PDD00017273 HCl

别名: PDD00017273 HCl PDD-00017273 PDD 00017273 PDD17273 PDD-17273 PDD 17273
目录号: V27198 纯度: ≥98%
PDD00017273 是一种新型、有效、选择性的聚 (ADP 核糖) 糖水解酶 (PARG) 抑制剂,IC50 为 26 nM。
PDD00017273 HCl CAS号: 1945950-21-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PDD00017273 是一种新型、高效且选择性的聚(ADP-核糖)糖苷水解酶 (PARG) 抑制剂,IC50 为 26 nM。PDD00017273 对 PARG 的选择性比包括 PARP1 和 ARH3 在内的一系列离子通道、酶和受体高出 350 倍。
PDD00017273 HCl(CAS 编号:1945950-21-9)是一种新型、高效且选择性的聚(ADP-核糖)糖苷水解酶 (PARG) 抑制剂。PDD00017273 HCl 的分子式为 C23H26N6O4S2·HCl,分子量为 514.62 g/mol(游离碱)或 551.08 g/mol(盐酸盐),是一种喹唑啉磺酰胺衍生物。 PDD00017273 可抑制 PARG,IC50 为 26 nM,KD 为 1.45 nM。该化合物对 PARG 的选择性比对包括 PARP1 和 ARH3 在内的一系列离子通道、酶和受体高 350 倍以上。PDD00017273 是一种放射增敏剂,具有抗肿瘤活性,尤其适用于上皮性卵巢癌的研究。该化合物可通过 PARG 抑制 DNA 损伤后的 NAD⁺/H⁺ 平衡,并增加磷酸化 H2AX (γH2AX) 的强度,γH2AX 是 DNA 双链断裂的标志物。PDD00017273 可抑制同源重组 (HR) 介导的 DNA 损伤修复,并减缓复制叉的移动。该化合物为白色至浅黄色固体粉末,logP 值为 1.7,可溶于 DMSO。 PDD00017273 HCl 仅供研究使用,不可用于人类治疗。
生物活性&实验参考方法
靶点
PARG (poly(ADP-ribose) glycohydrolase). PARG is the primary enzyme responsible for the degradation of poly(ADP-ribose) (PAR) chains, which are synthesized by PARP enzymes in response to DNA damage. By hydrolyzing PAR, PARG plays a critical role in the dynamic regulation of the DNA damage response, chromatin remodeling, and cellular metabolism. PDD00017273 inhibits PARG with an IC50 of 26 nM and a KD of 1.45 nM. The compound exhibits >350-fold selectivity for PARG over a panel of ion channels, enzymes, and receptors, including PARP1 and ARH3. PDD00017273 does not inhibit five common cytochrome P450 enzymes at 10 μM, indicating a favorable selectivity profile. By inhibiting PARG, PDD00017273 prevents PAR degradation, leading to persistent PAR accumulation and prolonged DNA damage signaling. This mechanism sensitizes cancer cells to DNA-damaging agents and radiotherapy.
