METTL16-IN-1

目录号: V88841 纯度: ≥98%
METTL16-IN-1(化合物 45)是一种有效的 METTL16 抑制剂,IC50 为 1.7 μM,Kd 为 1.35 μM。
METTL16-IN-1 产品类别: DNA Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
METTL16-IN-1(化合物 45)是一种强效的 METTL16 抑制剂,IC50 为 1.7 μM,Kd 为 1.35 μM。
METTL16-IN-1(化合物 45)是一种强效的 METTL16(甲基转移酶样蛋白 16)抑制剂,METTL16 是一种 RNA 甲基转移酶,可催化 RNA 分子中腺苷残基的甲基化。METTL16-IN-1 的 IC₅0 为 1.7 microM,Kd 为 1.35 microM。它能有效抑制 U6 snRNA 缺失与 METTL16 MTD 的结合,IC₅0 为 2.5 microM。METTL16-IN-1 具有抗肿瘤活性,并被用于研究癌症中的 RNA 甲基化 (m⁶A)。
生物活性&实验参考方法
靶点
METTL16 (Methyltransferase-like protein 16). METTL16 is an RNA methyltransferase that methylates adenosine residues in RNA molecules, particularly U6 snRNA at position 47. METTL16-IN-1 inhibits the activity of METTL16.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞实验中,METTL16-IN-1 能抑制 METTL16 甲基转移酶活性,IC₅0 为 1.7 uM,Kd 为 1.35 uM。它还能抑制 U6 snRNA 缺失与 METTL16 甲基转移酶结构域 (MTD) 的结合,IC₅0 为 2.5 uM。METTL16-IN-1 具有抗肿瘤活性,表明其有望成为研究 METTL16 在癌症中作用的研究工具。
酶活实验
一种用于评估 METTL16 甲基转移酶活性的通用无细胞方案:采用放射性或荧光法进行甲基转移酶活性测定。将重组 METTL16 蛋白 (100 nM) 与 3′-生物素标记的 U6 snRNA 底物 (1 uM) 在含有 1 uM S-腺苷-L-蛋氨酸 (SAM) 的测定缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 8.0,150 mM NaCl,1 mM DTT,0.01% Tween-20)中孵育。加入不同浓度的 METTL16-IN-1 (0.01 nM 至 100 uM)。反应在 30℃ 下孵育 60 分钟。通过加热至 65℃ 5 分钟终止反应。将生物素标记的 RNA 底物捕获到链霉亲和素包被的微孔板上。使用与辣根过氧化物酶 (HRP) 偶联的抗甲基化腺苷 (m⁶A) 抗体检测甲基化 RNA,随后加入化学发光或比色底物。IC₅0 由抑制曲线计算得出。Kd 的测定采用表面等离子共振 (SPR) 法。将 METTL16 蛋白固定在传感器芯片上,并将不同浓度的 METTL16-IN-1 溶液流过芯片。测量结合和解离速率以计算 Kd 值。U6 snRNA 结合抑制实验采用荧光偏振 (FP) 法。将 METTL16 MTD(甲基转移酶结构域)蛋白与荧光标记的 U6 snRNA 探针(U6 snRNA 缺失突变体)孵育。测量结合后 FP 信号的增加。加入不同浓度的 METTL16-IN-1 以竞争结合,并计算 IC₅0 值。
细胞实验
评估 METTL16 抑制和 m⁶A 水平的通用细胞实验方案:将癌细胞(例如 HeLa、HEK293T 或其他表达 METTL16 的癌细胞系)以 2×10⁵ 个细胞/孔的密度接种于 6 孔板中。24 小时后,用不同浓度的 METTL16-IN-1(0.1、0.5、1、2.5、5、10、25、50 uM)处理细胞 48 小时。使用 TRIzol 试剂从处理后的细胞中提取总 RNA。为了定量 m⁶A,将 RNA 变性后加入 m⁶A ELISA 试剂盒的孔中。根据制造商的说明测量 RNA 样品中的 m⁶A 水平。对于 METTL16 靶基因的 qRT-PCR 分析,首先将 RNA 反转录为 cDNA,然后使用 TaqMan 或 SYBR Green qPCR 检测 METTL16 靶基因(例如 MAT2A)的表达。GAPDH 或 β-actin 用作上样对照。对于细胞活力检测,将细胞接种于 96 孔板中,并用 METTL16-IN-1 处理 72 小时。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力。使用 Annexin V-FITC/PI 双染法通过流式细胞术评估细胞凋亡。
