TMX-4100

别名: TMX4100;3-[4-(3-噻吩基)-1H-1,2,3-三唑-1-基]-2,6-哌啶二酮
目录号: V72016 纯度: ≥98%
TMX-4100 是一种选择性磷酸二酯酶 6D (PDE6D) 降解剂。
TMX-4100 CAS号: 2367619-63-2
产品类别: Phosphodiesterase(PDE)
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
TMX-4100 是一种选择性磷酸二酯酶 6D (PDE6D) 降解剂。TMX-4100 对 MOLT4、Jurkat 和 MM.1S 肿瘤细胞中的 PDE6D 具有高度降解偏好性,其半数致死浓度 (DC50) 低于 200 nM。TMX-4100 可用于多发性骨髓瘤的研究。
TMX-4100 是一种高选择性的小分子降解剂,靶向磷酸二酯酶 6D (PDE6D)。PDE6D 是一种异戊二烯结合蛋白,可促进异戊二烯化蛋白(包括 Ras 和 Ras 相关蛋白)转运至细胞膜。TMX-4100 是一种分子胶降解剂,可促进 E3 泛素连接酶 cereblon 与 PDE6D 的相互作用,从而诱导 PDE6D 的泛素化及其后续降解。 TMX-4100 在 MOLT4、Jurkat 和 MM.1S 肿瘤细胞中表现出较高的降解偏好性,DC50 值小于 200 nM。它被用于多发性骨髓瘤的研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDE6D
TMX-4100 targets phosphodiesterase 6D (PDE6D), a prenyl-binding protein that plays a critical role in the trafficking of prenylated proteins to cellular membranes. PDE6D is involved in the localization and function of Ras and Ras-related proteins, which are important in cancer cell signaling. TMX-4100 is a molecular glue degrader that promotes the interaction between PDE6D and the E3 ubiquitin ligase cereblon. This interaction induces ubiquitination of PDE6D and its subsequent degradation by the proteasome. By degrading PDE6D, TMX-4100 disrupts the trafficking of prenylated proteins and impairs cancer cell signaling.
体外研究 (In Vitro)
在 MOLT4 细胞中,化合物 3(TMX-4100;1 μM;4 小时)对 PDE6D 的降解表现出强烈的亲和力 [1]。在 MOLT4 细胞中,与 PDE6D 降解剂 FPFT-2216 相比,TMX-4100 表现出更优异的蛋白质组范围降解选择性 [1]。KRAS 依赖性细胞系(MIA PaCa-2、NCI-H358、AGS 和 PA-TU-8988T 细胞)不受 TMX-4100 的抑制 [1]。TMX-4100 表现出强效的体外 PDE6D 降解能力。在 MOLT4、Jurkat 和 MM.1S 肿瘤细胞中,TMX-4100 表现出高度的降解偏好性,其 DC50 值小于 200 nM。该化合物是一种分子胶降解剂,可促进PDE6D与cereblon的相互作用,诱导PDE6D的泛素化和降解。这些体外实验结果证实了该化合物在癌细胞系中对PDE6D具有高效且选择性的降解作用。TMX-4100作为降解剂的作用机制与传统酶抑制剂不同。
体内研究 (In Vivo)
TMX-4100 的体内活性数据尚不充分。该化合物用于多发性骨髓瘤的研究,提示其在多发性骨髓瘤动物模型中可能具有体内疗效。标准的体内疗效研究将采用多发性骨髓瘤小鼠异种移植模型,通过口服或肠外途径给药 TMX-4100。研究将评估肿瘤生长情况和肿瘤内 PDE6D 蛋白水平。需要开展进一步研究以全面表征该化合物的体内活性和治疗潜力。
酶活实验
TMX-4100 的体外降解试验包括测定其诱导细胞内 PDE6D 降解的能力。将细胞(MOLT4、Jurkat、MM.1S)用不同浓度的 TMX-4100 处理一定时间。采用 Western blot 或 ELISA 法测定 PDE6D 蛋白水平。通过将降解数据拟合到剂量反应曲线来确定 DC50 值(50% 降解所需的浓度)。此外,还可以通过免疫共沉淀法评估 PDE6D 与 cereblon 之间的相互作用。这些试验证实了该化合物的降解活性。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: MOLT4 细胞
测试浓度: 1 μM
孵育时间: 4 小时
实验结果: 表明对 PDE6D 具有很高的降解偏好性。