体外研究 (In Vitro)
PDD 00017273 是一种强效的 PARG 试剂,其 KD 值为 1.45 nM,IC50 值为 26 nM。PDD 00017273 (10 μM) 不抑制五种常见的细胞色素 P450 酶。DNA 损伤后,PDD 00017273 (30 μM) 通过 PARG 抑制 NAD/H,并增加磷酸化 H2AX (γH2AX) 的强度。PDD 00017273 可抑制标记有野生型 BRCA1 和 BRCA2 的 ZR-75-1 细胞,但对标记有 BRCA1 5396 + 1G>A 突变的 MDA-MB-436 细胞的影响甚微 [1]。在 MCF7 细胞中,PDD 00017273 (0.3 μM) 可抑制 PAR 培养基的分解。此外,PDD 00017273 (0.3 μM) 可降低 BARD1、BRCA2、PALB2、FAM175A 和 BRCA1 的潜伏期。同源重组 (HR) 是修复 PDD 00017273 造成的 DNA 损伤所必需的,PDD 00017273 还会减缓复制叉的移动 [2]。
PDD00017273 是一种强效的 PARG 抑制剂,其 IC50 为 26 nM,KD 为 1.45 nM。DNA 损伤后,PDD00017273 (30 μM) 通过 PARG 抑制 NAD⁺/H⁺ 比值,并增加磷酸化 H2AX (γH2AX) 的强度,γH2AX 是 DNA 双链断裂的标志物。在具有野生型 BRCA1 和 BRCA2 的 ZR-75-1 细胞中,PDD00017273 可抑制细胞生长,但对携带 BRCA1 突变 (5396+1G>A) 的 MDA-MB-436 细胞的影响甚微,提示该化合物的活性可能依赖于同源重组修复能力。在 MCF7 细胞中,PDD00017273 (0.3 μM) 可抑制 PAR 培养基的降解。此外,PDD00017273 (0.3 μM) 可降低 BRCA1、BRCA2、PALB2、FAM175A 和 BARD1 蛋白的潜伏期。同源重组 (HR) 是修复 PDD00017273 造成的 DNA 损伤所必需的,PDD00017273 还会减缓复制叉的移动。 PDD00017273 是一种具有抗肿瘤活性的放射增敏剂,尤其适用于上皮性卵巢癌的研究。
体内研究 (In Vivo)
PDD00017273 已在体内进行了抗肿瘤和放射增敏作用的研究。该化合物是一种强效的 PARG 抑制剂,已被研究用于治疗上皮性卵巢癌。PDD00017273 通过抑制 PARG,使肿瘤对 DNA 损伤剂和放射疗法更加敏感。该化合物能够通过 PARG 抑制 NAD⁺/H⁺ 比值,并在 DNA 损伤后增加 γH2AX 水平,这支持了其作为放射增敏剂的作用。目前公开资料中关于 PDD00017273 的详细体内药代动力学和药效学数据有限,但 PDD00017273 被认为是一种研究 PARG 生物学和验证 PARG 作为癌症治疗靶点的有效工具。PDD00017273 主要用于癌症研究,以研究 DNA 修复机制并开发与基因毒性药物的联合疗法。
酶活实验
PARG酶活性测定采用重组PARG酶和荧光或放射性标记的PAR底物。将酶与底物在测定缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、100 mM NaCl、1 mM DTT、0.01% Triton X-100)中于37°C孵育30-60分钟。通过测量ADP-核糖的释放或荧光偏振来定量PAR的水解。将PDD00017273用DMSO进行系列稀释后加入反应混合物中。PDD00017273的IC50为26 nM,KD为1.45 nM。每个浓度均进行重复测试,IC50值通过非线性回归分析计算。设置适当的阳性对照(例如,已知的PARG抑制剂)和溶剂对照以验证测定结果。
细胞实验
本研究在包括 ZR-75-1(BRCA1/2 野生型)和 MDA-MB-436(BRCA1 突变型)细胞在内的癌细胞系中评估了 PARG 抑制作用。细胞在适宜的培养基(例如,含 10% FBS 的 RPMI-1640 或 DMEM)中于 37°C、5% CO₂ 条件下培养,并用浓度范围为 0.1 至 30 μM 的 PDD00017273 处理 1 至 24 小时。使用酶学方法测定细胞裂解液中的 PARG 活性。使用抗 PAR 抗体通过蛋白质印迹法检测 PAR 水平。通过免疫荧光或蛋白质印迹法检测 γH2AX 灶的形成来评估 DNA 损伤。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力和增殖。使用 DR-GFP 或类似的报告基因检测方法评估同源重组修复效率。每个实验都包括载体对照(DMSO)和适当的阳性对照(例如,已知的 PARP 抑制剂,如奥拉帕尼)。
动物实验
PDD00017273 的体内疗效在小鼠异种移植模型中得到评估,该模型采用癌细胞系,特别是上皮性卵巢癌细胞系。将肿瘤细胞皮下或原位植入免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤达到预定大小后,将小鼠随机分为治疗组和对照组。PDD00017273 通过腹腔注射或灌胃给药,剂量根据临床前研究确定。该化合物配制于合适的载体中(例如,DMSO/PEG300/Tween 80)。通过游标卡尺测量或生物发光成像监测肿瘤生长。在整个研究过程中监测体重和临床症状以评估耐受性。在研究终点,收集肿瘤进行组织病理学分析和生化检测(PAR 水平、γH2AX、DNA 损伤标志物)。每组样本量通常为 6-10 只动物。
