PROTAC ERRα Degrader-3

目录号: V67722 纯度: ≥98%
PROTAC ERRα Degrader-3 是一种基于 von Hippel-Lindau 配体的有效且特异性的 ERRα 降解剂。
PROTAC ERRα Degrader-3 CAS号: 2306388-65-6
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PROTAC ERRα Degrader-3 是一种基于 von Hippel-Lindau 配体的高效特异性 ERRα 降解剂。在 30 nM 的浓度下,PROTAC ERRα Degrader-3 能够特异性地降解 ERRα 蛋白,降解率超过 80%。PROTAC ERRα Degrader-3 对 ERRβ 和 ERRγ 蛋白无活性。
PROTAC ERRα Degrader-3 是一种基于 von Hippel-Lindau (VHL) E3 泛素连接酶配体的高效选择性 ERRα 降解剂。其分子式为 C₄₇H₅₀F₆N₆O₇S,分子量为 956.99 g/mol。这种 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)能够在 30 nM 的浓度下特异性地降解 ERRα 蛋白,降解率超过 80%。 PROTAC ERRα 降解剂-3 对 ERRα 具有高度选择性,对 ERRβ 和 ERRγ 蛋白无活性。它是研究 ERRα 生物学和开发靶向蛋白降解策略的宝贵工具。该化合物仅供研究使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
ERRα VHL
PROTAC ERRα Degrader-3 targets estrogen-related receptor alpha (ERRα), a nuclear receptor involved in energy metabolism, mitochondrial biogenesis, and cellular homeostasis. The compound functions as a PROTAC, recruiting the von Hippel-Lindau (VHL) E3 ubiquitin ligase to ERRα, leading to ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of the target protein. It shows high selectivity for ERRα and is inactive against the closely related ERRβ and ERRγ proteins. This selective degradation enables precise modulation of ERRα activity without affecting other ERR family members.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC ERRα 降解剂-3(化合物 6c;0.3 nM-10 μM;4 小时)以剂量依赖的方式刺激 ERRα 降解,在 4.0 小时时,有效浓度低至 3.0 nM。PROTAC ERRα 降解剂-3 在处理 24 小时后,有效降低了 MDA-MB-231 细胞中 ERRα 下游靶基因(如 ATP5B、中链酰基辅酶 A 脱氢酶 (MCAD) 和丙酮酸脱氢酶激酶 4 (PDK4))的蛋白水平[1]。 PROTAC ERRα Degrader-3 的 IC50 值为 12.67 nM,它能破坏 ERRα 与 PGC-1α 肽的蛋白-蛋白相互作用,在 100 nM 浓度下处理 4 小时后,ERRα 蛋白降解率约为 96% [1]。体外实验表明,PROTAC ERRα Degrader-3 能高效且选择性地降解 ERRα 蛋白。在 30 nM 的浓度下,该化合物可特异性地降解 ERRα 蛋白 80% 以上。该化合物对 ERRβ 和 ERRγ 蛋白无活性,表现出优异的选择性。这种选择性降解使其成为研究 ERRα 特异性功能和验证 ERRα 作为治疗靶点的宝贵工具。该化合物的活性通常在基于细胞的检测中进行评估,通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测不同浓度处理后的 ERRα 蛋白水平。
体内研究 (In Vivo)
公开文献中关于PROTAC ERRα降解剂-3的具体体内活性数据尚不充分。作为一种分子量为956.99 g/mol的PROTAC分子,其体内疗效取决于口服生物利用度、组织分布和靶点结合等因素。该化合物强大的体外降解活性表明其在ERRα驱动的疾病模型中具有潜在的体内应用价值。需要进一步研究以表征其体内药代动力学和药效学特性。该化合物仅供研究使用。
酶活实验
PROTAC ERRα Degrader-3 的体外酶/受体结合试验通常评估化合物在细胞系统中诱导 ERRα 蛋白降解的能力,而非直接的酶结合。化合物的活性通过在不同浓度处理后,使用蛋白质印迹法或免疫荧光法检测 ERRα 蛋白水平来评估。降解效率以剩余蛋白百分比或 DC₅₀ 值表示。化合物的选择性通过检测 ERRβ 和 ERRγ 的蛋白水平来评估,以确认其对这些靶点无活性。所有试验均在标准细胞培养条件下进行,并设置了适当的对照。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: MDA-MB-231 细胞
测试浓度: 0.3 nM、1 nM、3 nM、10 nM、30 nM、100 nM、300 nM、1 μM、3 μM、10 μM
孵育时间: 4 小时
实验结果: 剂量依赖性地诱导 ERRα 降解。
PROTAC ERRα Degrader-3 的体外细胞实验采用表达内源性 ERRα 或转染 ERRα 表达构建体的细胞系。细胞用不同浓度的化合物处理 6-24 小时。通过蛋白质印迹法或高内涵成像法检测ERRα蛋白水平,以确定降解效率。通过检测ERRβ和ERRγ蛋白水平来评估选择性。细胞活力和增殖可通过MTT或CCK-8法进行评估。采用标准细胞培养条件(37°C,5% CO₂)和合适的培养基。绘制剂量反应曲线以确定DC₅₀值。
动物实验
使用 PROTAC ERRα Degrader-3 进行的体内动物研究通常包括将该化合物给药于啮齿动物模型,以评估其在 ERRα 驱动的疾病模型中的疗效。潜在的研究设计包括使用 ERRα 依赖性癌细胞系的异种移植模型,或 ERRα 发挥作用的代谢疾病模型。典型的终点指标包括肿瘤生长测量、靶组织中 ERRα 蛋白水平的评估、下游基因表达的评估以及药代动力学分析。所有操作必须符合机构的动物护理和使用指南。目前尚无已发表的详细体内研究方案。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中关于PROTAC ERRα降解剂-3的具体药代动力学数据并不详尽。该化合物的分子量为956.99 g/mol,对于口服生物利用度而言相对较高。作为一种PROTAC分子,其药代动力学特性可能受到其双功能结构的影响,该结构包含靶点结合部分和E3连接酶募集部分。该化合物通常以粉末形式储存于-20°C。关于该产品稳定性,尤其是在溶液中的稳定性信息鲜有报道。需要进一步研究以阐明其药代动力学特征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PROTAC ERRα 降解剂-3 仅供研究使用,未获准用于人体治疗。作为一种研究用化学品,公开文献中没有全面的毒理学数据。处理该化合物时应遵守标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备。与所有研究用化学品一样,在考虑进行临床开发之前,必须进行全面的毒理学分析。该化合物应在通风良好的区域操作,并遵循正确的废物处理程序。
参考文献

