FIT-039

别名: FIT-039; KP1115; FIT039; KP-1115; FIT 039; KP 1115 N-[5-氟-2-(1-哌啶基)苯基]-4-吡啶硫代甲酰胺; N-(5-氟-2-(哌啶-1-基)苯基)吡啶-4-碳硫酰胺
目录号: V41638 纯度: ≥98%
FIT-039 (FIT039) 是一种口服、选择性、ATP 竞争性 CDK9(细胞周期蛋白依赖性激酶 9)抑制剂,具有抗病毒活性。
FIT-039 CAS号: 1113044-49-7
产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
25mg
50mg
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产品描述
FIT-039 (FIT039) 是一种口服、选择性、ATP 竞争性 CDK9(细胞周期蛋白依赖性激酶 9)抑制剂,具有抗病毒活性。FIT-039 可抑制 HSV-1、HSV-2、人腺病毒和人 CMV 的复制(IC50 为 0.69 μM)。FIT-039 是一种有前景的抗病毒药物,可用于抑制耐药性 HSV 和其他 DNA 病毒。
FIT-039 是一种选择性、ATP 竞争性、口服有效的细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (CDK9) 抑制剂。其分子量为 315.41 g/mol,分子式为 C17H18FN3S,CAS 编号为 1113044-49-7。FIT-039 是一种有前景的抗病毒药物,可通过抑制 mRNA 转录来抑制多种 DNA 病毒的复制。它呈浅黄色至黄色固体状。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK9/cyclinT1 (IC50 = 5.8 μM); HSV-1 (IC50 = 0.69 μM); HSV-2; CMV
FIT-039 targets CDK9, which forms a complex with cyclin T1 to constitute the positive transcription elongation factor b (P-TEFb). It inhibits CDK9/cyclin T1 with an IC50 of 5.8 µM. By inhibiting CDK9, FIT-039 blocks phosphorylation of the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II, thereby suppressing mRNA transcription of viral genes.
体外研究 (In Vitro)
与flavopiridol相比,FIT-039(30 μM;3小时;HEK293细胞)处理可降低感染或未感染细胞中磷酸化CTD的含量。使用FIT-039后,HSV-1即刻早期基因(IEGs)以及早期和晚期基因的表达水平均降低[1]。
FIT-039对HSV-1基因组的复制能力具有剂量依赖性效应(EC50和EC80分别为0.69 μM和4.0 μM)[1]。
FIT-039可有效抑制332种激酶中的8种激酶,CDK9除外:GSK3β、PKN1、haspin、p70s6K、DYRK1B、GSK3α、IRR和DYRK3。许多病毒的复制都依赖于这些激酶[1]。
体外实验表明,FIT-039 以 5.8 µM 的 IC50 值抑制 CDK9/cyclin T1 复合物。它以剂量依赖的方式抑制 HSV-1 基因组的复制,EC50 和 EC80 值分别为 0.69 µM 和 4.0 µM。FIT-039(30 µM;3 小时;HEK293 细胞)可降低感染或未感染细胞中磷酸化 CTD 的水平。它还能降低 HSV-1 即刻早期基因以及早期和晚期基因的表达水平。此外,该化合物还能抑制 HSV-2、人腺病毒、人巨细胞病毒 (CMV)、乙型肝炎病毒 (HBV) 和 HIV-1 的复制。
体内研究 (In Vivo)
每日两次使用FIT-039软膏治疗,可剂量依赖性地预防皮肤损伤,并挽救注射了HSV-1的雄性BALB/c小鼠的生命。使用5%至10%的FIT-039软膏观察病灶愈合情况,并在第10天使用5%的苹果醋软膏观察带状疱疹样扩散的完全消退[1]。
小鼠连续14天接受过量FIT-039(1000 mg/kg/d)治疗,体重增加未受影响,且小鼠血液中的生物标志物也未发生变化[1]。
体内研究表明,FIT-039对HPV诱导的体内肿瘤具有治疗作用。它能抑制HPV病毒癌基因E6和E7。该化合物具有口服活性,可在不影响宿主细胞周期的情况下抑制病毒复制。现有资料中没有详细说明具体的给药方案。
酶活实验
FIT-039 的体外酶活性测定包括测量 CDK9 激酶活性的抑制情况。将重组 CDK9/cyclin T1 复合物与底物肽和 ATP 在不同化合物浓度下孵育。通过放射性或荧光法定量分析底物磷酸化水平的降低来确定 IC50 值(5.8 µM)。
细胞实验
细胞实验采用HEK293细胞或病毒感染细胞进行。细胞用不同浓度的FIT-039处理(例如,30 µM,处理3小时)。CTD磷酸化水平通过Western blotting法,使用磷酸化特异性抗体进行检测。病毒复制通过qPCR定量病毒DNA或噬斑实验进行评估。
动物实验
FIT-039 的体内动物研究是在 HPV 诱导的肿瘤模型中进行的。该化合物采用口服给药。治疗效果通过测量肿瘤消退或病毒癌基因表达来评估。现有资料中未详细说明具体的动物模型、给药方案和疗效数据。
药代性质 (ADME/PK)
FIT-039 是一种口服活性化合物。它在 DMSO 中的溶解度为 100 mg/mL (317.05 mM)。用于体内给药时,可使用 10% DMSO、PEG300、Tween-80 和生理盐水,或使用玉米油配制制剂。粉剂应在 -20°C 下保存长达 3 年,或在 4°C 下保存长达 2 年;溶液应在 -80°C 下保存长达 6 个月,或在 -20°C 下保存长达 1 个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有资料中关于FIT-039毒性数据的详细信息并不多。该化合物在不影响宿主细胞周期的情况下抑制病毒复制,表明其具有良好的选择性。作为一种研究用化合物,它不适用于治疗用途。目前尚未对其具体的毒理学特征进行表征。
参考文献