动物实验
评估METTL16-IN-1在异种移植模型中抗肿瘤活性的通用动物实验方案:将5×10⁶个表达METTL16的癌细胞(例如HeLa、HCT116或A549细胞)悬浮于0.1 mL PBS与Matrigel(1:1)的混合液中,皮下注射至雌性BALB/c裸鼠体内。当平均肿瘤体积达到100-150 mm³时,将小鼠随机分为治疗组(每组n=8-10)。将METTL16-IN-1配制成合适的溶剂(例如10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45%生理盐水),并通过灌胃或腹腔注射给药,剂量分别为10、30和100 mg/kg,每日一次,连续给药14-21天。实验设置溶剂对照组。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积,并记录体重。研究结束时,处死小鼠,切除肿瘤并称重。从肿瘤组织中提取总RNA,并通过ELISA检测m⁶A水平。采用qRT-PCR检测METTL16靶基因的表达。同时,对肿瘤组织进行免疫组织化学染色(Ki-67和cleaved caspase-3)。
药代性质 (ADME/PK)
METTL16-IN-1 的一般药代动力学方案:雄性 Sprague-Dawley 大鼠分别通过灌胃(PO,10 mg/kg)和静脉注射(IV,2 mg/kg)给药 METTL16-IN-1。该化合物配制于赋形剂中,例如 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水。分别于给药后 0.083、0.25、0.5、1、2、4、8、12 和 24 小时采集血样。采用 LC-MS/MS 法定量测定血浆中 METTL16-IN-1 的浓度。使用非房室模型分析计算药代动力学参数(Cmax、Tmax、AUC、t½、清除率、Vd 和口服生物利用度)。 METTL16-IN-1 的分子式为 C1₉H12BrN3O₆S2,其分子量可由该分子式计算得出。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
METTL16-IN-1 的一般毒性试验方案:在 ICR 小鼠中进行为期 14 天的重复给药口服毒性研究。METTL16-IN-1 通过灌胃法给药,剂量分别为 30、100 和 300 mg/kg/天,连续 14 天。每日监测临床症状、体重和食物消耗量。研究结束时,采集血液样本进行血液学检查(全血细胞计数及分类)和血清生化检查(ALT、AST、ALP、BUN、肌酐、总蛋白、白蛋白、葡萄糖)。进行大体解剖,并记录主要器官(肝脏、肾脏、脾脏、心脏、肺脏、脑、睾丸)的重量。对这些器官进行组织病理学检查。由于 METTL16 参与 RNA 甲基化,因此对增殖活性高的组织(如骨髓和胃肠道)给予特别关注,以防出现骨髓抑制或胃肠道毒性。
参考文献

[1]. Aminothiazolone Inhibitors Disrupt the Protein-RNA Interaction of METTL16 and Modulate the m6A RNA Modification. JACS Au. 2024 Mar 21;4(4):1436-1449.

其他信息
METTL16-IN-1(化合物45)是一种强效的RNA甲基转移酶METTL16抑制剂。其分子式为C1₉H12BrN3O₆S2,包含一个溴原子。该化合物对METTL16的抑制IC₅₀值为1.7 μM,Kd值为1.35 μM,并且对U6 snRNA-METTL16相互作用的抑制IC₅₀值为2.5 μM。METTL16-IN-1具有抗肿瘤活性,是研究METTL16和RNA甲基化(m⁶A)在癌症生物学中作用的重要研究工具。METTL16正逐渐成为多种恶性肿瘤(包括急性髓系白血病(AML)和肝细胞癌(HCC))的潜在治疗靶点。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H12BRN3O6S2
分子量
522.35
外观&性状
Brown to reddish brown solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9144 mL 9.5721 mL 19.1443 mL
5 mM 0.3829 mL 1.9144 mL 3.8289 mL
10 mM 0.1914 mL 0.9572 mL 1.9144 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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