KU-0063794

别名: Ku0063794; Ku 0063794; KU0063794; Ku-0063794; KU-0063794; KU 0063794; KU 63794; 81HJG228AB; CHEMBL1078983; KU-63794; KU63794 5-[2-[(2R,6S)-2,6-二甲基-4-吗啉基]-4-(4-吗啉基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基]-2-甲氧基苯甲醇;KU0063794
目录号: V0179 纯度: ≥98%
KU-0063794 是一种新型、有效、细胞渗透性和选择性的 mTOR(哺乳动物雷帕霉素靶标)抑制剂,具有潜在的抗癌活性。
KU-0063794 CAS号: 938440-64-3
产品类别: mTOR
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
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纯度: ≥98%

产品描述
KU-0063794 是一种新型、有效、细胞渗透性和选择性 mTOR(雷帕霉素靶点)抑制剂,具有潜在的抗癌活性。它的 IC50 小于 10 nM,可抑制 mTORC1 和 mTORC2。 76 种其他蛋白激酶和 7 种脂质激酶,包括浓度高 1000 倍的 1 类 PI3K(磷酸肌醇 3-激酶),不受其抑制。此外,Ku-0063794 还可阻止 PDK1 磷酸化 Akt 的 T 环 Thr308 残基。此外,Ku-0063794 抑制细胞生长并导致 G1 细胞周期停滞。确定 mTOR 的生理功能将会有所帮助,而 Ku-0063794 可能有助于治疗该通路被不必要激活的癌症。
生物活性&实验参考方法
靶点
mTORC1 (IC50 = 10 nM); mTORC2 (IC50 = 10 nM)
The primary targets of KU-0063794 are the mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) and mammalian target of rapamycin complex 2 (mTORC2). For purified mTOR kinase (in complex with GβL), the IC₅₀ value of KU-0063794 for inhibiting its kinase activity is approximately 10 nM. In HEK293 cells, the IC₅₀ for inhibiting mTORC1-mediated phosphorylation of p70S6K at Thr389 is about 11 nM, and the IC₅₀ for inhibiting mTORC2-mediated phosphorylation of Akt at Ser473 (in serum-starved and then stimulated HEK293 cells) is approximately 16 nM [1]
- KU-0063794 also targets the mTOR signaling pathway by suppressing both mTORC1 and mTORC2 activities in prostate cancer cell lines (e.g., PC-3 and LNCaP). In PC-3 cells, the IC₅₀ for inhibiting cell proliferation (a readout of mTOR pathway inhibition) is about 25 nM, and in LNCaP cells, the IC₅₀ is approximately 32 nM [2]
体外研究 (In Vitro)
