PDD00017273

别名: PDD-00017273 PDD 00017273 PDD00017273 PDD-17273 PDD 17273 PDD 17273
目录号: V40907 纯度: ≥98%
PDD00017273 是一种新型、有效、选择性的聚 (ADP 核糖) 糖水解酶 (PARG) 抑制剂,IC50 为 26 nM。
PDD00017273 CAS号: 1945950-21-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
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  • PDD00017273 HCl
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产品描述
PDD00017273 是一种新型、高效且选择性的聚(ADP-核糖)糖苷水解酶 (PARG) 抑制剂,IC50 值为 26 nM。PDD00017273 对 PARG 的选择性比包括 PARP1 和 ARH3 在内的一系列离子通道、酶和受体高出 350 倍以上。PDD00017273 具有细胞渗透性,可用于特异性杀伤某些同源重组蛋白(例如 BRCA1/2)缺陷的细胞。它的分子式为 C23H26N6O4S2,分子量为 514.62 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDD00017273 targets PARG (poly(ADP-ribose) glycohydrolase), an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages of ADP-ribose polymers, reversing the effects of poly(ADP-ribose) polymerases (PARPs). PARG has been shown to be involved in the repair of single-strand DNA breaks. By inhibiting PARG, PDD00017273 disrupts the DNA damage response pathway, making it particularly useful in cancer research for studying DNA repair mechanisms and developing combination therapies with genotoxic agents.
体外研究 (In Vitro)
PDD 00017273 是一种强效的 PARG 试剂,IC50 为 26 nM,KD 为 1.45 nM。对于五种典型的细胞色素 P450 酶,PDD 00017273 (10 μM) 不具有抑制作用。除了在 DNA 损伤后通过 PARG 抑制 NAD/H 外,PDD 00017273 (30 μM) 还能增加磷酸化 H2AX (γH2AX) 的强度。对于标记有 BRCA1 5396 + 1G>A 突变的 MDA-MB-436 细胞,PDD 00017273 的活性极低,但它能抑制标记有野生型 BRCA1 和 BRCA2 的 ZR-75-1 细胞 [1]。PDD 00017273 (0.3 μM) 可抑制 MCF7 细胞中 PAR 培养基的降解。此外,PDD 00017273 (0.3 μM) 可降低 BARD1、BRCA2、PALB2、FAM175A 和 BRCA1 的潜伏期。PDD 00017273 的作用机制包括诱导必须通过同源重组 (HR) 修复的 DNA 损伤以及阻断复制叉 [2]。体外实验表明,PDD00017273 能有效抑制 PARG 酶活性,IC50 值为 26 nM。该化合物对 PARG 的选择性比对包括 PARP1 和 ARH3 在内的一系列离子通道、酶和受体高出 350 倍以上。它具有细胞渗透性,并已被证明能特异性地杀死某些同源重组蛋白(例如 BRCA1/2)缺陷的细胞。PDD00017273 被用于癌症研究,以研究 DNA 修复机制并作为放射增敏剂。
体内研究 (In Vivo)
在临床前模型中,PDD00017273 已展现出体内抗肿瘤活性。该化合物用于癌症研究,以探索 DNA 修复机制并开发与基因毒性药物的联合疗法。研究表明,PDD00017273 对 PARG 的抑制作用可增强肿瘤对放射线和化疗药物的敏感性,尤其是在 DNA 修复缺陷或 p53 突变的肿瘤中。目前正在进行进一步的体内研究,以评估其治疗潜力。
酶活实验
用于检测 PDD00017273 的体外酶抑制试验,采用纯化的 PARG 酶和合适的底物(例如 ADP-核糖聚合物或荧光标记底物)来测定 PARG 酶活性。该试验在 37°C 的优化缓冲体系中进行,反应通过加入终止液终止。产物生成量通过荧光、吸光度或高效液相色谱法 (HPLC) 进行定量。IC50 值通过将剂量-反应曲线数据拟合到四参数逻辑方程来计算。选择性评估针对一系列相关酶,包括 PARP1 和 ARH3。
细胞实验
体外细胞研究采用癌细胞系,特别是那些具有DNA修复缺陷或p53突变的细胞系。将细胞用不同浓度(通常为纳摩尔至微摩尔级)的PDD00017273处理特定时间。使用CellTiter-Glo或MTT法评估细胞活力。通过测量γH2AX焦点的形成、彗星试验或分析PAR聚合物的积累来评估DNA损伤和修复情况。进行与放射线或基因毒性药物的联合研究,以评估潜在的协同效应。
动物实验
体内动物实验采用人癌细胞系的异种移植小鼠模型。荷瘤小鼠经灌胃或腹腔注射给予不同剂量的PDD00017273。随时间推移测量肿瘤体积,终点指标包括肿瘤生长抑制、生存期以及PARG抑制的生物标志物(例如PAR聚合物水平)。药效学研究评估药物在肿瘤组织中的靶点结合和通路调控情况。
药代性质 (ADME/PK)
PDD00017273 的药代动力学特性包括细胞渗透性和在 DMSO 中的溶解度(10 mg/mL 或 100 mg/mL)。该化合物不溶于水和乙醇。其分子量为 514.62 g/mol,呈白色至米色粉末状。建议储存于 2-8°C。该化合物应防潮,DMSO 储备液应新鲜使用以保持溶解度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PDD00017273 的毒理学数据仅限于临床前研究。该化合物仅供研究使用,不适用于人类治疗。处理该化合物时应遵循标准安全预防措施。动物研究显示,在有效剂量下未观察到明显的急性毒性。尚未进行长期毒性和致癌性研究。
参考文献

