PD0325901-O-C2-dioxolane

别名: PD0325901-O-C2-dioxolane; 2581116-22-3; PD0325901-O-C2-dioxolane; 2581116-22-3; N-[2-(1,3-dioxolan-2-yl)ethoxy]-3,4-difluoro-2-(2-fluoro-4-iodoanilino)benzamide; SCHEMBL24072690; N-[2-(1,3-二氧戊环-2-基)乙氧基]-3,4-二氟-2-[(2-氟-4-碘苯基)氨基]-苯甲酰胺
目录号: V74086 纯度: ≥98%
PD0325901-O-C2-二氧戊环含有 MEK 抑制剂 PD0325901 的主要成分。
PD0325901-O-C2-dioxolane CAS号: 2581116-22-3
产品类别: Ligands for Target Protein for PROTAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
Other Sizes

Other Forms of PD0325901-O-C2-dioxolane:

  • MS432
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产品描述
PD0325901-O-C2-二氧戊环含有 MEK 抑制剂 PD0325901 的主要成分。PD0325901-O-C2-二氧戊环和 VHL 或 CRBN E3 连接酶的配体可用于合成 MEK1/2 降解剂。
PD0325901-O-C2-二氧戊环是一种合成中间体,包含MEK抑制剂PD0325901的主要部分。它被设计为靶蛋白配体,用于合成靶向MEK1/2的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)降解剂。当通过合适的连接子与VHL或CRBN E3连接酶配体结合时,PD0325901-O-C2-二氧戊环可作为双功能小分子降解剂中的MEK结合弹头。
生物活性&实验参考方法
靶点
MEK1/2
MEK1, MEK2 (as a ligand component in PROTAC design)
体外研究 (In Vitro)
PD0325901 是一种非 ATP 竞争性 MEK 抑制剂,可有效抑制肿瘤细胞生长和 ERK 信号通路[1]。
MEK1 和 MEK2(也称为 MAP2K1 和 MAP2K2)是 ERK 信号通路输出的“守门人”,在控制 ERK 活性方面发挥着冗余作用。目前已开发出多种靶向 MEK1/2 的抑制剂,其中包括三种 FDA 批准的药物。然而,患者中已观察到对 MEK1/2 抑制剂的获得性耐药,因此需要新的治疗策略来克服这种耐药性。本文报道了一种首创的 MEK1/2 降解剂 MS432 (23),它以 VHL E3 连接酶和蛋白酶体依赖的方式高效且选择性地降解 MEK1 和 MEK2,并抑制细胞中的 ERK 磷酸化。与阴性对照MS432N (24)相比,化合物23能更有效地抑制结直肠癌和黑色素瘤细胞的增殖,且MEK1/2敲低也能产生类似的效果。在全蛋白质组学分析研究中,化合物23对MEK1/2具有高度选择性。此外,该化合物在小鼠体内具有良好的生物利用度,可用于体内疗效研究。我们为生物医学界提供了两种特性明确的化学工具。[1]
PD0325901(母体化合物)是一种非ATP竞争性MEK抑制剂,可有效抑制ERK信号通路并抑制肿瘤细胞增殖。PD0325901-O-C2-二氧戊环保留了PD0325901的MEK结合特性,使其可用作PROTAC中的靶蛋白配体。当整合到PROTAC中时,它能促进MEK1/2的结合,并随后通过泛素-蛋白酶体途径降解MEK1/2。
体内研究 (In Vivo)
作为一种 PROTAC 配体中间体,PD0325901-O-C2-二氧戊环本身并非设计用于直接的体内活性。然而,当其与 E3 连接酶配体和连接子偶联后,所得的 PROTAC 降解剂可在细胞内实现高效的 MEK1/2 降解。例如,相关的 MEK PROTAC 已在小鼠模型中展现出纳摩尔级的 DC₅0 值和体内疗效。
酶活实验
PD0325901-O-C2-二氧戊环不直接用于非细胞结合实验,而是作为合成砌块。为进行质量控制,该化合物通过核磁共振(NMR)和液相色谱-质谱联用(LC-MS)进行鉴定,纯度>97%。通常以固体形式储存于-20℃,用于PROTAC合成或生物学评价时,需溶解于DMSO中(浓度最高可达100 mg/mL)。
细胞实验
PD0325901-O-C2-二氧戊环通常溶于DMSO中配制成储备液,然后在细胞研究中进一步用细胞培养基稀释(最终DMSO浓度≤0.1%)。它常用于PROTAC合成,细胞活性评估针对的是最终的PROTAC分子,而不是中间体本身。
动物实验
作为 PROTAC 配体中间体,PD0325901-O-C2-二氧戊环通常仅在完全偶联为 PROTAC 分子后才用于体外或体内实验。最终的 PROTAC 降解剂在小鼠异种移植模型或药代动力学研究中进行评估。目前尚未有直接使用该中间体进行体内实验的报道。
药代性质 (ADME/PK)
PD0325901-O-C2-二氧戊环本身的药代动力学数据尚未见报道,因为它是一种用于PROTAC合成的中间体,而非候选药物。然而,其母体化合物PD0325901已知具有口服生物利用度,且血浆半衰期适中。PD0325901-O-C2-二氧戊环很可能在体内代谢。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于PD0325901-O-C2-二氧戊环的毒性数据报道。作为PD0325901的结构类似物,其全身应用时可能具有与MEK抑制剂类似的毒性特征。然而,作为PROTAC中间体,其毒理学特征通常仅在最终降解分子的背景下进行评估。
参考文献

