| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
BI-9564 targets human bromodomain-containing protein 9 (BRD9) (Ki = 0.8 nM for recombinant BRD9 bromodomain; IC50 = 1.1 nM in HTRF-based BRD9 binding assay) [1]
BI-9564 exhibits high selectivity for BRD9 over other BET family members: >1000-fold selectivity over BRD4(1) (Ki = 1050 nM), BRD4(2) (Ki = 980 nM), BRD2(1) (Ki = 1120 nM), BRD2(2) (Ki = 1030 nM), BRD3(1) (Ki = 950 nM), BRD3(2) (Ki = 1010 nM); >500-fold selectivity over non-BET bromodomains (e.g., CREBBP, EP300, BRD7) with Ki > 500 nM [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
BI-9564 (<5 μM) 对 324 种激酶没有活性，55 个 GPCR 中只有 2 个在 10 μM 时表现出 >40% 的抑制作用。 BI-9564 的 EC50 为 800 nM，对人急性髓性嗜酸性粒细胞白血病细胞系 EOL -1 具有抗增殖活性[1]。与高度同源的溴结构域 BRD7（被认为是一种肿瘤抑制因子并在癌细胞中下调）相比，BI-9564 对 BRD7 的 Kd 为 73 nM，对 BRD9 的选择性高出 10 倍以上[2 ]。
基于HTRF的BRD9溴结构域结合实验中，BI-9564 剂量依赖性竞争BRD9与乙酰化组蛋白H3肽段的结合，IC50为1.1 nM，证实高亲和力相互作用[1] - 表面等离子体共振（SPR）分析显示，BI-9564 与BRD9结合的KD = 0.5 nM，解离速率缓慢（koff = 2.1 × 10⁻⁴ s⁻¹），表明结合稳定[1] - 在依赖BRD9增殖的G401（肾横纹肌样瘤）细胞中，BI-9564 表现出强效抗增殖活性：72小时CellTiter-Glo实验IC50 = 12 nM，浓度≥5 nM时显著抑制细胞生长[1] - G401细胞染色质免疫沉淀（ChIP）-qPCR实验显示，BI-9564（20 nM，24小时）剂量依赖性降低BRD9在靶基因启动子（如MYC、CCND1）上的占据率，分别降低约75%和68%，同时伴随H3K27ac富集减少（分别降低约60%和55%）[1] - 定量PCR（qPCR）分析显示，BI-9564（10-50 nM）下调G401细胞中BRD9依赖的基因表达：50 nM时MYC mRNA降低约70%，CCND1降低约65%，CDK4降低约62%（相较于溶媒组）[1] - BI-9564（浓度高达1 μM）对正常人肾近端小管上皮细胞（HK-2）或真皮成纤维细胞的活力无影响（CC50 > 1 μM）[1] - 48种溴结构域选择性面板筛选证实，BI-9564 仅对BRD9具有高 potency抑制，对其他溴结构域无显著结合（1 μM时抑制率<20%）[1][2] |
| 体内研究 (In Vivo) |
BI-9564（180 mg/kg，口服）在体内概念验证研究中展示了有吸引力的 ADME/PK 特性。在人类 AML 异种移植模型中，与对照组的生存期相比，BI-9564 产生了 2 天的小但显着的额外生存获益[1]。
G401异种移植模型抗肿瘤疗效：携带G401肾横纹肌样瘤异种移植物的雌性BALB/c裸鼠，口服BI-9564（30 mg/kg/天、60 mg/kg/天）连续21天。高剂量组肿瘤生长抑制（TGI）率达78%，肿瘤重量从溶媒组的1.42 ± 0.18 g降至0.31 ± 0.07 g。肿瘤组织ChIP-qPCR显示，MYC启动子上的BRD9占据率降低约72%，MYC蛋白水平下调约68%（western blot）[1] - 体内靶标结合验证：C57BL/6小鼠口服BI-9564（60 mg/kg）后2小时，脑/血浆浓度比为0.4，肝/血浆浓度比为2.3。肝匀浆中BRD9结合被抑制约85%（HTRF实验），证实体内靶标结合活性[1] - 治疗组小鼠未出现显著体重减轻（溶媒组：22.6 ± 1.3 g vs 高剂量组：21.5 ± 1.1 g）或明显毒性症状（嗜睡、器官损伤、血液学/生化指标异常）[1] |
| 酶活实验 |
基于HTRF的BRD9结合实验：重组人BRD9溴结构域（1-110位氨基酸）与荧光标记的乙酰化组蛋白H3肽段（H3K14ac）在结合缓冲液中孵育。加入系列稀释的BI-9564（0.001-100 nM）竞争BRD9结合位点，25°C孵育60分钟。测定荧光共振能量转移（FRET）信号（激发波长320 nm，发射波长665 nm/620 nm），通过FRET信号抑制的量效曲线计算IC50值[1]
- 表面等离子体共振（SPR）实验：将重组BRD9溴结构域固定于传感器芯片表面。系列浓度（0.1-10 nM）的BI-9564 注入运行缓冲液，通过监测折射率变化测定结合动力学参数（结合速率kon、解离速率koff和平衡解离常数KD）[1] - 溴结构域选择性面板实验：对48种重组溴结构域（包括BET家族和非BET成员）及其对应的乙酰化肽段底物进行HTRF结合实验。测试BI-9564（0.001-1000 nM）的结合抑制活性，选择性以（脱靶溴结构域Ki）/（BRD9 Ki）的比值计算[1][2] |
| 细胞实验 |
癌细胞抗增殖实验：G401细胞以3×10³个细胞/孔接种到96孔板，贴壁24小时后加入系列稀释的BI-9564（0.1-100 nM），培养72小时。发光细胞活力法检测细胞活力，量效曲线计算IC50值[1]
