AZ505 free base

别名: AZ-505 free base AZ-505 AZ505 AZ 505 N-环己基-3-(3,4-二氯苯乙基氨基)-N-[2-[[2-[5-羟基-3-氧代-3,4-二氢-2H-苯并[b][1,4]恶嗪-8-基]乙基]氨基]乙基]丙酰胺; N-环己基-3-(3,4-二氯苯乙基氨基)-N-[2-[[2-[5-羟基-3-氧代-3,4-二氢-2H-苯并[B][1,4]恶嗪-8-基]乙基]氨基]乙基]丙酰胺
目录号: V12012 纯度: ≥98%
AZ505 是一种有效且特异性的 SMYD2 抑制剂,IC50 为 0.12 μM。
AZ505 free base CAS号: 1035227-43-0
产品类别: SMYD
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
Other Sizes

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  • AZ-505 2TFA salt
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
AZ505 是一种有效且特异性的 SMYD2 抑制剂,IC50 为 0.12 μM。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
在体外,AZ505具有亚微摩尔剂量的作用,是一种高度选择性的药物。 AZ505 对 SMYD2 的 IC50 (0.12) 高于对其他甲基转移酶组 (IC50>83.3 μM)、DOT1L (IC50>83.3 μM) 和 EZH2 (IC50>83.3 μM) [1]。 AZ505 的 IC50 为 0.12 μM,使其成为强大的 SMYD2 缀合物。人类 SMYD(含 SET 和 MYND 结构域的蛋白)蛋白赖氨酸转移酶家族 (SMYD1-5) 有五个成员。此外,AZ505 不能抑制蛋白质赖氨酸甲基转移酶的酶活性。 Kd 为 0.5 μM 的 AZ505 被指定用于 ITC 结合研究。相比之下,p53 底物肽的预测 Kd 为 3.7 μM。 AZ505 与 SMYD2 的主要熵驱动结合通常意味着结合是通过邻近有限数量的不同氢键介导的 [2]。
参考文献

[1]. Overexpression of SMYD2 contributes to malignant outcome in gastric cancer. Br J Cancer. 2015 Jan 20;112(2):357-64.

[2]. Structural basis of substrate methylation and inhibition of SMYD2. Structure. 2011 Sep 7;19(9):1262-73.

[3]. Lysine methyltransferase SMYD2 promotes cyst growth in autosomal dominant polycystic kidney disease. J Clin Invest. 2017 Jun 30;127(7):2751-2764.

