PF-04979064

别名: PF-04979064; PF 04979064; PF04979064
目录号: V4430 纯度: ≥98%
PF-04979064 是一种新型、有效、选择性的 PI3K/mTOR 双激酶抑制剂,对 PI3Kα 和 mTOR 的 Ki 值分别为 0.13 nM 和 1.42 nM。
PF-04979064 CAS号: 1220699-06-8
产品类别: PI3K
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
PF-04979064 是一种新型、有效、选择性的 PI3K/mTOR 双激酶抑制剂,PI3Kα 和 mTOR 的 Kis 分别为 0.13 nM 和 1.42 nM,肿瘤学家将大量研究集中在 PI3K、AKT 和 mTOR 这三种重要的激酶上PI3K信号通路,治疗多种癌症。进行了三环咪唑并[1,5]萘啶系列先导化合物优化工作,以便找到结构独特的 PF-04691502 的备用候选药物,该候选药物目前正在 I/II 期临床试验中进行实体瘤治疗测试。基于结构的药物设计和基于物理性质的优化相结合,开发出了有效且特异性的 PI3K/mTOR 双激酶抑制剂 PF-04979064。
生物活性&实验参考方法
靶点
PI3Kα (Ki = 0.13 nM); PI3Kγ (Ki = 0.111 nM); PI3Kδ (Ki = 0.122 nM); mTOR (Ki = 1.42 nM)
PF-04979064 is tested against human class I PI3K isoforms PI3Kα, PI3Kγ, and PI3Kδ, with PI3Kα Ki of 0.13 nM, PI3Kγ Ki of 0.111 nM, and PI3Kδ Ki of 0.122 nM[1].
体外研究 (In Vitro)
PF-04979064 针对人类 I 类 PI3K 同工型 PI3Kα、PI3Kγ 和 PI3Kδ 进行测试,PI3Kα Ki 为 0.13 nM,PI3Kγ Ki 为 0.111 nM,PI3Kδ Ki 为 0.122 nM[1]。
在BT20细胞中测量对丝氨酸473位AKT磷酸化(pAKT)抑制的细胞实验中,PF-04979064 的 IC50 为 9.10 nM [1]。
该化合物表现出较高的激酶组选择性,在1 μM浓度下,对一组36种测试激酶的抑制均小于25% [1]。
该化合物在RRCK实验中表现出高渗透性 (17.2 x 10-6 cm/sec) 和非常好的动力学溶解度 (539 μM) [1]
体内研究 (In Vivo)
PF-04979064 在大鼠体内的 PK 曲线显示出进展,显示 Vdss=5.23 L/kg,Cl=19.3 mL/min/kg,T1/2=1.85 h,F%=61%[1]。
PF-04979064 在U87MG人胶质母细胞瘤小鼠异种移植模型中表现出剂量依赖性的肿瘤生长抑制作用。
当每日一次口服给药时,在最高测试且耐受剂量40 mg/kg QD下,实现了88%的肿瘤生长抑制 [1]。
观察到了稳健的药代动力学/药效学相关性。在U87MG荷瘤小鼠中单次口服40 mg/kg后,1小时时较高的游离药物血浆浓度与肿瘤AKT磷酸化(pS473)的最大抑制相一致。24小时时,当游离药物血浆浓度极低时,仅观察到最小程度的抑制 [1]
酶活实验
PF-04979064 针对各种激酶靶点 (mPI3Kα, mTOR, 人PI3K亚型) 的抑制常数 (Ki) 是使用已建立的体外生化测定法测定的,如文献中所引用。这些激酶活性测定的具体实验步骤在一篇先前出版物(文章内参考文献5和6)中有描述,其中详细说明了测量PI3K和mTOR激酶活性抑制的方法。这些测定的变异系数通常小于20% (n=2) [1]。
确定了PF-04979064与PI3Kγ结合的晶体结构,证实了其结合模式。关键相互作用包括萘啶环氮原子与铰链区残基之间的氢键、甲基吡啶氮原子与一个保守水分子之间的氢键,以及酰胺羰基与Lys833之间和醇基团与Asp964之间的额外氢键 [1]
细胞实验
PF-04979064的细胞活性在BT20细胞实验中进行了评估,该实验测量对丝氨酸473位AKT磷酸化的抑制。该细胞实验的详细方案引用自先前工作(文章内参考文献5和6)。简而言之,用化合物处理细胞,裂解细胞,然后定量磷酸化AKT (pS473)的水平以确定IC50值,该值代表引起50%磷酸化抑制的浓度 [1]
动物实验
疗效研究:在体内肿瘤生长抑制研究中,将U87MG肿瘤细胞皮下植入裸鼠体内。肿瘤形成后,将小鼠随机分组,并每日一次口服(PO)PF-04979064进行治疗。定期测量肿瘤大小。通过比较治疗组和载体对照组的肿瘤体积来计算肿瘤生长抑制率。采用单因素方差分析(ANOVA)确定统计学显著性[1]。药代动力学/药效学研究:对荷瘤小鼠单次口服40 mg/kg的PF-04979064。在给药后不同时间点收集肿瘤和血浆。将肿瘤组织裂解,用于分析AKT磷酸化抑制(pS473)。分析血浆样本以确定游离药物浓度[1]。
大鼠药代动力学研究:向大鼠施用PF-04979064以确定其药代动力学特征。本研究的具体给药途径、制剂和给药频率在提供的文本中未详细说明[1]。
药代性质 (ADME/PK)
PF-04979064在人肝微粒体(HLM)试验中表现出较低的固有清除率(< 10.3 mL/min/kg),表明其对细胞色素P450酶具有良好的代谢稳定性[1]。
在大鼠药代动力学研究中,PF-04979064显示出良好的药代动力学特征:稳态分布容积(Vdss)= 5.23 L/kg,清除率(Cl)= 19.3 mL/min/kg,半衰期(T1/2)= 1.85 小时,口服生物利用度(F%)= 61%[1]。
该化合物被鉴定为醛氧化酶(AO)的底物。在人肝S9组分试验中评估了其稳定性,结果显示其半衰期(T1/2)为38.7分钟。我们开发了一种经验标度方法来预测 AO 底物的人体清除率,预测 PF-04979064 在人体中的总血浆清除率为 8.1 mL/min/kg [1]。计算机模拟估计其血浆游离分数 (fu, p) 为 0.0875,血血浆比为 0.86 [1]。
参考文献

