COMPOUND 401

别名: Compound 401; Compound401; Compound-401 2-吗啉基-4H-嘧啶并[2,1-a]异喹啉-4-酮;2-Morpholino-4H-pyrimido[2,1-a]isoquinolin-4-one 2-吗啉基-4H-嘧啶并[2,1-a]异喹啉-4-酮;复合401;化合物401;2-(吗啉-4-基)嘧啶并[2,1-a]异喹啉-4-酮
目录号: V3996 纯度: ≥98%
化合物 401 是一种有效的 DNA 依赖性蛋白激酶合成抑制剂 (DNA-PK,IC50= 0.28 μM),在体外也靶向 mTOR,但不靶向 PI3K。
COMPOUND 401 CAS号: 168425-64-7
产品类别: DNA-PK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
在体外,Compound 401 靶向 mTOR,但不靶向 PI3K,并且是 DNA 依赖性蛋白激酶的有效合成抑制剂(对于 DNA-PK,IC50 = 0.28 M)。为了测试 mTOR 抑制对细胞的影响而不混淆对 PI3K 的副作用,使用了化合物 401。当用 401 处理细胞时,mTOR-Rictor 和 mTOR-Rictor 复合物改变的 Akt Ser(473) 和核糖体蛋白 S6 激酶 1 Thr(389) 位点的磷酸化被阻止。相反,依赖于 PI3K 的 Akt Thr(308) 磷酸化并未被直接抑制。在缺乏 DNA-PK 的细胞中,也观察到了类似的结果。 TSC1+/+细胞对401具有抗性,但它抑制TSC1-/-成纤维细胞的增殖。与雷帕霉素相比,401 长期治疗不会增加 TSC1-/- 细胞中磷酸化 Akt Ser(473) 的水平。事实上,在 401 而不是雷帕霉素存在的情况下,细胞凋亡水平增加,这可能是由于 Akt 活性增加促进了存活。这些发现表明,mTOR 激酶抑制剂在预防 TSC 错构瘤和其他依赖于 mTOR 活性增加的肿瘤的发展方面可能比雷帕霉素更有效。许多人类肿瘤,例如与结节性硬化症 (TSC) 相关的错构瘤,都具有高度活跃的 mTOR 信号传导。 LY294002 是众多抑制 mTOR 激酶活性的小分子之一,同时还能在相当浓度下抑制磷脂酰肌醇 3-激酶 (PI3K)。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA-PK (IC50 = 0.28 μM); mTOR (IC50 = 5.3 μM)
Compound 401 is a potent inhibitor of DNA-PK (IC50=0.28 μM). Compound 401 reportedly performs poorly in vitro as an inhibitor of PI3K, ATM, and ATR but is effective against mTOR. mTOR is active against compound 401 (IC50=5.3 μM), but p110/p85 PI3K is not (IC50>100 μM). When cells are exposed to Compound 401, these sites—ribosomal protein S6 kinase 1 Thr389 and Akt Ser473—that have been altered by the mTOR-Rictor and mTOR-Raptor complexes are no longer phosphorylated. However, Akt Thr308 phosphorylation, which is PI3K-dependent, is not directly inhibited. Cells lacking DNA-PK show a similar pattern of behavior. Compound 401 inhibits endogenous or immunoprecipitated epitope-tagged mTOR in Raptor immunoprecipitates. At 5 μM or 10 μM, respectively, of compound 401, inhibition of 67% or 78% is obtained in both cases. Contrarily, dose response curves reveal that Compound 401 exhibits only modest inhibition of the p110α/p85α or p110β/p85α PI3K complexes at these concentrations. TSC1+/+ cells are resistant to Compound 401's proliferative inhibitory effects on TSC1-/- fibroblasts[1].
体外研究 (In Vitro)
化合物 401 是 DNA-PK 的有效抑制剂 (IC50=0.28 μM)。据报道,化合物 401 作为 PI3K、ATM 和 ATR 抑制剂在体外表现不佳,但对 mTOR 有效。 mTOR 对化合物 401 有活性 (IC50=5.3 μM),但 p110/p85 PI3K 没有活性 (IC50>100 μM)。当细胞暴露于化合物 401 时,这些已被 mTOR-Rictor 和 mTOR-Raptor 复合物改变的位点(核糖体蛋白 S6 激酶 1 Thr389 和 Akt Ser473)不再磷酸化。然而,PI3K 依赖性的 Akt Thr308 磷酸化不会被直接抑制。缺乏 DNA-PK 的细胞表现出类似的行为模式。化合物 401 抑制 Raptor 免疫沉淀物中的内源性或免疫沉淀表位标记的 mTOR。化合物401分别在5μM或10μM时,在两种情况下均获得67%或78%的抑制。相反,剂量反应曲线表明,化合物401在这些浓度下仅表现出对p110α/p85α或p110β/p85αPI3K复合物的适度抑制。 TSC1+/+ 细胞对化合物 401 对 TSC1-/- 成纤维细胞的增殖抑制作用具有抵抗力[1]。
