MRTX1133

别名: MRTX1133; MRTX 1133; MRTX-1133
目录号: V2497 纯度: ≥98%
MRTX1133可与活化和失活的KRAS G12D突变体可逆结合并抑制其活性。它是突变型KRAS的高选择性抑制剂。MRTX1133对KRAS G12D的特异性比野生型KRAS高出1000倍以上。MRTX1133不仅在Panc 04.03异种移植物模型中表现出肿瘤消退,而且在细胞增殖测定中表现出个位数的nM效力。
MRTX1133 CAS号: 2621928-55-8
产品类别: Ras
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
MRTX-1133 (MRTX1133; MRTX 1133) 是一种新型、有效、非共价、选择性 KRAS G12D 抑制剂,具有抗肿瘤活性。它适用于 KRASG12D 突变小鼠肿瘤异种移植模型。最常见的致癌 KRAS 突变 KRASG12D 是治疗实体瘤的有希望的靶点。然而,与 KRASG12C 相比,KRASG12D 的选择性抑制提出了重大挑战,因为抑制剂必须以足够高的亲和力结合 KRASG12D,以消除与突变 KRAS 蛋白共价相互作用的需要。通过广泛的基于结构的药物设计,MRTX1133被鉴定为KRASG12D的非共价、强效和选择性抑制剂。MRTX1133在细胞和体内抑制KRASG12D信号传导,其抗肿瘤益处在小鼠动物模型中得到证实。据我们所知,这是文献中首次报道KRASG12D的小分子抑制剂具有强大的体内疗效。这些数据支持了针对这种“不可治愈”靶点的有效治疗方法的发展潜力。高分辨率X射线晶体结构促进了优化过程。源自共晶结构的深度结合模式分析允许优化抑制剂在结合袋中的亲脂性接触,并识别非经典氢键和离子对相互作用,最终将KRASG12D的选择性结合亲和力相对于初始命中5B提高了1000000倍以上。MRTX1133与开关II口袋结合,并抑制激活KRAS途径所需的蛋白质-蛋白质相互作用。MRTX1133不仅在细胞增殖测定中具有个位数的nM效力,而且在Panc 04.03异种移植物模型中也显示出肿瘤消退。MRTX1133的更全面的体外和体内药理学特征将在适当的时候公开.
生物活性&实验参考方法
靶点
KRas G12D (Kd = 0.2 pM)
体外研究 (In Vitro)
MRTX1133可与活化和失活的KRAS G12D突变体可逆结合并抑制其活性。它是突变型KRAS的高选择性抑制剂。MRTX1133对KRAS G12D的特异性比野生型KRAS高出1000倍以上。MRTX1133不仅在Panc 04.03异种移植物模型中表现出肿瘤消退,而且在细胞增殖测定中表现出个位数的nM效力。
体内研究 (In Vivo)
MRTX1133是通过广泛的基于结构的活性改进发现的,并在KRASG12D突变异种移植物小鼠肿瘤模型中显示出有效性。在CD-1小鼠中腹膜内(IP)给予30 mg/kg的MRTX1133导致KRASG12D突变体Panc 04.03细胞系中持续的血浆暴露超过游离组分调节的pERK IC50值约8小时。受此结果的鼓舞,我们评估了以30 mg/kg BID(IP)调节Panc 04.03-异种移植物肿瘤模型中KRAS依赖性ERK磷酸化的能力,并在第二次给药后1小时和12小时分别观察到pERK信号抑制62%和74%。该模型中的一项抗肿瘤疗效研究导致MRTX1133具有剂量依赖性抗肿瘤活性,在3 mg/kg BID(IP)时观察到94%的生长抑制,在10 mg/kg BID和30 mg/kg BID时分别观察到−62%和−73%的肿瘤消退)。相反,在非KRASG12D肿瘤模型MKN1中没有观察到显著的抗肿瘤活性(数据未显示)[2]。
酶活实验
HTRF结合测定
将重组人KRAS 4B G12D蛋白(对应于氨基酸1-169,在大肠杆菌中表达,具有C-末端Avi生物素化标签MW=22kDa)与缓冲液(50mM HEPES pH 7.5,5mM MgCl2,1mM DTT,约0.1%DMSO)、5nM KRASG12D、100nM示踪剂(化合物45)和0.5nM Tb SA(Cisbio)中的测试化合物一起孵育。在室温下孵育1小时后,根据制造商的说明,使用Clariostar读取器[(BMG)激发滤光片(Ex Tr)、二向色滤光片(LP TP)和发射滤光片(F 665-10和F 620-10)]测量HTRF信号。HTRF比率使用公式计算:[发射665/发射620]*10000。使用Xlfit软件(IDBS)拟合IC50,Hill方程固定为1(拟合背景+Bmax/(1+(x/IC50)^Hill))。
细胞实验
AGS ICW测定方案[2]
1.KRASG12D突变体AGS细胞(ATCC CRL-1739)在补充有10%胎牛血清和青霉素/链霉素的DMEM培养基中生长。将细胞以20000个细胞/孔的密度接种在经黑色透明底部组织培养物处理的96孔板中,并使其附着12-14小时。用化合物的3倍9点连续稀释液处理接种的细胞,最高终浓度为10µM。将稀释的化合物以0.5%DMSO的最终浓度加入到接种的细胞中。药物处理3小时后,通过在室温下将平板在50µl 4.0%甲醛中孵育20分钟来固定细胞。然后倾倒甲醛,加入150µL冰冷的100%甲醇10分钟,使细胞透化。倾倒甲醇,在室温下加入100µL Licor封闭缓冲液(Li-Cor Biotechnology,Lincoln NE)1小时,以抑制板中的非特异性抗体结合
2.使用对磷酸化形式的ERK特异性的抗体测定磷酸化ERK的量,并将其与GAPDH的量进行比较。用于检测的初级抗体添加如下:在Odyssey阻断缓冲液+0.05%Tween 20中稀释1:500的磷酸ERK(细胞信号传导CS-9101)和稀释1:5000的GAPDH(Millipore MAB374)。将平板在4°C下孵育过夜。将平板用150uL PBS+0.1%吐温20洗涤3次
3.用于显示一级抗体的二级抗体添加如下:在奥德赛阻断缓冲液+0.05%Tween20中以1:800稀释的山羊抗Rabbit-800(LI-COR,926-32211)和山羊抗Mouse680(LI-COR926-68070),并在室温下孵育1小时。将平板用150uL PBS+0.1%Tween20洗涤3次。在LiCOR Odyssey CLX印版读取器上对印版进行干燥成像。S192 4。通过将磷酸化ERK(Thr202/Tyr204)信号归一化为每个孔的GAPDH信号来分析板,并计算DMSO对照值的百分比。使用剂量响应曲线的4参数拟合生成IC50值
2D细胞增殖测定方案[2]
1.KRASG12D突变细胞系GP2d(Sigma-Aldrich#95090714)在补充有10%胎牛血清和青霉素/链霉素的DMEM培养基中生长。KRASWT细胞系MKN1(JCRB0252)在补充有10%胎牛血清、10mM HEPES、10mM丙酮酸钠和青霉素/链霉素的RPMI细胞中生长。将细胞以2000个细胞/孔的密度接种在白色透明底部组织培养物处理的96孔板中,并使其附着12-14小时。每个细胞系也以相同的密度在基线板中的3个孔中铺板,以在药物处理之前确定每个细胞系的发光RLU值。在用药物处理平板细胞之前,立即读取基线平板,方法是将每个细胞系的三个平板孔中的每一个与30µL CTG试剂孵育30分钟,遮光并剧烈摇晃。然后在CLARIOstar微孔板读取器上读取发光RLU值。用最高终浓度为3µM的MRTX1133的3倍9点系列稀释剂量反应处理接种的细胞。以0.5%DMSO的最终浓度加入稀释的化合物。药物治疗3天后,使用上述基线平板的条件在CLARIOstar上读取每个平板
