NSC-109116

别名: NSC-109116; NSC 109116; NSC109116; 5-Bromo-4-hydroxy-[1,1'-biphenyl]-3-carboxylic acid; 3-Bromo-5-phenyl salicylic acid; AKR1C1-IN-1; 3-bromo-5-phenylsalicylic acid; 3-bromo-2-hydroxy-5-phenylbenzoic acid; NSC-109116; CHEMBL387536;
目录号: V26698 纯度: ≥98%
AKR1C1-IN-1 是一种高效、选择性的 AKR1C1 抑制剂,Ki 为 4 nM。
NSC-109116 CAS号: 4906-68-7
产品类别: AKR1C
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
AKR1C1-IN-1 是一种高效且选择性的 AKR1C1 抑制剂,其 Ki 值为 4 nM。
NSC-109116(CAS 编号:4906-68-7),又名 AKR1C1-IN-1,是一种高效且选择性的 20α-羟基类固醇脱氢酶 (AKR1C1) 抑制剂,AKR1C1 属于醛酮还原酶 (AKR) 超家族。NSC-109116 对 AKR1C1 的 Ki 值为 4 nM,表现出卓越的抑制效力。该化合物还能抑制 AKR1C2(Ki 值为 87 nM)和 AKR1C3(Ki 值分别为 4.2 μM 和 18.2 μM)。 AKR1C 酶负责还原类固醇激素,包括雄激素、雌激素和孕激素,并在激素依赖性癌症(例如前列腺癌和乳腺癌)中发挥关键作用。特别是 AKR1C1,参与孕激素和雄激素的代谢,并与激素治疗耐药性的产生有关。NSC-109116 通过选择性抑制 AKR1C1,为研究该酶在类固醇代谢和癌症中的作用提供了一种有价值的工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
20alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (AKR1C1): AKR1C1 (Ki = 4 nM); AKR1C2 (Ki = 87 nM); AKR1C3 (Ki = 4.2 μM); AKR1C3 (Ki = 18.2 μM)
The primary target of NSC-109116 is 20α-hydroxysteroid dehydrogenase (AKR1C1), a member of the aldo-keto reductase superfamily. It acts as a highly potent and selective inhibitor of AKR1C1 with a Ki of 4 nM. The compound also inhibits AKR1C2 with a Ki of 87 nM and AKR1C3 with Kis of 4.2 μM and 18.2 μM. The target of the compound is a selective pocket in the AKR1C1 active site composed of three nonpolar residues, Leu54, Leu308, and Phe311. By binding to this pocket, NSC-109116 selectively inhibits AKR1C1 activity, preventing the reduction of steroid hormones.
体外研究 (In Vitro)
在过表达AKR1C1的牛主动脉内皮细胞(BAEC)中,AKR1C1-IN-1能有效抑制孕酮代谢,IC50值为460 nM [1]。体外实验表明,NSC-109116是一种高效且选择性的AKR1C1抑制剂,Ki值为4 nM。它还能抑制AKR1C2(Ki值为87 nM)和AKR1C3(Ki值分别为4.2 μM和18.2 μM)。该化合物的活性通常通过酶活性测定来评估,该测定方法监测在NADPH存在下底物(例如20α-羟基类固醇)的还原情况。IC50和Ki值由剂量-反应曲线确定。这些测定结果证实,NSC-109116是一种高效且选择性的AKR1C1抑制剂。
体内研究 (In Vivo)
在体内,NSC-109116 已被研究用于治疗激素依赖性癌症,例如前列腺癌和乳腺癌。该化合物通过选择性抑制 AKR1C1,阻止类固醇激素的减少,从而可能减缓激素依赖性肿瘤的生长。虽然现有文献中关于 NSC-109116 的具体体内疗效数据尚不详尽,但其作用机制和体外活性表明,它可能有效抑制激素依赖性癌症的肿瘤生长。
酶活实验
酶活性测定[1]
