DMX-5804

别名: DMX-5804; DMX 5804; DMX5804
目录号: V4271 纯度: ≥98%
DMX-5804 是一种新型、有效、口服生物活性和选择性 MAP4K4(丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶激酶 4)抑制剂,对人 MAP4K4 的 IC50 为 3 nM,apIC50 为 8.55,对 MINK1/MAP4K6 的效力较低(pIC50,8.18),并且TNIK/MAP4K7(pIC50,7.96)。
DMX-5804 CAS号: 2306178-56-1
产品类别: MAP4K
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
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250mg
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纯度: ≥98%

产品描述
DMX-5804 是一种新型、有效、口服生物活性和选择性 MAP4K4(丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶激酶 4)抑制剂,对人 MAP4K4 的 IC50 为 3 nM,pIC50 为 8.55,对 MINK1/MAP4K6 效力较低(pIC50,8.18)和 TNIK/MAP4K7(pIC50,7.96)。在小鼠中,DMX-5804 可减少缺血再灌注损伤并提高心肌细胞存活率。人类衰竭心脏和相关啮齿动物模型均激活蛋白激酶激酶激酶 MAP4K4 (MAP4K4)。我们利用人诱导多能干细胞来源的心肌细胞 (hiPSC-CM) 和基因沉默证明 MAP4K4 对于氧化应激诱导的死亡是必需的。
生物活性&实验参考方法
靶点
MAP4K4 (IC50 = 3 nM); MAP4K4 (pIC50 = 8.55); MINK1/MAP4K6 (pIC50 = 8.18); TNIK/MAP4K7 (pIC50 = 7.96); GCK/MAP4K2 (pIC50 = 6.50); KHS/MAP4K5 (pIC50 = 6.36); GLK/MAP4K3 (pIC50 = 4.95 nM); MLK1/MAP3K9 (pIC50 = 7.19); MLK3/MAP3K11 (pIC50 = 6.99); NUAK (pIC50 = 6.88); VEGFR (pIC50 = 5.72); ABL1 (pIC50 = 5.80 nM); Aurora B (pIC50 = 5.49 nM); FLT3 (pIC50 = 5.31); GSK3β (pIC50 = 4.66)
DMX-5804 exhibits great selectivity at MAP4K4 over other kinases, such as GCK/MAP4K2 (pIC50, 6.50), GLK/MAP4K3 (pIC50, 4.95), GSK3β (pIC50, 4.66), KHS/MAP4K5 (pIC50, 6.36), MLK1/MAP3K9 (pIC50, 7.19), MLK3/MAP3K11 (pIC50, 6.99), NUAK (pIC50, 6.88) and VEGFR (pIC50, 5.72), ABL1 (pIC50, 5.80), Aurora B (pIC50, 5.49), FLT3 (pIC50, 5.31)[1].
体外研究 (In Vitro)
与其他激酶相比,DMX-5804 对 MAP4K4 表现出极高的选择性,例如 GCK/MAP4K2 (pIC50, 6.50)、GLK/MAP4K3 (pIC50, 4.95)、GSK3β (pIC50, 4.66)、KHS/MAP4K5 (pIC50, 6.36)、MLK1/ MAP3K9 (pIC50, 7.19)、MLK3/MAP3K11 (pIC50, 6.99)、NUAK (pIC50, 6.88) 和 VEGFR (pIC50, 5.72)、ABL1 (pIC50, 5.80)、Aurora B (pIC50, 5.49)、FLT3 (pIC50, 5.31) )[1]。
DMX-5804 能保护人诱导多能干细胞来源的心肌细胞 (hiPSC-CMs) 免受氧化应激诱导的细胞死亡。在 vCor.4U 心室肌细胞中,10 µM 的 DMX-5804 对高达 200 µM H2O2 或 45 µM 甲萘醌诱导的细胞死亡提供了近乎完全的保护,此结果通过 CellTiter-Glo 活力检测和人心脏肌钙蛋白 I 释放实验证实。 [1]
在 iCell 心肌细胞中,针对 400 µM H2O2 诱导的细胞死亡,DMX-5804 的半最大效应浓度 (EC50) 为 500 nM,但该值取决于氧化应激的水平。即使在氧化应激刺激后1小时给予 DMX-5804,仍能观察到部分保护作用。 [1]
DMX-5804 (0.5-2 µM) 在经受亚致死剂量甲萘醌诱导的氧化应激的 hiPSC-CMs 中,能保护钙循环(峰值面积和峰值高度),且保护作用可持续长达96小时。 [1]
在浓度为10 µM时,DMX-5804 能将经甲萘醌处理的 hiPSC-CMs 的最大氧化能力(线粒体呼吸)提高5倍,并部分挽救细胞外酸化率(糖酵解功能)。 [1]
在由 vCor.4U 细胞构建的3D人工心脏组织中,10 µM 的 DMX-5804 能抑制甲萘醌在24小时内诱导的细胞死亡,并在处理后1小时和24小时完全挽救自发性搏动和收缩力产生。 [1]
DMX-5804 在2D或3D培养条件下,对 hiPSC-CMs 的活力、节律性、钙处理、线粒体功能或收缩力产生均未显示不良影响。 [1]
DMX-5804 对克隆的人源离子通道 hERG、hNaV1.5 和 hCaV1.2 无脱靶效应。 [1]
体内研究 (In Vivo)