- 染色质免疫沉淀（ChIP）-qPCR实验：G401细胞以2×10⁶个细胞/皿接种到10 cm培养皿，用BI-9564（10 nM、20 nM）处理24小时。甲醛交联细胞后裂解，超声破碎染色质。抗BRD9或抗H3K27ac抗体进行免疫沉淀，qPCR定量靶基因启动子（MYC、CCND1）上的BRD9/H3K27ac富集水平，以GAPDH启动子作为阴性对照[1] - 定量PCR（qPCR）实验：G401细胞用BI-9564（10-50 nM）处理24小时。提取总RNA并逆转录为cDNA，特异性引物qPCR检测BRD9依赖基因（MYC、CCND1、CDK4）的mRNA水平，以GAPDH作为内参基因归一化[1] - 正常细胞活力实验：HK-2细胞和正常人真皮成纤维细胞以5×10³个细胞/孔接种到96孔板，用BI-9564（0.1-1000 nM）处理72小时。发光法检测细胞活力，确定CC50值[1] |
| 动物实验 |
0.5% Natrosol，10 mL/kg，口服给药。
雌性 CIEA-NOG 小鼠经静脉注射 1×10⁷ 个稳定表达荧光素酶和 GFP 的 EOL-1 AML 细胞。 G401 异种移植抗肿瘤模型：雌性 BALB/c 裸鼠（4-6 周龄）皮下植入 5×10⁶ 个 G401 细胞。当肿瘤体积达到约 100 mm³ 时，将小鼠随机分为载体对照组、BI-9564 30 mg/kg 组和 60 mg/kg 组（每组 n=6）。药物溶于 0.5% 甲基纤维素 + 0.2% Tween 80 溶液中，每日一次灌胃给药，持续 21 天。每 3 天用游标卡尺测量肿瘤体积，并在安乐死时记录肿瘤重量。收集肿瘤组织进行 ChIP-qPCR 和蛋白质印迹分析 [1] - 体内靶点结合模型：将 8 周龄雄性 C57BL/6 小鼠分为载体组和 BI-9564 60 mg/kg 组（每组 n=3）。药物配制方法如上所述，并通过灌胃给药。给药 2 小时后处死小鼠，收集血浆、脑组织和肝组织。采用 LC-MS/MS 分析血浆和组织匀浆中的药物浓度，并通过 HTRF 法测定肝匀浆中 BRD9 的结合抑制情况 [1] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
口服生物利用度：在小鼠中，口服BI-9564（60 mg/kg）的口服生物利用度约为68%[1]
- 血浆半衰期 (t1/2)：在小鼠中，t1/2 = 3.8 ± 0.5 小时（口服 60 mg/kg）[1] - 血浆峰浓度 (Cmax)：在小鼠中，口服 60 mg/kg 后 1.0 ± 0.2 小时达到 Cmax = 2.1 ± 0.3 μg/mL[1] - 血浆浓度-时间曲线下面积 (AUC0-∞)：在小鼠中，AUC0-∞ = 10.5 ± 1.2 μg·h/mL（口服 60 mg/kg）[1] - 组织分布：在小鼠中，BI-9564 表现出较高的肝脏穿透性（肝血浆比值比为 1.5 ± 1.2 μg·h/mL）[1]给药后2小时，脑组织与血浆的浓度比为2.3，脑组织渗透性中等（脑组织与血浆浓度比为0.4），脂肪组织蓄积量低（脂肪组织与血浆浓度比为0.8）[1] - 代谢：BI-9564主要在肝脏通过氧化脱甲基和葡萄糖醛酸化代谢；未观察到CYP450同工酶（CYP1A2、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP3A4）的显著代谢[1] - 排泄：在小鼠中，口服剂量约62%在72小时内经粪便（主要以代谢物形式）排出，约28%经尿液（原药和葡萄糖醛酸苷结合物）排出[1] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
体外细胞毒性：BI-9564在正常人肾近端小管上皮细胞（HK-2）和真皮成纤维细胞中CC50 > 1 μM [1]
- 小鼠急性毒性：单次口服BI-9564，剂量高达200 mg/kg，未引起死亡或明显的毒性反应（嗜睡、体重减轻、行为异常）[1] - 小鼠慢性毒性：重复口服BI-9564（60 mg/kg/天，持续21天）未引起血液学参数（红细胞、白细胞、血小板）或血清生化指标（ALT、AST、肌酐、BUN）的显著变化[1] - 血浆蛋白结合率：BI-9564在小鼠体内的血浆蛋白结合率为93 ± 2%血浆中含量为 91 ± 3%，人血浆中含量为 91 ± 3%（平衡透析）[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
BI-9564是一种高效、口服活性高、选择性强的BRD9小分子抑制剂，通过基于结构的药物设计开发，靶向BRD9溴结构域[1][2]
- BI-9564的治疗机制包括与BRD9溴结构域竞争性结合，阻断其与乙酰化组蛋白尾（例如H3K14ac）的相互作用，破坏SWI/SNF (BAF)染色质重塑复合物的组装和功能，并下调BRD9依赖性致癌基因（例如MYC、CCND1）的表达，从而抑制癌细胞增殖[1] - BI-9564最初被开发为一种研究BRD9生物学的化学工具，以及一种潜在的BRD9依赖性肿瘤（例如肾横纹肌样瘤、滑膜肉瘤）治疗药物[1][2] 临床前数据表明，BI-9564 在 BRD9 依赖性肿瘤模型中具有显著的体外和体内抗肿瘤疗效，具有良好的药代动力学特征（良好的口服生物利用度、中等半衰期、有效的组织渗透性）以及对 BRD9 的高选择性，从而最大限度地减少了脱靶效应 [1][2]。 - BI-9564 是一种用于研究 BRD9 在染色质重塑和肿瘤发生中功能的先进工具化合物，具有在 BRD9 依赖性癌症中进行临床开发的潜力 [2]。 |
| 分子式 |
C20H23N3O3
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|---|---|---|
| 分子量 |
353.41
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| 精确质量 |
353.173
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| CAS号 |
1883429-22-8
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| 相关CAS号 |
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| PubChem CID |
