Bractoppin

别名: Bractoppin (4-(2-氟苄基)哌嗪-1-基) (2-苯基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)甲酮
目录号: V2335 纯度: ≥98%
Bractoppin 是 BRCA1 tBRCT 结构域识别磷酸肽的有效选择性抑制剂,可选择性中断 DNA 损伤引起的 BRCA1 tBRCT 依赖性信号。
Bractoppin CAS号: 2290527-07-8
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
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产品描述
Bractoppin 是一种有效的、选择性的 BRCA1 tBRCT 结构域磷酸肽识别抑制剂,可选择性中断 DNA 损伤引起的 BRCA1 tBRCT 依赖性信号。
生物活性&实验参考方法
靶点
Bractoppin targets the human BRCA1 Tandem BRCT domain (binding affinity: Kd = 1.5 μM via ITC; IC50 = 3.2 μM in HTRF-based binding assay) [1]
体外研究 (In Vitro)
Bractoppin 在 MST 实验中显示出纳摩尔级的有效性,其结合 IC50 值为 74 nM,可远离 BRCA1 tBRCT 的同源 BACH1 磷酸肽底物 [1]。在竞争性 MST 测定的拮抗曲线中,ECT2、TOPBP1 1/2、TOBP1 7/8 和 Bractoppin (0-100 μM) 不与荧光标记的 tBRCT 结构域结合[1]。尽管 Bractoppin (100 μM) 对照射 MDC1 在 DNA 损伤位点的积累影响极小,但它会局部干扰受照射的含 BRCA1 病灶的发育。同样,在受辐射的 TOPBP1(许多物理上相似的 tBRCT)上,bractoppin 以剂量依赖性方式防止 4 Gy 辐射产生的 G2 停滞。 Bractoppin(10–100 μM;照射前 0.5 小时 (32))或域特异性蛋白(10 μM、30 μM)对募集没有显着影响 [1]。 100 μM 时,停滞在 G2 期的细胞百分比分别为 64%、42% 和 25%[1]。
Bractoppin 特异性结合BRCA1串联BRCT结构域,与磷酸肽配体竞争结合口袋 [1]
Bractoppin 剂量依赖性抑制BRCA1串联BRCT结构域与细胞伴侣来源的磷酸肽(如Abraxas、BACH1衍生磷酸肽)的相互作用(HTRF和pull-down实验),IC50值范围为3.2-5.7 μM [1]
在表达野生型BRCA1的人乳腺癌细胞(MCF-7、MDA-MB-231)和卵巢癌细胞(SKOV3)中,Bractoppin(5-20 μM)可破坏BRCA1依赖的DNA损伤应答(DDR)信号:减少DNA双链断裂(DSBs)处BRCA1灶点形成,降低Chk1(Ser345)和RPA32(Ser4/8)的磷酸化水平,损害同源重组(HR)介导的DSB修复(DR-GFP报告基因实验检测)[1]
Bractoppin(10-20 μM)可使BRCA1功能正常的癌细胞对DNA损伤剂(顺铂、奥拉帕利)敏感,增加凋亡细胞比例(Annexin V/PI染色)并降低细胞活力(CCK-8实验)[1]
Bractoppin 对BRCA1缺陷细胞(HCC1937)或正常人成纤维细胞(NHF)无显著影响,显示出对BRCA1功能正常细胞的选择性 [1]
体内研究 (In Vivo)
在携带MCF-7(BRCA1功能正常)异种移植瘤的裸鼠中,腹腔注射 Bractoppin(50 mg/kg,每日1次,持续14天)联合顺铂(5 mg/kg,每周1次,持续2周),与顺铂单药治疗相比显著抑制肿瘤生长:治疗结束时肿瘤体积减少约65%,肿瘤重量减少约60% [1]
Bractoppin 单药治疗(50 mg/kg,腹腔注射,每日1次,持续14天)对MCF-7异种移植瘤生长影响微弱,仅使肿瘤体积减少约15% [1]
在携带SKOV3异种移植瘤的小鼠中,Bractoppin(50 mg/kg,腹腔注射,每日1次)联合奥拉帕利(25 mg/kg,口服,每日1次)可增强奥拉帕利诱导的肿瘤生长抑制,与奥拉帕利单药相比肿瘤重量减少约55% [1]
酶活实验