与 mTOR 抑制剂 PP242 相比,KU-0063794 对 mTOR 表现出更高的特异性,因为对 PI3K 或 76 种其他激酶没有活性。在 HEK-293 细胞中,30 nM 的 KU-0063794 足以通过阻断疏水基序 (Thr389) 的磷酸化以及随后的 T 环残基 (Thr229) 的磷酸化来快速消除 S6K1 活性。在 IGF1 刺激后,需要 300 nM 的 KU-0063794 才能完全抑制血清饥饿的 HEK-293 细胞中的 S6K1 活性。此外,浓度为 100–300 nM 的 KU-0063794 完全抑制氨基酸引起的 S6K1 和 S6 蛋白磷酸化。与 S6K1 类似,KU-0063794 以剂量和时间依赖性方式阻断 mTORC1 Ser2448 和 mTORC2 Ser2481。 KU-0063794 对 Akt Ser473 和意外 Thr308 的活性和磷酸化产生剂量依赖性抑制,以及 Akt 底物 PRAS40 在 Thr246、GSK3/GSK3 在 Ser21/Ser9 和 Foxo-1/3a 在 Thr24 的磷酸化/Thr32 在血清存在下或 IGF1 刺激后。 KU-0063794(而非雷帕霉素)以剂量依赖性方式抑制 SGK1 活性和 Ser422 磷酸化及其生理底物 NDGR1,其程度与 S6K1 和 Akt 磷酸化相同。然而,KU-0063794 不会抑制佛波酯诱导的 ERK 或 RSK 磷酸化或 RSK 激活。与雷帕霉素相比,KU-0063794 导致 4E-BP1 Thr37、Thr46 和 Ser65 完全去磷酸化的效力明显更高。 KU-0063794 比雷帕霉素更显着地抑制具有野生型和 mLST8 缺陷突变的 MEF 中的细胞生长,并导致 G1 细胞周期停滞。 [1]
激酶活性抑制:KU-0063794可强效抑制纯化mTOR激酶的活性。当与重组mTOR-GβL复合物孵育时,药物以剂量依赖性方式降低mTOR底物(如4E-BP1片段)的磷酸化水平,IC₅₀为10 nM。该药物对mTOR具有高选择性,即使在浓度高达1 μM时,也未显著抑制其他相关激酶(如PI3Kα、Akt1)的活性 [1]
- HEK293细胞中的信号通路调控:用KU-0063794处理HEK293细胞后,mTORC1和mTORC2下游信号通路被剂量依赖性抑制。在50 nM浓度下,药物使p70S6K(Thr389,mTORC1底物)的磷酸化水平较未处理对照组降低80%以上,使Akt(Ser473,mTORC2底物)的磷酸化水平降低约70%。单次处理后,磷酸化抑制效应至少可维持24小时 [1]
- 前列腺癌细胞中的抗增殖活性:在PC-3(雄激素非依赖性)和LNCaP(雄激素依赖性)前列腺癌细胞系中,KU-0063794表现出剂量依赖性抗增殖作用。采用MTT法检测,处理72小时后,其IC₅₀在PC-3细胞中为25 nM,在LNCaP细胞中为32 nM。在100 nM浓度下,药物对PC-3细胞的增殖抑制率达90%,对LNCaP细胞的增殖抑制率达85%(相较于溶剂对照组) [2]
- 前列腺癌细胞中的凋亡诱导:KU-0063794可诱导PC-3细胞凋亡。用100 nM药物处理48小时后,Annexin V-FITC阳性细胞(早期凋亡细胞)比例从对照组的5%升至25%,Annexin V-FITC/PI双阳性细胞(晚期凋亡/坏死细胞)比例从对照组的3%升至12%。Western blot分析显示,药物使凋亡标志物切割型caspase-3的表达水平较对照组上调3倍 [2]
- 细胞周期阻滞:在PC-3细胞中,KU-0063794可导致细胞周期阻滞于G₁期。流式细胞术分析显示,用50 nM药物处理24小时后,G₁期细胞比例从对照组的55%升至72%,而S期细胞比例从对照组的30%降至15% [2]
体内研究 (In Vivo)
Ku0063794 在临床前肾细胞癌模型中抑制肿瘤生长和 mTOR 信号传导。然而,在动物研究中,Ku0063794 并不比替西罗莫司更有效。替西罗莫司对肿瘤微环境具有显着影响的事实可能是Ku0063794体内活性缺乏增加的原因。虽然 Ku0063794 对异种移植肿瘤的血管生成没有影响,但替西罗莫司却有影响。与用 Ku0063794 治疗的肿瘤相比,用替西罗莫司治疗的肿瘤表达的 VEGF 和 PDGF 水平较低,从而减少了血管生成[2]。