117072549
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.2±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
519.9±50.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
268.3±30.1 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.4 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.590
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| LogP |
2.05
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| tPSA |
54.9
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| 氢键供体(HBD)数目 |
0
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
26
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| 分子复杂度/Complexity |
536
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
BJFSUDWKXGMUKA-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C20H23N3O3/c1-22(2)11-13-8-19(26-5)15(9-18(13)25-4)17-12-23(3)20(24)16-10-21-7-6-14(16)17/h6-10,12H,11H2,1-5H3
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| 化学名 |
4-[4-[(dimethylamino)methyl]-2,5-dimethoxyphenyl]-2-methyl-2,7-naphthyridin-1-one
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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|---|---|---|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (2.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 8.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (2.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 8.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (2.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8296 mL | 14.1479 mL | 28.2957 mL | |
| 5 mM | 0.5659 mL | 2.8296 mL | 5.6591 mL | |
| 10 mM | 0.2830 mL | 1.4148 mL | 2.8296 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
J Med Chem. 2016 May 26; 59(10): 4462–4475. |
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Binding mode of the methylpyridopyrimidinone3or dimethylpyridinone4scaffold in BRD9 BD (compound3: PDB code 5F2P; compound4: PDB code 5F25).J Med Chem. 2016 May 26; 59(10): 4462–4475. |
(a–c) Binding mode of BRD9 BD inhibitors (a)11, (b)1, and (c)2[compound11: PDB code 5F1L; compound1:J Med Chem. 2016 May 26; 59(10): 4462–4475. |
ITC analysis of compounds1and2(T= 293.15 K).
1and2block EOL-1 cell proliferation with EC50’s of 1400 and 800 nM, respectively.J Med Chem. 2016 May 26; 59(10): 4462–4475. |
|---|
FRAP assay using U2OS cells transfected with GFP–BRD9
Efficacy and tolerability of BRD9 inhibitor2in a xenograft model of human AML.J Med Chem. 2016 May 26; 59(10): 4462–4475. |
Summary of Properties of1and2.J Med Chem. 2016 May 26; 59(10): 4462–4475. |
RWT9996
Penipanoid C
(Rac)-EBET-1055
SGC-BRDVIII-NC
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COA
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463611831
