| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10 mM * 1 mL in DMSO |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
20alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (AKR1C1): AKR1C1 (Ki = 4 nM); AKR1C2 (Ki = 87 nM); AKR1C3 (Ki = 4.2 μM); AKR1C3 (Ki = 18.2 μM)
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| 体外研究 (In Vitro) |
在过度表达 AKR1C1 的 BAEC 中,AKR1C1-IN-1 可有效抑制孕酮代谢,IC50 为 460 nM [1]。
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| 酶活实验 |
酶和活性测定[1]
重组AKR1C1、AKR1C2、AKR1C3和AKR1C4在大肠杆菌JM109中表达,并如前所述纯化至均一性。使用牛血清白蛋白作为标准品,通过双辛可宁酸蛋白质测定试剂盒测定蛋白质浓度。如前所述,通过测量25°C下NADPH荧光(在455 nm处,激发波长为340 nm)或吸光度(在340 nm处)的变化率来测定酶的NADP+连接的S-四氢萘脱氢酶活性。在抑制试验中,抑制剂的IC50值最初是使用软件ED50和分级反应版本1.2的IC50用S-四氢萘浓度(AKR1C1为0.1 mM,其他酶为1 mM)确定的。在抑制剂浓度(0-0.5×IC50)存在的情况下,使用五种底物浓度(AKR1C3为0.2-2×Km,其他酶为0.5-5×Km)将初始速度拟合到Lineweaver−Burk和Dixon图中,从而确定抑制模式。Ki值是通过使用ENZFITTER的适当程序计算的,并表示为至少三次测定的平均值±标准误差。 |
| 细胞实验 |
细胞中抑制剂的评价[1]
在37°C、5%CO2培养箱中,在添加了10%胎牛血清、青霉素(100 U/mL)和链霉素(100μg/mL)的Dulbecco改良Eagle培养基中培养BAEC。在所有实验中,细胞在第4-8代使用,使用前通过显微镜确认内皮鹅卵石形态。根据先前报道的方法构建具有AKR1C1 cDNA的表达载体。首先通过PCR从细菌表达载体pGEX/AKR1C1中扩增cDNA,使用由正向引物(5′-GAGTCGACGACgccaccATGGATTCGAAATATCAGTG-3′)和反向引物(5’-AGTCGACTTAATACATCAAAATGGA-3′)组成的引物对,其中SalI位点、Kozak序列和起始密码子分别以斜体、小写和下划线表示。通过自动DNA测序验证PCR产物,并在真核表达载体pGW1的SalI位点进行亚克隆。然后使用Lipofectamine 2000将带有插入物的表达载体转染到亚融合的BAEC中。将转染的细胞在含有2%胎牛血清的培养基中保持24小时,然后用于评估3,5-二溴水杨酸和化合物4和9对细胞中孕酮代谢的抑制作用。细胞在无血清生长培养基中用不同浓度的抑制剂预处理2小时,然后用30μM孕酮孵育6小时。通过离心收集培养基,用乙酸乙酯提取培养基的脂质部分两次。代谢物20α-羟基孕酮在LC-MS上使用Chiralcel OJ-H 5μm柱进行定量,如前所述。 |
| 参考文献 |
[1]. El-Kabbani O, et al. Structure-guided design, synthesis, and evaluation of salicylic acid-based inhibitors targeting a selectivity pocket in the active site of human 20alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (AKR1C1). J Med Chem. 2009 May 28;52(10):3259-64.
