| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Bromodomain of BRD9 (IC50 = 19 nM in Alpha assay; Kd = 15.4 nM by ITC).
Bromodomain of BRD7 (IC50 = 117 nM in Alpha assay; Kd = 60 nM by ITC). Bromodomain of CECR2 (Kd = 2.3 µM by ITC). The compound is inactive (>100 µM) against BET family bromodomains (BRD4-BD1, BRD4-BD2, BRD2-BD1). |
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| 体外研究 (In Vitro) |
BI-7273 的 IC50 和 Kd 分别为 19 和 0.75 nM,是一种细胞渗透性、选择性的 BRD9 抑制剂。它还对 BRD7 表现出强烈的影响,IC50 和 Kd 分别为 117 nM 和 0.3 nM。 BI-7273 的 Kd 值分别为 8.8 nM、210 nM、2600 nM 和 8600 nM,对一组激酶也具有轻微活性,包括 CECR2、BRPF1、BRD1、CREBBP、EP300、FALZ、TAF1(2) 和TAF1L(2)。 1000 nM、1200 nM、850 nM 和 10,000 nM。 U2OS 细胞系在 1 μM BI-7273 下表现出活性。 BI-7273 的 EC50 为 1400 nM,可抑制 EOL-1 细胞的生长[1]。
在测量化合物对乙酰化组蛋白H3与重组溴结构域结合的抑制作用的生化Alpha检测中,BI-7273对BRD9 (IC50 = 19 nM) 和BRD7 (IC50 = 117 nM) 显示出强效抑制,在浓度高达100 µM时对BRD4-BD1、BRD4-BD2或BRD2-BD1没有可测定的活性。 等温滴定量热法 (ITC) 证实了与BRD9溴结构域的高亲和力结合 (Kd = 15.4 nM)。它也与BRD7 (Kd = 60 nM) 和CECR2 (Kd = 2.3 µM) 结合。 在使用表达GFP-BRD9融合蛋白的U2OS细胞的细胞荧光漂白恢复 (FRAP) 实验中,BI-7273(在1 µM,测试的最低浓度下)显示出对BRD9溴结构域染色质结合的100%抑制。 BI-7273抑制人急性髓系嗜酸性白血病细胞系EOL-1的增殖,EC50为1400 nM。 在一组癌细胞系中,用BI-7273处理导致测试的相当大比例的急性髓系白血病 (AML) 细胞系出现选择性生长抑制。 BI-7273处理导致AML细胞系中MYC表达强效但部分抑制。 在小鼠白血病细胞中的结构域交换实验证明,BI-7273的抗增殖活性是通过其对BRD9溴结构域的作用介导的。 通过差示扫描荧光法 (DSF) 对48个溴结构域进行选择性分析,仅鉴定出BRD9、BRD7和CECR2是在10 µM时具有显著热位移的靶点。 在10 µM下的激酶谱分析显示对31种激酶的抑制低于40%。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
在使用注射了表达荧光素酶的EOL-1细胞的CIEA-NOG小鼠的AML播散性小鼠模型中,口服给予BI-7273 (180 mg/kg,每日一次) 显示出抗白血病活性。虽然正文中没有单独报告BI-7273的特定肿瘤生长抑制 (TGI) 数据(疗效图侧重于化合物2/BI-9564),但文章指出两种化合物都进行了体内概念验证探索,并且其药理学特性允许进行此类研究。
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| 酶活实验 |
Alpha (放大均相发光) 检测: 建立了一种生化检测法,用于测量化合物对生物素化乙酰化组蛋白H3(或H4)肽与GST标记的溴结构域(BRD9、BRD7、BRD4-BD1、BRD4-BD2、BRD2-BD1)结合的抑制作用。该检测使用链霉亲和素包被的供体珠和抗GST受体珠。当溴结构域结合的肽使珠子接近时,激光激发会产生信号。测试化合物与乙酰化肽竞争结合溴结构域,从而降低信号。生成剂量反应曲线以确定IC50值。
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| 细胞实验 |
荧光漂白恢复 (FRAP) 检测: 用编码与全长BRD9融合的绿色荧光蛋白 (GFP) 的质粒转染U2OS细胞。用化合物或DMSO对照处理细胞,同时使用组蛋白去乙酰化酶抑制剂SAHA提高信噪比。使用激光对细胞核的特定区域进行光漂白,并监测一段时间内荧光进入漂白区域的恢复情况,这取决于GFP-BRD9与染色质结合池的交换。化合物抑制溴结构域的乙酰赖氨酸结合功能会减少其染色质滞留,导致更快的荧光恢复。计算恢复半衰期并与对照组比较,以评估细胞靶点结合情况。
细胞增殖检测 (CellTiter-Glo): 将癌细胞系(例如EOL-1)接种在多孔板中,并用BI-7273的稀释系列处理规定时间(例如3-5天)。通过添加发光的细胞活力试剂 (CellTiter-Glo) 评估细胞活力/增殖,该试剂产生与ATP量成正比的信号,指示代谢活跃的细胞。测量发光强度,分析数据以计算EC50值。 |
| 动物实验 |
在播散性急性髓系白血病(AML)模型中进行体内疗效研究:将10^7个稳定表达荧光素酶的EOL-1急性髓系白血病细胞静脉注射到雌性CIEA-NOG免疫缺陷小鼠体内。注射后第5天开始治疗。小鼠每日口服给予赋形剂(0.5% Natrosol)或BI-7273(180 mg/kg)。通过生物发光成像定期监测肿瘤负荷。当疾病负荷超过预设等级时处死小鼠,并记录生存期。监测体重作为耐受性的指标。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
在 pH 6.8 时水溶性高。