PC-3异种移植裸鼠的抗肿瘤活性:对携带皮下PC-3肿瘤的裸鼠进行KU-0063794处理。药物通过腹腔注射给药,剂量为15 mg/kg,每周2次,连续3周。与溶剂对照组相比,处理组肿瘤生长显著受抑:治疗结束时,平均肿瘤体积在处理组为320 mm³,对照组为910 mm³,肿瘤生长抑制率约为65%;药物还使肿瘤重量降低60%(平均肿瘤重量:处理组0.3 g vs 对照组0.75 g)。处理组小鼠未出现显著体重下降(体重变化<10%)或其他明显毒性症状 [2]
- 异种移植肿瘤中mTOR信号的调控:从KU-0063794处理组小鼠收集的肿瘤组织中,mTOR下游靶标的磷酸化水平降低。Western blot分析显示,肿瘤组织中p70S6K(Thr389)和Akt(Ser473)的磷酸化水平分别较对照组降低75%和65%。免疫组化染色也证实,处理组肿瘤中Ki-67(增殖标志物)阳性细胞比例降低(处理组20% vs 对照组60%) [2]
酶活实验
Specificity kinase panel/特异性激酶活性筛选[1]
\n所有检测均在国家蛋白激酶分析中心进行(http://www.kinase-screen.mrc.ac.uk/)如前所述。简而言之,所有检测都是在室温(21°C)下自动进行的,并且在所用条件下与时间和酶浓度呈线性关系。使用96孔形式的Multidrop Micro试剂分配器(Thermo Electron Corporation,Waltham,MA,U.S.A.)进行30分钟的分析。表1的图例中定义了每种激酶的缩写。测定中乙酸镁的浓度为10 mM,CK2α、DYRK3、EF2K、ERK1、ERK8、GSK3β、HIPK2、IGF1R、IRR、MARK3、MKK1、p38γMAPK(丝裂原活化蛋白激酶)、p38δMAPK、PAK4、PIM2、Akt1、PLK1、PKCζ和PRK2在5μm时使用[γ-33P]ATP(约800 c.p.m/pmol);20μM用于CaMKKβ、CDK2/细胞周期蛋白A、CHK1、CHK2、CK1δ、CSK、EPH-B3、FGF-R1、IR、JNK1α1、JNK2α2、MAPKAP-K2、MSK1、MST2、MST4、p38βMAPK、PKA、PAK5、PAK6、PDK1、PIM1、PIM3、PKCα、ROCKII、PRAK、S6K1、SGK1、SYK、VEGFR和YES1;或AMPK、BRSK2、BTK、CaMK1、DYRK1a、DYRK2、EPH-A2、ERK2、IKKε、LCK、MELK、NEK2A、NEK6、p38α、PhKγ1、Akt2、PKD1、RSK1、RSK2、SRPK1和TBK1为50μM,以达到或低于每种酶的ATP Km
\nLipid kinase pane/脂质激酶活性筛选[1]
\nSPHK1(鞘氨醇激酶1)的测定如下:在含有50 mM Tris/HCl、pH 7.5、150 mM NaCl、5 mM MgCl2、1 mM EGTA和1 mM DTT(二硫苏糖醇)的50μl终体积中,对SPHK1[稀释于50 mM Tris-HCl中,pH 7.5、150mM NaCl、5 mmol MgCl2、1mM EGTA、10μM鞘氨醇、10μM ATP和1 mM DT中]进行鞘氨醇测定,并在室温下孵育30分钟
\nSPHK2的测定如下:SPHK2(在50 mM Tris/HCl、pH 7.5、200 mM KCl、5 mM MgCl2、1 mM EGTA和1 mM DTT中稀释)在最终体积为50μl的鞘氨醇中进行了测定,其中含有50 mM Tris-HCl、pH 7.5200 mM KCl、5 mM氯化镁、1 mM EGFA、10μM鞘氨醇、1μM ATP和1 mM DT,并在室温下孵育30分钟
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\nView More\n\n胆碱激酶的测定如下:胆碱激酶(在25 mM甘氨酸/NaOH、pH 8.5、67 mM KCl和5 mM MgCl2中稀释)在最终体积为50μl的溶液中测定胆碱,该溶液含有25 mM甘氨酸/NaOH、pH8.5、67 mmol KCl、5 mM MgCl2、1 mM胆碱、1μM ATP和1 mM DTT,并在室温下孵育30分钟。通过加入50μl激酶-Glo Plus试剂,在室温下孵育10分钟并读取1秒/孔的读数,停止了这三次测定