其他信息
AZ505 is a benzoxazine that is 2H-1,4-benzoxazin-3(4H)-one substituted by a hydroxy group at position 5 and a 2-{[2-(cyclohexyl{N-[2-(3,4-dichlorophenyl)ethyl]-beta-alanyl}amino)ethyl]amino}ethyl group at position 8. It is a potent and selective inhibitor of SMYD2. It has a role as an EC 2.1.1.354 ([histone H3]-lysine(4) N-trimethyltransferase) inhibitor and an antineoplastic agent. It is a dichlorobenzene, a tertiary carboxamide, a secondary amino compound, a benzoxazine and an organic hydroxy compound.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H38CL2N4O4
分子量
577.542425632477
精确质量
576.227
CAS号
1035227-43-0
相关CAS号
AZ505 ditrifluoroacetate;1035227-44-1
PubChem CID
24961094
外观&性状
Off-white to light brown solid powder
LogP
5.412
tPSA
106.42
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
772
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
LIBVHXXKHSODII-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H38Cl2N4O4/c30-23-8-6-20(18-24(23)31)10-13-32-15-12-27(38)35(22-4-2-1-3-5-22)17-16-33-14-11-21-7-9-25(36)28-29(21)39-19-26(37)34-28/h6-9,18,22,32-33,36H,1-5,10-17,19H2,(H,34,37)
化学名
N-cyclohexyl-3-((3,4-dichlorophenethyl)amino)-N-(2-((2-(5-hydroxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-benzo[b][1,4]oxazin-8-yl)ethyl)amino)ethyl)propanamide
别名
AZ-505 free base AZ-505 AZ505 AZ 505
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 250 mg/mL (~432.87 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 6.25 mg/mL (10.82 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 62.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 6.25 mg/mL (10.82 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 62.5mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 6.25 mg/mL (10.82 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 62.5 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7315 mL 8.6574 mL 17.3148 mL
5 mM 0.3463 mL 1.7315 mL 3.4630 mL
10 mM 0.1731 mL 0.8657 mL 1.7315 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • AZ505 treatment delayed cyst formation in Pkd1-knockout mice.(A) Histological examination of kidneys from Pkd1nl/nl mice injected daily with AZ505 or DMSO vehicle control from P7 to P27. Scale bar: 2 mm. (B) Percent cystic area relative to total kidney area of kidneys from Pkd1nl/nl mice treated with AZ505 (n = 12) or DMSO (n = 12). (C and D) Treatment with AZ505 compared with DMSO decreased KW/BW ratios (C) and BUN levels (D) in Pkd1nl/nl mice. (E) AZ505 treatment reduced cyst-lining epithelial cell proliferation in kidneys from Pkd1nl/nl mice, as detected with Ki67 staining. The percentage of Ki67-positive nuclei in cystic epithelial cells was calculated from an average of 1,000 nuclei per mouse kidney section. Scale bars: 100 μm. (F) AZ505 treatment induced cyst-lining epithelial cell death in kidneys from Pkd1nl/nl mice as detected by TUNEL assay. Scale bars: 100 μm. The images in E and F are also shown in Supplemental Figure 3, A and B.[3]. Lysine methyltransferase SMYD2 promotes cyst growth in autosomal dominant polycystic kidney disease. J Clin Invest. 2017 Jun 30;127(7):2751-2764.
  • Treatment with AZ505 delayed cyst growth in conditional Pkd1-knockout mice.(A) Schedule of the induction and treatment of Pkd1 inducible knockout mice. (B) Histological examination of kidneys from Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre mice injected daily with AZ505 or DMSO vehicle control from P42 to 6 months. Scale bar: 2 mm. (C) Percent cystic area relative to total kidney section area of kidneys from Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre mice treated with AZ505 (n = 14) or DMSO (n = 14). (D and E) Treatment with AZ505 compared with DMSO decreased KW/BW ratios (D) and BUN levels (E) in Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre mice. (F) AZ505 treatment reduced cyst-lining epithelial cell proliferation in kidneys from Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre mice as detected with Ki67 staining. Scale bars: 100 μm. (G) AZ505 treatment induced cyst-lining epithelial cell death in kidneys from Pkd1fl/fl:tamoxifen-Cre mice as detected by TUNEL assay. Scale bars: 100 μm. The images in F and G are also shown in Supplemental Figure 3, C and D.[3]. Lysine methyltransferase SMYD2 promotes cyst growth in autosomal dominant polycystic kidney disease. J Clin Invest. 2017 Jun 30;127(7):2751-2764.
  • (A) Western blot analysis of p-STAT3 and p-p65 expression from whole cell lysates of Pkd1 WT MEK and Pkd1-null MEK cells. The phosphorylation of STAT3 and p65 was increased in Pkd1-null MEK versus WT MEK cells, whereas the expression of STAT3 and p65 was almost at the same level in these cells. (B) Western blot analysis of the expression of SMYD2, p-STAT3, STAT3, p-p65, and p65 in kidneys from Pkd1+/+:Smyd2+/+:Ksp-Cre, Pkd1fl/fl:Smyd2+/+:Ksp-Cre, and Pkd1fl/fl:Smyd2fl/fl:Ksp-Cre neonates at P7. The expression of SMYD2 and the phosphorylation of STAT3 and p65 were increased in kidneys from Pkd1fl/fl:Smyd2+/+:Ksp-Cre compared with Pkd1+/+:Smyd2+/+:Ksp-Cre mice, whereas the expression of these 3 proteins was decreased in kidneys from Pkd1fl/fl:Smyd2fl/fl:Ksp-Cre compared with Pkd1fl/fl:Smyd2+/+:Ksp-Cre neonates. (C) Interactions between SMYD2 and STAT3 (top panel) as well as SMYD2 and p65 (bottom panel) in Pkd1 WT and Pkd1-null MEK cells were detected with anti-SMYD2 antibody and then blotted with STAT3 antibody (top panel) and p65 (bottom panel) antibody, respectively. IgG was used as a negative control. (D) Methylation of STAT3 and p65 was increased in Pkd1 WT MEK cells compared with Pkd1-null MEK cells. These cells were immunoprecipitated with anti-STAT3 antibody (top panel) and anti-p65 antibody (bottom panel), and then blotted with STAT3, p65, and pan–methyl lysine antibody, respectively. IgG was used as a negative control. (E) The level of methylated STAT3 and p65 was decreased in Pkd1-null MEK cells treated with AZ505 (2 hours) compared with that in cells treated with DMSO as examined with anti–pan–methyl lysine antibody after these proteins were pulled down with STAT3 and p65 antibodies.[3]. Lysine methyltransferase SMYD2 promotes cyst growth in autosomal dominant polycystic kidney disease. J Clin Invest. 2017 Jun 30;127(7):2751-2764.
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