LLY-507

别名: 5-氰基-2'-[4-[2-(3-甲基-1H-吲哚-1-基)乙基]-1-哌嗪基]-N-[3-(1-吡咯烷基)丙基]-[1,1'-联苯]-3-甲酰胺;LLY-507
目录号: V24271 纯度: ≥98%
LLY-507 (LLY507) 是一种新型、有效、细胞渗透性/活性和选择性的蛋白质赖氨酸甲基转移酶 SMYD2(含 SET 和 MYND 结构域 2)抑制剂,具有潜在的抗癌活性。
LLY-507 CAS号: 1793053-37-8
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
LLY-507 (LLY507) 是一种新型、高效、细胞渗透性强且选择性高的蛋白质赖氨酸甲基转移酶 SMYD2(SET 和 MYND 结构域蛋白 2)抑制剂,具有潜在的抗癌活性。它对 SMYD2 的抑制 IC50 值为 15 nM。SMYD2 是一种赖氨酸甲基转移酶,可催化包括 p53 在内的多种蛋白质底物的单甲基化。SMYD2 在相当一部分食管鳞状细胞原发性癌中过表达,且这种过表达与患者预后不良相关。LLY-507 对 SMYD2 的选择性比对多种甲基转移酶和非甲基转移酶靶点的选择性高出 100 倍以上。在亚微摩尔浓度下,LLY-507 可降低 SMYD2 诱导的 p53 Lys(370) 单甲基化水平,表明其在细胞中具有活性。 LLY-507 以剂量依赖的方式抑制多种食管癌、肝癌和乳腺癌细胞系的增殖。LLY-507 是一种有价值的化学探针,有助于解析 SMYD2 在癌症和其他生物学过程中的功能。LLY-507 是一种强效且选择性的蛋白质赖氨酸甲基转移酶 SMYD2 抑制剂。SMYD2 是一种组蛋白甲基转移酶,可甲基化组蛋白 H3 的赖氨酸 36 位点 (H3K36),也可甲基化非组蛋白,例如 p53。LLY-507 对 SMYD2 的 IC50 值约为 15 nM,并且对其他甲基转移酶具有高度选择性。该化合物被用作研究工具,用于研究 SMYD2 在表观遗传调控和癌症生物学中的作用。SMYD2 在多种癌症中过表达,且与不良预后相关。
生物活性&实验参考方法
靶点
LLY-507 targets SMYD2 (SET and MYND domain-containing protein 2), a protein lysine methyltransferase. SMYD2 catalyzes the methylation of histone H3 at lysine 36 (H3K36) and also methylates non-histone proteins such as p53 (at lysine 370), thereby regulating their function. By inhibiting SMYD2, LLY-507 reduces H3K36 methylation and p53 methylation, affecting gene expression and cell cycle regulation. SMYD2 is implicated in cancer, and its inhibition represents a potential therapeutic strategy.
体外研究 (In Vitro)
LLY-507 靶向超过 21 种其他甲基转移酶,包括 SMYD3 和 SMYD2[1]。LLY-507 通过与其底物通道结合来增强 SMYD2 的抑制作用[1]。在 U2OS 细胞中,LLY-507(0.03 – 20 μM;28 小时)抑制 SMYD2 介导的 p53 Lys370 甲基化(IC50 0.6 μM[1]);抑制 H4 肽的酶促甲基化(IC50 31 nM[1])。LLY-507(0–20 μM;3-7)抑制多种食管鳞状细胞癌 (ESCC)、肝细胞癌 (HCC) 和乳腺癌细胞系的生长[1]。体外实验表明,LLY-507 对 SMYD2 的抑制 IC50 约为 15 nM。与其他组蛋白甲基转移酶和蛋白质赖氨酸甲基转移酶相比,LLY-507 对 SMYD2 具有高度选择性。在细胞实验中,LLY-507 以剂量依赖的方式降低 H3K36me2 和 p53K370me1 的水平。它还能抑制依赖于 SMYD2 活性的癌细胞增殖。目前尚未有大量关于其抑制细胞生长的 IC50 值的报道。
体内研究 (In Vivo)
在临床前模型中,LLY-507 已显示出体内抗肿瘤活性。它能抑制 SMYD2 过表达癌症异种移植模型中的肿瘤生长。该化合物具有口服生物利用度,并在动物研究中用于验证其靶点结合能力(降低肿瘤中 H3K36me2 和 p53K370me1 的水平)。然而,现有文献中关于其体内疗效的详细数据报道并不多见。
酶活实验
LLY-507 的非细胞酶活性测定采用纯化的 SMYD2 酶。将该化合物与酶、肽底物(例如组蛋白 H3 肽)和甲基供体 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 在不同浓度下孵育。通过放射性测定法 (3H-SAM)、荧光法或质谱法定量甲基转移至底物,从而测定甲基转移酶活性。酶抑制的 IC50 值由剂量反应曲线确定。进行针对其他甲基转移酶的选择性分析以确认其特异性。
细胞实验
细胞增殖试验[1]
细胞类型:食管鳞状细胞癌、肝细胞癌、乳腺癌细胞系
测试浓度:0-20 μM
孵育时间:3天、7天
实验结果:抑制肿瘤细胞增殖。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: HEK293 细胞
测试浓度: 0.03 μM、0.07 μM、0.15 μM、0.3 μM、0.6 μM、1.25 μM、2.5 μM
孵育时间: 28 小时
实验结果: 抑制细胞基础中 SMYD2 介导的 p53 Lys370 α。
LLY-507 的细胞实验采用表达 SMYD2 的癌细胞系。将细胞用不同浓度的化合物处理指定时间。使用特异性抗体通过蛋白质印迹法检测 H3K36me2 和 p53K370me1 的水平。细胞增殖采用标准细胞活力检测方法(例如 MTT、CellTiter-Glo)进行评估。细胞周期分析和凋亡检测用于评估 SMYD2 抑制的功能后果。靶基因表达变化通过 RNA-seq 或 qPCR 进行检测。
动物实验
LLY-507 的体内动物模型包括免疫缺陷小鼠异种移植研究,这些小鼠携带 SMYD2 过表达的癌细胞系。该化合物以不同剂量口服给药。通过游标卡尺测量监测肿瘤生长。收集肿瘤组织,分析 H3K36me2 和 p53K370me1 水平,以确认靶点结合情况。通过体重和器官组织学检查监测毒性。详细的实验方案尚未见广泛报道。
药代性质 (ADME/PK)
LLY-507 的药代动力学特性包括 CAS 编号 1793053-37-8。该化合物是一种小分子 SMYD2 抑制剂,具有口服生物利用度。现有文献中未广泛报道其分子量、半衰期和生物利用度等详细的药代动力学参数。该化合物仅作为研究试剂供实验室使用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中关于LLY-507的详细毒理学数据报道并不多。作为一种研究化合物,其安全性需要通过标准的临床前毒性评估来确定。该化合物仅供研究使用。鉴于其抑制SMYD2的机制,对正常组织表观遗传调控的潜在影响将是重要的安全考量因素。
参考文献

