HIV-1 integrase inhibitor

别名: 4-[3-(叠氮基甲基)苯基]-2-羟基-4-氧代-2-丁烯酸
目录号: V30213 纯度: ≥98%
HIV-1整合酶抑制剂可用于对抗HIV。
HIV-1 integrase inhibitor CAS号: 544467-07-4
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
10mg
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产品描述
HIV-1整合酶抑制剂可用于对抗HIV。HIV-1整合酶抑制剂是一种点击化学试剂。它含有叠氮(N3)基团,可与含有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可与含有BCN或DBCO基团的化合物发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
HIV-1整合酶抑制剂(CAS号:544467-07-4)是一种小分子抑制剂,靶向HIV-1整合酶,该酶是病毒DNA整合到宿主基因组中所必需的酶。该化合物的分子式为C11H9N3O4,分子量为247.21。它可用于抗HIV治疗,并能抑制HIV-1整合酶的活性,从而用于治疗HIV感染和艾滋病。该化合物含有叠氮基团,可与含炔烃的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。
生物活性&实验参考方法
靶点
HIV-1 integrase inhibitor targets HIV-1 integrase, a 32 kDa protein produced from the C-terminal portion of the Pol gene product. HIV-1 integrase is composed of three structurally independent functional domains: the N-terminal domain (NTD), catalytic core domain (CCD), and C-terminal domain (CTD). The compound functions as an integrase strand transfer inhibitor (INSTI), binding tightly and specifically to the integrase associated with the ends of viral DNA by chelating divalent metal ions (Mg2+) coordinated by the catalytic triad (DDE motif) located in the CCD. This inhibits the strand transfer reaction, blocking viral DNA integration into the host chromosome.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,HIV-1整合酶抑制剂能有效抑制HIV-1整合酶的链转移活性。该化合物在锰存在下IC50值为0.07 uM,在镁存在下IC50值为0.33 uM。它对HIV-1整合酶的链转移具有选择性,而对HIV-1整合酶3'端DNA加工的选择性较低,在锰或镁存在下IC50值均大于70 uM。该化合物对野生型HIV-1整合酶的选择性也高于双突变体(F185K/C280S)整合酶。在细胞实验中,该抑制剂能降低分泌的p24水平,p24是HIV-1复制的标志物。
体内研究 (In Vivo)
HIV-1整合酶抑制剂的体内活性可根据其作用机制和体外效力推断。该化合物通过抑制HIV-1整合酶链转移,有效阻断病毒在感染细胞中的复制和传播。该化合物靶向HIV生命周期中的关键步骤——病毒DNA整合到宿主基因组中——使其成为研究HIV复制和潜在治疗应用的重要工具。尽管目前针对该化合物的具体体内数据有限,但预计在HIV感染动物模型中仍能观察到其体内疗效。
酶活实验
HIV-1整合酶抑制剂的体外酶活性测定包括测量整合酶链转移活性的抑制情况。将重组HIV-1整合酶与供体DNA底物(代表病毒DNA末端)和靶DNA底物(代表宿主DNA)在不同浓度的抑制剂(通常为0.001-100 uM)和二价金属辅因子(Mn2⁺或Mg2⁺)存在下孵育。链转移反应在37℃下进行1-2小时,之后通过凝胶电泳分离反应产物,并用磷光成像或荧光检测进行定量。通过将抑制数据拟合到剂量-反应曲线来确定IC₅0值。
细胞实验
HIV-1整合酶抑制剂的体外细胞试验采用HIV感染细胞系或携带HIV-1整合酶依赖性报告系统的细胞系进行。细胞用不同浓度的化合物(通常为0.01-100 μM)处理24-72小时。通过ELISA检测培养上清液中p24抗原水平来评估HIV-1复制情况。使用MTT或CellTiter-Glo检测法监测细胞活力,以确保观察到的抗病毒作用并非由细胞毒性引起。化合物抑制细胞内HIV-1整合酶活性的能力也可以通过定量PCR检测整合病毒DNA与总病毒DNA的水平(Alu-PCR检测)来评估。
动物实验
HIV-1整合酶抑制剂的体内动物研究通常采用人源化小鼠模型(例如,移植了人造血干细胞的NSG小鼠),这些小鼠易感HIV-1感染。移植成功后,小鼠感染HIV-1,然后通过灌胃或腹腔注射给予不同剂量(通常为1-50 mg/kg)的受试化合物,持续2-4周。采用RT-qPCR检测血浆病毒载量,并采用流式细胞术监测CD4+ T细胞计数。研究结束时采集组织样本,通过Alu-PCR分析病毒DNA整合情况,并进行组织病理学检查。
药代性质 (ADME/PK)
HIV-1整合酶抑制剂(CAS 544467-07-4)的药代动力学性质已在研究中得到表征。该化合物的分子量为247.21,分子式为C11H9N3O4。它在DMSO中的溶解度为1-10 mg/mL,在DMSO中的溶解度为1-10 mg/mL。该化合物应储存于-20℃。该化合物含有一个叠氮基(N3),使其成为一种点击化学试剂,能够与含炔烃的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。现有文献中关于该化合物的ADME参数(如半衰期、生物利用度和血浆蛋白结合率)的详细记录尚不充分。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中关于HIV-1整合酶抑制剂的毒理学数据记载并不详尽。作为一种靶向HIV-1整合酶的研究化合物,标准的毒性筛选流程包括使用MTT或类似方法评估其在细胞系中的细胞毒性,以确定选择性指数(细胞毒性浓度与抗病毒IC50的比值)。在动物研究中,将监测包括体重、临床观察、血液学、临床化学和组织病理学在内的一般毒性参数。该化合物仅供研究使用,不用于人类治疗。现有文献中未报道具体的LD50值或详细的毒性特征。
参考文献

