BX-912

别名: BX 912; BX912; BX912 N-[3-[[5-溴-4-[[2-(1H-咪唑-5-基)乙基]氨基]-2-嘧啶基]氨基]苯基]-1-吡咯烷甲酰胺; BX-912
目录号: V0236
BX912 (BX-912) 是一种新型、有效、特异性的 PDK-1(磷酸肌醇依赖性激酶 1)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
BX-912 CAS号: 702674-56-4
产品类别: PDK-1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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产品描述
BX912 (BX-912) 是一种新型、有效、特异性的 PDK-1(磷酸肌醇依赖性激酶 1)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。在无细胞测定中,它对 PDK1 的选择性分别是 PKA 和 PKC 的 9 倍和 105 倍,并抑制 PDK-1,IC50 为 12 nM。通过特异性靶向 PDK1/Akt 信号通路,在体外表现出强大的抗增殖活性。该途径是抗癌药物的一个有前景的靶点,因为它对于癌细胞的生长、存活和血管生成至关重要。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDK-1 (IC50 = 2 nM); PKA (IC50 = 110 nM); KDR (IC50 = 410 nM); CDK2/CyclinE (IC50 = 650 nM); Chk1 (IC50 = 830 nM)
The target of BX-912 is 3-phosphoinositide-dependent kinase-1 (PDK1). For recombinant human PDK1, the half-maximal inhibitory concentration (IC50) of BX-912 is approximately 6 nM. BX-912 shows high selectivity for PDK1: it has no significant inhibitory activity against a panel of other kinases, including Akt1 (IC50 > 10 μM), PKCα (IC50 > 10 μM), PKA (IC50 > 10 μM), and ERK2 (IC50 > 10 μM), indicating minimal off-target effects [1]
体外研究 (In Vitro)
BX912 阻止 ChcK1、PKA、c-kit 和 KDR,IC50 分别为 0.83、0.11、0.85 和 0.41 μM。 BX912 抑制肿瘤细胞中的 PDK1/Akt 信号传导,并诱导细胞凋亡或抑制培养中的多种肿瘤细胞系(包括 PC-3 细胞)的贴壁依赖性生长。 PDK1/Akt 信号通路在细胞存活中的作用得到了以下事实的支持:许多 Akt 活性升高的癌细胞系(包括 MDA-468 乳腺癌细胞系)对 PDK1 抑制剂的生长抑制的敏感性提高了 30 倍以上软琼脂中的 BX912 比组织培养塑料中的 BX912 更重要,这对于未贴壁细胞尤其重要。在直接激酶测定形式中,BX912 有效抑制 PDK1 酶活性,但无法抑制预激活的 AKT2 活性 (IC50 > 10 μM)。因此,BX-912 是一种 PDK1 直接抑制剂。 BX912 可能与 PDK1 的 ATP 结合袋结合,因为它抑制该酶以竞争性方式使用其底物 ATP 的能力。 BX912 的氨基嘧啶主链在 PDK1 的活性位点采用类似的方向。 BX912 促进具有 4 N DNA 含量的 MDA-468 细胞群显着增加,表明细胞周期的 G2/M 期受阻。 BX912 还可有效抑制软琼脂中 HCT-116 细胞的生长,在 1 μM 剂量下显示出 96% 的抑制效果。 BX912 有效抑制软琼脂中 PC-3 细胞的生长,IC50 为 0.32 μM。 [1]
