ML364

别名: ML364; ML 364; ML-364 2-[[(4-甲基苯基)磺酰基]氨基]-N-(4-苯基-2-噻唑基)-4-(三氟甲基)苯甲酰胺; ML-364
目录号: V2858 纯度: ≥98%
ML364 是泛素特异性肽酶 2(USP2,一种去泛素酶)的小分子抑制剂,生化测定中的 IC50 为 1.1 μm。
ML364 CAS号: 1991986-30-1
产品类别: DUB
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
ML364 是一种小分子泛素特异性肽酶 2 (USP2,一种去泛素化酶) 抑制剂,生化分析显示其 IC50 值为 1.1 μM。ML364 被用于研究 USP2 及其假定底物细胞周期蛋白 D1 的生物学特性。Western blotting 和流式细胞术分析表明,ML364 可诱导细胞内细胞周期蛋白 D1 降解增加,并导致细胞周期阻滞,该结果适用于 Mino 和 HCT116 癌细胞系。ML364 在癌细胞系中具有抗增殖作用。与细胞周期蛋白 D1 在 DNA 损伤反应中的作用一致,ML364 还导致同源重组介导的 DNA 修复减少。 ML364 的这些作用表明 USP2 在细胞周期、DNA 修复和肿瘤细胞生长调控中发挥着关键作用,并且 ML364 可用于乳腺癌研究。
ML364 是一种选择性泛素特异性蛋白酶 2 (USP2) 抑制剂。在以内部淬灭荧光二泛素底物进行的生化测定中,其 IC₅₀ 值为 1.1 μM。ML364 可直接与 USP2 结合,Kd 值为 5.2 μM。该化合物可诱导细胞周期蛋白 D1 降解增加,并导致细胞周期阻滞。ML364 具有抗增殖活性,可用于乳腺癌研究。其分子量为 517.54 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
USP2(IC50= 1.1 μM);USP2(Kd= 5.2 μM)
USP2 (ubiquitin-specific protease 2). ML364 is a selective inhibitor of USP2. It directly binds to USP2 with a Kd of 5.2 μM and inhibits its deubiquitinating activity with an IC₅₀ of 1.1 μM. USP2 is a deubiquitinating enzyme that removes ubiquitin from target proteins, regulating protein degradation and signaling pathways. Inhibition of USP2 by ML364 leads to increased degradation of cyclin D1 and cell cycle arrest.
体外研究 (In Vitro)
ML364 是一种小分子泛素特异性肽酶 2 (USP2,一种去泛素化酶) 抑制剂,生化分析显示其 IC50 值为 1.1 μM。ML364 被用于研究 USP2 及其假定底物细胞周期蛋白 D1 的生物学特性。Western blotting 和流式细胞术分析表明,ML364 可诱导细胞内细胞周期蛋白 D1 降解增加,并导致细胞周期阻滞,该结果适用于 Mino 和 HCT116 两种癌细胞系。ML364 对癌细胞系具有抗增殖作用。与细胞周期蛋白 D1 在 DNA 损伤反应中的作用一致,ML364 还导致同源重组介导的 DNA 修复减少。 ML364 的这些作用表明 USP2 在细胞周期、DNA 修复和肿瘤细胞生长调控中发挥着关键作用,并且 ML364 可能用于乳腺癌的研究。
体外生化实验表明,ML364 对 USP2 的抑制作用 IC₅₀ 为 1.1 μM。它能直接与 USP2 结合,Kd 值为 5.2 μM。ML364 可诱导细胞周期蛋白 D1 降解增加,并导致细胞周期阻滞。该化合物具有抗增殖活性。这些体外活性表明,ML364 具有作为治疗药物的潜力,可用于治疗 USP2 发挥致病作用的癌症,例如乳腺癌。
体内研究 (In Vivo)
公开资料中关于ML364的详细体内活性数据有限。基于其作为USP2抑制剂的作用机制及其体外抗增殖活性,ML364有望在癌症(尤其是乳腺癌)的临床前小鼠模型中展现疗效。该化合物诱导细胞周期蛋白D1降解和细胞周期阻滞的能力表明其具有体内抑制肿瘤生长的潜力。
酶活实验
使用 Kinomescan(DiscoveRx,Fremont,CA)检测了 102 种激酶在 10 μM ML364 作用下的抑制情况。MMP1 和 MMP9 的数据来自 Reaction Biology(Malvern,PA),采用其标准条件(5 μM FRET 肽)。Caspase 6 和 caspase 7 的活性检测使用 Promega(Madison,WI)的 caspase 6 和 Caspase 3/7 Glo 试剂盒进行。该试剂盒将半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶(即 caspase)的活性与荧光素酶偶联。首先,将2.5 μl的caspase 6(0.5单位/ml;Enzo Life Sciences,Farmingdale,NY)和caspase 7(0.5单位/ml;Enzo Life Sciences)溶于10 mM HEPES缓冲液(pH 7.2)、2 mM DTT、10%甘油和0.05% CHAPS中,并分装至白色1536孔板中。本实验中底物的浓度为5 μM,这是制造商提供的底物Km值。然后,使用点样针分装23 nl化合物,并在室温下孵育30分钟。最后,加入2.5 μl caspase Glo试剂(caspase Glo 6或caspase Glo 3/7),并使用Viewlux荧光显微镜对发光进行动力学监测,总共持续50分钟(曝光1秒)。
ML364的USP2酶抑制试验使用内部淬灭的荧光二泛素底物。将重组USP2与底物在不同浓度的ML364存在下孵育。去泛素化活性会切割底物,产生荧光信号,并随时间进行测量。IC₅₀值由剂量反应曲线计算得出。使用表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC)评估结合亲和力,以确定Kd值。
