GSK-3484862

别名: GSK3484862; GSK-3484862; 2170136-65-7; GSKMI-714; (2R)-2-[3,5-dicyano-6-(dimethylamino)-4-ethylpyridin-2-yl]sulfanyl-2-phenylacetamide; SCHEMBL19717424; BDBM491120; US10975056, Example 64; NSC825088; GSK 3484862

目录号: V37622 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

GSK-3484862 (GSK3484862) 是一种新型、有效的非共价 Dnmt1（DNA 甲基转移酶）抑制剂，具有潜在的抗癌活性。

GSK-3484862 CAS号: 2170136-65-7
产品类别: DNA Methyltransferase

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

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Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

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Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

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Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
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GSK-3484862 (GSK3484862) 是一种新型、有效的非共价 Dnmt1（DNA 甲基转移酶）抑制剂，具有潜在的抗癌活性。它会诱导癌细胞 DNA 低甲基化。

生物活性&实验参考方法

靶点	DNMT1/DNA methyltransferase
体外研究 (In Vitro)	GSK-3484862（0-10 μM，6 或 14 天）可显着减少 DNA 甲基化 [2]。 GSK-3484862（0-10 μM，4 天）会导致 DNMT1 蛋白水平略有降低 [2]。在这项研究中，研究人员通过用从两个商业来源获得的不同浓度的化合物处理野生型（WT）或Dnmt1/3a/3b三重敲除（TKO）mESC，确定了GSK-3484862的细胞毒性和最佳浓度。10µM或以下的浓度很容易耐受14天的培养。已知的DNA甲基化靶点，如种系基因和GLN家族转座子，在GSK-3484862治疗开始后的2天内上调。相比之下，5-氮杂胞苷和地西他滨诱导了甲基化基因的较弱上调和广泛的细胞死亡。全基因组亚硫酸氢盐测序显示，用GSK-3484862治疗诱导了显著的DNA甲基化损失，在用GSK-344862治疗6天后，Gloval CpG甲基化水平从WT mESC的近70%下降到不到18%。处理过的细胞显示出与Dnmt1缺陷型mESC中观察到的甲基化水平和模式相似的甲基化。结论：GSK-3484862介导mESC的显著去甲基化，具有最小的非特异性毒性。 [2]
酶活实验	确定GSK-3484862毒性[1] 使用J1 WT和DNMT TKO mESC进行测定，以确定GSK-3484862的最佳浓度和毒性。将30000个细胞接种在预先涂有0.1%明胶的24孔板中。第二天，将培养基换成新鲜mESC培养基或含有DMSO（0.1%或1%）的培养基，用于以下浓度的GSK-3484862：2 pM、20 pM、200 pM、2 nM、20 nM、2µM、20µM（0.1%DMSO）和200µM（1%DMSO）。在接下来的六天里，每天刷新培养基，然后评估细胞形态，然后用0.05%胰蛋白酶-EDTA进行细胞分离以进行细胞计数。[1] 接下来，在重复实验中评估了GSK-3484862的去甲基化功效和长期细胞毒性。为了提高溶解度，在DMSO中重新悬浮后，对GSK-3484862进行超声波处理。来自两家公司的GSK-3484862在超声波水浴中以42kHz的频率超声处理6分钟（Sper Scientific）。尽管如此，在培养基中观察到浓度达到或超过20µM的药物沉淀，因此选择了10µM的上限浓度。将WT和DNMT TKO细胞接种在预先涂有0.1%明胶的12孔板中，并从第0天开始在培养基中添加0.1%DMSO、2µM或10µM GSK348862。每天刷新培养基，使用Countess II FL仪器计数细胞，并在接下来的14天内每2-3天传代一次。
细胞实验	细胞活力测定[2] 细胞类型：小鼠胚胎干细胞（mESC、野生型 (WT) 或 Dnmt1/3a/3b 三重敲除 (TKO)）已测试浓度：2 µM 和 10 µM 孵育时间：6 或 14 天实验结果：结果 DNA 甲基化急剧丧失6 天后，WT mESC 中的总体 CpG 甲基化水平从近 70% 下降至不到 18%。蛋白质印迹分析[2] 细胞类型：小鼠胚胎干细胞（mESC、野生型 (WT) 或 Dnmt1/3a/3b 三重敲除 (TKO)）测试浓度： 2 µM 和 10 µM 孵育时间： 4 天实验结果： DNMT1 蛋白水平的产生均适度减少。
参考文献	[1]. Keystone Symposia 2019 - Epigenetics and Human Disease. [2]. The DNMT1 inhibitor GSK-3484862 mediates global demethylation in murine embryonic stem cells. [Epigenetics Chromatin. 2021 Dec 15;14(1):56. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34906184/ ]
其他信息	从研究角度来看，GSK-3484862展现出巨大的潜力。5-氮杂核苷具有显著的非特异性毒性，且作用浓度范围较窄。我们观察到，用0.3 µM 5-氮杂胞苷处理后，部分甲基化基因被重新激活，但在此浓度下存活的细胞极少；而0.1 µM 5-氮杂胞苷不足以重新激活甲基化基因。此外，我们需要培养两天才能观察到存活细胞的克隆形成。相比之下，2 µM或10 µM的GSK-3484862能够重新激活甲基化基因的表达，且仅导致细胞生长轻微抑制，这种抑制作用在处理的第6天至第10天最为明显。这种生长抑制可能反映了该化合物的特异性活性。当小鼠胚胎干细胞（mESCs）经MEK抑制剂、糖原合成酶激酶3抑制剂和高浓度抗坏血酸处理后发生去甲基化时，转座子表达会爆发式增加，并且异染色质状态也会在这一时间段内发生重构[2]。无论使用何种剂量或处理时间，经GSK-3484862处理的mESCs的DNA甲基化水平从未低于16%，且甲基化基因的重新激活程度也未达到TKO细胞中观察到的水平。这可能反映了mESCs中DNMT3A和DNMT3B的高活性，正如已发表的Dnmt1 KO mESCs中类似的DNA甲基化水平所证实的那样。Dnmt1缺陷或抑制的细胞可能达到一种平衡状态，其中甲基化不断地由DNMT3A和DNMT3B添加，并通过复制和Tet蛋白活性丢失。其他细胞类型对Dnmt1抑制的反应可能不同。大多数体细胞和癌细胞并不表达如此高水平的从头DNA甲基转移酶，因此在缺乏Dnmt1活性的情况下可能无法维持如此高的DNA甲基化水平。同时，体细胞或癌细胞可能无法在DNA甲基化水平显著降低的情况下存活。Dnmt1缺陷型和Dnmt1/3a/3b三敲除型小鼠胚胎干细胞（mESCs）在分化后无法存活，而DNMT1在子宫着床后变得至关重要。这种转变可能反映了mESCs高度依赖TRIM28来沉默转座子，但在mESCs分化或胚胎子宫着床后，DNA甲基化对于抑制转座子变得至关重要。因此，研究其他细胞类型的研究人员很可能在较低剂量下观察到特定的毒性，事实上，GSK-3484862及其相关化合物在白血病中表现出显著的疗效。我们也不能排除某些细胞类型中可能出现非特异性毒性，GSK-3484862 在相对较低的浓度下即可抑制小鼠发育，这提示了上述可能性。尽管如此，这种新型 DNA 甲基转移酶抑制剂似乎比 5-氮杂核苷类药物有显著改进，并且是一种很有前景的研究工具。结论：GSK-3484862 可显著降低小鼠胚胎干细胞的甲基化水平。在甲基化基因激活和非特异性毒性方面，GSK-3484862 的性能均远优于 5-氮杂核苷类药物。