1. PDK1酶活性抑制:使用纯化的重组人PDK1进行的体外实验显示,BX-912可剂量依赖性抑制PDK1介导的其特异性底物肽(PDKtide,序列:H-His-Arg-Ser-Gly-Arg-Thr-Ser-Phe-Ser-Ala-Arg-Lys-OH)的磷酸化。通过8个浓度梯度(0.1 nM~100 nM)数据拟合的抑制曲线证实,其IC50约为6 nM,与靶点结合特异性一致[1]
2. 抑制癌细胞中PDK1下游信号通路:用BX-912(0.5 μM、2 μM、10 μM)处理HCT116结肠癌细胞4小时,Western blot检测显示,PDK1的关键下游底物Akt在Thr308位点的磷酸化水平呈浓度依赖性降低。具体而言,2 μM BX-912可抑制约70%的Akt Thr308磷酸化,而总Akt蛋白水平无变化。在HeLa宫颈癌细胞中观察到类似结果:1 μM BX-912处理6小时后,Akt Thr308磷酸化水平降低约50%[1]
3. 对癌细胞的抗增殖活性:采用MTT法评估细胞活力,BX-912对多种人癌细胞系表现出剂量依赖性抗增殖作用。对于HCT116结肠癌细胞,72小时增殖抑制的IC50约为2.1 μM;对于HeLa宫颈癌细胞,IC50约为3.3 μM;对于A549肺腺癌细胞,IC50约为4.5 μM。相反,即使在浓度高达10 μM时,BX-912对正常人包皮成纤维细胞(NHFF)的活力也无显著影响,表明其对癌细胞具有优先作用[1]
体内研究 (In Vivo)
不适用
酶活实验
在 PDK1 和偶联检测形式中,AKT2 由 PDK1 和 PtdIns-3,4-P2 激活。对于偶联测定,最终测定混合物 (60 μL) 含有:15 mM MOPS,pH 7.2,1 mg/mL 牛血清白蛋白,18 mM β-磷酸甘油,0.7 mM 二硫苏糖醇,3 mM EGTA,10 mM MgOAc,7.5 μM ATP、0.2 μCi [γ- 33P]ATP、7.5 μM 生物素化肽底物 (生物素-ARRRDGGGAQPFRPRAATF)、0.5 μL 含 PtdIns-3,4-P2 的磷脂囊泡、60 pg 纯化的重组人 PDK1 和 172 ng纯化的重组人 AKT2。在室温下孵育 2 小时后,在链霉亲和素包被的 SPA 珠上捕获 10 L 测定混合物中的生物素标记的肽。然后通过 Wallac MicroBeta 计数器中的闪烁接近度测量产物形成。添加的 PDK1 和无活性 AKT2 的量以及孵育时间决定了形成的产物的量。 PDK1 以次优水平添加,以便该测定可以灵敏地检测 AKT2 激活抑制剂以及 PDK1 或 AKT2 的直接抑制剂 BX912。为了直接测量 PDK1 活性,最终测定混合物 (60 μL) 含有 50 mM Tris-HCl,pH 7.5、0.1 mM EGTA、0.1 mM EDTA、0.1% β-巯基乙醇、1 mg/mL 牛血清白蛋白、10 mM MgOAc、 10 μM ATP、0.2 μCi 的 [γ-33P]ATP、7.5 μM 底物肽 (H2N-ARRRGVTTKTFCGT) 和 60 ng 纯化的重组人 PDK1。室温下 4 小时后,添加 25 mM EDTA,并将一些反应混合物点在 P81 磷酸纤维素纸上。用0.75%磷酸洗涤滤纸3次,用丙酮洗涤1次。磷成像仪用于测量干燥后与过滤器结合的标记肽。
1. 试剂制备:首先制备纯化的重组人PDK1(在Sf9昆虫细胞中表达,通过亲和层析纯化);配制含50 mM Tris-HCl(pH 7.5)、10 mM MgCl2、1 mM二硫苏糖醇(DTT)和0.1 mg/mL牛血清白蛋白(BSA)的反应缓冲液;将PDK1特异性底物肽(PDKtide)溶解于反应缓冲液中,终浓度为100 μM;向反应体系中加入[γ-32P]ATP(放射性ATP),终浓度为10 μM,比活度约为1000 cpm/pmol[1]