[1]. Discovery of a First-in-Class Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 1/2 Degrader. J Med Chem. 2019;62(23):10897-10911.

其他信息
MEK1 和 MEK2(也称为 MAP2K1 和 MAP2K2)是 ERK 信号通路输出的“守门人”,在控制 ERK 活性方面发挥着冗余作用。目前已开发出多种靶向 MEK1/2 的抑制剂,其中包括三种获得 FDA 批准的药物。然而,患者中已观察到对 MEK1/2 抑制剂的获得性耐药,因此亟需新的治疗策略来克服这种耐药性。本文报道了一种首创的 MEK1/2 降解剂 MS432 (23),它以 VHL E3 连接酶和蛋白酶体依赖的方式高效且选择性地降解 MEK1 和 MEK2,并抑制细胞中的 ERK 磷酸化。与阴性对照 MS432N (24) 相比,MS432 能更有效地抑制结直肠癌和黑色素瘤细胞的增殖,并且 MEK1/2 敲低模拟了其抑制作用。化合物 23 在全蛋白质组学分析中表现出对 MEK1/2 的高选择性。它还具有小鼠生物利用度,可用于体内疗效研究。我们为生物医学界提供了两种明确的化学工具。[1]
PD0325901-O-C2-二氧戊环(CAS:2581116-22-3;分子式:C1₈H1₆F3IN2O4;分子量:508.23)含有二氧戊环保护基,可作为连接基团偶联的通用合成基团。其在DMSO中的溶解度为80-100 mg/mL,固态形式在-20℃下稳定。该化合物仅供研究使用,未获准用于临床应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H16F3IN2O4
分子量
508.23
精确质量
508.010
CAS号
2581116-22-3
相关CAS号
MS432;2672512-44-4
PubChem CID
154573762
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
4.3
tPSA
68.8Ų
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
515
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NOCCC1OCCO1)(=O)C1=CC=C(F)C(F)=C1NC1=CC=C(I)C=C1F
InChi Key
OGHJINAFAYYQDK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H16F3IN2O4/c19-12-3-2-11(18(25)24-28-6-5-15-26-7-8-27-15)17(16(12)21)23-14-4-1-10(22)9-13(14)20/h1-4,9,15,23H,5-8H2,(H,24,25)
化学名
N-[2-(1,3-dioxolan-2-yl)ethoxy]-3,4-difluoro-2-(2-fluoro-4-iodoanilino)benzamide
别名
PD0325901-O-C2-dioxolane; 2581116-22-3; PD0325901-O-C2-dioxolane; 2581116-22-3; N-[2-(1,3-dioxolan-2-yl)ethoxy]-3,4-difluoro-2-(2-fluoro-4-iodoanilino)benzamide; SCHEMBL24072690;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (196.76 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.92 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.92 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.92 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9676 mL 9.8381 mL 19.6761 mL
5 mM 0.3935 mL 1.9676 mL 3.9352 mL
10 mM 0.1968 mL 0.9838 mL 1.9676 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们