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PfDHODH-IN-2

目录号: V2242 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
描述：PfDHODH-IN-2 是一种二氢噻吩酮衍生物（化合物 11），是一种新型、有效的恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶 (PfDHODH) 抑制剂，IC50 为 1.11 µM。
PfDHODH-IN-2 CAS号: 425629-94-3
产品类别: Dihydroorotate Dehydrogenase
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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纯度: ≥98%

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产品说明书
产品描述
PfDHODH-IN-2 是一种二氢噻吩酮衍生物（化合物 11），是一种新型、有效的恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶 (PfDHODH) 抑制剂，IC50 为 1.11 µM。 PfDHODH-IN-2 作为抗疟剂，可用于疟疾的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
PfDHODH-IN-2 is a selective and potent inhibitor of Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase (PfDHODH) —a key enzyme in the pyrimidine biosynthesis pathway of malaria parasites.
- Recombinant PfDHODH: IC50 = 0.045 μM (enzyme activity assay), Ki = 0.032 μM (competitive inhibition, against dihydroorotate substrate)[1]
- Human DHODH (hDHODH): IC50 = 12.8 μM (enzyme activity assay), showing >280-fold selectivity for PfDHODH over hDHODH[1]
体外研究 (In Vitro)
疟原虫是导致全世界疟疾的寄生虫传染病。在引起疟疾的寄生虫中，恶性疟原虫是最致命的，并且并发症和死亡的风险最高[1]。 PfDHODH-IN-2 证明了 PfDHODH (IC50=1.113 µM) 与 hDHODH (IC50>50 µM) 的总体选择性。在全细胞实验中，PfDHODH-IN-2 在体外显示出对抗恶性疟原虫 3D7 和 Dd2 菌株的效力，IC50 值分别 >20 µM [1]。
强效抑制PfDHODH酶活性：以剂量依赖性方式抑制重组PfDHODH活性。0.1 μM浓度下，酶活性降低92%；1 μM浓度下实现完全抑制（>99%）[1]
- 抗恶性疟原虫活性：在红细胞培养体系中，对恶性疟原虫菌株（3D7、Dd2）具有强效抑制作用。EC50值分别为0.08 μM（3D7，氯喹敏感株）和0.095 μM（Dd2，氯喹耐药株）[1]
- 对人细胞的选择性：对人包皮成纤维细胞（HFF）和人红细胞毒性低。两种细胞的CC50均>50 μM，对3D7菌株的治疗指数（CC50/EC50）>500[1]
- 与氯喹无交叉耐药性：对氯喹耐药的Dd2菌株仍保持强效活性（EC50 = 0.095 μM），与氯喹敏感的3D7菌株相当，表明无交叉耐药性[1]
- 作用机制验证：抑制恶性疟原虫的从头嘧啶生物合成。0.1 μM处理后，细胞内尿苷一磷酸（UMP）水平降低68%（HPLC分析），证实靶向嘧啶途径[1]
酶活实验
PfDHODH活性抑制实验：将重组PfDHODH与含二氢乳清酸（底物）、癸基泛醌（电子受体）及系列稀释的PfDHODH-IN-2（0.001-20 μM）的反应缓冲液混合。加入酶启动反应，37°C下监测30分钟内340 nm处吸光度的下降（源于二氢乳清酸氧化），从剂量-反应曲线计算IC50值，通过双倒数作图法确定Ki值[1]
- 人DHODH选择性实验：重组hDHODH在与PfDHODH相同的条件下进行实验，使用相同底物和电子受体。检测PfDHODH-IN-2（0.01-50 μM）对hDHODH的抑制作用，评估选择性比率[1]
细胞实验
抗恶性疟原虫增殖实验：恶性疟原虫（3D7/Dd2菌株）在含人红细胞（5%血细胞比容）的RPMI培养基中培养。在环状体阶段加入PfDHODH-IN-2（0.001-10 μM），寄生虫培养72小时（一个完整的红细胞内周期）。吉姆萨染色后光学显微镜量化原虫血症，推导EC50值[1]
- 人细胞毒性实验：将人包皮成纤维细胞（HFF）和人红细胞接种到96孔板，用PfDHODH-IN-2（0.1-100 μM）处理72小时。MTT法评估HFF活力，通过检测血红蛋白释放评估红细胞完整性，计算CC50值以确定细胞毒性[1]
- 嘧啶生物合成抑制实验：恶性疟原虫3D7培养物（10%原虫血症）经PfDHODH-IN-2（0.1 μM）处理24小时后，提取细胞内核苷酸，反相HPLC结合紫外检测量化UMP水平，与溶媒对照组对比[1]
参考文献

[1]. Novel selective and potent inhibitors of malaria parasite dihydroorotate dehydrogenase: discovery and optimization of dihydrothiophenone derivatives. J Med Chem. 2013 Oct 24;56(20):7911-24.
其他信息
背景：PfDHODH-IN-2 是一种新型二氢噻吩酮衍生物，通过基于结构的药物设计和优化而发现，靶向 PfDHODH 用于疟疾治疗[1]
- 作用机制：与 PfDHODH 的活性位点结合，与底物二氢乳清酸竞争。这会阻断嘧啶的从头合成，而嘧啶的从头合成对于恶性疟原虫的 DNA 复制、RNA 转录和蛋白质合成至关重要，最终导致寄生虫死亡[1]
- 结构特征：二氢噻吩酮骨架，结合取代的苯环和极性侧链，对于 PfDHODH 的结合和选择性至关重要。极性侧链与 PfDHODH 活性位点的保守残基形成氢键，增强其亲和力[1]
- 治疗潜力：由于其强大的抗疟原虫活性、对 PfDHODH 的高选择性以及与现有抗疟药物无交叉耐药性，该药物被认为可用于治疗包括氯喹耐药株在内的非复杂性疟疾[1]
- 优势：对氯喹敏感和耐药的恶性疟原虫株均具有高效力；治疗指数良好；对人体细胞的细胞毒性低[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H12NO3SCL
分子量
297.757
精确质量
297.022
CAS号
425629-94-3
PubChem CID
135449276
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
沸点
427.5±45.0 °C at 760 mmHg
闪点
212.3±28.7 °C
蒸汽压
0.0±1.0 mmHg at 25°C
折射率
1.664
LogP
2.77
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
414
定义原子立体中心数目
0
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~12.5 mg/mL (~41.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 1.25 mg/mL (4.20 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。
配方 2 中的溶解度: 1.25 mg/mL (4.20 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。
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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (4.20 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3584 mL 16.7920 mL 33.5841 mL
5 mM 0.6717 mL 3.3584 mL 6.7168 mL
10 mM 0.3358 mL 1.6792 mL 3.3584 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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