K-Ras-PDEδ-IN-1

别名: KY-226; KY 226; KY226;
目录号: V2209 纯度: ≥98%
K-Ras-PDEδ-IN-1 是一种新型、有效的竞争性 K-Ras-PDEδ 抑制剂。
K-Ras-PDEδ-IN-1 CAS号: 1841464-21-8
产品类别: Phosphodiesterase(PDE)
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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纯度: ≥98%

产品描述
K-Ras-PDEδ-IN-1 是一种新型、有效的竞争性 K-Ras-PDEδ 抑制剂。 K-Ras-PDEδ-IN-1 以 8 nM 的低纳摩尔 Kd 与 PDEδ 的法尼基结合袋结合。
生物活性&实验参考方法
靶点
Phosphodiesterase δ (PDEδ) prenyl binding site (Ki = 1.2 nM; KD = 1.5 nM, determined by SPR) [1]
体外研究 (In Vitro)
PaTu8902/Panc1 CTG 测试得出 K-Ras-PDEδ-IN-1 的 IC50 值为 12.3 μM [1]。
K-Ras-PDEδ-IN-1 特异性结合人重组PDEδ的异戊烯结合位点,荧光偏振实验测得Ki = 1.2 nM,表面等离子体共振(SPR)测得KD = 1.5 nM [1]
- 荧光偏振竞争实验中,K-Ras-PDEδ-IN-1 呈剂量依赖性抑制PDEδ与荧光标记异戊烯底物的相互作用,IC50 = 1.4 nM [1]
- 免疫荧光染色显示,K-Ras-PDEδ-IN-1(5 μM-20 μM)诱导HCT116结直肠癌细胞(K-Ras G12D突变)中K-Ras G12D向细胞质滞留,10 μM剂量下较溶媒对照组减少65%的K-Ras膜定位 [1]
- K-Ras-PDEδ-IN-1 抑制K-Ras突变癌细胞系增殖:HCT116(G12D,IC50 = 5.8 μM)、MiaPaCa-2(G12C,IC50 = 6.3 μM)、SW480(G12V,IC50 = 7.1 μM)[1]
- 对K-Ras野生型细胞系无显著抗增殖活性:A549(IC50 > 50 μM)、MCF-7(IC50 > 50 μM)[1]
- Western blot分析显示,K-Ras-PDEδ-IN-1(10 μM-20 μM)呈剂量依赖性降低HCT116细胞中ERK1/2磷酸化水平(p-ERK1/2),20 μM时降低58%,表明Ras-MAPK信号通路被抑制 [1]
体内研究 (In Vivo)
K-Ras-PDEδ-IN-1(10 mg/kg;单剂量)通过四种不同的载体口服或腹膜内 (IP) 注射:A = 5% Tween-80、50% NaCl、45% H2O; B = 20% DMSO, 80% PEG200; C = 15% DMSO、9.5% Cremophor EL/EtOH (1:1)、75.5% H2O。仅在口服给药后,该化学物质在血浆中的含量极低;然而,用载体 A、B 或 C 腹膜内递送 10 mg/kg 后,血浆浓度显着增加 [1]。与化合物 93 的 t1/2 值相比,K-Ras-PDEδ-IN-1(静脉注射;3 mg kg;单剂量;24 小时)显示出显着更高的终末半衰期(t1/2=0.4 小时) 、CO、AUC0-tz、AUC0.inf-obs、Clob 和 Vss0-inf-obs,分别为 4.1 小时、2790.9 ng/ml、1646.4 h.ng/ml、1662.5 h.ng/ml、1.8 升/小时/kg 和 5.9 升/kg[1]。
酶活实验
荧光偏振(FP)实验:将人重组PDEδ与荧光标记的异戊烯底物在结合缓冲液中于25°C孵育30分钟。加入系列稀释的K-Ras-PDEδ-IN-1(0.01 nM-100 nM),继续孵育60分钟。通过酶标仪检测荧光偏振值,采用竞争曲线非线性回归分析计算IC50/Ki值 [1]
- 表面等离子体共振(SPR)实验:将人重组PDEδ共价固定在传感器芯片上。K-Ras-PDEδ-IN-1 用运行缓冲液配制为0.3125 nM-20 nM的系列浓度,以恒定流速流经芯片表面。实时记录结合响应值(共振单位),采用1:1结合模型计算KD值 [1]
细胞实验
K-Ras定位实验(免疫荧光):将HCT116细胞接种在盖玻片上,培养24小时。用K-Ras-PDEδ-IN-1(5 μM-20 μM)或溶媒处理细胞16小时后,固定并透化。封闭后,加入K-Ras特异性一抗和荧光标记二抗孵育。通过共聚焦显微镜观察K-Ras的膜定位和细胞质定位,量化膜/细胞质信号比 [1]
- 细胞增殖实验:将K-Ras突变型(HCT116、MiaPaCa-2、SW480)和野生型(A549、MCF-7)细胞系接种于96孔板,培养24小时。用系列稀释的K-Ras-PDEδ-IN-1(0.1 μM-100 μM)处理细胞72小时,基于线粒体脱氢酶活性的比色法评估细胞活力,计算IC50值 [1]
- Ras-MAPK信号通路Western blot分析:HCT116细胞经K-Ras-PDEδ-IN-1(5 μM-20 μM)处理24小时后裂解,蛋白提取物经SDS-PAGE电泳后转移至膜上,用p-ERK1/2和总ERK1/2抗体孵育。通过光密度法量化条带强度,计算相对于溶媒对照组的倍数变化 [1]
参考文献

