BAM 7

别名: BAM 7; BAM7; BAM-7 3-甲基-1-(4-苯基-2-噻唑)-1H-吡唑-4,5-二酮 4-[2-(2-乙氧基苯基)肼酮]; 3-甲基-1-(4-苯基-2-噻唑基)-1H-吡唑-4,5-二酮 4-[2-(2-乙氧基苯基)腙]; 3-甲基-1-(4-苯基-2-噻唑基)-1H-吡唑-4,5-二酮4-(2-(2-乙氧基苯基)腙;BAM7
目录号: V8454 纯度: ≥98%
BAM 7 是一种 Bax 激活剂 (EC50 = 3.3 μM)。
BAM 7 CAS号: 331244-89-4
产品类别: Bcl-2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BAM 7 是一种 Bax 激活剂(EC50 = 3.3 μM)。BCL-2 家族蛋白是细胞凋亡通路的关键调控因子。为了维持细胞存活,抗凋亡成员会与促凋亡成员(例如 BAX)的 BCL-2 同源性 3 (BH3) 死亡结构域结合。为了成功地在癌症中重新激活细胞凋亡,抗凋亡蛋白的 BH3 结合槽已成为研究靶点。


BAM7(4-(2-(2-乙氧基苯基)腙基)-3-甲基-1-(4-苯基噻唑-2-基)-1H-吡唑-5(4H)-酮,分子量 405.5 Da)是一种通过计算机筛选发现的小分子,它能直接结合促凋亡蛋白 BAX 上的 BH3 触发位点。它选择性地与BAX结合于由α螺旋1和6形成的新型相互作用位点,诱导构象变化,进而导致BAX寡聚化、线粒体孔道形成以及BAX依赖性细胞凋亡。BAM7与抗凋亡的BCL-2家族蛋白(BCL-XL、MCL-1、BFL-1/A1)或BAK无显著结合,表明其对BAX具有极高的选择性。该化合物是首个针对促凋亡BCL-2家族成员的功能获得性激活剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
Bax (IC50 = 3.3 μM)
BAX (proapoptotic BCL-2 family member) – binds to the BH3 trigger site (α1-α6 groove) with IC50 = 3.3 μM (competitive fluorescence polarization assay against FITC-BIM SAHB); resynthesized BAM7 showed IC50 = 4.4 μM. No binding detected to BCL-XLΔC, MCL-1ΔNΔC, BFL-1/A1ΔC, or BAKΔC at up to 50 μM dosing.
体外研究 (In Vitro)
BAM7 直接结合 BAX N 端此前未被鉴定的 BH3 结合槽。在 BAX 的 N 端,BAM7 特异性识别该 BH3 结合槽。事实上,BAM7 与 BAX 表面 BIM BH3 螺旋激活 BAX 的区域直接相互作用。BAM7 可激活 BAX 的功能。BAM7 以剂量和时间依赖的方式诱导 BAX 从单体转变为寡聚体,当 BAX 与 BAM7 的剂量比为 1:8 时,该过程的动力学接近饱和。体外 BAX 寡聚化、BAX 介导的孔道形成以及 BAX 依赖性细胞死亡均由 BAM7 触发。BAM7 通过触发细胞内 BAX 激活的标志性特征,选择性地诱导 BAX 介导的细胞凋亡。 BAX介导的细胞凋亡的生化和形态学特征仅在含有BAX的细胞系中由BAM7诱导。[1]
BAM7 (10-40 μM) 可剂量和时间依赖性地诱导单体BAX (5 μM) 转化为寡聚体,这可通过尺寸排阻色谱法检测到;当BAX:BAM7比例为1:8时,寡聚化接近饱和。无活性的类似物ANA-BAM16和BAXK21E突变体几乎没有或完全没有作用。[1]
BAM7 (5-40 μM) 可剂量依赖性地触发BAX介导的脂质体中包裹的荧光团(ANTS/DPX)的释放,表明功能性孔道的形成;单独的BAX、单独的BAM7或BAX/ANA-BAM16或BAXK21E/BAM7的组合均无作用。 [1]
BAM7 (15 μM) 可诱导 Bak−/− MEF 细胞中 N 端 BAX 激活表位(6A7 抗体)的剂量依赖性暴露,这通过免疫沉淀法检测到。[1]
BAM7 (15 μM) 可引起 Bak−/− MEF 细胞中线粒体细胞色素 c 的剂量依赖性释放,这通过对上清液和沉淀组分进行蛋白质印迹分析得到证实。[1]
BAM7 (15 μM) 可诱导用 EGFP-BAX 重组的 Bax−/−Bak−/− MEF 细胞中 BAX 从胞质溶胶易位至线粒体,这通过共聚焦显微镜观察到。[1]
酶活实验
