GNF-5837

别名: GNF-5837; GNF 5837; GNF5837 GNF5837 ;N-[3-[[2,3-二氢-2-氧代-3-(1H-吡咯-2-基亚甲基)-1H-吲哚-6-基]氨基]-4-甲基苯基]-N'-[2-氟-5-(三氟甲基)苯基]-脲; 脲,N-[3-[[2,3-二氢-2-氧代-3-(1H-吡咯-2-基亚甲基)-1H-吲哚-6-基]氨基]-4-甲基苯基]-N'-[2-氟-5-(三氟甲基)​苯基]-;脲, N-[3-[[2,3-二氢-2-氧代-3-(1H-吡咯-2-基亚甲基)-1H-吲哚-6-基]氨基]-4-甲基苯基]-N'-[2-氟-5-(三氟甲基)苯基]-; GNF-5837
目录号: V0641 纯度: ≥98%
GNF-5837 (GNF5837) 是一种口服生物可利用的泛 TRK (TrkA, TrkB) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
GNF-5837 CAS号: 1033769-28-6
产品类别: Trk receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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纯度: ≥98%

产品描述
GNF-5837 (GNF5837) 是一种口服生物可利用的泛 TRK (TrkA、TrkB) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 TrkA/B,IC50 分别为 8 nM 和 12 nM。 GNF-5837 在体外对 Ba/F3 细胞表现出高抗增殖活性,IC50 为 0.042 μM。 GNF-5837 在源自表达 TRKA 和 NGF 的 RIE 细胞的小鼠异种移植模型中显示出高体内抗肿瘤功效。
生物活性&实验参考方法
靶点
TrkB (IC50 = 9 nM); TrkC (IC50 = 7 nM); TrkA (IC50 = 11 nM)
体外研究 (In Vitro)
体外活性:在过表达组成型活性 Tel-TRKC 融合体的 Ba/F3 细胞中,GNF-5837 显示出有效的抗 Trk 活性和有效的抗增殖活性,IC50 为 0.042 μM。激酶测定:TrkA和TrkC生化测定通过HTRF方法进行。反应混合物含有 1 μM 肽底物、1 μM ATP 以及反应缓冲液中的 1.8 nM TrkA 或 34 nM TrkC(50mM HEPES pH 7.1、10mM MgCl2、2 mM MnCl2、0.01% BSA、2.5 mM DTT 和 0.1 mM Na3VO4 ),最终体积为 10 μL。所有反应均在白色 ProxiPlate™ 384 孔 Plus 板中于室温下进行,并用 5 μL 0.2mM EDTA 猝灭 60 分钟。加入5 μL检测试剂(每孔2.5 ng PT66K和0.05 μg SAXL),将板在室温下孵育1小时,然后在EnVision读数器中读取。将化合物稀释到测定混合物中(最终DMSO 0.5%),并通过在测定条件下一式两份的12点(从50至0.000282μM)抑制曲线测定IC 50 值。 TrkB生化测定是通过卡尺微流控方法进行的。反应混合物含有 1 μM 肽底物、10 μM ATP 和 2 nM TrkB,反应缓冲液含有 100 mM HEPES、pH 7.5、5 mM MgCl2、0.01% Triton X-100、0.1% BSA、1 mM DTT、10 μMNa3VO4和10 μM β-甘油磷酸盐。反应在室温下进行3小时,产物通过Caliper EZ-reader测定。将化合物稀释到测定混合物中(最终DMSO 1%),并通过在测定条件下一式两份的12点(从50至0.000282μM)抑制曲线测定IC 50 值。细胞测定:测试化合物抑制wt Ba/F3细胞和用组成型表达的荧光素酶报告基因和BCR-ABL或Tel-KDR或其他Tel融合激酶转化的Ba/F3细胞增殖的能力。亲代Ba/F3细胞维持在含有重组小鼠IL3的培养基中,而激酶转化的Ba/F3细胞维持在不含IL-3的培养基中。通过液体处理系统 Echo 555 (Labcyte) 将 7.5 nL 化合物点样到 1536 孔测定板的每个孔中。然后将 700 个细胞接种到测定板的每个孔中,每孔含 7 μL 培养基,并以 3 倍系列稀释液在 0.17 nM 至 10 uM 下测试化合物。然后将细胞在 37°C 下孵育 48 小时。将 3 μL Bright-Glo® 添加到每个孔中,并使用 ViewLux 读取板。细胞系:Wt Ba/F3细胞和用组成型表达的荧光素酶报告基因和BCR-ABL或Tel-KDR或其他Tel融合激酶转化的Ba/F3细胞
体内研究 (In Vivo)
在雄性 Balb/c 小鼠和 Sprague-Dawley 大鼠中,GNF-5837 的药物清除率较低,生物利用度中等。在携带表达 TrkA 和 NGF 的 Rie 异种移植物的小鼠中,GNF-5837(100 mg/kg/d po)显着抑制肿瘤生长。
酶活实验
