EZM2302 (GSK-3359088)

别名: EZM2302 GSK3359088EZM-2302 GSK-3359088EZM 2302 GSK 3359088
目录号: V20887
EZM 2302 是一种共激活剂相关精氨酸甲基转移酶 1 (CARM1) 制剂,IC50 为 6 nM。
EZM2302 (GSK-3359088) CAS号: 1628830-21-6
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
EZM 2302 是一种共激活剂相关精氨酸甲基转移酶 1 (CARM1) 制剂,IC50 为 6 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
CARM1 (IC50 = 6 nM)
体外研究 (In Vitro)
当与 CARM1 结合时,EZM 2302 对其他组蛋白甲基转移酶表现出广泛的选择性,同时选择性抑制 CARM1 活性 (IC50=6 nM)。将 EZM 2302 应用于 MM 细胞系可防止细胞停滞以及 PABP1 和 SMB 甲基化,IC50 值在纳摩尔范围内(分别为 9 和 31 nM)。 EZM 2302 在体外抑制许多造血细胞系;第 14 天时,15 个细胞系中有 9 个的 IC50 值低于 100 nM [1]。
体内研究 (In Vivo)
EZM 2302 在人肝细胞中表现出稳定性 (CL<3 mL/min/kg),并在小鼠、大鼠和人类中表现出与血浆蛋白的中等结合,平均未结合分数依次为 0.66、0.46 和 0.74。大鼠和小鼠的血浆清除率(CL)分别为91 mL/min/kg和43 mL/min/kg。在 RPMI-8226 异种移植模型中使用 21 天后,EZM 2302 显示出剂量依赖性暴露和肿瘤生长抑制 (TGI)。第 21 天,所有 EZM 2302 给药组的肿瘤发展均明显慢于媒介物 [1]。
酶活实验
组蛋白甲基转移酶测定[1]
如先前报道的组蛋白甲基转移酶PRMT1/6/865和PRMT558那样测量CARM1活性。简言之,在开始反应之前,将CARM1与化合物在室温下预孵育30分钟。最终测定条件为0.25 nM CARM1、30 nM 3H-S-腺苷甲硫氨酸(SAM)和250 nM生物素化肽,缓冲液含有20 mM联苯胺、1 mM三(2-羧乙基)膦、0.005%牛皮明胶和0.002%吐温-20,pH 7.5。通过添加300μM未标记的SAM来猝灭测定。通过Topcount读取器上的Flashplate测量产生的3H标记肽的量。更多的细节可以在补充方法中找到。[1]
蛋白质生产[1]
用于生物化学研究的FLAG-CARM1(氨基酸2-585)-His在293F哺乳动物细胞中表达,并使用FLAG亲和层析进行纯化。使用昆虫细胞生产用于x射线晶体学的His-TEV-CARM1(氨基酸134-479),并使用Ni亲和和尺寸排阻色谱进行纯化。详细方法见补充方法
X射线晶体学[1]
使用蒸汽扩散法生长CARM1(氨基酸134-479)的晶体,并将化合物浸泡在预先形成的晶体中。结晶和结构测定方法,包括数据收集和细化统计,可在补充方法和补充表S1中找到。结构已经与以下PDB代码一起存储在蛋白质数据库中:化合物2:6ARV;EZM2302:6ARJ.
细胞实验
体外复合治疗[1]
线性/对数期生长的培养细胞在2–20mL的培养基中分裂为2e5个细胞/mL的接种密度,这取决于生长期结束时所需的产量。将化合物在DMSO中稀释并以0.2%的最终DMSO浓度添加到每个培养容器中。使细胞生长96小时。在每个处理期结束时,通过离心(5分钟,1200rpm)收获细胞,并用PBS冲洗细胞颗粒一次,然后冷冻在干冰上等待进一步处理。
蛋白质印迹[1]
在含有0.1%SDS的1X RIPA缓冲液中,从细胞颗粒、快速冷冻的肿瘤异种移植物样品或外周组织制备裂解物。使用红外发射的第二抗体和ODYSSEY红外成像系统进行蛋白质印迹的定量。
体外增殖测定[1]
使用先前描述的方法进行长期(14-15天)细胞增殖测定,并根据每个细胞系的生长特性调整初始接种密度。有关6天的增殖研究,请参阅补充方法。
动物实验
体内异种移植研究[1]
本研究中所有与动物操作、护理和治疗相关的程序均按照上海康普顿生物技术有限公司机构动物护理和使用委员会(IACUC)批准的指南进行,并遵循实验动物评估和认证协会(AAALAC)的指导原则。实验方案已获得上海康普顿生物技术有限公司IACUC的批准。在体内疗效研究中,每个剂量组使用8只小鼠,每只小鼠均在右侧腹部皮下接种。所有细胞均悬浮于0.2 mL基础培养基和Matrigel(1:1)的混合物中,用于肿瘤生长。RPMI-8226细胞的接种量为5 × 10⁶个细胞/只小鼠,当平均肿瘤体积达到120 mm³(接种后28天)时开始治疗。CB-17 SCID小鼠采用随机区组设计分组。 EZM2302 或赋形剂(0.5% 甲基纤维素水溶液)以 37.5、75、150 或 300 mg/kg 的剂量,每日两次口服给药,持续 21 天。研究期间每周测量两次体重。使用游标卡尺每周两次测量肿瘤大小(二维),并以立方毫米表示体积。末次给药后 3 小时处死动物,采集血液和组织进行分析。
小鼠和大鼠药代动力学研究[1]
本研究中所有与动物操作、护理和治疗相关的程序均按照上海科友生物技术有限公司机构动物护理和使用委员会 (IACUC) 批准的指南进行,并遵循实验动物评估和认证协会 (AAALAC) 的指导。实验方案已获得上海科友生物技术有限公司 IACUC 的批准。雄性CD-1小鼠(每组n=9,每个时间点3只)和雄性Sprague-Dawley大鼠(n=3)分别接受单次静脉注射(iv)2 mg/kg和灌胃(po;仅限小鼠)10 mg/kg的EZM2302给药,药物配制于pH 3.5的5%葡萄糖溶液中。另取一组大鼠,在颈静脉和门静脉插管后,通过灌胃给药(10 mg/kg,溶于0.5%甲基纤维素溶液中)。在预设的时间间隔,分别通过眼眶后静脉(小鼠)、尾静脉(大鼠iv)或颈静脉和门静脉(大鼠po)采集约110 μL血液。将2小时采集的血液样本分成两份,分别用于平行测定血液和血浆中的药物浓度(离体比值)。血液样本采集于K2-EDTA抗凝管中,离心后获得血浆。蛋白质沉淀后,采用LC-MS/MS分析法测定EZM2302浓度,并使用Phoenix WinNonlin 6.2或更高版本软件进行数据分析。
ADME测定[1]
肝细胞稳定性、血浆蛋白结合率和细胞色素P450测定均采用标准方法进行。详细信息请参见补充方法。
参考文献