2. 实验设置:将BX-912用二甲基亚砜(DMSO)进行系列稀释,得到8个浓度梯度(0.1 nM、0.3 nM、1 nM、3 nM、10 nM、30 nM、100 nM、300 nM),并将每个稀释液加入反应缓冲液中,确保DMSO终浓度≤1%(此浓度对PDK1活性无影响)。向BX-912、PDKtide和[γ-32P]ATP的混合物中加入重组PDK1(终浓度2 nM)启动反应。设置空白对照(含DMSO但不含BX-912)和阳性对照(已知的非选择性激酶抑制剂)。每个反应在96孔板中做三重重复,将板在30°C下孵育30分钟[1]
3. 检测与数据分析:孵育后,取20 μL反应混合物点样到磷酸纤维素滤纸上。将滤纸用1%磷酸洗涤3次(每次5分钟)以去除未结合的[γ-32P]ATP,然后用丙酮漂洗1次并风干。使用液体闪烁计数器测量滤纸上的放射性。PDK1抑制率按以下公式计算:[(空白对照放射性-样品放射性)/空白对照放射性]×100%。通过将抑制率数据拟合到四参数逻辑回归模型中,确定IC50值[1]
细胞实验
MDA-468、MDA-453 等细胞以低密度(1.5-3 × 103 个细胞/孔,0.1 mL/孔,96 孔板)接种并孵育过夜。 BX912 处理是通过添加 10 μL/孔的化合物于 1% 二甲基亚砜和生长培养基(二甲基亚砜的终浓度为 0.1%)中,然后短暂摇动来进行的。孵育 72 小时后,将代谢染料 WST-1 添加到处理过的细胞中,以确定活力。通过从 WST-1 信号中减去无细胞或零时间细胞背景来计算净信号,该信号在酶标仪上在 450 nm 处读取。
1. 抗增殖实验(MTT法): - 细胞接种:将人癌细胞系(HCT116、HeLa、A549)和正常NHFF细胞用胰酶消化,重悬于完全培养基(含10%胎牛血清和1%青霉素-链霉素的DMEM)中。将细胞以每孔5×10³个细胞的密度接种到96孔板中,在37°C、5% CO₂条件下孵育24小时,使其贴壁[1]
- 药物处理:用完全培养基将BX-912稀释为8个浓度梯度(0.1 μM、0.3 μM、1 μM、3 μM、10 μM、30 μM、100 μM),DMSO终浓度≤1%。更换每孔中的培养基为100 μL稀释后的BX-912溶液,并设置溶剂对照(含1% DMSO的培养基)。每个浓度做三重重复,将板孵育72小时[1]
- 活力检测:孵育后,向每孔加入20 μL MTT溶液(5 mg/mL,溶于PBS),继续孵育4小时。小心吸去上清液,向每孔加入150 μL DMSO溶解甲瓒结晶。使用酶标仪测量570 nm处的吸光度。细胞活力百分比按(样品吸光度/溶剂对照吸光度)×100%计算,通过将活力数据拟合到逻辑模型中,获得抗增殖作用的IC50[1]
2. PDK1下游信号通路Western blot实验: - 细胞制备与处理:将HCT116或HeLa细胞以每孔2×10⁵个细胞的密度接种到6孔板中,在37°C、5% CO₂条件下培养至汇合度达70%-80%。更换培养基为含BX-912(浓度0.5 μM、2 μM、10 μM)的新鲜培养基(溶剂对照:含1% DMSO的培养基),将细胞孵育4-6小时[1]
- 蛋白提取与电泳:用冰预冷的PBS洗涤细胞2次,向每孔加入200 μL RIPA裂解缓冲液(添加蛋白酶和磷酸酶抑制剂)。在冰上刮取细胞,将裂解液在4°C下以12,000×g离心15分钟,收集上清液(总蛋白)。采用BCA法测定蛋白浓度。将等量蛋白(每泳道30 μg)通过10% SDS-PAGE分离,转移至PVDF膜上[1]
- 免疫检测:将PVDF膜用含5%脱脂牛奶的TBST封闭1小时(室温),然后在4°C下与抗磷酸化Akt(Thr308)、总Akt和β-肌动蛋白(内参)的一抗孵育过夜。用TBST洗涤膜3次后,与辣根过氧化物酶(HRP)偶联的二抗在室温下孵育1小时。再次洗涤膜后,使用增强化学发光(ECL)试剂显影蛋白条带。采用图像分析软件对条带强度进行定量,计算磷酸化Akt与总Akt的比值,以评估BX-912对PDK1下游信号通路的抑制作用[1]
动物实验
不适用;
参考文献

[1]. Novel small molecule inhibitors of 3-phosphoinositide-dependent kinase-1. J Biol Chem. 2005 May 20;280(20):19867-74.