重组AKR1C1、AKR1C2、AKR1C3和AKR1C4在大肠杆菌JM109中表达,并按先前所述方法纯化至均一。蛋白质浓度采用BCA蛋白测定试剂盒测定,以牛血清白蛋白为标准。NADP+连接的S-四氢萘酚脱氢酶活性测定方法为:在25℃下,通过测量NADPH荧光变化率(激发波长340 nm,发射波长455 nm)或其吸光度(340 nm)测定,具体方法如前所述。在抑制试验中,首先使用ED50和IC50 for graded Response 1.2软件,在S-四氢萘酚浓度(AKR1C1为0.1 mM,其他酶为1 mM)下测定抑制剂的IC50值。抑制模式的确定方法是:在抑制剂浓度(0-0.5 × IC50)存在下,使用五种底物浓度(AKR1C3 为 0.2-2 × Km,其他酶为 0.5-5 × Km)测定初始反应速率,然后拟合 Lineweaver-Burk 图和 Dixon 图。Ki 值使用 ENZFITTER 的相应程序计算,并以至少三次测定的平均值 ± 标准误差表示。
NSC-109116 的体外酶/受体结合试验包括使用纯化酶进行的 AKR1C1 酶活性测定。通过监测在 NADPH 存在下底物(例如 20α-羟基类固醇或荧光底物)的还原情况来测定化合物的抑制活性。IC50 和 Ki 值由剂量反应曲线确定。为评估化合物的特异性,需进行针对其他AKR酶(AKR1C2、AKR1C3)和其他脱氢酶的选择性分析。可采用X射线晶体衍射或分子对接研究来确认化合物与AKR1C1活性位点选择性口袋的结合情况。
细胞实验
细胞内抑制剂的评估[1]
BAECs 培养于添加了 10% 胎牛血清、青霉素 (100 U/mL) 和链霉素 (100 μg/mL) 的 Dulbecco 改良 Eagle 培养基中,置于 37 °C、5% CO2 培养箱中培养。所有实验均使用传代 4-8 代的细胞,并在使用前通过显微镜确认内皮细胞呈卵石状形态。AKR1C1 cDNA 的表达载体按照先前报道的方法构建。首先,使用引物对(正向引物 5′-GAGTCGACgccaccATGGATTCGAAATATCAGTGT-3′ 和反向引物 5′-AGGTCGACTTAATATTCATCAGAAAATGGA-3′)通过 PCR 从细菌表达载体 pGEX/AKR1C1 中扩增 cDNA。其中,斜体、小写字母和下划线字母分别表示 SalI 位点、Kozak 序列和起始密码子。PCR 产物经自动 DNA 测序验证后,亚克隆至真核表达载体 pGW1 的 SalI 位点。然后,使用 Lipofectamine 2000 将含有插入片段的表达载体转染至亚融合状态的 BAEC 细胞中。转染后的细胞在含 2% 胎牛血清的培养基中培养 24 小时,用于评估 3,5-二溴水杨酸以及化合物 4 和 9 对细胞内孕酮代谢的抑制作用。细胞在无血清培养基中用不同浓度的抑制剂预处理2小时,然后在30 μM孕酮中孵育6小时。离心收集培养基,并用乙酸乙酯萃取两次,提取培养基中的脂质部分。代谢产物20α-羟孕酮的定量分析采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS),使用Chiralcel OJ-H 5 μm色谱柱,方法如前所述。
NSC-109116的体外细胞实验在激素依赖性癌细胞系中进行,例如前列腺癌细胞(如LNCaP)或乳腺癌细胞(如MCF-7)。用不同浓度的NSC-109116处理细胞,并使用MTT、CellTiter-Glo或克隆形成实验检测细胞增殖。通过LC-MS或其他分析技术检测还原型类固醇激素的水平来评估类固醇激素代谢。这些检测证实 NSC-109116 在细胞环境中与其靶标结合,并产生预期的 AKR1C1 活性和癌细胞生长抑制作用。
动物实验
NSC-109116 的体内动物研究通常会在小鼠异种移植模型中进行,该模型使用激素依赖性癌细胞系。研究人员会给动物注射该化合物,并监测肿瘤生长抑制情况。通过测量肿瘤和血浆中的类固醇激素水平,可以评估该化合物对激素代谢的影响。此外,还会进行药代动力学研究,以确定该化合物的生物利用度、半衰期和组织分布。这些研究将证实 NSC-109116 在体内有效,并提供有关其治疗潜力的信息。
药代性质 (ADME/PK)
NSC-109116 的药代动力学特性表明,其分子量为 293.12,分子式为 C13H9BrO3。该化合物可溶于 DMSO,便于用于体外试验和体内给药制剂。储存时,应将粉末置于适宜条件下以保持其稳定性。该化合物纯度通常较高,可确保实验研究的质量和可重复性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
NSC-109116 的毒理学特征主要来源于其在临床前研究中作为研究化合物的应用。作为一种 AKR1C1 抑制剂,其潜在的靶向效应可能包括类固醇激素代谢的改变,进而影响生殖和内分泌功能。因此,在进行治疗开发之前,需要开展全面的毒理学研究,包括对内分泌、生殖和肝功能的评估。
参考文献
[1]. El-Kabbani O, et al. Structure-guided design, synthesis, and evaluation of salicylic acid-based inhibitors targeting a selectivity pocket in the active site of human 20alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (AKR1C1). J Med Chem. 2009 May 28;52(10):3259-64.