TrkA 和 TrkC 生化测试使用 HTRF 技术进行。在反应缓冲液中(50 mM HEPES pH 7.1、10 mM MgCl2、2 mM MnCl2、0.01% BSA、2.5 mM DTT 和 0.1 mM Na 3VO4),反应混合物含有 1 μM 肽底物、1 μM ATP 和 1.8 nM TrkA 或 34 nM TrkC。混合物的最终体积为 10 μL。每个反应均在白色 ProxiPlateTM 384 孔 Plus 板中于室温下进行,60 分钟后,使用 5 μL 0.2mM EDTA 淬灭反应。加入5 μL检测试剂(0.05 μg SAXL和2.5 ng PT66K)后,室温孵育1小时,然后使用EnVision读数器读取结果。将化合物稀释到测定混合物中(最终DMSO 0.5%),并且一式两份地使用12点(从50至0.000282μM)抑制曲线来确定测定条件下的IC 50 值。 TrkB 生化测定是使用微流控卡尺方法进行的。在含有 100 mM HEPES、pH 7.5、5 mM MgCl2、0.01% Triton X-100、0.1% BSA、1 mM DTT、10 μM Na3 的反应缓冲液中>VO4和10μMβ-甘油磷酸,反应混合物含有1μM肽底物、10μM ATP和2nM TrkB。 Caliper EZ-reader 用于测定反应在室温下进行三小时后的产物。将化合物稀释到测定混合物中(最终DMSO 1%),并且一式两份地使用12点(从50至0.000282μM)抑制曲线来确定测定条件下的IC 50 值。
细胞实验
使用组成型表达的荧光素酶报告基因和 BCR-ABL、Tel-KDR 或其他 Tel 融合激酶评估化合物阻止野生型和转化 Ba/F3 细胞生长的能力。激酶转化的 Ba/F3 细胞保存在不含 IL-3 的培养基中,而亲本 Ba/F3 细胞则保存在含有重组小鼠 IL3 的培养基中。使用液体处理系统 Echo 555 (Labcyte),将 7.5 nL 化合物点样到 1536 孔测定板的每个孔中。随后将 700 个细胞置于 7 μL 培养基中,放入测定板的每个孔中,并以 0.17 nM 至 10 uM 范围内的 3 倍系列稀释度测试化合物。然后将细胞在 37°C 下孵育 48 小时。每个孔接收 3 μL Bright-Glo®,并使用 ViewLux 读取板。
动物实验
Mice bearing Rie xenografts expressing TrkA and NGF.
100 mg/kg/d
p.o.
参考文献
[1]. ACS Med Chem Lett . 2012 Jan 1;3(2):140-5.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H21F4N5O2
分子量
535.49
精确质量
535.16
元素分析
C, 62.80; H, 3.95; F, 14.19; N, 13.08; O, 5.98
CAS号
1033769-28-6
相关CAS号
1033769-28-6
外观&性状
Orange to red solid powder
SMILES
CC1=C(C=C(C=C1)NC(=O)NC2=C(C=CC(=C2)C(F)(F)F)F)NC3=CC4=C(C=C3)/C(=C/C5=CC=CN5)/C(=O)N4
InChi Key
YYDUWLSETXNJJT-MTJSOVHGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H21F4N5O2/c1-15-4-6-19(35-27(39)37-25-11-16(28(30,31)32)5-9-22(25)29)13-23(15)34-18-7-8-20-21(12-17-3-2-10-33-17)26(38)36-24(20)14-18/h2-14,33-34H,1H3,(H,36,38)(H2,35,37,39)/b21-12-
化学名
1-[2-fluoro-5-(trifluoromethyl)phenyl]-3-[4-methyl-3-[[(3Z)-2-oxo-3-(1H-pyrrol-2-ylmethylidene)-1H-indol-6-yl]amino]phenyl]urea
别名
GNF-5837; GNF 5837; GNF5837
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外)
DMSO: ~100 mg/mL (~186.7 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol:~9 mg/mL(~16.8 mM)
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8674 mL 9.3372 mL 18.6745 mL
5 mM 0.3735 mL 1.8674 mL 3.7349 mL
10 mM 0.1867 mL 0.9337 mL 1.8674 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • GNF-5837

    Efficacy of GNF-5837 (22) in Rie-TRKAmNGF xenograft model. ACS Med Chem Lett. 2012 Feb 9; 3(2): 140–145.

  • GNF-5837

    X-ray crystal structure of compound 20 (stick representation; carbon in yellow, oxygen in red, nitrogen in blue, and fluorine in light blue) binding to the active site of TRKC kinase domain. ACS Med Chem Lett. 2012 Jan 1;3(2):140-5.

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