其他信息
N-[3-[[5-溴-4-[2-(1H-咪唑-5-基)乙基氨基]-2-嘧啶基]氨基]苯基]-1-吡咯烷甲酰胺是脲类化合物。
1. BX-912是最早报道的PDK1选择性小分子抑制剂之一,旨在靶向PDK1的ATP结合口袋。 BX-912 通过与 ATP 竞争结合 PDK1 的催化结构域发挥抑制作用,从而阻断 PDK1 磷酸化并激活 PI3K-Akt 信号通路中的下游激酶(例如 Akt、PKC)的能力 [1]。
2. 在癌症研究中,BX-912 是一种有价值的工具化合物,可用于解析 PDK1 的生物学功能及其在 PI3K-Akt 信号通路失调的癌症(例如结肠癌、宫颈癌)进展中的作用。该化合物对 PDK1 的高选择性以及对癌细胞(与正常细胞相比)的优先抗增殖活性,支持其作为开发 PDK1 靶向抗癌药物的先导化合物的潜力,尽管它尚未进入临床开发阶段 [1]。
3. BX-912 的开发为验证 PDK1 作为治疗靶点提供了重要的实验工具。使用BX-912的研究表明,抑制PDK1可以有效抑制癌细胞中PI3K-Akt通路的激活,从而降低细胞增殖——证实了PDK1作为癌细胞存活和生长关键介质的作用[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H23BRN8O
分子量
471.35
精确质量
470.117
元素分析
C, 50.96; H, 4.92; Br, 16.95; N, 23.77; O, 3.39
CAS号
702674-56-4
相关CAS号
702674-56-4
PubChem CID
11754511
外观&性状
White solid powder
密度
1.6±0.1 g/cm3
折射率
1.750
LogP
1.38
tPSA
110.86
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
549
定义原子立体中心数目
0
SMILES
BrC1=C(NCCC2=CNC=N2)N=C(NC3=CC(NC(N4CCCC4)=O)=CC=C3)N=C1
InChi Key
DMMILYKXNCVKOJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H23BrN8O/c21-17-12-24-19(28-18(17)23-7-6-16-11-22-13-25-16)26-14-4-3-5-15(10-14)27-20(30)29-8-1-2-9-29/h3-5,10-13H,1-2,6-9H2,(H,22,25)(H,27,30)(H2,23,24,26,28)
化学名
N-(3-((4-((2-(1H-imidazol-4-yl)ethyl)amino)-5-bromopyrimidin-2-yl)amino)phenyl)pyrrolidine-1-carboxamide
别名
BX 912; BX912; BX912
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~94 mg/mL (~199.4 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: N/A
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (5.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 27.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (5.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 27.5mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (5.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 27.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 30% PEG400+0.5% Tween80+5% propylene glycol: 30mg/mL

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1216 mL 10.6078 mL 21.2157 mL
5 mM 0.4243 mL 2.1216 mL 4.2431 mL
10 mM 0.2122 mL 1.0608 mL 2.1216 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Fig. 1Compound structures for BX-795, BX-912, and BX-320. J Biol Chem . 2005 May 20;280(20):19867-74.
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