[1]. Hobaika, Z.; Zargarian, L.; Maroun, R. G.; Mauffret, O.; Burke, T. R., Jr.; Fermandjian, S. HIV-1 Integrase and Virus and Cell DNAs: Complex Formation and Perturbation by Inhibitors of Integration. Neurochemical Research (2010), 35(6), 888-893.

[2]. Loizidou, Eriketi Z.; Zeinalipour-Yazdi, Constantinos D.; Christofides, Tasos; Kostrikis, Leondios G. Analysis of binding parameters of HIV-1 integrase inhibitors: Correlates of drug inhibition and resistance. Bioorganic & Medicinal Chemistry (2009), 17(13), 4806-4818.

[3]. Kawasuji T.Carbamoyl Pyridone HIV-1 Integrase Inhibitors. 1. Molecular Design and Establishment of an Advanced Two-Metal Binding Pharmacophore.J Med Chem. 2012 Sep 10.

[4]. Yan A, Xuan S, Hu X.Classification of Active and Weakly Active ST Inhibitors of HIV-1 Integrase Using a Support Vector Machine.Comb Chem High Throughput Screen. 2012 Aug 28.

[5]. Yu S, Zhao G.Development of Polyphenols as HIV-1 Integrase Inhibitors: A Summary and Perspective.Curr Med Chem. 2012 Aug 27.

其他信息
HIV-1整合酶抑制剂(CAS 544467-07-4)是一种有效的抗HIV化合物,靶向HIV-1整合酶。它也被称为118-D-24和MA-DKA。该化合物的正式名称为4-[3-(叠氮甲基)苯基]-2-羟基-4-氧代-2-丁烯酸。它是一种整合酶链转移抑制剂(INSTI),该类药物包括一些临床批准的药物,例如拉替拉韦、埃尔维格拉韦和多替拉韦。该化合物的作用机制是螯合整合酶活性位点中的二价金属离子,从而阻断链转移反应。该化合物仅供研究用途,纯度≥95%。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H9N3O4
分子量
247.20686
精确质量
247.059
CAS号
544467-07-4
相关CAS号
LEDGIN6;957890-42-5
PubChem CID
5496124
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
1.658
tPSA
124.35
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
413
定义原子立体中心数目
0
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~404.51 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.0451 mL 20.2257 mL 40.4514 mL
5 mM 0.8090 mL 4.0451 mL 8.0903 mL
10 mM 0.4045 mL 2.0226 mL 4.0451 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们