\n1类PI3Kα的测定如下:PI3Kα(在50 mM Hepes、pH 7.5、150 mM NaCl、0.02%胆酸钠和1 mM DTT中稀释)针对PtdIns(4,5)P2 diC8进行测定,最终体积为50μl,含有37 mM Hepes,pH 7.5、111 mM NaCl、0.02%胆酸钠、5 mM DTT、5 mM MgCl2、1 mM ATP和2μM PtdIns。通过加入5.5μl 50 mM EDTA和0.02%(w/v)胆酸钠溶液停止测定。将所得混合物的等分试样(25μl)转移到Lumitrac 200平板上。加入检测混合物1[41 mM Hepes,pH 7.5,123 mM NaCl,1.7μg GST-GRP1(鸟嘌呤核苷酸释放蛋白1),0.16μM PtdIns(3,4,5)P3-生物素,1.6μg链霉抗生物素蛋白-别藻蓝蛋白和0.96μg/ml铕螯合标记抗体],使最终体积为50μl,在室温下孵育20分钟,然后读取
\n1类PI3Kβ的测定如下:PI3Kβ(在50 mM Hepes、pH 7.5、150 mM NaCl、0.02%胆酸钠和1 mM DTT中稀释)在最终体积为50μl的PtdIns(4,5)P2-diC8中进行了测定,其中含有37 mM Hepes,pH 7.5、111 mM NaCl、0.02%胆酸钠、5 mM DTT、5 mM MgCl2、1 mM ATP和2μM PtdNs(4.5)P2,并在室温下孵育70分钟。通过加入5.5μl 50 mM EDTA停止测定,并将25μl测定混合物转移到Lumitrac 200平板上。加入检测混合物1,使最终体积为50μl,在读取之前,将混合物在室温下孵育20分钟
\n第2类PI3KC2β的测定如下:在最终体积为50μl的含有19mM Tris/HCl、pH 7.5、143mM NaCl、0.96mM EDTA、0.96 mM DTT、0.96 mmol DTT、0.48mM EGTA、0.02%CHAPS、20μM磷脂酰肌醇、0.2mM ATP和2mM MgCl2的磷酸肌醇底物中,对PI3KClβ(在20mM Tris/HCl中稀释,pH 7.5、150mM NaCl、1mM DTT、0.5mM EGTA和0.02%CHAPS中)进行测定,并在室温下孵育30分钟。通过加入5.5μl 50 mM EDTA和2%CHAPS停止测定,并将25μl转移到Lumitrac 200平板上。加入检测混合物2(18.6 mM Tris/HCl,pH 7.5,140 mM NaCl,0.9 mM DTT,0.02%CHAPS,1.4μg SGK PX,0.06μM PtdIns3P–生物素,1.6μg链霉抗生物素蛋白–别藻蓝蛋白和0.64μg/ml Eu螯合物标记抗体),使最终体积为50 ml,在室温下孵育30分钟,然后读取
\n3类VPS34的测定如下:VPS34(在20 mM Tris/HCl、pH 7.5、150 mM NaCl、1 mM EDTA、1 mM DTT、0.5 mM EGTA和0.02%CHAPS中稀释)在最终体积为50μl的磷酸肌醇底物中进行测定,该底物含有19 mM Tris/HCl、pH 7.5,143 mM NaCl、0.96 mM EDTA、0.96 mmol DTT、0.48 mM EGTA、0.02%CHAPS、20μM磷脂酰肌醇、0.2 mM ATP和2 mM MnCl2,并在室温下孵育60分钟。通过加入5.5μl 50 mM EDTA和2%CHAPS停止测定,并将25μl转移到Lumitrac 200平板上。加入检测混合物2,使最终体积为50ml,在室温下孵育30分钟,然后读取
\nmTOR复合物激酶测定[1]
