyssey 检测系统检测信号(参考文献 6b、6d)。
C3-TAg 细胞中 EphA2 磷酸化测定:细胞饥饿后,在有或无 1 μM NG-25 或 ALW-II-41-27 的情况下,用 ephrin-A1-Fc (1 μg/ml) 刺激指定时间。对 EphA2 进行免疫沉淀,并用酪氨酸磷酸化探针检测沉淀产物(参考文献 6e)。
动物实验
PDX 研究:将 2 mm³ 冷冻保存的组织(HCI-001 和 HCI-010 TNBC 衍生细胞系)植入 3-4 周龄 NOD-SCID 受体雌性小鼠经手术清除的腹股沟乳腺脂肪垫中。待肿瘤植入并生长至至少 200 mm³ 后,随机分组,并腹腔注射载体对照或 15 mg/kg 的 ALW-II-41-27(溶于 10% 1-甲基-2-吡咯烷酮和 90% 聚乙二醇 300 的混合溶液中),每日两次,持续 1 周。每周测量肿瘤四次,并根据公式“体积 = 长 × 宽² × 0.52”计算肿瘤体积。治疗结束后,收集肿瘤并分析其增殖(Ki67)、凋亡(cleaved caspase 3)和微血管密度(CD31)(参考文献 6h-6j;S7)。
靶点验证的独立队列:将携带 HCC-010 PDX 肿瘤的动物分别在 0 小时和 8 小时接受载体或 ALW-II-41-27(15 mg/kg)治疗。在最后一次治疗后 1 小时收集肿瘤以验证 EphA2 靶向性(S7g)。
参考文献

[1]. Discovery and structural analysis of Eph receptor tyrosine kinase inhibitors. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2009), 19(15), 4467-4470.

[2]. Targeting EphA2 impairs cell cycle progression and growth of basal-like/triple-negative breast cancers. Oncogene. 2017 Jun 5.

其他信息
ALW-II-41-27(CAS#: 1186206-79-0)是一种 EphA2 的小分子酪氨酸激酶抑制剂。 Nathanael Gray 实验室之前的研究测试了 ALW-II-41-27 对 EphA2 激酶活性的亲和力和抑制作用,并将其与其他 Eph RTK 家族成员和其他激酶进行了比较,结果表明 ALW-II-41-27 对 EphA2 激酶活性具有显著的特异性(参考文献 22, 23)。
最近的一项研究报道,ALW-II-41-27 可抑制 RET 转化成纤维细胞、HEK293 细胞以及人甲状腺癌原发肿瘤细胞和细胞系中的 RET 酪氨酸激酶活性和功能(参考文献 25)。
作者在 EphA2 缺失模型(EphA2 缺陷型 C3-TAg 细胞)中测试了 ALW-II-41-27 的潜在脱靶效应,发现其对 EphA2 缺陷型细胞系的影响并不显著,表明该抑制剂的脱靶效应极小(参考文献)。 6f, 6g)。
ALW-II-41-27购自MedChem Express(参见材料和方法)。
此前研究表明,该抑制剂能有效抑制非小细胞肺癌模型中的EphA2功能(参见参考文献22, 23)。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H32F3N5O2S
分子量
607.6890
精确质量
607.223
元素分析
C, 63.25; H, 5.31; F, 9.38; N, 11.52; O, 5.27; S, 5.28
CAS号
1186206-79-0
相关CAS号
1186206-79-0
PubChem CID
42628503
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
7.423
tPSA
112.79
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
933
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S1C([H])=C([H])C([H])=C1C1C([H])=NC([H])=C(C=1[H])C(N([H])C1=C(C([H])([H])[H])C([H])=C([H])C(=C1[H])C(N([H])C1C([H])=C([H])C(=C(C(F)(F)F)C=1[H])C([H])([H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])([H])C1([H])[H])=O)=O
InChi Key
HYWXBDQAYLPMIX-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H32F3N5O2S/c1-3-39-10-12-40(13-11-39)20-23-8-9-26(17-27(23)32(33,34)35)37-30(41)22-7-6-21(2)28(16-22)38-31(42)25-15-24(18-36-19-25)29-5-4-14-43-29/h4-9,14-19H,3,10-13,20H2,1-2H3,(H,37,41)(H,38,42)
化学名
N-[5-[[4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoyl]-2-methylphenyl]-5-thiophen-2-ylpyridine-3-carboxamide
别名
ALWII-41-27; ALW-II-41-27; ALW II-41-27; ALW II-4127; ALW-II-4127; ALWII-4127
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~164.6 mM)
Ethanol: ~100 mg/mL (~164.6 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.11 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6456 mL 8.2279 mL 16.4558 mL
5 mM 0.3291 mL 1.6456 mL 3.2912 mL
10 mM 0.1646 mL 0.8228 mL 1.6456 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Pharmacologic inhibition of EphA2 recapitulates effects of genetic ablation. (a–c) MDA-MB-231 and wild-type (WT) C3-TAg tumor cells were grown in the presence of increasing concentrations of an EphA2 small molecule tyrosine kinase inhibitor ALW-II-41-27 (ALW) versus analog control and growth assessed by MTT assay after 72 h in culture. Oncogene . 2017 Oct 5;36(40):5620-5630.
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