KRCA-0008

别名: KRCA-0008; KRCA0008; KRCA 0008
目录号: V23301 纯度: ≥98%
KRCA-0008 是一种新型、有效的 Ack1 和间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 双重抑制剂,对 ALK 和 Ack1 的 IC50 分别为 12 nM/4 nM;显示出类似药物的特性,而无需 hERG 责任。
KRCA-0008 CAS号: 1472795-20-2
产品类别: ALK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
KRCA-0008 具有类药特性,且不影响 hERG 受体。它是一种新型高效的间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 和 Ack1 双重抑制剂,对 ALK 和 Ack1 的 IC50 值分别为 12 nM 和 4 nM。
KRCA-0008 是一种新型高效选择性的小分子间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 和活化的 Cdc42 相关激酶 1 (ACK1/TNK2) 双重抑制剂。它属于双邻烷氧基对哌嗪取代的 2,4-二苯胺基嘧啶类化合物,分子量为 609.12 g/mol,分子式为 C₃₀H₃₇ClN₈O₄。 KRCA-0008 主要用作肿瘤学研究工具,用于研究 ALK 和 ACK1 在癌细胞增殖和存活中的作用。它具有类药特性,且不具有 hERG 靶向性,表明其作为一种激酶抑制剂具有良好的安全性。该化合物的双重靶向机制使其成为研究由 ALK 或 ACK1 信号异常驱动的癌症(包括各种实体瘤和血液系统恶性肿瘤)的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
ALK (IC50 = 12 nM); Ack1 (IC50 = 4 nM)
KRCA-0008 targets two distinct kinases: anaplastic lymphoma kinase (ALK) and activated Cdc42-associated kinase 1 (ACK1, also known as TNK2). ALK is a receptor tyrosine kinase that, when activated through mutation, amplification, or chromosomal translocation, drives oncogenesis in several cancers, notably non-small cell lung cancer and anaplastic large cell lymphoma. ACK1 is a non-receptor tyrosine kinase that plays a critical role in cell proliferation, survival, and migration, and its overexpression or mutation is implicated in various cancers. KRCA-0008 acts as a potent dual inhibitor by binding to the ATP-binding pocket of both kinases, thereby blocking their enzymatic activity and downstream signaling pathways.
体外研究 (In Vitro)
KRCA-0008 (0-1000 μM) 对 ALK (wt)、ALK L1196 M、ALK C1156Y、ALK F1174L、ALK R1275Q 和胰岛素受体均表现出抑制活性,其 IC50 值分别为 12、75、4、17、17 和 17。KRCA-0008 (0-1000 nM;4 小时) 抑制 ALK 依赖性信号通路调控的效率高于克唑替尼 [2]。在 210 nM 浓度下,KRCA-0008 (0-1000 nM;72 小时) 可刺激细胞 [1]。KRCA-0008 的半衰期为 48 小时 (0-100 nM) [2]。体外实验表明,KRCA-0008 对其靶点具有强效的酶抑制作用。该化合物对ALK的抑制IC₅₀为12 nM,对ACK1的抑制IC₅₀为4 nM。如此高的抑制活性转化为显著的细胞活性,该化合物对H3122肺癌细胞(一种ALK驱动型癌症的模型细胞)的增殖具有抑制作用,IC₅₀为80 nM。该化合物有效抑制这两种激酶的能力凸显了其作为强效抗癌药物的潜力,以及作为研究ALK和ACK1在癌症生物学中联合作用的重要研究工具的价值。
体内研究 (In Vivo)
KRCA-0008(25 和 50 mg/kg;侧位给药,每日两次,间歇给药)可抑制 ALK 阳性 Karpas-299 异种移植瘤模型的发展 [2]。
现有文献中关于 KRCA-0008 的详细体内活性数据报道不多。然而,作为一种高效且选择性的 ALK 和 ACK1 抑制剂,KRCA-0008 具有良好的类药特性,预计其在肿瘤模型中具有体内疗效。该化合物对这两种临床相关激酶的双重靶向作用提示其具有显著的体内抗肿瘤活性。需要开展进一步的体内研究,例如异种移植瘤模型研究,以全面评估其治疗潜力。
酶活实验
KRCA-0008 的非细胞体外检测通常包括使用纯化的重组 ALK 和 ACK1 酶进行激酶活性测定。将该化合物与激酶、肽底物和 ATP 在不同浓度下孵育。通过定量底物磷酸化来测定激酶活性,所用技术包括放射性检测(例如,³³P-ATP 掺入)、荧光偏振或基于 ELISA 的检测。根据剂量反应曲线确定 IC₅₀ 值,例如 ALK 和 ACK1 的 IC₅₀ 值分别为 12 nM 和 4 nM。进行针对一系列其他激酶的选择性分析以确认其特异性。
细胞实验
细胞增殖分析[1]
细胞类型: H3122 和 H1993 细胞系
测试浓度: 200 nM
孵育时间: 6 小时
实验结果: 抑制 H3122 和 H1993 细胞的增殖,IC50 分别为 0.08 nM 和 3.6 nM。
细胞增殖试验[2]
细胞类型: NPM-ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤细胞系(Karpas-299和SU-DHL-1)和NPM-ALK阴性淋巴瘤细胞系U937
测试浓度: 200 nM
孵育时间: 72小时
实验结果: 增殖受到抑制。Karpas-299、SU-DHL-1和U937细胞的GI50分别为12 nM、3 nM和3.5 μM。
蛋白质印迹分析[2]
细胞类型: Karpas-299 和 SU-DHL-1 细胞系
测试浓度: 0、10、100 和 1000 nM
孵育时间: 4 小时
实验结果: 在 NPM-ALK 阳性 ALCL 细胞中,100 nM 剂量下 ALK 及其效应分子的磷酸化完全受到抑制。
细胞凋亡分析[2]
细胞类型: SU-DHL-1 细胞系
测试浓度: 0-1 μM
孵育时间: 72 小时
实验结果: cspase-3/7 活性呈剂量依赖性增加,并诱导细胞凋亡。细胞周期分析
使用多种癌细胞系,特别是 ALK 或 ACK1 驱动的细胞系(例如 H3122 肺癌细胞),对 KRCA-0008 进行细胞分析。将细胞用不同浓度的化合物处理特定时间。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 等标准细胞活力检测方法评估细胞增殖。对该化合物抑制细胞生长的能力进行定量分析,并确定其IC₅₀值,例如H3122细胞的IC₅₀值为80 nM。机制研究包括Western blotting实验,以评估ALK和ACK1磷酸化及其下游信号通路的抑制情况。
动物实验
动物/疾病模型:携带 Karpas-299 异种移植瘤的 NOD/SCID(重症联合免疫缺陷)小鼠[2]
剂量:25 和 50 mg/kg
给药途径:口服(po);25 和 50 mg/kg,每日两次;持续两周
实验结果:通过抑制 NPM-ALK 磷酸化显著抑制肿瘤生长,且未表现出明显的毒性或与化合物相关的显著体重减轻。
需要建立 KRCA-0008 的体内动物模型来评估其治疗潜力。基于其作为 ALK 和 ACK1 双重抑制剂的作用机制,相关模型可以包括携带 ALK 驱动或 ACK1 驱动的癌细胞系的免疫缺陷小鼠的异种移植瘤研究。该化合物将通过适当途径(例如,灌胃)以不同剂量给药。将持续监测肿瘤生长抑制情况。将评估肿瘤组织中ALK和ACK1磷酸化等药效学标志物,以确认靶点结合情况。现有文献中未广泛报道详细的实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
KRCA-0008 的分子量为 609.12 g/mol,分子式为 C₃₀H₃₇ClN₈O₄,CAS 编号为 1472795-20-2。该化合物为固体,纯度 ≥96.2%,可溶于 DMSO。储存条件:-20°C。该化合物具有类药特性,且不具有 hERG 受体阻滞作用,表明其作为激酶抑制剂具有良好的药代动力学特征,包括良好的生物利用度和代谢稳定性。然而,其详细的药代动力学参数,例如半衰期、Cmax 和分布容积,尚未见详细报道。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中关于KRCA-0008的详细毒理学数据报道并不多。该化合物表现出类似药物的特性,且不具有hERG受体阻滞作用,这表明其心脏毒性风险较低,而心脏毒性是激酶抑制剂常见的风险。作为一种研究用化合物,其完整的安全性需要通过标准的临床前毒性评估来确定。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全操作规程。
参考文献