细胞实验
将HCT116细胞以25,000个细胞/孔的密度接种于透明的96孔板(Costar,Corning,Tewksbury,MA)中,并用化合物处理24小时。之后,用4%多聚甲醛固定细胞15分钟,用含0.1% Triton X-100的PBS溶液透化30分钟,并在室温下用2×封闭缓冲液(Sigma)封闭2小时。每一步操作后,均使用BioTek Elx406微孔板洗板机用PBS充分洗涤细胞。为了定量细胞周期蛋白D1的蛋白水平,将细胞与小鼠抗细胞周期蛋白D1抗体(DCS6,Cell Signaling,1:500稀释)在1×封闭缓冲液(Sigma)中于4℃孵育过夜,然后与HRP标记的抗小鼠IgG抗体(Cell Signaling,1:500稀释)在1×封闭缓冲液(Sigma)中于室温孵育2小时。每次孵育后,使用BioTek Elx406微孔板洗板机,用含0.1% Tween 20的PBS缓冲液洗涤细胞。随后,向每个孔中加入100 μl TMB ELISA底物系统(Sigma),显色5分钟后,加入等体积的1 M HCl终止反应。使用 Envision 多功能酶标仪定量测定 450 nm 波长处的吸光度。
将乳腺癌细胞系(例如 MCF-7、MDA-MB-231 或其他相关细胞系)培养于适宜的培养基中。用浓度递增的 ML364(通常为 0.1 至 100 μM)处理细胞 24-72 小时。使用 MTT、CCK-8 或 CellTiter-Glo 检测法评估细胞活力。通过蛋白质印迹法检测细胞周期蛋白 D1 的水平,以确认靶点结合和作用机制。通过碘化丙啶染色和流式细胞术分析细胞周期分布。
动物实验
ML364 的体内疗效研究可能采用乳腺癌或其他癌症的小鼠异种移植模型。将人肿瘤细胞皮下移植到免疫缺陷小鼠体内。待肿瘤形成后,以不同剂量和给药方案(通常为口服或腹腔注射)给予 ML364。使用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测小鼠体重。研究结束时切除肿瘤,分析细胞周期蛋白 D1 水平和其他生物标志物,以确认靶点结合情况。
药代性质 (ADME/PK)
ML364 的分子量为 517.54 g/mol,分子式为 C₂₄H₁₈F₃N₃O₃S₂。其详细的药代动力学参数尚未广泛发表。作为一种小分子,ML364 预计具有口服生物利用度。该化合物通常以粉末形式储存于 -20°C。需要进行药代动力学研究以支持体内疗效研究和进一步开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
公开资料中关于ML364的详细毒理学数据有限。作为一种正在开发用于癌症研究的USP2抑制剂,该化合物本应已完成标准的临床前安全性评估。该化合物的作用机制是靶向一种去泛素化酶,这表明其毒性可能与正常组织中蛋白质降解途径的紊乱有关。
参考文献
2016 Nov 18;291(47):24628-24640;http://www.freepatentsonline.com/WO2016134026A1.html
其他信息
ML364 是一种选择性 USP2 抑制剂,IC₅₀ 为 1.1 μM,Kd 为 5.2 μM。它能诱导细胞周期蛋白 D1 降解和细胞周期阻滞,并具有抗增殖活性。ML364 可用于乳腺癌研究。该化合物的分子量为 517.54 g/mol,分子式为 C₂₄H₁₈F₃N₃O₃S₂。它为研究 USP2 功能以及开发靶向泛素-蛋白酶体系统的新型癌症疗法提供了一种有价值的工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H18F3N3O3S2
分子量
517.54
精确质量
517.074
元素分析
C, 55.70; H, 3.51; F, 11.01; N, 8.12; O, 9.27; S, 12.39
CAS号
1991986-30-1
相关CAS号
1991986-30-1
PubChem CID
70789348
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
6.1
tPSA
125
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
822
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1C([H])=C([H])C(C([H])([H])[H])=C([H])C=1[H])(N([H])C1C([H])=C(C(F)(F)F)C([H])=C([H])C=1C(N([H])C1=NC(=C([H])S1)C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])=O)(=O)=O
InChi Key
QZUGMNXETPARLI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H18F3N3O3S2/c1-15-7-10-18(11-8-15)35(32,33)30-20-13-17(24(25,26)27)9-12-19(20)22(31)29-23-28-21(14-34-23)16-5-3-2-4-6-16/h2-14,30H,1H3,(H,28,29,31)
化学名
2-[(4-Methylphenyl)sulfonylamino]-N-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-(trifluoromethyl)benzamide
别名
ML364; ML 364; ML-364
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 33~60 mg/mL ( 63.76~115.93 mM )
Ethanol : ~15 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