[1]. CDK9 Inhibitor FIT-039 Prevents Replication of Multiple DNA Viruses. J Clin Invest. 2014 Aug;124(8):3479-88.

其他信息
FIT-039 是一种正在研究的广谱抗病毒药物。它是一种选择性 CDK9 抑制剂,具有口服活性。该化合物可抑制 HSV-1、HSV-2、人腺病毒、人巨细胞病毒 (CMV)、乙型肝炎病毒 (HBV) 和 HIV-1 的复制。它还显示出对 HPV 诱发肿瘤的治疗作用。该化合物仅供研究使用,可从商业供应商处购买。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H18FN3S
分子量
315.4104
精确质量
315.12
元素分析
C, 64.74; H, 5.75; F, 6.02; N, 13.32; S, 10.16
CAS号
1113044-49-7
相关CAS号
1113044-49-7
PubChem CID
25186688
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
460.4±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
232.2±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.1 mmHg at 25°C
折射率
1.662
LogP
3.05
tPSA
60.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
367
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=NC=CC(C(NC2=CC(F)=CC=C2N2CCCCC2)=S)=C1
InChi Key
VRKZHYSJZOUICG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H18FN3S/c18-14-4-5-16(21-10-2-1-3-11-21)15(12-14)20-17(22)13-6-8-19-9-7-13/h4-9,12H,1-3,10-11H2,(H,20,22)
化学名
N-(5-fluoro-2-piperidin-1-ylphenyl)pyridine-4-carbothioamide
别名
FIT-039; KP1115; FIT039; KP-1115; FIT 039; KP 1115
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~317.1 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (7.93 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (7.93 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.93 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.1705 mL 15.8524 mL 31.7048 mL
5 mM 0.6341 mL 3.1705 mL 6.3410 mL
10 mM 0.3170 mL 1.5852 mL 3.1705 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • The FIT-039 ointment suppressed skin lesions caused by HSV-1 infection. J Clin Invest . 2014 Aug;124(8):3479-88.
  • FIT-039 suppressed the replication of HSV-2, HCMV, and HAdVs. J Clin Invest . 2014 Aug;124(8):3479-88.
  • FIT-039 inhibited the replication of ACV-resistant HSV-1. J Clin Invest . 2014 Aug;124(8):3479-88.
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