[1]. Identification of New Small-Molecule Inducers of Estrogen-related Receptor α (ERRα) Degradation. ACS Med Chem Lett. 2019 Apr 12;10(5):767-772.

其他信息
PROTAC ERRα降解剂-3(CAS#: 2306388-65-6)的分子式为C₄₇H₅₀F₆N₆O₇S,分子量为956.99 g/mol。其IUPAC名称为(2S,4R)-1-((S)-2-(5-((E)-3-(4-((2,4-双(三氟甲基)苯基)氧)-3-甲氧基苯基)-2-氰基丙酰胺)-戊酰胺)-3,3-二甲基丁酰胺)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)吡咯烷-2-羧酰胺。它是一种强效且选择性的ERRα降解剂,基于冯·希佩尔-林道配体,能够在30 nM时降解ERRα蛋白超过80%。对ERRβ和ERRγ无活性。该化合物不是药物,且未经过临床试验。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C47H50F6N6O7S
分子量
956.991331577301
精确质量
956.336
CAS号
2306388-65-6
PubChem CID
155561684
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
7.5
tPSA
211
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
18
重原子数目
67
分子复杂度/Complexity
1760
定义原子立体中心数目
3
SMILES
S1C=NC(C)=C1C1C=CC(=CC=1)CNC([C@@H]1C[C@H](CN1C([C@H](C(C)(C)C)NC(CCCCNC(/C(/C#N)=C/C1C=CC(=C(C=1)OC)OCC1C=CC(C(F)(F)F)=CC=1C(F)(F)F)=O)=O)=O)O)=O
InChi Key
POTUUCUOBIVSIX-BDUCEWPUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C47H50F6N6O7S/c1-27-40(67-26-57-27)30-12-9-28(10-13-30)23-56-43(63)36-21-34(60)24-59(36)44(64)41(45(2,3)4)58-39(61)8-6-7-17-55-42(62)32(22-54)18-29-11-16-37(38(19-29)65-5)66-25-31-14-15-33(46(48,49)50)20-35(31)47(51,52)53/h9-16,18-20,26,34,36,41,60H,6-8,17,21,23-25H2,1-5H3,(H,55,62)(H,56,63)(H,58,61)/b32-18+/t34-,36+,41-/m1/s1
化学名
(2S,4R)-1-[(2S)-2-[5-[[(E)-3-[4-[[2,4-bis(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]-3-methoxyphenyl]-2-cyanoprop-2-enoyl]amino]pentanoylamino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 80 mg/mL (83.60 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (2.09 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.0 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0449 mL 5.2247 mL 10.4494 mL
5 mM 0.2090 mL 1.0449 mL 2.0899 mL
10 mM 0.1045 mL 0.5225 mL 1.0449 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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