COMPOUND 401 在体外实验中抑制免疫沉淀的表位标记mTOR或Raptor免疫沉淀物中的内源性mTOR。在5 µM浓度下抑制67%,在10 µM浓度下抑制78%[1]
COMPOUND 401 在浓度高达10 µM时对p110α/p85α或p110β/p85α PI3K复合物的抑制效果很弱,这与强效抑制剂LY294002不同[1]
COMPOUND 401 (25 µM) 对p110α/p85α PI3K复合物中p85α亚基的自磷酸化没有影响[1]
针对40种蛋白激酶的选择性筛选显示,大多数激酶在5 µM COMPOUND 401 作用下抑制率低于20%。显著的例外包括MAPKAPK2 (40%抑制)、Pim1 (44%抑制) 和 Aurora A (44%抑制)[1]
在用PDGF刺激的血清饥饿Rat-1成纤维细胞中,用COMPOUND 401 (1-10 µM)预处理以剂量依赖的方式降低了S6K1 Thr389 (mTORC1位点) 和Akt Ser473 (mTORC2位点) 的磷酸化。在10 µM时,抑制几乎完全。它不抑制PDGF诱导的Erk磷酸化[1]
COMPOUND 401 (10 µM) 抑制了Rat-1细胞中苯肾上腺素诱导的S6K1 Thr389磷酸化,该通路不依赖于PI3K活性[1]
COMPOUND 401 抑制了转染了Akt磷酸化位点突变体的COS7细胞中胰岛素诱导的Akt Ser473磷酸化,但不抑制Thr308磷酸化,表明它不抑制PDK1[1]
在缺乏DNA-PK的M059J胶质母细胞瘤细胞中,COMPOUND 401 (1-10 µM) 降低了IGF-1诱导的Akt Ser473和S6K1 Thr389磷酸化,证实其效应并非由于DNA-PK抑制[1]
用10 µM COMPOUND 401 长期处理(长达24小时)TSC1-/-小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs),阻断了S6K1 Thr389磷酸化并维持了低水平的Akt Ser473磷酸化,这与雷帕霉素不同,后者会增加Akt Ser473磷酸化[1]
COMPOUND 401 以剂量依赖的方式强烈抑制了TSC1-/- MEFs的增殖(半数最大效应浓度约2 µM)。在10 µM浓度下,处理1天后细胞数量减少54%,2天后减少84%。TSC1+/+ MEFs具有耐药性[1]
COMPOUND 401 的生长抑制作用并非由于普遍毒性(TSC1+/+ MEFs未受影响)或DNA-PK抑制(TSC1-/- MEFs对DNA-PK抑制剂AMA37具有耐药性)[1]
COMPOUND 401 (10 µM) 在处理24小时后,诱导TSC1-/- MEFs的凋亡显著增加(通过细胞质核小体水平测量),而雷帕霉素则没有[1]
酶活实验
使用 293fectin 将 AU1-mTOR 的 cDNA 转染 FreeStyle 293-F 细胞。两天后裂解细胞,并使用 AU1 抗体制备 mTOR 免疫沉淀物。 Raptor 抗体还可用于免疫沉淀未转染细胞中的 mTORC1 复合物。作为底物,细菌表达的谷胱甘肽 S-转移酶 (GST)-4E-BP1 用于测量在载体 (DMSO) 或化合物 401(1、5 和 10 M)存在下免疫沉淀物中的激酶活性。通过在 SDS 样品缓冲液中煮沸样品来停止激酶反应,然后对样品进行 SDS-PAGE。放射自显影可以识别磷酸化的 4E-BP1。闪烁计数用于测量带中的放射性[1]。
对于mTOR激酶实验,从转染的FreeStyle 293-F细胞中免疫沉淀AU1-mTOR,或使用Raptor抗体从未转染的细胞中免疫沉淀mTORC1复合物。在免疫沉淀物中的激酶活性在存在载体或化合物的情况下进行测定,使用细菌表达的GST-4E-BP1作为底物,反应体系中含有ATP。通过放射自显影检测磷酸化的4E-BP1,并通过液体闪烁计数进行定量[1]
对于PI3K脂质激酶实验,将载体或化合物在试管中干燥,用PI3K测定缓冲液重新溶解,并与酶(p110α/p85α 或 p110β/p85α 复合物)混合。通过添加超声处理的L-α-磷脂酰肌醇以及含有ATP和[γ-32P]ATP的反应混合液来启动激酶反应。孵育后,提取脂质,通过薄层色谱分离,放射性PI 3-磷酸斑点通过放射自显影观察并通过液体闪烁计数定量[1]
对于PI3K自磷酸化实验,将载体或化合物干燥,用自磷酸化缓冲液重新溶解,并与p110α/p85α PI3K混合。通过添加ATP和[γ-32P]ATP启动反应。孵育后,终止反应,通过SDS-PAGE和放射自显影分析样品以检测磷酸化的p85α[1]
细胞实验
对于信号通路分析,将细胞(Rat-1、COS7、M059J、MEFs)血清饥饿(通常过夜或20-22小时),然后用指定浓度的COMPOUND 401(溶解在DMSO中)或载体(DMSO)预孵育20分钟。然后用适当的激动剂(PDGF、苯肾上腺素、胰岛素、IGF-1)刺激细胞指定时间(5-20分钟)。用冷PBS洗涤细胞并裂解。取等量的澄清裂解液蛋白,通过SDS-PAGE和Western blotting分析,使用磷酸化特异性抗体(例如,抗磷酸化S6K1 Thr389、抗磷酸化Akt Ser473/Thr308)和总蛋白抗体。使用HRP标记的二抗和化学发光法检测信号[1]
对于增殖实验,将TSC1-/- 或 TSC1+/+ MEFs以每6厘米培养皿0.5 x 10^5个细胞的密度铺板。第二天,加入药物或载体(DMSO)。1或2天后,使用台盼蓝排除法计数活细胞[1]
对于凋亡实验,将TSC1-/- MEFs接种到96孔板中(每孔2000个细胞)。第二天加入药物或载体。24小时后,裂解细胞并使用商业酶联免疫吸附测定试剂盒定量细胞质部分的核小体含量[1]
参考文献

