| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
BRD9539 targets G9a (EHMT2) and PRC2 (polycomb repressive complex 2), which catalyze histone H3K9 and H3K27 methylation, respectively. It is selective for these enzymes over SUV39H1, NSD2, and DNMT1 up to a concentration of 40 µM.
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
在HeLa细胞中，BRD9539以剂量依赖的方式降低ATP水平[1]。与它的甲酯类似物BRD4770相比，BRD9539是一种更有效的生化抑制剂，在筛选剂量下，其G9a残余活性为20%，而BRD4770的残余活性为45%。与BRD4770不同，BRD9539在基于细胞的实验中表现不佳，这可能是由于其细胞渗透性降低所致。此外，在5或10 μM BRD9539存在的情况下，研究人员检测了100种激酶和16种与癌细胞生物学和细胞周期调控相关的染色质修饰酶的活性；在这些检测中均未检测到活性[1]。
BRD9539在无细胞实验中抑制G9a和PRC2的酶活性。在基于酶的实验中，它的效力高于相关化合物BRD4770。然而，在浓度为 5 和 10 µM 时，该化合物在基于细胞的检测中未显示任何活性。该化合物对 SUV39H1、NSD2 和 DNMT1 均无活性。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
BRD9539的体内活性数据有限。该化合物在浓度高达10 µM时缺乏细胞活性，表明其在体内应用中的效用可能受限，原因可能是细胞渗透性差或代谢迅速。需要进一步优化以开发具有细胞活性的类似物用于体内研究。
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| 酶活实验 |
用于检测 BRD9539 的无细胞组蛋白甲基转移酶活性的分析方法，采用纯化的重组 G9a 或 PRC2 酶以及组蛋白肽或核小体底物。甲基化反应在 SAM 存在下进行，并逐渐增加化合物的浓度。H3K9（针对 G9a）或 H3K27（针对 PRC2）的甲基化水平通过放射性或荧光检测进行定量。IC50 值由浓度-反应曲线确定。
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| 细胞实验 |
将细胞（例如癌细胞系）用浓度高达 10 µM 的 BRD9539 处理。通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测整体 H3K9me2 和 H3K27me3 水平。采用 qRT-PCR 分析基因表达变化。进行细胞增殖和活力检测以评估其功能后果。然而，在所测试的浓度下，BRD9539 在基于细胞的检测中未显示任何活性，这可能是由于细胞摄取率低所致。
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| 动物实验 |
目前尚未有关于BRD9539的体内动物研究报道。该化合物缺乏细胞活性，因此在未进行进一步化学优化以提高细胞渗透性和细胞靶点结合能力的情况下，不适用于体内应用。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
BRD9539的药代动力学性质尚未明确。作为一种中等分子量的小分子（分子量399.44，分子式C24H21N3O3），其较差的细胞活性提示其细胞渗透性可能有限。该化合物可能溶于DMSO。详细的药代动力学参数尚待确定。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
BRD9539的毒性数据有限。作为一种靶向组蛋白甲基转移酶的研究化合物，其开发需要进行标准的毒理学评估。该化合物对G9a和PRC2的选择性优于其他组蛋白甲基转移酶，表明其脱靶效应相对较好。然而，其缺乏细胞活性限制了其应用。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
BRD9539（分子式 C24H21N3O3，分子量 399.44）又名 2-(苯甲酰氨基)-1-(3-苯基丙基)-1H-苯并咪唑-5-羧酸。它对 G9a 和 PRC2 的选择性高于 SUV39H1、NSD2 和 DNMT1。虽然在酶活性测定中其效力高于 BRD4770，但它缺乏细胞活性。该化合物仅供研究使用。
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| 分子式 |
C24H21N3O3
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|---|---|
| 分子量 |
399.4418
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| 精确质量 |
399.158
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| CAS号 |
1374601-41-8
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| PubChem CID |
73755260
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.3±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
676.4±57.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
362.9±32.1 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±2.2 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.650
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| LogP |
5.82
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| tPSA |
84.2
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
7
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| 重原子数目 |
30
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| 分子复杂度/Complexity |
586
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
WPXMEOBILYVKBC-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C24H21N3O3/c28-22(18-11-5-2-6-12-18)26-24-25-20-16-19(23(29)30)13-14-21(20)27(24)15-7-10-17-8-3-1-4-9-17/h1-6,8-9,11-14,16H,7,10,15H2,(H,29,30)(H,25,26,28)
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| 化学名 |
2-benzamido-1-(3-phenylpropyl)benzimidazole-5-carboxylic acid
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~16.67 mg/mL (~41.73 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 1.67 mg/mL (4.18 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (4.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 16.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.5035 mL | 12.5175 mL | 25.0350 mL | |
| 5 mM | 0.5007 mL | 2.5035 mL | 5.0070 mL | |
| 10 mM | 0.2504 mL | 1.2518 mL | 2.5035 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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