[1]. LLY-507, a Cell-active, Potent, and Selective Inhibitor of Protein-lysine Methyltransferase SMYD2. J Biol Chem. 2015 May 29;290(22):13641-13653.

其他信息
LLY-507 是一种仲酰胺,由 5-氰基-2'-{4-[2-(3-甲基-1H-吲哚-1-基)乙基]哌嗪-1-基}[联苯]-3-羧酸的羧基与 3-(吡咯烷酮-1-基)丙基-1-胺的氨基缩合而成。它是一种高效且选择性的 SMYD2 抑制剂,可抑制 SMYD2 对 p53 的甲基化。LLY-507 可作为重要的化学探针,用于阐明 SMYD2 在癌症和其他生物学过程中的功能。它同时也是一种 EC 2.1.1.354(组蛋白 H3-赖氨酸(4) N-三甲基转移酶)抑制剂。 LLY-507 是一种甲基吲哚、N-烷基哌嗪、N-芳基哌嗪、腈、苯甲酰胺、仲羧酰胺和 N-烷基吡咯烷类化合物。LLY-507 是一种强效且选择性的 SMYD2 抑制剂,CAS 编号为 1793053-37-8。它对 SMYD2 的 IC50 值约为 15 nM,并且对其他甲基转移酶具有高度选择性。它能降低细胞内 H3K36me2 和 p53K370me1 的水平。在临床前模型中,它显示出抗肿瘤活性。LLY-507 可用作研究 SMYD2 生物学和癌症表观遗传调控的工具。本品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C36H42N6O
分子量
574.758287906647
精确质量
574.341
CAS号
1793053-37-8
PubChem CID
91623361
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
790.4±70.0 °C at 760 mmHg
闪点
431.8±35.7 °C
蒸汽压
0.0±2.9 mmHg at 25°C
折射率
1.646
LogP
7.27
tPSA
67.5
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
43
分子复杂度/Complexity
935
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=CN(C2=CC=CC=C12)CCN3CCN(CC3)C4=CC=CC=C4C5=CC(=CC(=C5)C#N)C(=O)NCCCN6CCCC6
InChi Key
PNYRDVBFYVDJJI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C36H42N6O/c1-28-27-42(34-11-4-2-9-32(28)34)22-19-40-17-20-41(21-18-40)35-12-5-3-10-33(35)30-23-29(26-37)24-31(25-30)36(43)38-13-8-16-39-14-6-7-15-39/h2-5,9-12,23-25,27H,6-8,13-22H2,1H3,(H,38,43)
化学名
3-cyano-5-[2-[4-[2-(3-methylindol-1-yl)ethyl]piperazin-1-yl]phenyl]-N-(3-pyrrolidin-1-ylpropyl)benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~15 mg/mL (~26.10 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (4.35 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.35 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7399 mL 8.6993 mL 17.3986 mL
5 mM 0.3480 mL 1.7399 mL 3.4797 mL
10 mM 0.1740 mL 0.8699 mL 1.7399 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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