\nHEK-293细胞在Hepes裂解缓冲液中新鲜裂解。赖氨酸盐(1-4mg)通过与5-20μl与免疫前IgG结合的G蛋白琼脂糖孵育进行预清除。然后将裂解物提取物与5-20μl的G蛋白琼脂糖结合,该G蛋白琼脂糖与5-二十μG的抗Rictor或抗Raptor抗体或免疫前IgG结合。所有抗体均与G蛋白琼脂糖共价结合。在振动平台上于4°C下进行免疫沉淀1小时。用Hepes裂解缓冲液洗涤免疫沉淀物四次,然后用Hepes激酶缓冲液洗涤两次。对于用于磷酸化S6K1的Raptor免疫沉淀物,在最初的两个洗涤步骤中,缓冲液中含有0.5 M NaCl,以确保最佳的激酶活性[7]。GST-Akt1是从用PI-103(1μM)孵育1小时的无血清HEK-293细胞中分离出来的[24]。GST-S6K1从用雷帕霉素(0.1μM,1小时)孵育的无血清HEK-293细胞中纯化[25]。在有或没有Ku-0063794和GST-Akt1(0.5μg)或GST-S6K1(0.5μg)的情况下,通过添加0.1 mM ATP和10 mM MgCl2引发mTOR反应。在30°C的振动平台上进行反应30分钟,并通过加入SDS样品缓冲液停止反应。然后将反应混合物通过0.22-μm孔径的Spin-X过滤器过滤,并对样品进行电泳和免疫印迹分析
\n激酶测定[1]
\nHEK-293在Tris裂解缓冲液中裂解。为了进行Akt和S6K检测,将500μg裂解物与5μg与g蛋白琼脂糖偶联的相应抗体一起孵育。为了进行SGK1活性测定,将50μg转染的裂解物与5μg谷胱甘肽琼脂糖孵育。所有培养均在振动平台上在4°C下进行1小时。使用Crosstide肽(GRPRTSSFAEG)在30μM下精确测定激酶活性,如前所述[35]。通过将反应混合物施加到P81磷酸纤维素纸上,并在磷酸中洗涤纸张后进行放射性液体闪烁计数,确定[32P]磷酸盐掺入肽底物中的情况。一个活性单位被定义为催化1 nmol[32P]磷酸盐掺入底物的单位。[1]
\nHEK-293细胞在Hepes裂解缓冲液中新鲜裂解。通过将溶胞产物(1-4mg)与5-20L与免疫前IgG结合的G-糖蛋白孵育,溶胞产物被预先清除。之后,将5-20L的G-Sepharose蛋白与5-20g的抗Rictor或抗Raptor抗体或免疫前IgG偶联,与裂解物提取物一起孵育。G-琼脂糖蛋白与每种抗体共价偶联。免疫沉淀在4°C的振动平台上进行1小时。用Hepes裂解缓冲液洗涤免疫沉淀物四次,然后用Hepes激酶缓冲液洗涤两次。为了确保最佳的激酶活性,用于磷酸化S6K1的Raptor免疫沉淀物的前两个洗涤步骤的缓冲液含有0.5 M NaCl。在PI-103(1μM,1小时)孵育一小时后,从血清饥饿的HEK-293细胞中纯化GST-Akt1。GST-S6K1是从血清和雷帕霉素(0.1μM,1小时)耗尽的HEK-293细胞中分离出来的。为了启动mTOR反应,加入0.1 mM ATP和10 mM MgCl2,同时加入不同浓度的Ku-0063794和GST-Akt1(0.5μg)或GST-S6K1(0.5μg)。在振动平台上于30°C下运行30分钟后,加入SDS样品缓冲液会停止反应。之后,将反应混合物通过孔径为0.22米的Spin-X过滤器过滤,并使用指定的抗体对样品进行电泳和免疫印迹分析。\n

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mTOR激酶活性测定:首先将重组mTOR蛋白与GβL(mTOR结合蛋白)在含Tris-HCl(pH 7.5)、MgCl₂和DTT的反应缓冲液中形成复合物。将不同浓度的KU-0063794(0.1 nM至1 μM)加入mTOR-GβL复合物中,混合物在30°C预孵育15分钟。随后,加入含4E-BP1片段(特异性mTOR底物)和[γ-³²P]ATP的底物混合物启动反应,30°C孵育30分钟后,加入SDS上样缓冲液终止反应。通过SDS-PAGE分离磷酸化的4E-BP1片段,使用磷屏成像仪检测磷酸化底物条带的放射性。相较于溶剂对照组计算激酶活性抑制百分比,通过拟合剂量-反应曲线确定IC₅₀值 [1]
- 激酶选择性测定:使用一组重组激酶(包括PI3Kα、Akt1、ERK1和JNK1)评估KU-0063794对mTOR的选择性。每种激酶在各自优化的反应缓冲液中,与特异性底物、ATP(含用于放射性检测的[γ-³²P]ATP)以及1 μM KU-0063794(或溶剂)共同孵育,反应温度和时间针对每种激酶进行优化。反应终止后,采用与mTOR激酶测定相同的方法检测磷酸化底物,通过比较药物存在与否时各激酶的活性评估选择性 [1]