在小鼠心肌缺血-再灌注损伤模型中,口服给予 DMX-5804 (50 mg/kg,两次,间隔10小时) 能显著减小梗死面积。当在缺血前20分钟开始给药时,梗死面积(占危险区域的百分比)从48.5%减少到20.9%。当在再灌注(损伤后)1小时开始给药时,梗死面积从55.1%减少到25.6%。 [1]
在损伤后治疗的研究中,通过 TUNEL 染色检测,DMX-5804 还将梗死区内部及邻近危险心肌中的心肌细胞凋亡分别抑制了39%和52%。 [1]
酶活实验
使用均相时间分辨荧光竞争性免疫分析法测定化合物对重组人 MAP4K4 激酶结构域的抑制活性。在该实验中,激酶反应产生 ADP,ADP 与染料标记的 ADP 示踪剂竞争结合铕穴状化合物标记的抗 ADP 抗体。信号通过测定665 nm和620 nm处的发射光比率来读取。反应在 ATP 处于其 Km 浓度 (10 µM)、MAP4K4 激酶结构域和生物素化髓鞘碱性蛋白底物存在下进行。抑制百分比是相对于含 DMSO 的对照反应(100%活性)和无酶反应(0%活性)计算的。通过绘制剂量反应曲线来确定 IC50 值。 [1]
针对包含 376 种人源激酶的 panel 评估了 DMX-5804 更广泛的激酶选择性谱。该化合物以其 MAP4K4 IC50 值的30倍浓度(即90 nM)进行测试。测定并报告了残留的激酶活性。 [1]
细胞实验
细胞活力与死亡: 将 hiPSC-CMs(iCell 或 vCor.4U 系)铺板于适当的维持培养基中。对于活力检测,在加入死亡诱导剂(H2O2 或甲萘醌)前1小时,用 DMX-5804(DMSO 中的系列稀释液,终浓度0.1% DMSO)处理细胞。24小时后,使用 CellTiter-Glo 发光法评估细胞活力,该方法通过量化 ATP 来反映活细胞数量。或者,通过使用 AlphaLISA 免疫分析法测量释放到培养基中的人心脏肌钙蛋白 I 来量化细胞死亡。在 iCell 心肌细胞中,也使用细胞不通透性染料 DRAQ7 在高内涵成像分析中评估膜完整性损失,并特异性分析通过 Myh6-RFP 报告基因识别的成功转导的 (GFP+) 心肌细胞。 [1]
钙循环: 用 DMX-5804 和甲萘醌处理 vCor.4U hiPSC-CMs。2-3小时后,用荧光钙指示剂染料加载细胞。使用荧光成像微孔板检测仪监测细胞内钙振荡。计算搏动频率、峰值高度、峰值宽度和总峰值面积等参数,并与对照组进行比较。 [1]
线粒体功能: 将 vCor.4U hiPSC-CMs 接种于专用板中。用 DMX-5804 和甲萘醌处理后,将培养基更换为不含碳酸氢盐的检测培养基。使用 Seahorse 细胞外通量分析仪实时测量耗氧率(OCR,线粒体呼吸指标)和细胞外酸化率(ECAR,糖酵解指标)。依次注入寡霉素(ATP合酶抑制剂)、FCCP(线粒体解偶联剂)以及抗霉素 A 和鱼藤酮的混合物(复合物 III 和 I 抑制剂)以评估线粒体功能的不同参数。 [1]
3D 人工心脏组织: 将 vCor.4U 心肌细胞与纤维蛋白原和凝血酶混合,注入包含柔性硅胶柱的模具中形成3D组织。成熟12天后,在存在或不存在 DMX-5804 的情况下用甲萘醌处理 hEHTs。评估细胞死亡。通过光学跟踪硅胶柱的偏转,并根据柱的尺寸和材料特性计算力,每天测量自发性收缩力。 [1]
细胞内的靶点结合: 为确认对内源性 MAP4K4 的抑制,用先导化合物 F1386-0303 (10 µM) 处理 HEK293T 细胞。1小时后,通过免疫复合物激酶实验测量内源性 MAP4K4 活性,显示70%的抑制。 [1]
动物实验
Myocardial Infarction Model in Mice: Female CD-1 mice (9-10 weeks old) were used. Under general anesthesia and mechanical ventilation, a left thoracotomy was performed. The left anterior descending coronary artery (LAD) was ligated for 45 minutes to induce ischemia, followed by release of the ligature to allow reperfusion. DMX-5804 was formulated in 1.5% Captisol (sulfobutylether-β-cyclodextrin) solution. Mice received two oral gavage doses of DMX-5804 (50 mg/kg), spaced 10 hours apart. In the "pre-injury" protocol, the first dose was given 20 minutes before LAD occlusion. In the "post-injury" protocol, the first dose was given 1 hour after the initiation of reperfusion. After 24 hours of reperfusion, infarct size was quantified. Mice were re-anesthetized, the LAD was re-occluded, and Evans blue dye was perfused to delineate the non-ischemic area. The heart was excised, sectioned, stained with triphenyltetrazolium chloride (TTC) to visualize viable (red) and infarcted (white) tissue within the area at risk (unstained by blue). Infarct size was expressed as a percentage of the area at risk. Apoptosis was assessed in separate heart sections by TUNEL staining co-labeled with an antibody against sarcomeric myosin to identify cardiomyocytes. [1]