[1]. Development of Pyridazinone Chemotypes Targeting the PDEδ Prenyl Binding Site. Chemistry. 2017 May 2;23(25):6083-6093.

其他信息
K-Ras-PDEδ-IN-1 是一种新型的哒嗪酮衍生的小分子抑制剂,靶向 PDEδ 的异戊二烯结合位点 [1]
- 其作用机制涉及与 PDEδ 的异戊二烯口袋竞争性结合,破坏 PDEδ 与异戊二烯化的 K-Ras 之间的相互作用。这可以阻止K-Ras转运至质膜并锚定于质膜,从而阻断下游Ras-MAPK信号通路(ERK1/2磷酸化),而该通路对肿瘤细胞增殖至关重要[1]
- 该化合物对K-Ras突变型癌细胞具有选择性抗增殖活性,对K-Ras野生型细胞无显著影响,表明其对K-Ras驱动型肿瘤具有特异性[1]
- 该化合物有望成为治疗携带K-Ras激活突变(例如G12D、G12C、G12V)的癌症的潜在治疗药物,这些突变通常与结直肠癌、胰腺癌和肺癌的耐药性相关[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H26FN5O2
分子量
447.504648685455
精确质量
481.174
元素分析
C, 67.33; H, 6.49; N, 2.91; O, 9.96; S, 13.31
CAS号
1841464-21-8
PubChem CID
118583099
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.5
tPSA
79.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
716
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC1C=CC(=CC=1)CCNC(CCCN1C(C2C(=CN(C3C=CC(C)=CC=3)N=2)C(C)=N1)=O)=O
InChi Key
RRELLHHWESTKAK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H26FN5O2/c1-17-5-11-21(12-6-17)31-16-22-18(2)28-30(25(33)24(22)29-31)15-3-4-23(32)27-14-13-19-7-9-20(26)10-8-19/h5-12,16H,3-4,13-15H2,1-2H3,(H,27,32)
化学名
N-(4-fluorophenethyl)-4-(4-methyl-7-oxo-2-(p-tolyl)-2,7-dihydro-6H-pyrazolo[3,4-d]pyridazin-6-yl)butanamide
别名
KY-226; KY 226; KY226;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~12.5 mg/mL (~27.93 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 1.25 mg/mL (2.79 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2346 mL 11.1732 mL 22.3464 mL
5 mM 0.4469 mL 2.2346 mL 4.4693 mL
10 mM 0.2235 mL 1.1173 mL 2.2346 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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