细胞实验
每 24 小时,将新一批新鲜溶解的 KU-0063794 添加到培养基中,并用其处理细胞 24、48 和 72 小时。将细胞固定在含 4% (v/v) 多聚甲醛的 PBS 中 15 分钟,以测量细胞生长。将细胞用水洗涤一次,用0.1%结晶紫的10%乙醇溶液染色20分钟,然后用水洗涤3次。使用 0.5 mL 10% (v/v) 乙酸 20 分钟从细胞中提取结晶紫。然后,将洗脱液以1:10的比例用水稀释,并测量590 nm处的吸光度。
细胞活力测定[2]
按照制造商的建议,使用CellTiter Glo®发光细胞活力测定试剂盒在96孔透明底部组织培养板中进行细胞活力测定。Caki-1、786-O或HUVEC细胞以足够低的密度铺板,以确保细胞永远不会达到完全融合。在细胞接种后一天,以指定浓度在三个孔中加入药物(Ku-0063794或坦西罗莫司)或赋形剂(DMSO)。在处理24、48、72和96小时后测量细胞存活率。使用Wallac 1420 VICTOR2™读板器测量发光。细胞活力以每个时间点对应阴性对照的百分比表示。使用Graphpad Prism(6.0版)计算抑制浓度(如IC50、IC30和IC20)。 细胞周期分布的流式细胞术分析[2]
将Caki-1和786-O细胞铺在10cm的细胞培养皿中,以使未经处理的对照在实验结束时达到50%的融合。在细胞接种后一天,将药物(Ku-0063794或坦西罗莫司)或载体(DMSO)以指定浓度加入三个重复孔中。处理72小时后,对每个培养皿中的活细胞进行计数。为了评估细胞周期分布,将细胞重新悬浮在70%乙醇(v/v)中。细胞在黑暗中用含有50µg/ml碘化丙啶和50µg/ml RNase A的PBS染色1小时。用FACS Calibur流式细胞仪和CellQuest软件测量细胞的DNA含量。使用Modfit LT软件确定细胞周期分布。
MTT细胞增殖测定:将PC-3和LNCaP细胞以每孔2×10³个细胞的密度接种于96孔板,在37°C、5% CO₂条件下培养过夜。次日,向孔中加入不同浓度的KU-0063794(1 nM至1 μM),每个浓度设3个复孔,同时设置溶剂对照组(含与药物组等量的DMSO)。细胞培养72小时后,每孔加入20 μL MTT溶液(5 mg/mL,溶于PBS),37°C继续孵育4小时。小心吸弃上清液,每孔加入150 μL DMSO溶解甲瓒结晶,使用酶标仪在570 nm波长处测定吸光度。细胞存活率按(药物组吸光度/对照组吸光度)×100%计算,通过绘制剂量-反应曲线获得IC₅₀值 [2]
- 信号蛋白Western blot分析:将HEK293、PC-3或LNCaP细胞以每孔5×10⁵个细胞的密度接种于6孔板,培养过夜。随后用不同浓度的KU-0063794(0、10、50、100 nM)处理细胞24小时。处理后,用冰预冷的PBS洗涤细胞2次,加入含蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂的RIPA裂解液裂解细胞。细胞裂解液在4°C、12,000 × g条件下离心15分钟,收集上清液(总蛋白)。采用BCA法测定蛋白浓度,每泳道上样30 μg蛋白,经10% SDS-PAGE分离后转移至PVDF膜。膜用含5%脱脂牛奶的TBST封闭1小时(室温),随后加入一抗(抗磷酸化p70S6K Thr389、抗p70S6K、抗磷酸化Akt Ser473、抗Akt、抗切割型caspase-3或抗GAPDH),4°C孵育过夜。次日,用TBST洗涤膜3次,加入HRP标记的二抗,室温孵育1小时。再次洗涤后,使用ECL化学发光试剂盒显影蛋白条带,用ImageJ软件定量条带强度 [1,2]