Pharmacokinetics Study: For pharmacokinetic profiling, DMX-5804 was formulated similarly. Female CD-1 mice received a single oral dose (50 mg/kg). Blood samples were collected at multiple time points (e.g., 10 min, 30 min, 1 h, 2.5 h, 5 h, 10 h, 20 h) post-dose. Plasma concentrations of DMX-5804 were determined. [1]
Target Engagement In Vivo: Mice were orally dosed with DMX-5804. Hearts were harvested at various times or after different doses. Cardiac lysates were prepared and incubated with a desthiobiotin-ATP probe, which covalently labels active kinase ATP-binding sites. MAP4K4 was subsequently immunoprecipitated, and the level of probe labeling was assessed by western blot to measure the degree of target occupancy by the inhibitor. [1]
药代性质 (ADME/PK)
Following a single intravenous dose (1 mg/kg) in mice, DMX-5804 had a clearance (Cl) of 2.50 L hr⁻¹ kg⁻¹, a volume of distribution (Vd) of 1.22 L kg⁻¹, a half-life (t₁/₂) of 0.6 hours, and a peak plasma concentration (Cmax) of 1590 nM. [1]
Following a single oral dose (50 mg/kg) in mice, DMX-5804 had an area under the plasma concentration-time curve (AUC₀→∞) of 63733 nMhr, a Cmax of 13847 nM, a time to Cmax (Tmax) of 1 hour, and a half-life of 1.8 hours. [1]
Plasma concentrations of DMX-5804 were 334 nM and 8 nM at 1 and 10 hours, respectively, after a 50 mg/kg oral dose. A second dose at 10 hours maintained plasma levels above the in vitro EC50 for cardiomyocyte protection for nearly a full day. [1]
The oral bioavailability and plasma exposure (AUC and Cmax) of DMX-5804 were substantially improved (29.5-fold and 46.9-fold, respectively) compared to its predecessor compound F1386-0303. [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DMX-5804 showed no adverse effects on hiPSC-CM viability, contractility, calcium handling, or mitochondrial function at tested concentrations. [1]
DMX-5804 showed no significant inhibition of key cardiac ion channels (hERG, hNaV1.5, hCaV1.2) in electrophysiological safety screening. [1]
DMX-5804 was tested in an Ames genotoxicity reverse mutation assay using Salmonella typhimurium strains TA98 and TA100, with and without metabolic activation (S9). No mutagenic potential was observed at tested concentrations up to 250 µg/mL. [1]
DMX-5804 was screened against a panel of 44 off-target safety-related proteins (SafetyScreen44 panel). The only hit reported was activity against metallothionein 3. [1]
参考文献

