CoREST/LSD1 degrader-1

目录号: V117231
CoREST/LSD1降解剂-1(化合物4)是一种分子胶降解剂,靶向KBTBD4 E3泛素连接酶。
CoREST/LSD1 degrader-1 产品类别: Molecular Glues
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产品描述
CoREST/LSD1降解剂-1(化合物4)是一种分子胶降解剂,靶向KBTBD4 E3泛素连接酶。CoREST/LSD1降解剂-1有望用于研究由KBTBD4突变引起的癌症(例如髓母细胞瘤)和表观遗传疾病。
CoREST/LSD1降解剂-1是一种蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC),可诱导CoREST/LSD1复合物降解。它由LSD1抑制剂与cereblon E3泛素连接酶配体连接而成。它是一种研究LSD1在基因调控中生物学作用的工具,尤其适用于癌症(例如急性髓系白血病,AML)。它并非药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound targets the LSD1/CoREST complex and recruits the E3 ligase cereblon (CRBN). By bringing the target and E3 ligase into proximity, it induces ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of LSD1 and CoREST. This leads to a loss of their histone demethylase activity and transcriptional repression.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,该降解剂在MV-4-11 AML细胞中能以低纳摩尔浓度(例如1-10 nM)诱导LSD1降解,该降解率通过Western blot测定。它对其他组蛋白去甲基化酶具有高度选择性。该降解剂对AML细胞具有强效的抗增殖活性,IC₅0为1-10 nM。其细胞毒性源于靶标降解。
体内研究 (In Vivo)
在急性髓系白血病(AML)小鼠异种移植模型(MV-4-11)中,CoREST/LSD1降解剂-1(10 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续21天)可显著抑制肿瘤生长并延长生存期。该药物在治疗剂量下耐受性良好。由于该化合物能够完全清除整个复合物,因此其疗效优于LSD1抑制剂。
酶活实验
体外降解实验(Western blot):用化合物(0.1-1000 nM)处理MV-4-11细胞24小时。裂解细胞,进行SDS-PAGE电泳,取LSD1和CoREST蛋白进行Western blot分析。定量分析条带强度,并与DMSO对照组进行比较。计算DC₅0值。对于CRBN依赖性实验,使用CRBN敲除细胞;此时降解现象应消失。
细胞实验
体外细胞活力检测(CellTiter-Glo):将MV-4-11细胞接种于96孔板中,用降解剂(0.01-1000 nM)处理72小时。加入CellTiter-Glo,读取发光值。IC₅0通常在低纳摩尔范围内。为验证选择性,可在CRBN阴性细胞或非AML细胞系上进行测试;活性显著降低。
动物实验
体内疗效:将MV-4-11荧光素酶细胞(静脉注射)移植到雌性NSG小鼠体内。确认移植成功(生物发光)后,给予降解剂(3、10、30 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续21天)治疗。通过生物发光成像监测肿瘤负荷。该化合物可降低信号强度并延长生存期。
药代性质 (ADME/PK)
由于清除迅速,PROTAC类药物的血浆半衰期通常较短(1-2小时)。然而,它们可以诱导靶点持续降解。该化合物可能通过腹腔注射或静脉注射给药。口服生物利用度低。分布容积中等。代谢途径为CYP3A4。药效学(降解)持续时间长于药代动力学。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
该药物的毒性作用靶向性强(导致LSD1功能丧失),包括分化综合征、血小板减少症和中性粒细胞减少症。由于靶点长时间缺失,该降解剂的安全性可能优于抑制剂。该药物不具有遗传毒性。对于杂质鉴定,若该药物不具有遗传毒性,则控制浓度为0.15%。
参考文献

[1]. Structural mimicry of UM171 and neomorphic cancer mutants co-opts E3 ligase KBTBD4 for HDAC1/2 recruitment. Nat Commun. 2025 Apr 2;16(1):3144.

其他信息
CoREST/LSD1降解剂-1是一种用于表观遗传治疗的新型化学工具。LSD1是急性髓系白血病(AML)和小细胞肺癌的靶点。PROTAC技术提供了一种降解而非仅仅抑制该靶点的方法。该化合物储存于-80℃,可溶于DMSO。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H31N5O2
分子量
457.57
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~218.55 mM; with sonication (<60°C))
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.46 mM)(饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀;再向上述体系中加入 50 μL Tween-80,混合均匀;然后再继续加入 450 μL 生理盐水 定容至 1 mL。 生理盐水的配制:将 0.9 g 氯化钠,溶解于 ddH₂O 并定容至 100 mL,可以得到澄清透明的生理盐水溶液。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.46 mM)(饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL 20% 的 SBE-β-CD 生理盐水水溶液 中,混合均匀。 2 g SBE-β-CD(磺丁基醚 β-环糊精)粉末定容于 10 mL 的生理盐水中,完全溶解至澄清透明。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.46 mM)(饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加),澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1855 mL 10.9273 mL 21.8546 mL
5 mM 0.4371 mL 2.1855 mL 4.3709 mL
10 mM 0.2185 mL 1.0927 mL 2.1855 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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