[1]. Novel bis-ortho-alkoxy-para-piperazinesubstituted-2,4-dianilinopyrimidines (KRCA-0008) as potent and selective ALK inhibitors for anticancer treatment. Bioorg Med Chem Lett. 2013 Nov 15;23(22):6192-6.

[2]. KRCA-0008 suppresses ALK-positive anaplastic large-cell lymphoma growth. Invest New Drugs. 2020 Oct;38(5):1282-1291.

其他信息
KRCA-0008 的化学名称为 1,1'-(4,4'-(((5-氯嘧啶-2,4-二基)双(氮杂二基))双(3-甲氧基-4,1-亚苯基))双(哌嗪-4,1-二基))二乙酮。它是一种强效、选择性的 ALK 和 ACK1 双重抑制剂,IC₅₀ 值分别约为 12 nM 和 4 nM。该化合物对 H3122 肺癌细胞的增殖具有抑制作用,IC₅₀ 值为 80 nM。它具有类药特性,且不影响 hERG 通道。KRCA-0008 是研究 ALK 和 ACK1 在癌症中的作用以及开发新型抗癌疗法的宝贵研究工具。本品仅供实验室研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H37CLN8O4
分子量
609.12
精确质量
608.262
元素分析
C, 59.16; H, 6.12; Cl, 5.82; N, 18.40; O, 10.51
CAS号
1472795-20-2
相关CAS号
1472795-20-2
PubChem CID
72547474
外观&性状
White to gray solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
870.2±75.0 °C at 760 mmHg
闪点
480.1±37.1 °C
蒸汽压
0.0±0.3 mmHg at 25°C
折射率
1.643
LogP
0.75
tPSA
115
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
919
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1=C([H])N=C(N=C1N([H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1OC([H])([H])[H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C(C([H])([H])[H])=O)C([H])([H])C1([H])[H])N([H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1OC([H])([H])[H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C(C([H])([H])[H])=O)C([H])([H])C1([H])[H]
InChi Key
TXDIRJCYNAWBOS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H37ClN8O4/c1-20(40)36-9-13-38(14-10-36)22-5-7-25(27(17-22)42-3)33-29-24(31)19-32-30(35-29)34-26-8-6-23(18-28(26)43-4)39-15-11-37(12-16-39)21(2)41/h5-8,17-19H,9-16H2,1-4H3,(H2,32,33,34,35)
化学名
1-[4-[4-[[2-[4-(4-acetylpiperazin-1-yl)-2-methoxyanilino]-5-chloropyrimidin-4-yl]amino]-3-methoxyphenyl]piperazin-1-yl]ethanone
别名
KRCA-0008; KRCA0008; KRCA 0008
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~230 mg/mL (~377.6 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5.75 mg/mL (9.44 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,将 100 μL 57.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 5.75 mg/mL (9.44 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 57.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (2.05 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6417 mL 8.2086 mL 16.4171 mL
5 mM 0.3283 mL 1.6417 mL 3.2834 mL
10 mM 0.1642 mL 0.8209 mL 1.6417 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们