2.通过从添加MRTX1133 3 3天后的处理板的RLU值中减去基线RLU值来分析数据。细胞增殖百分比抑制值是通过将每个处理过的孔的发光单位值除以载体处理过的孔中发光单位值的平均值并乘以100来计算的。将数据转换并传递到GraphPad Prism中,以使用剂量响应曲线的4参数拟合来获得IC50值。
动物实验
Tumor Pharmacodynamic and Tumor Xenograft Studies
All mouse studies were conducted in compliance with all applicable regulations and guidelines of the Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) from the National Institutes of Health (NIH). Mice were maintained under pathogen-free conditions, and food and water were provided ad libitum. 6–8-weekold, female, athymic nude-Foxn1nu mice (Envigo, San Diego) were injected subcutaneously with Panc 04.03 cells in 100 l of PBS and Matrigel matrix in the right hind flank with 5.0 x 106 cells (Corning #356237; Discovery Labware, MA) 50:50 cells : Matrigel. Mouse health was monitored daily, and caliper measurements began when tumors were palpable. Tumor volume measurements were determined utilizing the formula 0.5 x L x W2 in which L refers to length and W refers to width of each tumor.  Tumor pharmacodynamic studies: When tumors reached an average tumor volume of ~400 mm3 , mice were randomized into treatment groups. Mice were treated by intraperitoneal injection with either vehicle consisting of 10% research grade Captisol (CyDex Pharmaceuticals, KS) in 50 mM citrate buffer pH 5.0 or MRTX1133 at 30mg/kg. Tumors and plasma were collected at 1 hour and 12 hours after a single dose to determine exposure levels. Tumor fragments were snap frozen in homogenization tubes (Omni, #19-628-3) with liquid nitrogen and homogenized (MPBio FastPrep-24 system) with Lysis/Binding Buffer AM11 (Active Motif, #52097) with protease and phosphatase inhibitors added fresh before use. Tumor lysates were then assayed for ERK1/2 phosphorylation. Xenograft studies: When tumors reached an average tumor volume of ~350 mm3 , mice were randomized into treatment groups. Mice were treated by intraperitoneal injection with either vehicle consisting of 10% research grade Captisol (CyDex Pharmaceuticals, KS) in 50 mM citrate buffer pH 5.0 or MRTX1133 in vehicle at 3, 10, or 30mg/kg BID.  Animals were monitored daily, tumors were measured 3 times per week, and body weights were measured 2 times per week. Data are expressed as mean +/- SEM. Statistical analysis of differences in mean tumor volume between vehicle and MRTX1133-treated cohorts was run using a two-tailed Student’s t-test with equal variance in Excel (Microsoft; Redmond, WA).
Animal/Disease Models: 6-8-week age, female/athymic nude-Foxn1nu mice (Panc 04.03 model)
Doses: 3, 10, 30 mg/kg
Route of Administration: Intraperitoneal injection/ip; twice a day for 28 days
Experimental Results: MRTX1133 dose-dependent suppressed tumor growth with a TGI of 94% observed at 3 mg/kg BID (IP) and TGIs of -62% and -73% observed at 10 and 30 mg/kg BID (IP), respectively.
参考文献

