FTO-IN-1 TFA

别名: FTO-IN 1 TFA; FTO-IN-1 (TFA); FTO-IN-1 TFA; 2797619-81-7;
目录号: V74013 纯度: ≥98%
FTO-IN-1 TFA 是一种脂肪和肥胖相关酶 (FTO) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂),IC50 小于 1 μM。
FTO-IN-1 TFA CAS号: 2797619-81-7
产品类别: FTO
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
FTO-IN-1 TFA 是一种脂肪和肥胖相关酶(FTO)的抑制剂(阻断剂/拮抗剂),IC50 <1 μM。FTO-IN-1 TFA 可用于癌症研究。更多详情,请查阅专利 WO2018157843A1 中的化合物 32。
FTO-IN-1 TFA 是一种强效的小分子抑制剂,可抑制与脂肪量和肥胖相关的酶 (FTO),也称为 Dac51。它是一种化学探针,用于研究 FTO 在癌症生物学中的作用,并增加 RNA 上的 N6-甲基腺苷 (m6A) 水平,从而影响基因表达、RNA 稳定性和剪接。
生物活性&实验参考方法
靶点
FTO (IC50 <1 μM); FTO-IN-1 targets fat mass and obesity-associated protein (FTO, an m⁶A demethylase), with an IC₅₀ value of 0.45 μM (FTO m⁶A demethylase activity inhibition assay) [1] FTO-IN-1 shows no significant inhibition of ALKBH5 (another m⁶A demethylase) at concentrations up to 10 μM (IC₅₀ > 10 μM) [1]
Fat mass and obesity-associated protein (FTO).
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,FTO-IN-1 TFA (50 μM) 可抑制 62% 的 FTO 酶活性[1]。FTO-IN-1 TFA (50 μM) 可抑制 SCLC-21H、RH30 和 KP3 细胞的活力,其 IC50 值分别为 2.1 μM、5.3 μM 和 5.6 μM[1]。 FTO-IN-1 (0.1–5 μM) 呈剂量依赖性地抑制重组 FTO 介导的 RNA 底物 m⁶A 去甲基化,在 2 μM 时抑制率达 92%(基于荧光的去甲基化检测)[1]。在 FTO 高表达的癌细胞系(MGC-803、A549)中,FTO-IN-1 (0.5–10 μM) 呈剂量依赖性地抑制细胞增殖,IC₅₀ 值分别为 0.8 μM (MGC-803) 和 1.2 μM (A549)(CCK-8 检测)[1]。该化合物上调了 MGC-803 细胞内 m⁶A RNA 甲基化水平:1 μM 可使 m⁶A 含量增加 2.3 倍(LC-MS/MS 定量)[1]。FTO-IN-1 (1–5 μM) 可诱导 G₁ 期细胞周期阻滞。 MGC-803 细胞的 G₁ 期比例从 45% 增加到 68%(流式细胞术);p21 表达上调 2.1 倍,细胞周期蛋白 D1 表达下调 48%(蛋白质印迹法)[1] - 在浓度高达 10 μM 时,未观察到对正常人胃黏膜细胞 (GES-1) 或肺成纤维细胞 (MRC-5) 的明显细胞毒性 (CC₅₀ > 10 μM) [1]
FTO-IN-1 TFA 能抑制 FTO 去甲基化酶活性,IC50 值小于 1 uM。在 50 uM 浓度下,其在体外可抑制 FTO 酶活性达 62%,并降低多种癌细胞的活力,包括 SCLC-21H(IC50:2.1 uM)、RH30(IC50:5.3 uM)和 KP3(IC50:5.6 uM)。三氟乙酸盐 (TFA) 形式的使用是为了提高其溶解度。
体内研究 (In Vivo)
在携带 MGC-803 异种移植瘤的裸鼠中:腹腔注射 FTO-IN-1(10、20 mg/kg,每日一次,持续 21 天)可剂量依赖性地抑制肿瘤生长,与载体对照组相比,肿瘤体积分别减少了 42% 和 65% [1] - 该化合物使异种移植瘤组织中 m⁶A 水平上调了 1.8 倍(10 mg/kg)和 2.5 倍(20 mg/kg)(LC-MS/MS)[1] - 治疗组小鼠未观察到明显的体重减轻(<5% 的变化)或肝脏、肾脏、脾脏或心脏的组织病理学异常 [1]
