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PROTAC RAF degrader 1

目录号: V74142 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
PROTAC RAF 降解剂 1（化合物 512）是一种 PROTAC RAF 降解剂。
PROTAC RAF degrader 1 CAS号: 2413035-41-1
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
PROTAC RAF降解剂1（化合物512）是一种PROTAC RAF降解剂。PROTAC RAF降解剂1可诱导BRAF突变体的靶向降解（BRAF V600E、V600K、G464V、G469A和K601E的DC50值分别为5.4 nM、4.64 nM、15.5 nM、2.11 nM和63.9 nM）。PROTAC RAF降解剂1具有抗癌作用。PROTAC RAF降解剂1可用于研究由RAF聚集、积累或RAF组成型激活引起的疾病。
PROTAC RAF降解剂1（化合物512）是一种靶向蛋白水解的嵌合体，可诱导BRAF突变体的靶向降解。它基于BRAF抑制剂维莫非尼（PLX4032）与E3连接酶配体偶联而成。该化合物可诱导BRAF V600E、V600K、G464V、G469A和K601E的降解，其DC₅0值分别为5.4 nM、4.64 nM、15.5 nM、2.11 nM和63.9 nM。该化合物具有抗癌活性，可用于研究由RAF聚集、积累或组成型激活引起的疾病。
生物活性&实验参考方法
靶点
RAF (BRAF mutants including V600E, V600K, G464V, G469A, K601E)
体外研究 (In Vitro)
PROTAC RAF降解剂1（化合物512）能有效诱导多种BRAF突变体的靶向降解，其DC₅0值分别为：5.4 nM (BRAF V600E)、4.64 nM (V600K)、15.5 nM (G464V)、2.11 nM (G469A)和63.9 nM (K601E)。该化合物具有抗癌活性，可用于研究包括癌症在内的RAF驱动疾病。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未有关于PROTAC RAF降解剂1的详细体内活性数据报道。作为一种强效的多种BRAF突变体降解剂，它有望通过持续的靶标降解和减少MAPK反常激活，在BRAF突变异种移植模型中抑制肿瘤生长。
酶活实验
在结合研究中，将重组BRAF突变蛋白与PROTAC RAF降解剂1（0.1-1000 nM）孵育，并通过表面等离子共振或荧光偏振法测定结合亲和力。在细胞实验中，通过与蛋白酶体抑制剂（例如MG132）共同处理来验证降解机制。
细胞实验
PROTAC RAF降解剂1溶于DMSO，并用细胞培养基稀释（最终DMSO浓度≤0.1%）。BRAF突变型黑色素瘤细胞（例如，V600E突变的A375细胞，V600E突变的SK-MEL-28细胞）用浓度范围为0.1-1000 nM的化合物处理6-24小时。采用Western blotting法检测BRAF和pERK的表达水平。处理72-96小时后，采用MTT或CellTiter-Glo法评估细胞增殖情况。
动物实验
目前尚未报道PROTAC RAF降解剂1的详细体内实验方案。根据PROTAC的标准流程，该化合物将配制成合适的溶剂（例如，10% DMSO、40% PEG400、5% Tween 80），并腹腔注射给携带BRAF突变型黑色素瘤异种移植瘤的小鼠。随后将评估肿瘤生长抑制、BRAF降解和pERK抑制情况。
药代性质 (ADME/PK)
目前尚未有关于PROTAC RAF降解剂1的药代动力学数据报道。作为一种高分子量PROTAC（分子量1010.18），其口服生物利用度可能较低，需要肠外给药。半衰期、Cmax和清除率等详细参数尚未公开。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于PROTAC RAF降解剂1的毒性数据报道。作为一种BRAF突变体降解剂，其潜在毒性可能包括皮疹和胃肠道反应。该降解剂对突变型BRAF的高选择性可能减少MAPK的异常激活，从而与传统BRAF抑制剂相比，潜在地提高其安全性。目前尚未发表任何毒理学研究。
参考文献

[1]. Compounds and methods for the targeted degradation of rapidly accelerated fibrosarcoma polypeptides. Patent. US 20200129627 A1.

[2]. The Targeted Degradation of BRAF V600E Reveals the Mechanisms of Resistance to BRAF-Targeted Treatments in Colorectal Cancer Cells. Cancers (Basel). 2023 Dec 12;15(24):5805.
其他信息
PROTAC RAF降解剂1（化合物512；CAS：2413035-41-1；分子式：C₅1H₅₇F2N₉O₇S2；分子量：1010.18）是一种基于维莫非尼（PLX4032）的高效PROTAC降解剂，可降解多种BRAF突变体。对于几种具有临床意义的BRAF突变体，其DC₅0值在低纳摩尔范围内。该化合物仅供研究使用；尚未有临床试验或监管部门批准的报道。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C51H57F2N9O7S2
分子量
1010.18119597435
精确质量
1009.379
CAS号
2413035-41-1
PubChem CID
146547699
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
6.4
tPSA
247
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
17
重原子数目
71
分子复杂度/Complexity
1940
定义原子立体中心数目
3
SMILES
S1C=NC(C)=C1C1C=CC(=CC=1)CNC([C@@H]1C[C@H](CN1C([C@H](C(C)(C)C)NC(CN1CCN(C2C=CC(C3C=NC4=C(C(C(C5C(=CC=C(C=5F)NS(CCC)(=O)=O)F)=O)=CN4)C=3)=CC=2)CC1)=O)=O)O)=O
InChi Key
MBCAVOCJJAQHHT-FGUOTCRGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C51H57F2N9O7S2/c1-6-21-71(68,69)59-40-16-15-39(52)43(44(40)53)45(65)38-26-55-48-37(38)22-34(25-54-48)32-11-13-35(14-12-32)61-19-17-60(18-20-61)28-42(64)58-47(51(3,4)5)50(67)62-27-36(63)23-41(62)49(66)56-24-31-7-9-33(10-8-31)46-30(2)57-29-70-46/h7-16,22,25-26,29,36,41,47,59,63H,6,17-21,23-24,27-28H2,1-5H3,(H,54,55)(H,56,66)(H,58,64)/t36-,41+,47-/m1/s1
化学名
(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[4-[3-[2,6-difluoro-3-(propylsulfonylamino)benzoyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl]phenyl]piperazin-1-yl]acetyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 160 mg/mL (158.39 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 4 mg/mL (3.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 40.0 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。
配方 2 中的溶解度: ≥ 4 mg/mL (3.96 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 40.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9899 mL 4.9496 mL 9.8992 mL
5 mM 0.1980 mL 0.9899 mL 1.9798 mL
10 mM 0.0990 mL 0.4950 mL 0.9899 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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