| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 2mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Bromodomain and PHD Finger-Containing Protein 1 (BRPF1) Bromodomain (Ki = 0.15 nM for human recombinant BRPF1 bromodomain; HTRF IC50 = 0.3 nM) [1]
- Bromodomain and PHD Finger-Containing Protein 2 (BRPF2) Bromodomain (Ki = 18 nM for human recombinant BRPF2 bromodomain) [1] - Bromodomain and PHD Finger-Containing Protein 3 (BRPF3) Bromodomain (Ki = 3.5 nM for human recombinant BRPF3 bromodomain) [1] - No significant binding to other bromodomains (e.g., BPTF, CREBBP, EP300, BRD4) with IC50 > 10 μM [1] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外活性:根据一组 48 项不相关测定筛选 GSK6853,仅显示脱靶活性,与 BRPF1 效力相比相对较弱。然而,为了尽量减少脱靶效应的可能性,在基于细胞的测定中,推荐浓度不高于 1 μM。激酶测定:GSK6853 是一种新型、有效、选择性苯并咪唑酮 BRPF1 溴结构域抑制剂,pIC50 为 8.1 (TR-FRET),并且比所有其他测试的溴结构域显示出超过 1600 倍的选择性。 BRPF(含溴结构域和 PHD Finger)蛋白家族是组装 MYST 组蛋白乙酰转移酶复合物的重要支架蛋白。针对 48 项不相关检测的一组筛选 GSK6853 仅显示出与 BRPF1 效力相比相对较弱的脱靶活性。然而,为了尽量减少脱靶效应的可能性,在基于细胞的测定中,推荐浓度不高于 1 μM。细胞测定:
GSK6853(0.01-100 nM)剂量依赖性结合人重组BRPF1溴结构域,1 nM浓度下结合抑制率达98% [1] - GSK6853 对BRPF1的选择性显著高于BRPF2(120倍)和BRPF3(23倍),对非BRPF家族溴结构域(如BRD4、CREBBP)的选择性>66,000倍 [1] - 细胞热转移实验(CETSA)中,GSK6853(1-20 μM)在HEK293T细胞中呈浓度依赖性稳定BRPF1蛋白,10 μM时热稳定性变化(ΔTm)达4.2°C,证实细胞内靶点结合 [1] - GSK6853(5-50 μM)处理HEK293T、HeLa或MCF-7细胞72小时后,对细胞增殖无明显影响(细胞存活率>90%),表明固有细胞毒性低 [1] - 免疫共沉淀实验中,GSK6853(10 μM)未破坏BRPF1与MOZ/MORF乙酰转移酶复合物其他组分的相互作用 [1] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在前瞻性 PK/PD 模型中,腹腔注射给药途径适合 GSK6853 给药[1]。
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| 酶活实验 |
表面等离子体共振(SPR)结合实验:重组人BRPF1/BRPF2/BRPF3溴结构域蛋白固定在传感器芯片上。系列浓度的GSK6853(0.001-100 nM)在25°C下流过芯片,记录结合响应信号。计算动力学参数(ka、kd)以推导Ki值 [1]
- HTRF结合抑制实验:生物素化乙酰化组蛋白H3肽段(H3K9ac)与重组BRPF1溴结构域、Eu标记抗GST抗体及系列浓度GSK6853(0.01-100 nM)共同孵育。检测荧光共振能量转移(FRET)信号(激发=320 nm,发射=665 nm/620 nm),从剂量-反应曲线计算IC50值 [1] - 溴结构域选择性面板实验:GSK6853(0.01-10 μM)通过HTRF或AlphaScreen实验对48个人类溴结构域进行测试。检测结合抑制率以证实对BRPF家族溴结构域(尤其BRPF1)的选择性 [1] |
| 细胞实验 |
细胞热转移实验(CETSA):HEK293T细胞裂解后,裂解液与GSK6853(1-20 μM)或溶媒在室温孵育30分钟。样品经温度梯度处理(40-65°C)后离心分离可溶性蛋白。Western blot检测可溶性组分中BRPF1蛋白水平,绘制熔解曲线并计算ΔTm值 [1]
- 细胞活力实验:HEK293T、HeLa和MCF-7细胞在添加胎牛血清的DMEM培养基中培养,用GSK6853(0.5-100 μM)处理72小时,MTT法检测细胞活力 [1] - 免疫共沉淀(Co-IP)实验:HEK293T细胞转染FLAG标签的BRPF1质粒,24小时后用GSK6853(10 μM)处理6小时,随后裂解细胞。抗FLAG抗体免疫沉淀BRPF1,Western blot检测相互作用蛋白(MOZ、MORF)[1] |
| 动物实验 |
mg/kg(静脉注射);静脉注射、口服、腹腔注射
CD1小鼠 |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
GSK6853 (≤50 μM) 对正常人包皮成纤维细胞 (CCD-18Co) 和乳腺上皮细胞 (MCF-10A) 的细胞毒性较低,72 小时后细胞存活率 >85% [1]
- GSK6853 在人血浆中的血浆蛋白结合率为 95%,在大鼠血浆中的血浆蛋白结合率为 93% [1] - GSK6853 在人肝微粒体中表现出良好的代谢稳定性,半衰期 (t1/2) 为 3.2 小时 [1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