[1]. Discovery of the Highly Potent PI3K/mTOR Dual Inhibitor PF-04979064 through Structure-Based Drug Design. ACS Med Chem Lett, 2012 Nov 7, 4(1):91-7.

其他信息
PF-04979064 是通过基于结构的药物设计和基于物理性质的优化,从具有高亲脂性和较差 ADMET 特性的先导化合物 (1) 中发现的。优化显著提高了亲脂性效率 (LipE),提高了 4 个单位以上 [1]。
它被开发为 PF-04691502 的结构差异化备选方案,PF-04691502 是另一种正在进行临床试验的 PI3K/mTOR 双重抑制剂 [1]。
该化合物与 PI3Kγ 的结合模式涉及铰链区和磷酸盐结合口袋中的关键氢键相互作用,这已通过 X 射线晶体衍射(PDB 代码:4HVB)得到证实 [1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H26N6O3
分子量
446.5016
精确质量
446.206
元素分析
C, 64.56; H, 5.87; N, 18.82; O, 10.75
CAS号
1220699-06-8
相关CAS号
1220699-06-8
PubChem CID
46866705
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
682.0±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
366.3±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.2 mmHg at 25°C
折射率
1.668
LogP
0.35
tPSA
106.14
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
744
定义原子立体中心数目
1
SMILES
O=C1N(C([H])([H])[H])C2=C([H])N=C3C([H])=C([H])C(C4=C([H])N=C(C([H])([H])[H])C([H])=C4[H])=NC3=C2N1C1([H])C([H])([H])C([H])([H])N(C([C@]([H])(C([H])([H])[H])O[H])=O)C([H])([H])C1([H])[H]
InChi Key
GACQNUHFDBEIQH-HNNXBMFYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H26N6O3/c1-14-4-5-16(12-25-14)18-6-7-19-21(27-18)22-20(13-26-19)28(3)24(33)30(22)17-8-10-29(11-9-17)23(32)15(2)31/h4-7,12-13,15,17,31H,8-11H2,1-3H3/t15-/m0/s1
化学名
1-[1-[(2S)-2-hydroxypropanoyl]piperidin-4-yl]-3-methyl-8-(6-methylpyridin-3-yl)imidazo[4,5-c][1,5]naphthyridin-2-one
别名
PF-04979064; PF 04979064; PF04979064
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~10 mg/mL (~22.4 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1 mg/mL (2.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 10.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2396 mL 11.1982 mL 22.3964 mL
5 mM 0.4479 mL 2.2396 mL 4.4793 mL
10 mM 0.2240 mL 1.1198 mL 2.2396 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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