ZNL-05-044

目录号: V73441 纯度: ≥98%
ZNL-05-044 是一种 CDK11 抑制剂(拮抗剂),在 NanoBRET 实验中,CDK11A 和 CDK11B 的 IC50 值分别为 0.23 μM 和 0.27 μM。
ZNL-05-044 产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
ZNL-05-044 是一种 CDK11 抑制剂(拮抗剂),在 NanoBRET 实验中,其对 CDK11A 和 CDK11B 的 IC50 值分别为 0.23 μM 和 0.27 μM。ZNL-05-044 可导致 G2/M 期细胞周期阻滞并损害 RNA 剪接。
ZNL-05-044 是一种高效、选择性强且细胞渗透性良好的细胞周期蛋白依赖性激酶 11 (CDK11) 抑制剂。它是一种小分子抑制剂,能够高效靶向 CDK11A 和 CDK11B 两种亚型。由于 CDK11 是肿瘤学领域新兴的治疗靶点,ZNL-05-044 可作为研究 CDK11 在细胞周期调控、RNA 剪接和癌症生物学中作用的科研工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 0.23 μM (CDK11A in NanoBRET assay), 0.27 μM (CDK11B in NanoBRET assay), 135 nM (CDK4/cyclin D1 in Adapta activity assay), 189 nM (CDK9/cyclin T1 in Adapta activity assay), 217 nM (CDK6/cyclin D1 in Adapta activity assay)[1] Kd: 69 nM (CDK11A in KdELECT assay)[1]
ZNL-05-044 targets cyclin-dependent kinase 11 (CDK11), specifically both the A and B isoforms (CDK11A and CDK11B). In NanoBRET assays, it exhibits IC50 values of 0.23 microM for CDK11A and 0.27 microM for CDK11B. The compound has a Kd of 69 nM for CDK11A in KdELECT assays. It also shows activity against CDK4/cyclin D1 (IC50 = 135 nM), CDK9/cyclin T1 (IC50 = 189 nM), and CDK6/cyclin D1 (IC50 = 217 nM) in Adapta activity assays, indicating some off-target CDK activity. Its primary mechanism is CDK11 inhibition.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,ZNL-05-044 可抑制 CDK11A 和 CDK11B,NanoBRET 检测的 IC50 值分别为 0.23 uM 和 0.27 uM。ZNL-05-044 处理可导致 G2/M 期细胞周期阻滞并损害 RNA 剪接,这与已知的 CDK11 在剪接体组装和细胞周期进程中的功能相符。该化合物在高浓度下还能抑制 CDK4、CDK9 和 CDK6,从而增强其抗增殖作用。ZNL-05-044 可用于研究 CDK11 在癌细胞增殖和存活中的作用。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中关于ZNL-05-044体内活性的数据并不多见。作为一种强效的CDK11抑制剂,它具有抑制动物癌症模型(尤其是由CDK11过表达或剪接体失调驱动的癌症模型)肿瘤生长的潜力。需要进一步的体内研究来评估其药代动力学特性和抗肿瘤疗效。该化合物有望诱导肿瘤组织细胞周期阻滞和凋亡。
酶活实验
采用NanoBRET靶标结合实验测定ZNL-05-044对CDK11的体外抑制活性。将表达NanoLuc-CDK11融合蛋白的HEK293细胞接种于白色96孔板中。在37℃下,用不同浓度的ZNL-05-044(0.001-100 uM)处理细胞2小时。随后加入NanoBRET示踪剂(例如CDK特异性荧光示踪剂),继续孵育2小时。平衡后,加入NanoBRET Nano-Glo底物,并使用酶标仪测量BRET信号。BRET比值计算为460 nm处的发射光强度除以600 nm处的发射光强度。根据剂量-反应曲线计算靶标结合的IC50值。对于生化激酶活性测定,采用LanthaScreen Eu激酶结合实验或Adapta激酶实验。将重组 CDK11/cyclin D3 与不同浓度的 ZNL-05-044(0.001-100 uM)和荧光示踪剂孵育。孵育后,加入铽标记的抗 GST 抗体,并测量 TR-FRET 信号。采用非线性回归法确定 IC50 值。
细胞实验
对于基于细胞的检测,将癌细胞系(例如 HeLa、MDA-MB-231、HCT116)接种于 96 孔板中,并用浓度范围为 0.01-50 uM 的 ZNL-05-044 处理 24-72 小时。采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法评估细胞活力。碘化丙啶染色后,通过流式细胞术分析细胞周期分布。可通过 RT-PCR 或 RNA-seq 检测内含子保留或剪接缺陷,从而评估 RNA 剪接异常。采用 Annexin V/PI 双染法检测细胞凋亡。
动物实验
ZNL-05-044 的体内实验方案尚不完善。典型的异种移植疗效研究是将癌细胞(例如 HCT116 或 MDA-MB-231)皮下植入免疫缺陷小鼠体内。当肿瘤体积达到 100-200 mm³ 时,将小鼠随机分组,并给予 ZNL-05-044 治疗,剂量为 10-100 mg/kg,每日一次或根据预实验结果调整给药方案。每周两次使用游标卡尺测量肿瘤体积。监测体重作为毒性的一般指标。研究结束时,切除肿瘤组织,用于分析 CDK11 靶点结合、细胞周期标志物和细胞凋亡(例如 Ki67、磷酸化组蛋白 H3、裂解型 caspase-3)。
药代性质 (ADME/PK)
ZNL-05-044 的药代动力学数据有限。该化合物的分子量为 477.41,分子式为 C21H22Cl2N6OS。它在 DMSO 中的溶解度为 100 mg/mL。由于其亲脂性,在水性缓冲液中的溶解度可能较低。体内研究中常用的制剂包括 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水。研究人员应在其特定的动物模型中进行初步药代动力学研究,以确定该化合物的半衰期、Cmax、口服生物利用度和组织分布。该化合物应在氮气保护下于 4℃ 保存,在溶剂中于 -80℃ 保存最长 6 个月,或在 -20℃ 保存最长 1 个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
ZNL-05-044 的毒理学数据仅限于体外细胞活力测定。在癌细胞系中,该化合物在与其 CDK11 抑制活性一致的浓度下可降低细胞活力(IC50 在低微摩尔范围内)。在非癌细胞系中,其细胞毒性可能较低,但未提供具体数据。在动物研究中,需要进行剂量探索研究以确定最大耐受剂量 (MTD)。应遵循研究用化学品的标准安全操作规程。
参考文献

[1]. Synthesis and Structure-Activity relationships of cyclin-dependent kinase 11 inhibitors based on a diaminothiazole scaffold. Eur J Med Chem. 2022 Aug 5;238:114433.

其他信息
ZNL-05-044 是一种研究级化合物,尚未获准用于临床。它是一种选择性 CDK11 抑制剂,通过结构导向设计,基于多靶点骨架开发而成。CDK11 因其在 RNA 剪接和细胞周期进程中发挥的关键作用,已成为肿瘤治疗领域新兴的靶点。ZNL-05-044 可导致 G2/M 期细胞周期阻滞并抑制 RNA 剪接,使其成为研究 CDK11 在癌症生物学中功能的重要工具。请将 ZNL-05-044 粉末储存于 4℃ 氮气保护下,或储存于 -80℃ 溶剂中。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H22CL2N6OS
分子量
477.41
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~209.46 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0946 mL 10.4732 mL 20.9464 mL
5 mM 0.4189 mL 2.0946 mL 4.1893 mL
10 mM 0.2095 mL 1.0473 mL 2.0946 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们