GSK6853 是一种高效、选择性的 BRPF1 溴结构域化学探针,旨在特异性靶向 BRPF1 的乙酰赖氨酸结合口袋 [1]。其作用机制是与 BRPF1 溴结构域竞争性结合,阻断其与乙酰化组蛋白尾部(例如 H3K9ac)的相互作用,同时不破坏 MOZ/MORF 乙酰转移酶复合物的完整性 [1]。该药物对于研究 BRPF1 在表观遗传调控、染色质重塑和转录控制中的生物学功能具有重要价值 [1]。与其他溴结构域相比,GSK6853 对 BRPF1 的高选择性最大限度地减少了脱靶效应,使其成为解析 BRPF1 特异性通路的可靠工具 [1]。GSK6853 具有良好的体外特性(高结合亲和力、代谢稳定性、低细胞毒性),支持其在细胞和生化研究中的应用 [1]。
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| 分子式 |
C22H27N5O3
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|---|---|---|
| 分子量 |
409.48
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| 精确质量 |
409.211
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| CAS号 |
1910124-24-1
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| 相关CAS号 |
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| PubChem CID |
121232405
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.2±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
545.9±50.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
284.0±30.1 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.5 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.621
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| LogP |
0.98
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| tPSA |
77.2
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
4
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| 重原子数目 |
30
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| 分子复杂度/Complexity |
646
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| 定义原子立体中心数目 |
1
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| SMILES |
C[C@@H]1CNCCN1C2=CC3=C(C=C2NC(=O)C4=CC=CC=C4OC)N(C(=O)N3C)C
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| InChi Key |
FQWDVNSBYDXPIO-CQSZACIVSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C22H27N5O3/c1-14-13-23-9-10-27(14)17-12-19-18(25(2)22(29)26(19)3)11-16(17)24-21(28)15-7-5-6-8-20(15)30-4/h5-8,11-12,14,23H,9-10,13H2,1-4H3,(H,24,28)/t14-/m1/s1
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| 化学名 |
N-[1,3-dimethyl-6-[(2R)-2-methylpiperazin-1-yl]-2-oxobenzimidazol-5-yl]-2-methoxybenzamide
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.4421 mL | 12.2106 mL | 24.4212 mL | |
| 5 mM | 0.4884 mL | 2.4421 mL | 4.8842 mL | |
| 10 mM | 0.2442 mL | 1.2211 mL | 2.4421 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
X-ray structure of BRPF1 with 1 (PDB 4UYE).ACS Med Chem Lett.2016 May 9;7(6):552-7. td> |
X-ray structures of BRPF1 with 34 (cyan, PDB 5G4R) and 38 (magenta, PDB 5G4S).ACS Med Chem Lett.2016 May 9;7(6):552-7. td> |
Potency for endogenous cellular BRPF1. pIC50 of 34 for BRPF1 and BRD3 measured in a chemoproteomic competition binding assay (Supplementary Methods, Supporting Information).ACS Med Chem Lett.2016 May 9;7(6):552-7. td> |