[1]. Inhibition of mammalian target of rapamycin signaling by 2-(morpholin-1-yl)pyrimido[2,1-alpha]isoquinolin-4-one. J Biol Chem. 2007 Aug 17;282(33):24463-70.

其他信息
化合物 401 是一种源自 LY294002 的合成小分子,最初设计为 DNA-PK 抑制剂,但也发现其能抑制 mTOR[1]。它是一种用于研究 mTOR 激酶抑制的工具化合物,避免了 PI3K 抑制带来的副作用[1]。与仅抑制 mTORC1 的雷帕霉素不同,化合物 401 能同时抑制 mTORC1(负责 S6K1 磷酸化)和 mTORC2(负责 Akt Ser473 磷酸化)复合物[1]。在 mTOR 信号过度激活的细胞(例如 TSC1 缺陷细胞)中,化合物 401 比雷帕霉素更能有效地抑制细胞增殖并诱导细胞凋亡,这可能是因为化合物 401 不会像雷帕霉素那样上调促生存的 Akt 活性。研究表明,mTOR激酶抑制剂(如化合物401)在治疗依赖于mTOR活性升高的增生性疾病(例如与结节性硬化症相关的肿瘤)方面,可能比雷帕霉素类似物更有效。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H15N3O2
分子量
281.32
精确质量
281.116
元素分析
C, 68.31; H, 5.37; N, 14.94; O, 11.37
CAS号
168425-64-7
相关CAS号
168425-64-7
PubChem CID
10039361
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
456.9±55.0 °C at 760 mmHg
熔点
214 °C
闪点
230.1±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.1 mmHg at 25°C
折射率
1.695
LogP
2.36
tPSA
46.84
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
21
分子复杂度/Complexity
532
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O1C([H])([H])C([H])([H])N(C2=C([H])C(N3C([H])=C([H])C4=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C4C3=N2)=O)C([H])([H])C1([H])[H]
InChi Key
BVRDQVRQVGRNHG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H15N3O2/c20-15-11-14(18-7-9-21-10-8-18)17-16-13-4-2-1-3-12(13)5-6-19(15)16/h1-6,11H,7-10H2
化学名
2-morpholin-4-ylpyrimido[2,1-a]isoquinolin-4-one
别名
Compound 401; Compound401; Compound-401
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ≥5 mg/mL
Water: N/A
Ethanol: N/A
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 1 mg/mL (3.55 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 1 mg/mL (3.55 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 1 mg/mL (3.55 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5547 mL 17.7734 mL 35.5467 mL
5 mM 0.7109 mL 3.5547 mL 7.1093 mL
10 mM 0.3555 mL 1.7773 mL 3.5547 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • COMPOUND 401

    Effect of compound 401 on mTOR and PI3K activitiesin vitro.2007 Aug 17;282(33):24463-70.

  • COMPOUND 401

    Selective inhibition of Akt Ser473phosphorylation by compound 401.2007 Aug 17;282(33):24463-70.

  • COMPOUND 401

    Effect of compound 401 on mTOR signaling in M059J glioblastoma cells.2007 Aug 17;282(33):24463-70.

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