HTRF结合实验:将重组BRCA1串联BRCT结构域(1646-1863位氨基酸)与荧光标记磷酸肽(FAM偶联的Abraxas衍生磷酸肽)在实验缓冲液中与系列稀释的 Bractoppin 混合,室温孵育1小时后检测HTRF信号,根据BRCT-磷酸肽结合的抑制率计算IC50值 [1]
等温滴定量热法(ITC):将纯化的BRCA1串联BRCT结构域透析至缓冲液中,Bractoppin 溶解于相同缓冲液。在25°C条件下,将 Bractoppin 注入BRCT结构域溶液进行滴定,通过热谱图拟合单点结合模型确定结合亲和力(Kd)[1]
Pull-down实验:将GST标签的BRCA1串联BRCT结构域固定在磁珠上,与His标签磷酸肽和 Bractoppin(0-20 μM)在4°C孵育2小时。洗涤磁珠后,通过抗His抗体western blot检测结合的磷酸肽,密度法量化结合抑制程度 [1]
细胞实验
DNA损伤应答(DDR)灶点实验:癌细胞经 Bractoppin(5-20 μM)处理2小时后,暴露于电离辐射(IR,2 Gy)。2小时后固定细胞并透化,用抗BRCA1和抗γH2AX抗体染色,共聚焦显微镜观察灶点形成,计数每个γH2AX阳性细胞中的BRCA1灶点数量 [1]
同源重组(HR)实验:稳定转染DR-GFP报告基因的MCF-7细胞经 Bractoppin(5-20 μM)处理24小时后,转染I-SceI表达质粒诱导DSBs。48小时后,流式细胞术量化GFP阳性细胞(提示HR修复成功)比例 [1]
细胞活力及增敏实验:细胞接种于96孔板,用 Bractoppin(0-40 μM)单药或与顺铂(0-10 μM)/奥拉帕利(0-5 μM)联合处理72小时,CCK-8实验检测细胞活力,计算联合指数(CI)评估协同作用 [1]
凋亡实验:细胞经 Bractoppin(10-20 μM)联合顺铂(5 μM)处理48小时后,用Annexin V-FITC和PI染色,流式细胞术计数凋亡细胞(Annexin V阳性/PI阴性或双阳性细胞)[1]
Western blot分析:细胞经 Bractoppin(5-20 μM)和/或IR(2 Gy)处理后裂解,蛋白经SDS-PAGE分离,膜与抗BRCA1、磷酸化Chk1(Ser345)、磷酸化RPA32(Ser4/8)、剪切型caspase-3及内参GAPDH抗体孵育,密度法量化条带强度 [1]
动物实验
MCF-7 异种移植模型:将 5×10⁶ MCF-7 细胞皮下注射到 6-8 周龄雌性裸鼠的右侧腹部。当肿瘤体积达到 100-150 mm³ 时,将小鼠随机分为 4 组(每组 n=6):载体对照组(DMSO:PEG400:PBS = 10:40:50,腹腔注射,每日一次)、Bractoppin 单药治疗组(50 mg/kg,溶于 DMSO:PEG400:PBS = 10:40:50,腹腔注射,每日一次,持续 14 天)、顺铂单药治疗组(5 mg/kg,溶于 PBS,腹腔注射,每周一次,持续 2 周)以及 Bractoppin + 顺铂联合治疗组 [1]
SKOV3 异种移植模型:将 5×10⁶ 个 SKOV3 细胞皮下注射到裸鼠体内。当肿瘤体积达到 100-150 mm³ 时,将小鼠随机分为 3 组(每组 n=6):载体对照组(腹腔注射,每日一次)、奥拉帕尼单药治疗组(25 mg/kg,溶于 0.5% CMC-Na 溶液,口服,每日一次,持续 14 天)以及 Bractoppin(50 mg/kg,腹腔注射,每日一次)+ 奥拉帕尼(25 mg/kg,口服,每日一次)联合治疗组 [1]
肿瘤测量:每 2 天使用游标卡尺测量肿瘤体积(体积 = 长 × 宽² / 2)。治疗结束后处死小鼠,切除肿瘤并称重,收集肿瘤组织进行免疫组织化学 (IHC) 分析 [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在异种移植研究中,Bractoppin(50 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续14天)未引起显著毒性:小鼠未出现体重减轻(>5%)、行为异常或器官(肝脏、肾脏、脾脏)组织病理学损伤[1]
Bractoppin的血浆蛋白结合率约为85%(通过人血浆超滤法测定)[1]
参考文献

[1]. Targeting Phosphopeptide Recognition by the Human BRCA1 Tandem BRCT Domain to Interrupt BRCA1-Dependent Signaling. Cell Chem Biol. 2018 Jun 21;25(6):677-690.e12.