药代性质 (ADME/PK)
分子量:514.62(游离碱),551.08(盐酸盐)。分子式:C23H26N6O4S2·HCl。CAS号:1945950-21-9。外观:白色至浅黄色固体粉末。LogP:1.7。溶解性:DMSO。储存:粉末-20℃保存;溶剂中-80℃保存6个月;-20℃保存1个月。纯度:≥98%。PDD00017273是一种新型、高效、选择性的PARG抑制剂,IC50为26 nM,KD为1.45 nM。PDD00017273对PARG的选择性比PARP1和ARH3高350倍以上。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无PDD00017273的公开毒理学数据。该化合物仅供研究使用,尚未完成临床开发所需的完整临床前毒理学评估。作为一种PARG抑制剂,其潜在毒性可能包括对DNA修复和细胞代谢的影响。该化合物对PARG的选择性高于PARP1和其他酶,这可能降低脱靶毒性。标准毒性研究包括啮齿动物急性毒性评估、重复给药毒性研究(14天和28天)以及遗传毒性筛选(Ames试验、微核试验)。PDD00017273仅供研究使用,不得用于人类治疗。
参考文献

[1]. First-in-Class Chemical Probes against Poly(ADP-ribose) Glycohydrolase (PARG) Inhibit DNA Repair with Differential Pharmacology to AZD2281. ACS Chem Biol. 2016 Nov 18;11(11):3179-3190. Epub 2016 Oct 12.

[2]. Specific killing of DNA damage-response deficient cells with inhibitors of poly(ADP-ribose) glycohydrolase. DNA Repair (Amst). 2017 Apr;52:81-91.

其他信息
PDD00017273 也称为 PDD-00017273、PDD 00017273、PDD17273 和 PDD-17273。其 IUPAC 名称为 1-[(1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)甲基]-1,2,3,4-四氢-N-(1-甲基环丙基)-3-[(2-甲基-5-噻唑基)甲基]-2,4-二氧代-6-喹唑啉磺酰胺。PDD00017273 是一种强效且选择性的 PARG 抑制剂,IC50 为 26 nM。PDD00017273 是一种放射增敏剂,具有抗肿瘤活性,尤其适用于上皮性卵巢癌的研究。 PDD00017273 主要用于癌症研究,以研究 DNA 修复机制并开发与基因毒性药物的联合疗法。目前尚未有关于该化合物的临床试验报告。PDD00017273 仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H26N6O4S2
分子量
514.6203
精确质量
514.145
CAS号
1945950-21-9
相关CAS号
1945950-21-9;
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
1.7
tPSA
154
SMILES
S(C1C=CC2=C(C(N(CC3=CN=C(C)S3)C(N2CC2=CC(C)=NN2C)=O)=O)C=1)(NC1(C)CC1)(=O)=O
InChi Key
PIBCFKLPKFMUHX-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H26N6O4S2.ClH/c1-14-9-16(27(4)25-14)12-28-20-6-5-18(35(32,33)26-23(3)7-8-23)10-19(20)21(30)29(22(28)31)13-17-11-24-15(2)34-17/h5-6,9-11,26H,7-8,12-13H2,1-4H31H
化学名
1-[(1,3-Dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydro-N-(1-methylcyclopropyl)-3-[(2-methyl-5-thiazolyl)methyl]-2,4-dioxo-6-quinazolinesulfonamide hydrochloride
别名
PDD00017273 HCl PDD-00017273 PDD 00017273 PDD17273 PDD-17273 PDD 17273
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~48.58 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9432 mL 9.7159 mL 19.4318 mL
5 mM 0.3886 mL 1.9432 mL 3.8864 mL
10 mM 0.1943 mL 0.9716 mL 1.9432 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们