为了绘制直接结合曲线,首先将 FITC-BIM SAHB (50 nM) 与全长 BAX、BCL-XLΔC、MCL-1ΔNΔC、BFL-1/A1ΔC 或 BAKΔC 或 BAKC 的系列稀释液孵育,20 分钟后使用 SpectraMax M5 微孔板读数仪测量荧光偏振。对于竞争性结合实验,将小分子或乙酰化 BIM SAHB (Ac-BIM SAHB) 与 FITC-BIM SAHB (50 nM) 混合,然后加入重组蛋白,其浓度约为 EC75 值(BAX、BAKΔC:500 nM;BCL-XLΔC、MCL-1ΔNΔC、BFL-1/A1ΔC:200 nM),该浓度由直接结合实验确定。 IC50 值是通过 Prism 软件对竞争性结合曲线进行非线性回归分析确定的,分析前需进行 20 分钟的荧光偏振测量。
竞争性荧光偏振结合实验:将重组 BAX (50 nM) 与 FITC 标记的 BIM SAHB (10 nM) 和不同浓度的 BAM7 (0.01–100 μM) 在测定缓冲液(PBS,0.01% Tween-20,pH 7.4)中孵育。平衡后,在激发波长 485 nm 和发射波长 530 nm 处测量荧光偏振。IC50 值通过四参数逻辑方程的非线性回归计算得出。使用 FITC-BIM SAHB 和未标记的竞争物,对 BCL-XLΔC、MCL-1ΔNΔC、BFL-1/A1ΔC 和 BAKΔC 进行了类似的实验。 [1] 核磁共振结合分析:将均匀标记的15N全长BAX或BAXK21E(100 μM)在20 mM磷酸盐缓冲液(pH 6.5)、50 mM NaCl、1 mM DTT和10% D2O中用BAM7(0–200 μM)进行滴定。在600 MHz核磁共振波谱仪上于25°C下采集二维1H-15N HSQC谱图。绘制化学位移变化并与阈值进行比较。 [1]
尺寸排阻色谱寡聚化分析:将单体BAX(5 μM)与BAM7(10–40 μM)在25°C下孵育0–16小时,然后在用20 mM HEPES pH 7.2、150 mM NaCl平衡的Superdex 200柱上进行分离。通过280 nm处的吸光度和Western blot检测洗脱组分。[1]
脂质体释放分析:将由50% POPC、30% POPS和20%胆固醇组成的脂质体加载50 mM ANTS和20 mM DPX。将BAX(1 μM)与BAM7(5–40 μM)预孵育30分钟,然后加入脂质体(最终脂质浓度为50 μM)。监测荧光(激发波长 355 nm,发射波长 520 nm)随时间的变化;用 Triton X-100 测定最大释放量。[1]
细胞实验
将 MEF 细胞(每孔 2.5 × 10³ 个细胞)接种于 96 孔不透明板中,培养 18–24 小时后,在 37 °C 下,以 100 μL 的终体积,加入 BAM7、ANA-BAM16 或溶剂(0.15% (v/v) DMSO)的系列稀释液进行孵育。根据制造商的说明,在 24 小时后加入 CellTiter-Glo 试剂检测细胞活力,并使用 SpectraMax M5 微孔板读数仪测量发光值。至少进行三次重复的细胞活力检测,并将数据标准化至载体处理的对照孔。
细胞活力检测:将Bak−/−、Bax−/−和Bax−/−Bak−/− MEF细胞接种于96孔板(2.5×10³个细胞/孔),培养18-24小时,然后用系列稀释的BAM7(0-50 μM)或ANA-BAM16(0-50 μM)处理,培养基为含0.15% DMSO的DMEM,处理24小时。采用CellTiter-Glo发光法检测细胞活力。BAM7选择性地抑制Bak−/− MEF细胞的活力(呈剂量依赖性,浓度最高可达~15 μM),而对Bax−/−或Bax−/−Bak−/− MEF细胞无影响。ANA-BAM16无影响。在用野生型 BAX 或 BAXK21E 重组的 Bax−/−Bak−/− MEF 细胞中,BAM7 仅杀死表达野生型 BAX 的细胞。[1]
BAX 构象变化(6A7 免疫沉淀):将 Bak−/− MEF 细胞(5×10⁵ 个细胞)用 BAM7(0–15 μM)处理 6 小时,在 CHAPS 缓冲液中裂解,并用 6A7 抗体进行免疫沉淀。用 N20 抗 BAX 抗体进行 Western blot 分析,检测到活化的 BAX。 [1]
细胞色素c释放实验:将Bak−/− MEF细胞用BAM7(0–15 μM)处理15小时后,用洋地黄皂苷透化,分离上清液(胞质)和沉淀(线粒体)组分,并通过Western blot分析细胞色素c的表达。[1]
BAX易位实验:将Bax−/−Bak−/− MEF细胞转染EGFP-BAX(60%阳性),用BAM7(0–15 μM)处理24小时,用MitoTracker染色,并通过共聚焦显微镜成像。定量分析线粒体BAX定位的细胞百分比。 [1]
活细胞形态学:用BAM7(15 μM)处理Bak−/− MEF细胞,并拍摄延时图像以记录细胞凋亡形态(收缩、起泡)。[1]
参考文献

[1]. Direct and selective small-molecule activation of proapoptotic BAX. Nat Chem Biol. 2012 Jul;8(7):639-45.

其他信息