[1]. MAP4K4 Inhibition Promotes Survival of Human Stem Cell-Derived Cardiomyocytes and Reduces Infarct Size In Vivo. Cell Stem Cell. 2019 Mar 1. pii: S1934-5909(19)30013-X.

其他信息
DMX-5804 (5-[4-(2-methoxy-ethoxy)-phenyl]-7-phenyl-3,7-dihydro-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-one) is a highly selective small-molecule inhibitor of MAP4K4, developed through pharmacophore modeling, virtual screening, and medicinal chemistry optimization from a lead compound F1386-0303. [1]
MAP4K4 is activated in failing human hearts and promotes cardiomyocyte death in response to oxidative stress, which is a hallmark of cardiac ischemia-reperfusion injury. [1]
This study utilized human iPSC-derived cardiomyocytes (hiPSC-CMs) as a critical human-relevant platform for target validation and drug discovery, highlighting their predictive value over traditional animal models alone for cardiac drug development. [1]
The protection conferred by MAP4K4 inhibition in hiPSC-CMs was comparable to that of the clinically effective beta-blocker metoprolol and superior to inhibition of the p38 MAPK pathway, which failed in clinical trials, suggesting the predictive fidelity of the hiPSC-CM model. [1]
The chemical series containing DMX-5804 provided valuable tool compounds for validation but was noted to have solubility and pharmacokinetic properties insufficient for direct development as an intravenous drug candidate for acute ischemic injury, though it supports the target's rationale for further drug development. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H19N3O3
分子量
361.393864870071
精确质量
361.14
元素分析
C, 69.79; H, 5.30; N, 11.63; O, 13.28
CAS号
2306178-56-1
相关CAS号
2306178-56-1
PubChem CID
137334091
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
LogP
2.9
tPSA
64.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
527
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
FUSHFOGORKZNNQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H19N3O3/c1-26-11-12-27-17-9-7-15(8-10-17)18-13-24(16-5-3-2-4-6-16)20-19(18)21(25)23-14-22-20/h2-10,13-14H,11-12H2,1H3,(H,22,23,25)
化学名
5-[4-(2-methoxyethoxy)phenyl]-7-phenyl-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-one
别名
DMX-5804; DMX 5804; DMX5804
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 72~125 mg/mL (199.2~345.9 mM)
Ethanol: ~1.5 mg/mL (~4.2 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.76 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.76 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.76 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7671 mL 13.8355 mL 27.6709 mL
5 mM 0.5534 mL 2.7671 mL 5.5342 mL
10 mM 0.2767 mL 1.3835 mL 2.7671 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • DMX-5804

    MAP4K4 Inhibition Promotes Survival of Human Stem Cell-Derived Cardiomyocytes and Reduces Infarct Size In Vivo.2019 Apr 4;24(4):579-591.e12.

  • DMX-5804

    Selective Small-Molecule Inhibitors of MAP4K4 Created by Field-Point Modeling and ScreeningIn Silico.2019 Apr 4;24(4):579-591.e12.

  • DMX-5804

    MAP4K4 Inhibition Reduces Infarct Size in Mice.2019 Apr 4;24(4):579-591.e12.

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