[1]. Front Oncol . 2021 May 3:11:672612.

[2]. J Med Chem . 2022 Feb 24;65(4):3123-3133.

[3]. Nat Med . 2022 Oct;28(10):2171-2182.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C33H31F3N6O2
分子量
600.6462
精确质量
600.24605874
元素分析
C, 65.99; H, 5.20; F, 9.49; N, 13.99; O, 5.33
CAS号
2621928-55-8
相关CAS号
2621928-55-8;
外观&性状
Solid powder
LogP
5.2
tPSA
86.6Ų
SMILES
C#CC1=C(C=CC2=CC(=CC(=C21)C3=NC=C4C(=C3F)N=C(N=C4N5CC6CCC(C5)N6)OC[C@@]78CCCN7C[C@@H](C8)F)O)F
InChi Key
SCLLZBIBSFTLIN-IFMUVJFISA-N
InChi Code
InChI=1S/C33H31F3N6O2/c1-2-23-26(35)7-4-18-10-22(43)11-24(27(18)23)29-28(36)30-25(13-37-29)31(41-15-20-5-6-21(16-41)38-20)40-32(39-30)44-17-33-8-3-9-42(33)14-19(34)12-33/h1,4,7,10-11,13,19-21,38,43H,3,5-6,8-9,12,14-17H2/t19-,20?,21?,33+/m1/s1
化学名
4-[4-(3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl)-8-fluoro-2-[[(2R,8S)-2-fluoro-1,2,3,5,6,7-hexahydropyrrolizin-8-yl]methoxy]pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl]-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol
别名
MRTX1133; MRTX 1133; MRTX-1133
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外)
DMSO:50~100 mg/mL (83.3~166.5 mM)
溶解度 (体内)
配方 1 中的溶解度: 10 mg/mL (16.65 mM) in 10% SBE-β-CD/50 mM citrate pH 5.0 (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 3.5 mg/mL (5.83 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 35.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.16 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。


配方 4 中的溶解度: 5%DMSO+40%PEG300+5%Tween80+50%ddH2O: 25mg/ml

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6649 mL 8.3243 mL 16.6486 mL
5 mM 0.3330 mL 1.6649 mL 3.3297 mL
10 mM 0.1665 mL 0.8324 mL 1.6649 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT05737706 Recruiting Drug: MRTX1133 Solid Tumor
Advanced Solid Tumor
Mirati Therapeutics Inc. March 20, 2023 Phase 1
Phase 2
生物数据图片
  • We report herein the structure-based optimization of a series of molecules culminating in the discovery of MRTX1133 (Figure 1, compound 1), a potent, selective, noncovalent KRASG12D inhibitor with picomolar binding affinity, single digit nanomolar activity in cellular assays, and marked in vivo efficacy in tumor models harboring KRASG12D mutations. J Med Chem . 2022 Feb 24;65(4):3123-3133.
  • MRTX1133 with KRASG12D/GDP (7RPZ). J Med Chem . 2022 Feb 24;65(4):3123-3133.
  • pERK modulation in Panc 04.03 model after intraperitoneal administration of MRTX1133. J Med Chem . 2022 Feb 24;65(4):3123-3133.
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