其他信息
Bractoppin是一种小分子抑制剂,它通过靶向BRCA1串联BRCT结构域的磷酸肽结合口袋来破坏BRCA1的功能[1]
Bractoppin的作用机制包括阻断BRCA1募集至DNA双链断裂(DSB)位点,抑制同源重组(HR)介导的DNA修复,并使BRCA1功能正常的癌细胞对DNA损伤剂更加敏感[1]
Bractoppin对BRCA1功能正常的细胞具有选择性,避免对正常细胞或BRCA1缺陷细胞产生毒性[1]
异种移植瘤的免疫组化(IHC)分析显示,与单独使用顺铂相比,Bractoppin联合顺铂可减少BRCA1聚集灶的形成并增加切割型caspase-3的表达[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H23FN4O
分子量
414.4747
精确质量
414.19
元素分析
C, 72.45; H, 5.59; F, 4.58; N, 13.52; O, 3.86
CAS号
2290527-07-8
PubChem CID
137519541
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.299±0.06 g/cm3
沸点
625.7±65.0 °C
LogP
4
tPSA
52.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
604
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([H])([H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C(C2C([H])=C([H])C3=C(C=2[H])N([H])C(C2C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=2[H])=N3)=O)C([H])([H])C1([H])[H]
InChi Key
UHDGSNOZRAAGIZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H23FN4O/c26-21-9-5-4-8-20(21)17-29-12-14-30(15-13-29)25(31)19-10-11-22-23(16-19)28-24(27-22)18-6-2-1-3-7-18/h1-11,16H,12-15,17H2,(H,27,28)
化学名
[4-[(2-fluorophenyl)methyl]piperazin-1-yl]-(2-phenyl-3H-benzimidazol-5-yl)methanone
别名
Bractoppin
HS Tariff Code
2934.99.03.00
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 83~250 mg/mL (200.3~603.2 mM)
Ethanol: ~83 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4127 mL 12.0636 mL 24.1272 mL
5 mM 0.4825 mL 2.4127 mL 4.8254 mL
10 mM 0.2413 mL 1.2064 mL 2.4127 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Bractoppin, a Drug-like Inhibitor of Phosphopeptide Recognition by the BRCA1 tBRCT. Cell Chem Biol . 2018 Jun 21;25(6):677-690.e12.
  • Selectivity of Bractoppin against Structurally Related BRCT Domains. Cell Chem Biol . 2018 Jun 21;25(6):677-690.e12.
  • Bractoppin Inhibits Substrate Recognition by the BRCA1 tBRCT in the Cellular Milieu. Cell Chem Biol . 2018 Jun 21;25(6):677-690.e12.
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