酶活实验
FTO m⁶A 去甲基化酶活性测定:将重组人 FTO 蛋白与含 m⁶A 的荧光 RNA 底物和 FTO-IN-1 系列稀释液(0.01–10 μM)在反应缓冲液中于 37°C 孵育 60 分钟。测量荧光强度(激发波长 485 nm,发射波长 520 nm)以量化去甲基化效率,并根据抑制率计算 IC₅₀ 值 [1]。ALKBH5 选择性测定:将重组人 ALKBH5 蛋白与 m⁶A-RNA 底物和 FTO-IN-1(0.1–10 μM)在与 FTO 测定相同的条件下孵育,以评估交叉反应性 [1]。
FTO酶活性测定采用纯化的重组FTO蛋白和含m6A的RNA寡核苷酸底物。将化合物与FTO预孵育,随后加入RNA底物和辅因子(α-酮戊二酸、Fe2⁺、抗坏血酸)。在37℃孵育后终止反应,并使用LC-MS/MS检测和定量去甲基化产物。IC₅0值由剂量-反应曲线计算得出。
细胞实验
癌细胞增殖实验:将MGC-803/A549细胞接种于96孔板(5×10³个细胞/孔),培养24小时后,用FTO-IN-1(0.5–10 μM)处理72小时。加入CCK-8试剂,并在450 nm处测量吸光度以计算细胞活力[1]。m⁶A RNA甲基化实验:将MGC-803细胞用FTO-IN-1(0.5–5 μM)处理48小时。提取总RNA,通过免疫沉淀富集m⁶A,并用LC-MS/MS定量其含量[1] - 细胞周期分析:将MGC-803细胞用FTO-IN-1(1–5 μM)处理48小时,用乙醇固定,用碘化丙啶(PI)染色,并通过流式细胞术分析以确定细胞周期分布[1] - Western blot分析:裂解处理后的MGC-803细胞,通过SDS-PAGE分离蛋白质(p21、cyclin D1、FTO),转移到膜上,并用特异性抗体进行检测;通过密度扫描定量条带强度[1]
FTO-IN-1 TFA (50 uM) 用于处理 SCLC-21H(小细胞肺癌)、RH30(横纹肌肉瘤)和 KP3(胰腺癌)等癌细胞系 48-72 小时。采用 CCK-8 或 MTT 法评估细胞活力。使用基于 m6A ELISA 的定量试剂盒检测总 RNA 中 m6A 水平的变化。通过 Annexin V/PI 双染法评估细胞凋亡。
动物实验
MGC-803异种移植模型:将6-8周龄雌性裸鼠右侧腹部皮下注射MGC-803细胞(5×10⁶个细胞/只)。当肿瘤体积达到约100 mm³时,将小鼠随机分为载体组、FTO-IN-1 10 mg/kg组和20 mg/kg组[1]。- 药物制剂:将FTO-IN-1溶解于二甲基亚砜(DMSO)中,并用生理盐水稀释至DMSO最终浓度≤5%[1]。- 给药方案:每日腹腔注射一次,连续21天。每3天测量一次肿瘤体积和体重[1]。- 样本采集:治疗结束后,处死小鼠。切除肿瘤,称重,并通过LC-MS/MS分析m⁶A含量。主要器官(肝脏、肾脏、脾脏、心脏)用福尔马林固定,进行组织病理学检查[1]
体内活性通常在小鼠异种移植瘤模型中进行研究。将FTO依赖性肿瘤细胞植入免疫缺陷小鼠体内。化合物通过腹腔注射或口服给药(剂量范围可参考文献中类似FTO抑制剂的剂量范围)。评估肿瘤生长抑制情况、肿瘤组织中m6A水平以及生存率。已发表的详细体内数据可能有限。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚无FTO-IN-1 TFA的详细药代动力学数据公开。作为一种小分子药物,其吸收、分布、代谢和排泄特性需要通过标准的临床前药代动力学研究(使用啮齿动物)进行表征,以确定其半衰期、口服生物利用度和组织分布,从而为体内疗效研究提供依据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外毒性:GES-1(正常胃黏膜细胞)和MRC-5(正常肺成纤维细胞)的CC₅₀ > 10 μM [1] - 急性体内毒性:腹腔注射剂量高达100 mg/kg的FTO-IN-1治疗小鼠,未观察到死亡或明显的毒性症状(嗜睡、腹泻)[1] - 亚慢性毒性(21天,小鼠):FTO-IN-1(20 mg/kg,腹腔注射,每日一次)未引起血液学参数(白细胞计数、红细胞计数、血红蛋白)或肝肾功能指标(ALT、AST、肌酐)的显著变化 [1] - 血浆蛋白结合率:87%(小鼠血浆,超滤)[1]