Western Blot 分析[1]
细胞类型: MOLT4、Jurkat 和 MM.1S 细胞
测试浓度: 0 nM、40 nM、200 nM、1 μM;
孵育时间: 4 小时
实验结果: 表明 TMX-4100 对 PDE6D 具有很高的降解偏好性,DC50 值小于 200 nM。
TMX-4100 的体外细胞实验通常使用 MOLT4、Jurkat 和 MM.1S 等癌细胞系。细胞用不同浓度的 TMX-4100 处理。通过蛋白质印迹法检测 PDE6D 蛋白水平以评估降解情况。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 等标准方法检测细胞活力和增殖情况,以评估 PDE6D 降解的功能后果。通过蛋白质印迹法检测下游靶点,可以评估该化合物对癌细胞信号通路的影响。这些实验证实了该化合物的细胞活性。
动物实验
TMX-4100 的体内动物实验通常会采用多发性骨髓瘤小鼠异种移植模型。作为一种 PDE6D 降解剂,TMX-4100 可通过口服或肠外途径给药。实验期间将监测肿瘤生长情况,并收集肿瘤组织用于分析 PDE6D 蛋白水平以及细胞增殖和凋亡的生物标志物。药效学研究可以评估靶点结合和通路调控。该化合物在治疗多发性骨髓瘤方面的潜力支持使用合适的动物模型。
药代性质 (ADME/PK)
TMX-4100 的药代动力学特性尚未得到充分研究。作为一种小分子降解剂,该化合物的分子量和化学性质会影响其吸收、分布、代谢和排泄 (ADME)。该化合物能够诱导 PDE6D 降解,提示其可能到达细胞内靶点。需要开展进一步的药代动力学研究,以全面表征其药代动力学特征,并支持其作为多发性骨髓瘤治疗药物的开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
TMX-4100 的毒理学数据在公开领域并不广泛。作为一种用于癌症研究的研究化合物,TMX-4100 尚未经过全面的毒理学评估。通常会对癌细胞系进行标准细胞毒性试验以评估其抗增殖作用。在动物研究中,将监测其耐受性和潜在的不良反应。作为一种分子胶降解剂,该化合物的脱靶降解效应需要仔细评估。在进行临床开发之前,还需要开展进一步的临床前毒理学研究。
参考文献

[1]. Development of PDE6D and CK1α Degraders through Chemical Derivatization of FPFT-2216. J Med Chem. 2022 Jan 13;65(1):747-756.

其他信息
TMX-4100是一种选择性的PDE6D降解剂,在MOLT4、Jurkat和MM.1S细胞中的DC50值低于200 nM。它是一种分子胶降解剂,促进PDE6D与cereblon的相互作用,诱导PDE6D的泛素化和降解。该化合物用于多发性骨髓瘤的研究。尚未报告临床试验或监管批准。TMX-4100作为研究级化合物可用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H10N4O2S
分子量
262.29
精确质量
262.052
CAS号
2367619-63-2
PubChem CID
151449452
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
0.4
tPSA
105
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
18
分子复杂度/Complexity
365
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N1C(=O)CCC(N2C=C(C3C=CSC=3)N=N2)C1=O
InChi Key
PGEUBQZQGXWTFO-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H10N4O2S/c16-10-2-1-9(11(17)12-10)15-5-8(13-14-15)7-3-4-18-6-7/h3-6,9H,1-2H2,(H,12,16,17)
化学名
3-(4-thiophen-3-yltriazol-1-yl)piperidine-2,6-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (381.26 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.71 mg/mL (2.71 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 7.1 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 0.71 mg/mL (2.71 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 7.1mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.8126 mL 19.0629 mL 38.1257 mL
5 mM 0.7625 mL 3.8126 mL 7.6251 mL
10 mM 0.3813 mL 1.9063 mL 3.8126 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们