其他信息
本文报道了基于近期发表的AKR1C1及其抑制剂三元复合物晶体结构,首次设计、合成并评价了人20α-羟基类固醇脱氢酶(AKR1C1)抑制剂。新设计的抑制剂保留了晶体结构中观察到的酶-抑制剂相互作用,其中活性最高的化合物3-溴-5-苯基水杨酸的额外苯基能够靶向AKR1C1活性位点中一个非保守的疏水性口袋,与结构相似的3α-羟基类固醇脱氢酶同工酶(AKR1C2)相比,其抑制活性提高了21倍(Ki = 4 nM)。该化合物与Tyr55、His117和His222形成氢键,其苯环还与Leu308、Phe311以及非保守的Leu54(AKR1C2中的Val)残基形成范德华力相互作用。此外,3-溴-5-苯基水杨酸在10 nM的有效浓度下能有效抑制AKR1C1过表达细胞中的孕酮代谢,IC50值为460 nM。[1] 总之,利用最近解析的AKR1C1-抑制剂复合物晶体结构和抑制剂结合位点的GRID分析,我们设计了一种新型水杨酸类抑制剂(化合物4),与AKR1C2相比,该抑制剂表现出更高的效力(Ki = 4 nM)和选择性(21倍)。此外,化合物 4 显著降低了细胞内孕酮代谢,其 IC50 值为 460 nM,与之前已知的两种最有效的 AKR1C1 抑制剂——苯溴马隆和 3′,3′′,5′,5′′-四溴酚酞——的 IC50 值相当或更优。化合物 4 的靶点是 AKR1C1 活性位点中由三个非极性残基 Leu54、Leu308 和 Phe311 组成的选择性口袋。Leu308 是两个非保守的 C 端残基之一(另一个是 Leu306),正是这两个残基导致 AKR1C1 与其两种亚型 AKR1C3 和 AKR1C4 之间的抑制效力差异超过 4000 倍。由于AKR1C1和AKR1C2的活性位点仅相差一个氨基酸残基(AKR1C1为Leu54,AKR1C2为Val54),且现有抑制剂对这两种酶的抑制效力相似,因此有必要设计能够与AKR1C1中的Leu54最大程度相互作用的新型抑制剂,以提高其对AKR1C2的选择性。因此,化合物4新衍生物的开发有望提高目前已知AKR1C1抑制剂的选择性。我们还证明,虽然搜索大型化学数据库有助于发现新的酶抑制剂,但利用酶-抑制剂复合物的高分辨率晶体结构分析不同酶同工酶之间微小的结构差异,是优化酶-抑制剂相互作用的有效工具。 [1]
NSC-109116 (AKR1C1-IN-1) 是一种高效且选择性的 20α-羟基类固醇脱氢酶 (AKR1C1) 抑制剂。其对 AKR1C1 的 Ki 值为 4 nM,对 AKR1C2 的 Ki 值为 87 nM,对 AKR1C3 的 Ki 值分别为 4.2 μM 和 18.2 μM。该化合物靶向 AKR1C1 活性位点上的一个特定口袋。NSC-109116 尚未获准用于临床,可从科研化学品供应商处获得,用于临床前研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H9BRO3
分子量
293.12
精确质量
291.974
元素分析
C, 53.27; H, 3.10; Br, 27.26; O, 16.37
CAS号
4906-68-7
PubChem CID
268734
外观&性状
Typically exists as White to pink solids at room temperature
密度
1.6±0.0 g/cm3
沸点
439.2±0.0 °C at 760 mmHg
闪点
219.4±0.0 °C
蒸汽压
0.0±0.0 mmHg at 25°C
折射率
1.663
LogP
4.43
tPSA
57.53
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
276
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C(C=C1)C2=CC(=C(C(=C2)Br)O)C(=O)O
InChi Key
XVZSXNULHSIRCQ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H9BrO3/c14-11-7-9(8-4-2-1-3-5-8)6-10(12(11)15)13(16)17/h1-7,15H,(H,16,17)
化学名
3-bromo-2-hydroxy-5-phenylbenzoic acid
别名
NSC-109116; NSC 109116; NSC109116; 5-Bromo-4-hydroxy-[1,1'-biphenyl]-3-carboxylic acid; 3-Bromo-5-phenyl salicylic acid; AKR1C1-IN-1; 3-bromo-5-phenylsalicylic acid; 3-bromo-2-hydroxy-5-phenylbenzoic acid; NSC-109116; CHEMBL387536;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~341.17 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.4116 mL 17.0579 mL 34.1157 mL
5 mM 0.6823 mL 3.4116 mL 6.8231 mL
10 mM 0.3412 mL 1.7058 mL 3.4116 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们