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C19H19N5OS
分子量	365.452061891556
精确质量	365.131
元素分析	C, 62.45; H, 5.24; N, 19.16; O, 4.38; S, 8.77
CAS号	2170136-65-7
相关CAS号	(Rac)-GSK-3484862;2170136-02-2
PubChem CID	132233666
外观&性状	Light yellow to yellow solid powder
LogP	3
tPSA	132
氢键供体(HBD)数目	1
氢键受体(HBA)数目	6
可旋转键数目(RBC)	6
重原子数目	26
分子复杂度/Complexity	585
定义原子立体中心数目	1
SMILES	S(C1=C(C#N)C(=C(C#N)C(=N1)N(C)C)CC)[C@@H](C(N)=O)C1C=CC=CC=1
InChi Key	KIEQQZZDWUNUQK-MRXNPFEDSA-N
InChi Code	InChI=1S/C19H19N5OS/c1-4-13-14(10-20)18(24(2)3)23-19(15(13)11-21)26-16(17(22)25)12-8-6-5-7-9-12/h5-9,16H,4H2,1-3H3,(H2,22,25)/t16-/m1/s1
化学名	(R)-2-((3,5-dicyano-6-(dimethylamino)-4-ethylpyridin-2-yl)thio)-2-phenylacetamide
别名	GSK3484862; GSK-3484862; 2170136-65-7; GSKMI-714; (2R)-2-[3,5-dicyano-6-(dimethylamino)-4-ethylpyridin-2-yl]sulfanyl-2-phenylacetamide; SCHEMBL19717424; BDBM491120; US10975056, Example 64; NSC825088; GSK 3484862
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~20.83 mg/mL (~57.00 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (5.69 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 2.08 mg/mL (5.69 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~20.83 mg/mL (~57.00 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (5.69 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (5.69 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.7364 mL	13.6818 mL	27.3635 mL
	5 mM	0.5473 mL	2.7364 mL	5.4727 mL
	10 mM	0.2736 mL	1.3682 mL	2.7364 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。