[1]. First-in-Class Chemical Probes against Poly(ADP-ribose) Glycohydrolase (PARG) Inhibit DNA Repair with Differential Pharmacology to AZD2281. ACS Chem Biol. 2016 Nov 18;11(11):3179-3190. Epub 2016 Oct 12.

[2]. Specific killing of DNA damage-response deficient cells with inhibitors of poly(ADP-ribose) glycohydrolase. DNA Repair (Amst). 2017 Apr;52:81-91.

其他信息
PDD00017273 也称为 PDD 00017273。它是一种高效且选择性的 PARG 抑制剂,IC50 值为 26 nM,对 PARP1 和 ARH3 的选择性超过 350 倍。该化合物用于癌症研究,特别是用于研究 DNA 修复机制以及开发与基因毒性药物的联合疗法。它以粉末形式供应,纯度 ≥98%,并提供多种规格以满足研究需求。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H26N6O4S2
分子量
514.6203
精确质量
514.146
CAS号
1945950-21-9
相关CAS号
1945950-21-9;
PubChem CID
121398766
外观&性状
White to light yellow solid powder
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
954
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1C=CC2=C(C(N(CC3=CN=C(C)S3)C(N2CC2=CC(C)=NN2C)=O)=O)C=1)(NC1(C)CC1)(=O)=O
InChi Key
IFWUBRBMMNTBRZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H26N6O4S2/c1-14-9-16(27(4)25-14)12-28-20-6-5-18(35(32,33)26-23(3)7-8-23)10-19(20)21(30)29(22(28)31)13-17-11-24-15(2)34-17/h5-6,9-11,26H,7-8,12-13H2,1-4H3
化学名
1-[(1,3-Dimethyl-1H-pyrazol-5-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydro-N-(1-methylcyclopropyl)-3-[(2-methyl-5-thiazolyl)methyl]-2,4-dioxo-6-quinazolinesulfonamide
别名
PDD-00017273 PDD 00017273 PDD00017273 PDD-17273 PDD 17273 PDD 17273
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~48.58 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9432 mL 9.7159 mL 19.4318 mL
5 mM 0.3886 mL 1.9432 mL 3.8864 mL
10 mM 0.1943 mL 0.9716 mL 1.9432 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们