BAM7是一种首创的小分子直接激活剂,可激活促凋亡蛋白BAX。其作用机制涉及与BAX上一个新型的BH3触发位点(不同于抗凋亡蛋白的经典BH3结合槽)结合,诱导一系列变构变化,包括α1-α2环的位移、6A7表位的暴露、BH3结构域的动员以及C端α9螺旋的重排,最终导致BAX寡聚化和线粒体外膜通透性增加。BAM7对BAX具有高度选择性,优于BAK和抗凋亡蛋白BCL-2家族成员。该化合物可作为研究细胞凋亡中BAX直接激活的化学工具,并具有治疗凋亡阻滞型癌症的潜在应用价值。阴性对照试剂包括ANA-BAM16(一种具有间氯取代的结构类似物,不与BAX结合)和BAXK21E点突变体。 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H19N5O2S
分子量
405.476
精确质量
405.125
元素分析
C, 62.21; H, 4.72; N, 17.27; O, 7.89; S, 7.91
CAS号
331244-89-4
相关CAS号
331244-89-4
PubChem CID
3101542
外观&性状
Pink to red solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
567.3±52.0 °C at 760 mmHg
闪点
296.9±30.7 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.685
LogP
3.18
tPSA
107.42
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
649
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCOC1=CC=CC=C1N/N=C2C(C)=NN(C3=NC(C4=CC=CC=C4)=CS3)C\2=O
InChi Key
WRLVHADVOGFZOZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H19N5O2S/c1-3-28-18-12-8-7-11-16(18)23-24-19-14(2)25-26(20(19)27)21-22-17(13-29-21)15-9-5-4-6-10-15/h4-13,25H,3H2,1-2H3
化学名
4-[(2-ethoxyphenyl)diazenyl]-5-methyl-2-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)-1H-pyrazol-3-one
别名
BAM 7; BAM7; BAM-7
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 2~5 mg/mL (4.9~12.3 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.5 mg/mL (1.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 5.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4662 mL 12.3311 mL 24.6621 mL
5 mM 0.4932 mL 2.4662 mL 4.9324 mL
10 mM 0.2466 mL 1.2331 mL 2.4662 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • n silico screen for small-molecule binders of the BAX trigger site identifies BAM7. Nat Chem Biol . 2012 Jul;8(7):639-45.
  • BAM7 directly engages the BAX trigger site. Nat Chem Biol . 2012 Jul;8(7):639-45.
  • BAM7 triggers in vitro BAX oligomerization, BAX-mediated pore formation and BAX-dependent cell death. Nat Chem Biol . 2012 Jul;8(7):639-45.
  • BAM7 induces the biochemical and morphologic features of BAX-mediated apoptosis in Bak−/− MEFs. Nat Chem Biol . 2012 Jul;8(7):639-45.
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