- Annexin V-FITC/PI凋亡测定:将PC-3细胞以每孔5×10⁵个细胞接种于6孔板,用100 nM KU-0063794(或溶剂)处理48小时。胰酶消化收集细胞,用冰预冷的PBS洗涤2次,重悬于1×结合缓冲液中,细胞浓度调整为1×10⁶个/mL。向100 μL细胞悬液中加入5 μL Annexin V-FITC和5 μL PI染色液,室温避光孵育15分钟后,加入400 μL 1×结合缓冲液。1小时内用流式细胞仪分析凋亡细胞,细胞分为四个象限:活细胞(Annexin V⁻/PI⁻)、早期凋亡细胞(Annexin V⁺/PI⁻)、晚期凋亡/坏死细胞(Annexin V⁺/PI⁺)和坏死细胞(Annexin V⁻/PI⁺) [2]
- 细胞周期分析:用50 nM KU-0063794(或溶剂)处理PC-3细胞24小时。收集细胞,用PBS洗涤后,加入70%冰预冷乙醇,4°C固定过夜。固定后的细胞用PBS洗涤2次,重悬于含RNase A(100 μg/mL)的PBS中,37°C孵育30分钟。随后加入PI染色液(50 μg/mL),室温避光孵育30分钟。用流式细胞仪分析细胞DNA含量,使用ModFit软件计算G₁、S、G₂/M期细胞比例 [2]
动物实验
Nu/Nu裸鼠
8 mg/kg
腹腔注射
异种移植模型[2]
六周龄雌性Nu/Nu裸鼠购自Charles River Laboratories。将约5×10⁶个786-O细胞皮下注射至小鼠侧腹部,待肿瘤直径达到5 mm后开始治疗。小鼠随机分为三组,分别腹腔注射DMSO(溶剂对照)、替西罗莫司(0.6 mg/kg)或Ku0063794(8 mg/kg),每日一次(每周五天)。每周至少测量两次肿瘤大小和体重。肿瘤体积采用标准公式(长×宽²)/2计算。治疗46天后处死小鼠并切除肿瘤。将肿瘤组织分割后,一部分置于液氮中速冻,另一部分置于10%中性缓冲福尔马林溶液中固定,并进行石蜡包埋(PE)。速冻后的肿瘤组织用组织匀浆器在去污剂裂解缓冲液中匀浆。取上清液进行蛋白质印迹分析。为制备注射用药物,将替西罗莫司溶解于DMSO中,配制成5 mM的储备液。腹腔注射前,将替西罗莫司稀释至15 µg/100 µl,稀释液为PEG1500(50% (w/v),溶于75 mM HEPES缓冲液,pH 8.0)。 Ku0063794 溶于一份 DMSO 中,然后用 4 份 PEG1500(50% (w/v),溶于 75 mM Hepes,pH 8.0)稀释至 200 µg/100 µl[2]。
PC-3 异种移植裸鼠模型建立及治疗:使用雄性 BALB/c 裸鼠(6-8 周龄,SPF 级)。收集对数生长期的 PC-3 细胞,用 PBS 洗涤,并重悬于浓度为 5×10⁷ 个细胞/mL 的细胞悬液中。将 0.2 mL 细胞悬液(1×10⁷ 个细胞)皮下注射到每只小鼠的右侧腹部,建立异种移植模型。当肿瘤体积达到约 100 mm³ 时,将小鼠随机分为两组(每组 n=6):溶剂对照组和 KU-0063794 治疗组。
- 药物配制和给药:将 KU-0063794 溶解于 DMSO、聚乙二醇 400 和生理盐水(体积比 1:4:5)的混合溶液中,配制成浓度为 3 mg/mL 的储备液。治疗组小鼠腹腔注射 KU-0063794,剂量为 15 mg/kg,每周两次,持续 3 周。对照组小鼠以相同途径和频率注射等体积的溶剂混合物。
- 数据采集和样本处理:在治疗期间,每周测量每只小鼠的体重两次,并使用游标卡尺测量肿瘤体积(肿瘤体积 = 长 × 宽² / 2)。治疗结束后,所有小鼠均被安乐死,肿瘤被切除、称重并拍照。部分肿瘤组织保存在-80℃用于Western blot分析,剩余部分用4%多聚甲醛固定用于免疫组织化学染色[2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
裸鼠体内毒性:用KU-0063794(15 mg/kg,腹腔注射,每周两次)治疗裸鼠3周,未观察到明显的毒性症状。治疗组小鼠体重保持稳定,最大体重下降小于初始体重的5%(对照组:体重增加3%,治疗组:体重增加1%)。治疗组未发现死亡、异常行为(例如活动减少、食欲不振)或器官损伤(安乐死后通过大体解剖观察到)[2]
- 两篇文献[1,2]中均未报道KU-0063794的体外毒性(例如对正常细胞的细胞毒性)、半数致死剂量(LD₅₀)、肝毒性、肾毒性、药物相互作用或血浆蛋白结合率等数据。
参考文献

[1]. Biochem J. 2009 Jun 12;421(1):29-42.