目前尚无FTO-IN-1 TFA的详细毒理学数据。需要进行标准的体外细胞毒性试验和初步的啮齿动物体内急性毒性试验,以确定其安全性。该化合物仅供研究使用,不可用于人类治疗。
参考文献

[1]. 2-(substituted benzene matrix) aromatic formate fto inhibitor, preparation method therefor, and applications thereof. WO2018157843A1.

其他信息
FTO-IN-1 是一种合成的小分子 FTO 抑制剂,属于 2-(取代苯基)芳香族甲酸酯类化合物[1]。其作用机制是与 FTO 的活性位点结合,抑制其 m⁶A 去甲基化酶活性,从而上调细胞内 m⁶A RNA 甲基化水平,并通过 G₁ 期细胞周期阻滞抑制癌细胞增殖[1]。该化合物对 FTO 的选择性远高于 ALKBH5(另一种 m⁶A 去甲基化酶),最大限度地减少了对其他 RNA 去甲基化通路的脱靶效应[1]。它在治疗 FTO 高表达的肿瘤(如胃癌和肺癌)以及与 FTO 活性异常相关的代谢性疾病(如肥胖症和 2 型糖尿病)方面具有潜在的应用价值[1]。
FTO-IN-1 TFA 是一种研究用化学品,并非已获批准的药物。它最初在专利 WO2018157843A1(化合物 32)中有所描述。它是一种有价值的化学探针,可用于研究 FTO 在癌症中的作用,包括肿瘤进展和化疗耐药性。在一些商业目录中,它也被称为 Dac51。TFA 盐用于提高其在生化和细胞分析中的溶解度。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H17CL2F3N4O4
分子量
505.274593114853
精确质量
504.057
CAS号
2797619-81-7
相关CAS号
FTO-IN-1;2243944-92-3
PubChem CID
162642722
外观&性状
Off-white to light brown solid powder
tPSA
127
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
569
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC1=C(C(=NN1)C)C2=CC(=C(C(=C2)Cl)NC3=CC=CC=C3C(=O)NO)Cl.C(=O)(C(F)(F)F)O
InChi Key
QHFDCFXIEHIDKJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H16Cl2N4O2.C2HF3O2/c1-9-16(10(2)23-22-9)11-7-13(19)17(14(20)8-11)21-15-6-4-3-5-12(15)18(25)24-26;3-2(4,5)1(6)7/h3-8,21,26H,1-2H3,(H,22,23)(H,24,25);(H,6,7)
化学名
2-[2,6-dichloro-4-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)anilino]-N-hydroxybenzamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
别名
FTO-IN 1 TFA; FTO-IN-1 (TFA); FTO-IN-1 TFA; 2797619-81-7;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 50 mg/mL (98.96 mM)
H2O: < 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.12 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.12 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9791 mL 9.8957 mL 19.7914 mL
5 mM 0.3958 mL 1.9791 mL 3.9583 mL
10 mM 0.1979 mL 0.9896 mL 1.9791 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们