OF-1 (OF-1)

别名: OF-1; SGC OF 1; SGC OF1; SGC OF-1; SGCOF1; SGC-OF-1; 4-溴-N-(2,3-二氢-6-甲氧基-1,3-二甲基-2-氧代-1H-苯并咪唑-5-基)-2-甲基苯磺酰胺;OF-1
目录号: V0420 纯度: ≥98%
OF-1 (OF1; SGC-OF-1) 是一种有效的、选择性的溴结构域和 PHD 指含蛋白 1 (BRPF1) 抑制剂,具有重要的生物活性。
OF-1 (OF-1) CAS号: 919973-83-4
产品类别: Epigenetic Reader Domain
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
OF-1 (OF1; SGC-OF-1) 是一种有效的、选择性的溴结构域和 PHD 含指蛋白 1 (BRPF1) 抑制剂,具有重要的生物活性。它抑制 BRPF1B 和 BRPF2 溴结构域,Kd 分别为 100 nM 和 500 nM。 BRPF(包含 BRomodomain 和 PHD Finger)蛋白家族是组装 MYST 组蛋白乙酰转移酶复合物的支架蛋白。 MYST 复合物在 DNA 修复、重组、复制和转录激活中发挥重要作用。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
OF-1(1 μM 和 2 μM,0、1、2 和 3 天)可诱导多核抗酒石酸酸性磷酸酶 (TRAP) 阳性细胞数量显着减少[1]。 OF-1 是完全抑制多核“破骨细胞样”细胞融合的唯一抑制剂[1]。
细胞实验
细胞活力测定[1]
细胞类型:使用 10 ng/mL RANKL 分化期间的小鼠 BMC。
测试浓度:1 μM 和 2 μM。
孵化持续时间:0、1、2 和 3 天。
实验结果: RANKL 诱导分化后第 2 天特别强。
动物实验


参考文献

[1]. Selective Targeting of Bromodomains of the Bromodomain-PHD Fingers Family Impairs Osteoclast Differentiation. ACS Chem Biol. 2017 Oct 20;12(10):2619-2630.

[2]. Discovery of a Chemical Tool Inhibitor Targeting the Bromodomains of TRIM24 and BRPF. J Med Chem. 2016 Feb 25;59(4):1642-7.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H18BRN3O4S
分子量
440.31
精确质量
439.02
CAS号
919973-83-4
相关CAS号
919973-83-4
PubChem CID
35397514
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.6±0.1 g/cm3
沸点
573.8±60.0 °C at 760 mmHg
闪点
300.8±32.9 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.644
LogP
3.32
tPSA
90.71
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
640
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
YUNQZQREIHWDQT-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H18BrN3O4S/c1-10-7-11(18)5-6-16(10)26(23,24)19-12-8-13-14(9-15(12)25-4)21(3)17(22)20(13)2/h5-9,19H,1-4H3
化学名
4-Bromo-N-(6-methoxy-1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzoimidazol-5-yl)-2-methyl-benzenesulfonamide
别名
OF-1; SGC OF 1; SGC OF1; SGC OF-1; SGCOF1; SGC-OF-1;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 76 mg/mL (172.6 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.68 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.68 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2711 mL 11.3556 mL 22.7113 mL
5 mM 0.4542 mL 2.2711 mL 4.5423 mL
10 mM 0.2271 mL 1.1356 mL 2.2711 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT04591171 Completed Has Results Procedure: n-of-1 trial guided
clinical decision making
Hypertension
Chronic Kidney Diseases
The University of Texas Health
Science Center, Houston
January 25, 2021 Not Applicable
NCT02744456 Completed Drug: Amlodipine
Drug: Hydrochlorothiazide
Hypertension
High Blood Pressure
Columbia University August 1, 2014 Early Phase 1
NCT00299169 Terminated Behavioral: N of 1 Trials Diabetes
Cardiovascular Disease
Lawson Health Research Institute September 2006 Phase 4
NCT04757584 Completed Has Results Drug: Beta blockers Heart Failure
Heart Failure, Diastolic
Weill Medical College
of Cornell University
April 1, 2021 Phase 4
生物数据图片
  • Substrate recognition and inhibitor binding modes. (A) Details of the interaction of H4K5acK8ac with BRPF1B. The inset on the right shows a surface representation indicating the electrostatic potential ranging from +1.5 V (blue) to −1.5 V (red). (B) Details of the interaction of OF-1 with the BRPF1B bromodomain. OF-1 is shown in ball and stick representation. Hydrogen bonds are shown as dotted lines. (C) 2D projection showing the interactions of OF-1 with the BRPF1B acetyl-lysine binding site. Blue dashed lines represent hydrogen bonds; green solid lines, hydrophobic interactions; and green dashed lines, π–π stacking and edge-to-face aromatic interactions. The panel on the top right shows a 2Fo–Fc electron density map contoured at 1.2 σ around the inhibitor at 1.65 Å. (D) Details of the interaction of the BRPF1B bromodomain with PFI-4.
  • Inhibition of BRPF bromodomains in the nucleus. (A) Dose-dependent inhibition of the BRPF1B and histone H3.3 protein interaction with NI-57 and PFI-4 measured by NanoBRET assay. (B) Representative confocal images of nuclei from U2OS cells transfected with plasmids encoding triple bromodomains of BRPF1B treated either with or without SAHA (*) and the panBRPF Inhibitor NI-57. The bleached area is indicated by a red circle. (C) Half-times of fluorescence recovery (t1/2) after photo bleaching measured for the BRPF1B triple bromodomain construct. (D) Half-times of fluorescence recovery (t1/2) after photo bleaching measured for full-length BRPF2 (WT) after treatment with NI-57 at different concentrations with or without SAHA. Bars in panel C and D represent the mean t1/2 calculated from at least 10 individual recovery curves, and error bars depict the standard error of the mean. *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001, ****p < 0.0001 significant difference from wild type with or without SAHA (‡2.5 μM; n-way ANOVA and Dunnett’s posthoc-test).
  • BRPF bromodomain family and its inhibitors. (A) Domain organization of human BRPF proteins. Two splice isoforms of BRPF1B are expressed (A and B) that differ in the ZA loop of the bromodomain. In BRPF1A (or isoform 2), six residues EVTELD (661–666) are inserted into the ZA loop. Annotated domains are the PHD (plant homeo-domain) connected by a zinc finger, the bromodomain (BRD), and the PWWP domain (harboring the PWWP motif). (B) Sequence alignment of human BRPF bromodomains. The main secondary structural elements are highlighted. (C) BLI (BioLayer Interferometry) data measured on the two splice isoforms of BRPF1A and BRPF1B. Shown are the raw data traces for acetylated as well as nonacetylated peptide. (D) Location of the isoform BRPF1A specific insertion depicted on the structure of BRPF1B.
相关产品
联系我们