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| 其他信息 |
本文报道了基于近期发表的20α-羟基类固醇脱氢酶(AKR1C1)与抑制剂三元复合物晶体结构,首次设计、合成并评价了人20α-羟基类固醇脱氢酶(AKR1C1)抑制剂。虽然新设计的抑制剂保留了晶体结构中观察到的酶-抑制剂相互作用,但活性最强的化合物3-溴-5-苯基水杨酸的额外苯基能够靶向AKR1C1活性位点中一个非保守的疏水口袋,使其抑制活性(Ki = 4 nM)比结构相似的3α-羟基类固醇脱氢酶同工酶(AKR1C2)提高了21倍。该化合物与Tyr55、His117和His222形成氢键,其苯环还与Leu308、Phe311以及非保守的Leu54(AKR1C2中为Val)残基形成范德华力相互作用。此外,3-溴-5-苯基水杨酸能有效抑制AKR1C1过表达细胞中孕酮的代谢,其有效浓度为10 nM,IC(50)值为460 nM。[1]
总之,利用最近确定的AKR1C1与抑制剂复合物的晶体结构,结合抑制剂结合位点的GRID分析,设计了一种新的基于水杨酸的抑制剂(化合物4),其效力(Ki = 4 nM)和选择性(21倍)均优于AKR1C2。此外,化合物 4 显著降低了细胞内孕酮的代谢,其 IC50 值为 460 nM,与先前已知的两种最有效的 AKR1C1 抑制剂——苯溴马隆和 3′,3′′,5′,5′′-四溴酚酞——的 IC50 值相当或更优。化合物 4 的设计靶点是 AKR1C1 活性位点中由三个非极性残基 Leu54、Leu308 和 Phe311 构成的选择性口袋。Leu308 是两个非保守的 C 端残基之一(另一个残基是 Leu306),正是这两个残基导致了 AKR1C1 与其两种亚型 AKR1C3 和 AKR1C4 之间抑制效力超过 4000 倍的差异。由于AKR1C1和AKR1C2的活性位点仅相差一个氨基酸残基(AKR1C1中为Leu54,AKR1C2中为Val54),且现有抑制剂对这两种酶的抑制效力相似,因此需要设计能够最大程度与AKR1C1中Leu54相互作用的新型抑制剂,以提高其对AKR1C2的选择性。因此,化合物4的新衍生物的开发有望提高目前已知AKR1C1抑制剂的选择性。我们还证明,虽然大型化学数据库检索有助于发现新的酶抑制剂,但利用酶-抑制剂复合物的高分辨率晶体结构,通过分析不同酶同工酶之间微小的结构差异,是优化酶-抑制剂相互作用的有效工具。[1] |
| 分子式 |
C13H9BRO3
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|---|---|
| 分子量 |
293.12
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| 精确质量 |
291.974
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| 元素分析 |
C, 53.27; H, 3.10; Br, 27.26; O, 16.37
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| CAS号 |
4906-68-7
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| PubChem CID |
268734
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| 外观&性状 |
Typically exists as White to pink solids at room temperature
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| 密度 |
1.6±0.0 g/cm3
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| 沸点 |
439.2±0.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
219.4±0.0 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±0.0 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.663
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| LogP |
4.43
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| tPSA |
57.53
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
3
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| 可旋转键数目(RBC) |
2
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| 重原子数目 |
17
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| 分子复杂度/Complexity |
276
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1=CC=C(C=C1)C2=CC(=C(C(=C2)Br)O)C(=O)O
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| InChi Key |
XVZSXNULHSIRCQ-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C13H9BrO3/c14-11-7-9(8-4-2-1-3-5-8)6-10(12(11)15)13(16)17/h1-7,15H,(H,16,17)
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| 化学名 |
3-bromo-2-hydroxy-5-phenylbenzoic acid
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| 别名 |
NSC-109116; NSC 109116; NSC109116; 5-Bromo-4-hydroxy-[1,1'-biphenyl]-3-carboxylic acid; 3-Bromo-5-phenyl salicylic acid; AKR1C1-IN-1; 3-bromo-5-phenylsalicylic acid; 3-bromo-2-hydroxy-5-phenylbenzoic acid; NSC-109116; CHEMBL387536;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~341.17 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.53 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.4116 mL | 17.0579 mL | 34.1157 mL | |
| 5 mM | 0.6823 mL | 3.4116 mL | 6.8231 mL | |
| 10 mM | 0.3412 mL | 1.7058 mL | 3.4116 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。