[2]. PLoS One. 2013;8(1):e54918.

其他信息
Ku-0063794 属于吡啶并嘧啶类化合物,是一种 mTOR 抑制剂,具有抗肿瘤特性。它既是 mTOR 抑制剂,也是一种抗肿瘤药物。它属于吗啉类、吡啶并嘧啶类、单甲氧基苯类、叔胺类化合物和苄醇类化合物。
KU-0063794 是一种小分子抑制剂,可特异性靶向 mTORC1 和 mTORC2,这与雷帕霉素及其类似物(仅抑制 mTORC1)不同。这种双重抑制作用使得KU-0063794能够同时阻断mTORC1介导的细胞增殖和mTORC2介导的Akt激活,从而发挥更强的抗肿瘤作用,尤其是在Akt信号激活的肿瘤中[1,2]
- 在HEK293细胞中,KU-0063794对mTOR信号的抑制是可逆的。从培养基中去除药物后,p70S6K 和 Akt 的磷酸化水平在 48 小时内逐渐恢复至对照水平,表明该药物的作用依赖于其持续存在 [1]
- KU-0063794 在 PC-3 异种移植小鼠中的抗肿瘤活性与肿瘤细胞增殖的抑制(Ki-67 表达降低)和细胞凋亡的诱导(cleaved caspase-3 上调)均相关,提示其在体内具有双重作用机制 [2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H31N5O4
分子量
465.5447
精确质量
465.237
元素分析
C, 64.50; H, 6.71; N, 15.04; O, 13.75
CAS号
938440-64-3
相关CAS号
938440-64-3
PubChem CID
16736978
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
694.3±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
373.7±34.3 °C
蒸汽压
0.0±2.3 mmHg at 25°C
折射率
1.609
LogP
0.27
tPSA
93.07
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
643
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@@H]1O[C@H](C)CN(C2N=C3N=C(C4C=CC(OC)=C(CO)C=4)C=CC3=C(N3CCOCC3)N=2)C1
InChi Key
RFSMUFRPPYDYRD-CALCHBBNSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H31N5O4/c1-16-13-30(14-17(2)34-16)25-27-23-20(24(28-25)29-8-10-33-11-9-29)5-6-21(26-23)18-4-7-22(32-3)19(12-18)15-31/h4-7,12,16-17,31H,8-11,13-15H2,1-3H3/t16-,17+
化学名
[5-[2-[(2R,6S)-2,6-dimethylmorpholin-4-yl]-4-morpholin-4-ylpyrido[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-2-methoxyphenyl]methanol
别名
Ku0063794; Ku 0063794; KU0063794; Ku-0063794; KU-0063794; KU 0063794; KU 63794; 81HJG228AB; CHEMBL1078983; KU-63794; KU63794
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~16 mg/mL (~34.4 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (3.59 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (3.59 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (3.59 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 30% PEG400+0.5% Tween80+5% propylene glycol: 13mg/mL

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1480 mL 10.7402 mL 21.4804 mL
5 mM 0.4296 mL 2.1480 mL 4.2961 mL
10 mM 0.2148 mL 1.0740 mL 2.1480 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Single Dose Study to Evaluate the Safety, and Efficacy of S-1226 (8%) in Subjects With Mild Atopic Asthma
CTID: NCT02334553
Phase: Phase 2
Status: Completed
Date: 2019-02-18
Phase1, Placebo-Controlled, Randomized, Double-blind, Single-ascending Dose Study in Healthy Subjects.
CTID: NCT02616770
Phase: Phase 1
Status: Completed
Date: 2015-11-30
生物数据图片
  • KU-0063794

    Ku-0063794 inhibits mTORC1 activity in vivo.2009 Jun 12;421(1):29-42.




  • KU-0063794

    Ku-0063794 inhibits both mTORC1 and mTORC2 complexesin vitro.2009 Jun 12;421(1):29-42.

  • KU-0063794

    Ku-0063794 ablates mTORC2in vivo.2009 Jun 12;421(1):29-42.

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