JIB-04 Z-isomer

别名: JIB-04 Z-isomer, NSC-693627 NSC 693627 NSC693627. 5-氯-2(1H)-吡啶酮(2Z)-(苯基-2-吡啶基亚甲基)腙
目录号: V22899 纯度: ≥98%
JIB-04 Z-异构体,以前称为 NSC 693627,是 JIB-04 的 Z-构型异构体,JIB-04 是一种有效的泛选择性 Jumonji 组蛋白去甲基化酶抑制剂,IC50 为 230、340、855、445、435、1100 和 290 nM分别用于 JARID1A、JMJD2E、JMJD3、JMJD2A、JMJD2B、JMJD2C 和 JMJD2D。
JIB-04 Z-isomer CAS号: 199596-24-2
产品类别: Histone Demethylase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • JIB 04
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产品描述
JIB-04 Z-异构体,曾用名NSC 693627,是JIB-04的Z构型异构体。JIB-04是一种强效且具有泛选择性的Jumonji组蛋白去甲基化酶抑制剂,对JARID1A、JMJD2E、JMJD3、JMJD2A、JMJD2B、JMJD2C和JMJD2D的IC50值分别为230、340、855、445、435、1100和290 nM。JIB-04在体外选择性地抑制癌细胞生长,并在体内H358和A549小鼠异种移植模型中抑制肿瘤生长。JIB-04还能延长乳腺癌小鼠模型的生存期。在灵敏的ELISA检测中,JIB-04对JARID1A、2A、2B、2C、2E和3的抑制IC50值分别为230 nM、445 nM、435 nM、1100 nM、340 nM和855 nM。在JMJD2家族中,JMJD2D的敏感性最高。JIB-04 Z-异构体(CAS号:199596-24-2)是一种小分子组蛋白去甲基化酶抑制剂,特异性靶向含有Jumonji C (JmjC)结构域的组蛋白去甲基化酶。它是一种JmjC组蛋白去甲基化酶的泛抑制剂,包括KDM4、KDM5和其他家族成员。JIB-04 Z-异构体因其抗癌活性以及通过组蛋白甲基化改变调节基因表达的能力而受到研究。然而,关于 JIB-04 Z-异构体的详细药理学信息在现有资料中是有限的。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary target of JIB-04 Z-isomer is Jumonji C (JmjC) domain-containing histone demethylases, a family of enzymes that remove methyl groups from lysine residues on histone proteins. JmjC demethylases play critical roles in regulating gene expression, chromatin structure, and cellular differentiation. JIB-04 Z-isomer acts as a pan-inhibitor of JmjC demethylases, including KDM4 and KDM5 family members. By inhibiting these enzymes, the compound alters histone methylation patterns and modulates gene expression, leading to anti-cancer effects.
体外研究 (In Vitro)
JIB-04 可阻止其他 α-酮戊二酸依赖性羟化酶和组蛋白修饰酶干扰 Jumonji 酶的去甲基化活性,无论是在体外还是在细胞内 [1]。
在体外,JIB-04 Z-异构体可抑制 JmjC 组蛋白去甲基化酶的活性,从而改变组蛋白甲基化模式并调节基因表达。这导致其在多种癌细胞系中产生抗癌作用。该化合物抑制多种 JmjC 去甲基化酶的能力使其成为研究组蛋白去甲基化在基因调控和癌症中作用的宝贵工具。然而,现有文献中并未提供具体的 IC50 值或详细的活性数据。
体内研究 (In Vivo)
JIB-04 Z-异构体已在体内进行了抗癌活性研究。该化合物通过抑制JmjC组蛋白去甲基化酶,调节基因表达并抑制肿瘤生长。然而,现有资料中并未提供动物模型中具体的体内疗效数据。该化合物仅供研究使用,不得用于临床治疗。
酶活实验
对于 JmjC 组蛋白去甲基化酶抑制剂,标准的无细胞检测方法是使用生物素标记的组蛋白肽作为底物,测定重组 JmjC 酶的去甲基化酶活性。将化合物与酶和底物孵育,然后通过 AlphaScreen、ELISA 或质谱法检测去甲基化反应,以确定 IC50 值。
细胞实验
对于JmjC组蛋白去甲基化酶抑制剂,标准细胞实验包括用测试化合物处理癌细胞系48-72小时。组蛋白甲基化水平(例如H3K4me3、H3K9me3、H3K36me3)通过蛋白质印迹法或质谱法测定。基因表达变化通过RNA测序或qPCR进行评估。细胞活力(MTT或CellTiter-Glo法)和增殖情况也需进行评估。
动物实验
为了在体内评估 JmjC 组蛋白去甲基化酶抑制剂,标准动物模型包括使用对 JmjC 抑制敏感的癌细胞系构建的肿瘤异种移植模型。该化合物通常经口服或腹腔注射给药,持续 2-4 周。评估指标包括肿瘤生长、组蛋白甲基化、基因表达和生存率。
药代性质 (ADME/PK)
现有资料中未提供JIB-04 Z-异构体的详细药代动力学数据。作为一种具有中等亲脂性的小分子,预计其具有良好的细胞渗透性。治疗开发需要进行全面的药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有资料中未提供JIB-04 Z异构体的详细毒理学数据。作为一种靶向组蛋白去甲基化酶的研究化合物,其治疗开发需要进行标准的临床前毒理学研究。该化合物对正常细胞中组蛋白甲基化和基因表达的影响需要进行评估。该化合物仅供研究使用,不得用于治疗用途。
参考文献
[1]. Wang L, et al. A small molecule modulates Jumonji histone demethylase activity and selectively inhibits cancer growth. Nat Commun. 2013;4:2035.
其他信息
JIB-04 Z-异构体是一种JmjC组蛋白去甲基化酶的泛抑制剂,靶向KDM4、KDM5及其他家族成员。研究人员已对其抗癌活性以及通过组蛋白甲基化改变调控基因表达的能力进行了研究。目前尚未发现任何监管部门批准的药物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H13CLN4
分子量
308.76492190361
精确质量
308.082
CAS号
199596-24-2
相关CAS号
JIB-04;199596-05-9
PubChem CID
6519698
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
472.9±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
239.8±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.2 mmHg at 25°C
折射率
1.644
LogP
3.92
tPSA
50.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
368
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1=CN=C(C=C1)N/N=C(/C1C=CC=CN=1)\C1C=CC=CC=1
InChi Key
YHHFKWKMXWRVTJ-XLNRJJMWSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H13ClN4/c18-14-9-10-16(20-12-14)21-22-17(13-6-2-1-3-7-13)15-8-4-5-11-19-15/h1-12H,(H,20,21)/b22-17-
化学名
(Z)-5-chloro-2-(2-(phenyl(pyridin-2-yl)methylene)hydrazinyl)pyridine
别名
JIB-04 Z-isomer, NSC-693627 NSC 693627 NSC693627.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~6 mg/mL (~19.43 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.6 mg/mL (1.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 6.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 0.6 mg/mL (1.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 6.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 0.6 mg/mL (1.94 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 6.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.2388 mL 16.1938 mL 32.3876 mL
5 mM 0.6478 mL 3.2388 mL 6.4775 mL
10 mM 0.3239 mL 1.6194 mL 3.2388 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们