K-Ras-IN-1

别名: K-Ras-IN-1; K-Ras-IN1; K-Ras-IN 1; K-Ras Inhibitor-1; K-Ras Inhibitor 1 (2-羟基苯基)-1-吡咯烷基甲硫酮; K-Ras-IN-1
目录号: V2944 纯度: ≥98%
K-Ras-IN-1(以前称为 K-Ras-Inhibitor-1)是一种新型小分子 K-Ras 抑制剂,可与 apo-Ras 中被 Tyr-71 占据的疏水口袋中的 K-Ras 结合换句话说,K-Ras-IN-1 在开关 I 和开关 II 之间直接与 K-Ras 结合,并抑制 Sos 催化的 K-Ras 激活。
K-Ras-IN-1 CAS号: 84783-01-7
产品类别: Ras
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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纯度: ≥98%

产品描述
K-Ras-IN-1(以前称为 K-Ras-Inhibitor-1)是一种新型小分子 K-Ras 抑制剂,可与载脂蛋白中被 Tyr-71 占据的疏水口袋中的 K-Ras 结合-Ras晶体结构,换句话说,K-Ras-IN-1直接与开关I和开关II之间的K-Ras结合,并抑制Sos催化的K-Ras激活。通过与 K-Ras 结合并阻断与 Sos 的结合,它会抑制 Sos 介导的核苷酸交换。 K-Ras-IN-1 代表了获得探针分子的起点,这些探针分子可用于阐明 Ras 信号传导的新见解和发现用于治疗癌症的 K-Ras 抑制剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
K-Ras
体外研究 (In Vitro)
体外活性:K-Ras-IN-1 是一种新型小分子 K-Ras 抑制剂,在 apo-Ras 晶体结构中被 Tyr-71 占据的疏水口袋中与 K-Ras 结合,换句话说,K -Ras-IN-1 直接与开关 I 和开关 II 之间的 K-Ras 结合,并抑制 Sos 催化的 K-Ras 激活。通过与 K-Ras 结合并阻断与 Sos 的结合,它会抑制 Sos 介导的核苷酸交换。 K-Ras-IN-1 代表了获得探针分子的起点,这些探针分子可用于阐明 Ras 信号传导的新见解和发现用于治疗癌症的 K-Ras 抑制剂。激酶测定:为了检查与 K-Ras 结合的功能后果,测试了化合物抑制 Sos 介导的核苷酸交换的能力。在此测定中,未标记的 GDP 被 Sos 催化的 BODIPY-GTP 交换,导致荧光增加。
酶活实验
测试了阻断 Sos 介导的核苷酸交换的化合物的能力,以研究与 K-Ras 结合的功能效应。在这个实验中,BODIPY-GTP 被替换为未标记的 GDP,它被 Sos 催化并导致荧光增强。
动物实验


参考文献

[1]. J Chem Inf Model . 2014 Feb 24;54(2):530-8.

[2]. Angew Chem Int Ed Engl . 2012 Jun 18;51(25):6140-3.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H13NOS
分子量
207.29
精确质量
207.071
元素分析
C, 63.74; H, 6.32; N, 6.76; O, 7.72; S, 15.47
CAS号
84783-01-7
相关CAS号
84783-01-7
PubChem CID
551134
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
332.1±44.0 °C at 760 mmHg
闪点
154.7±28.4 °C
蒸汽压
0.0±0.7 mmHg at 25°C
折射率
1.668
LogP
2.06
tPSA
55.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
2
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
14
分子复杂度/Complexity
213
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S=C(N1CCCC1)C1C(O)=CC=CC=1
InChi Key
QIKLOVZAPGSYNO-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H13NOS/c13-10-6-2-1-5-9(10)11(14)12-7-3-4-8-12/h1-2,5-6,13H,3-4,7-8H2
化学名
(2-hydroxyphenyl)-pyrrolidin-1-ylmethanethione
别名
K-Ras-IN-1; K-Ras-IN1; K-Ras-IN 1; K-Ras Inhibitor-1; K-Ras Inhibitor 1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ≥ 28 mg/mL
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (12.06 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (12.06 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (12.06 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.8242 mL 24.1208 mL 48.2416 mL
5 mM 0.9648 mL 4.8242 mL 9.6483 mL
10 mM 0.4824 mL 2.4121 mL 4.8242 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • K-Ras-IN-1

    Ribbon and molecular surface representations of the X-ray co-crystal structures of GDP-K-Ras complexed to: a)4(PDB code 4EPV), b)5(PDB code 4EPW), c)2(PDB code 4EPT) and d)6(PDB code 4EPX).2012 Jun 18;51(25):6140-3.

  • K-Ras-IN-1

    Electrostatic surface representations of GDP-K-Ras a) in the absence of a ligand (PDB code 4EPR) and b) in the “open” form showing the primary hydrophobic binding pocket and the adjacent electronegative cleft. c) Schematic representation of the transition of GDP-K-Ras from the “closed” form (green) to the “open” form (cyan).2012 Jun 18;51(25):6140-3.

  • K-Ras-IN-1

    a) Ribbon and molecular surface representations of GDP-bound K-Ras complexed to13(PDB code 4EPY). b) K-Ras/13X-ray structure overlaid with a previously reportedRas-Sos complex crystal structure (PDB code 1BKD).

    2012 Jun 18;51(25):6140-3.

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