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配方 3 中的溶解度: 5% DMSO + Corn oil: 3mg/ml


配方 4 中的溶解度: 20 mg/mL (38.64 mM) in 0.5% CMC-Na/saline water (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9322 mL 9.6611 mL 19.3222 mL
5 mM 0.3864 mL 1.9322 mL 3.8644 mL
10 mM 0.1932 mL 0.9661 mL 1.9322 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • ML364


    ML364 induces cell cycle arrest and inhibits cell growth in HCT116 and Mino cells.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    Kinomescan visualization for ML364 (10 μm) tested for binding to 102 kinases.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 reduces cyclin D1 protein levels in a time-, dose-, and proteasome-dependent manner in HCT116 cells and Mino cells.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 binds to USP2 and inhibits its activity, although a related chemical analog 2 does not.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 directly targets cyclin D1 for degradation.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.


    ML364

    Inhibition of USP2 activity by ML364 causes a decrease in HR-mediated DNA repair.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

  • ML364


    ML364 exposure decreases cell viability and promotes cyclin D1 degradation in cancer cell lines.2016 Nov 18;291(47):24628-24640. Epub 2016 Sep 28.


    ML364

    Schematic showing the impact of ML364 on USP2, which leads to accelerated cyclin D1 degradation and subsequent G0/G1cell cycle arrest.2016 Nov 18;291(47): 24628-24640. Epub 2016 Sep 28.

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