[1]. Identification of a CARM1 Inhibitor with Potent In Vitro and In Vivo Activity in Preclinical Models of Multiple Myeloma. Sci Rep. 2017 Dec 21;7(1):17993.

其他信息
CARM1 是一种精氨酸甲基转移酶,其底物包括多种组蛋白和非组蛋白,参与调控包括转录共激活和 RNA 加工在内的多种细胞过程。已有报道称 CARM1 在多种癌症类型中过表达,并且体外研究表明其能够调节致癌通路。由于缺乏选择性工具化合物,特别是用于体内研究的工具化合物,我们对 CARM1 在肿瘤发生中的作用机制的深入了解仍然有限。我们描述了我们所知的首个高效选择性 CARM1 抑制剂的鉴定和表征,该抑制剂在体外和体内均表现出抗增殖作用,并且据我们所知,首次证实了 CARM1 在多发性骨髓瘤 (MM) 中的作用。EZM2302 (GSK3359088) 在生化分析中表现出对 CARM1 酶活性的抑制作用 (IC50 = 6 nM),并且对其他组蛋白甲基转移酶具有广泛的选择性。用 EZM2302 处理 MM 细胞系可抑制 PABP1 和 SMB 甲基化,并导致细胞停滞,IC50 值在纳摩尔范围内。口服 EZM2302 可在体内剂量依赖性地抑制 CARM1,并在 MM 异种移植模型中表现出抗肿瘤活性。EZM2302 是一种经过验证的化学探针,适用于进一步了解 CARM1 在癌症和其他疾病中的生物学作用[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H37CLN6O5
分子量
585.094285726547
精确质量
584.251
元素分析
C, 59.53; H, 6.37; Cl, 6.06; N, 14.36; O, 13.67
CAS号
1628830-21-6
PubChem CID
90425581
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.4
tPSA
126
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
41
分子复杂度/Complexity
873
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC1=C(N=C(N=C1N2CC3(C2)CCN(CC3)C(=O)OC)C4=C(C=CC(=C4)OC[C@@H](CNC)O)Cl)C5=C(ON=C5C)C
InChi Key
OWCOTUVKROVONT-HXUWFJFHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H37ClN6O5/c1-17-25(24-18(2)34-41-19(24)3)32-26(22-12-21(6-7-23(22)30)40-14-20(37)13-31-4)33-27(17)36-15-29(16-36)8-10-35(11-9-29)28(38)39-5/h6-7,12,20,31,37H,8-11,13-16H2,1-5H3/t20-/m1/s1
化学名
Methyl (R)-2-(2-(2-chloro-5-(2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy)phenyl)-6-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl)-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate
别名
EZM2302 GSK3359088EZM-2302 GSK-3359088EZM 2302 GSK 3359088
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~170.91 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.27 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.56 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.56 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7091 mL 8.5457 mL 17.0914 mL
5 mM 0.3418 mL 1.7091 mL 3.4183 mL
10 mM 0.1709 mL 0.8546 mL 1.7091 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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