预测小鼠、大鼠和人肝细胞的肝清除率 (CL) 为中等至高(以肝血流量 Qh 的百分比表示)。 小鼠、大鼠和人的血浆蛋白结合率均较低。 未观察到对主要细胞色素 P450 酶的显著抑制。 Caco-2 细胞渗透性试验显示吸收渗透性 (Papp, A-to-B) 为中等至高,但外排比率也升高。 小鼠药代动力学(单次给药):静脉推注 5 mg/kg 后,血浆清除率为中等,稳态分布容积 (Vss) 为中等。口服 20 mg/kg 后,测定了血浆浓度-时间曲线下面积 (AUC(0-last)) 和最大浓度 (Cmax),结果显示口服生物利用度高 (F > 95%)。口服180 mg/kg剂量后,药物暴露量(AUC)升高,但与剂量并非呈线性正比关系。 |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
在采用 U2OS 细胞进行的细胞 FRAP 检测中,在测试浓度下,用 BI-7273 处理 24 小时后未观察到化合物相关的毒性。
在小鼠体内疗效研究中,部分动物观察到的体重减轻主要归因于对照组肿瘤负荷增加,但也不能完全排除高剂量 (180 mg/kg) 下化合物相关的耐受性问题。未提供具体的器官毒性或致死剂量数据。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
BI-7273(化合物 1)是一种化学探针,旨在选择性抑制 SWI/SNF 染色质重塑复合物亚基 BRD9 的溴结构域。
它基于 2-甲基-2,7-萘啶-1-酮骨架,该骨架是通过片段筛选和虚拟筛选鉴定的。 该化合物的设计旨在避免 BET 家族抑制剂引起的多效性。 其分子量为 353.4 Da,具有良好的配体效率 (LE = 0.41) 和亲脂性配体效率 (LLE = 5.7)。 由于其良好的效力、选择性和 ADME/PK 特性,该化合物适用于体外和体内研究。 它已被用于模拟 BRD9 的基因扰动并研究其在急性髓系白血病 (AML) 中的功能。 |
| 分子式 |
C20H23N3O3
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|---|---|
| 分子量 |
353.4149
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| 精确质量 |
353.173
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| CAS号 |
1883429-21-7
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| 相关CAS号 |
1883429-21-7; 2305379-66-0 (BRD7-IN-1 free base)
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| PubChem CID |
118796358
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.2±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
509.2±50.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
261.8±30.1 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.3 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.590
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| LogP |
1.85
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| tPSA |
54.9
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
26
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| 分子复杂度/Complexity |
522
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
RBUYFHLQNPJMQM-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C20H23N3O3/c1-22(2)11-17-18(25-4)8-13(9-19(17)26-5)16-12-23(3)20(24)15-10-21-7-6-14(15)16/h6-10,12H,11H2,1-5H3
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| 化学名 |
4-(4-((dimethylamino)methyl)-3,5-dimethoxyphenyl)-2-methyl-2,7-naphthyridin-1(2H)-one
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| 别名 |
BI-7273; BI 7273; BI7273.
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~10 mg/mL (~28.30 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: 1 mg/mL (2.83 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8296 mL | 14.1479 mL | 28.2957 mL | |
| 5 mM | 0.5659 mL | 2.8296 mL | 5.6591 mL | |
| 10 mM | 0.2830 mL | 1.4148 mL | 2.8296 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。